Perfuzja i trawienie nerek zapewniają wysoką żywotność komórek nabłonka cewek:
Komórki nabłonka cewek nerkowych myszy zostały wyizolowane zgodnie z krokami opisanymi w sekcjach 1–3 powyższego protokołu.
Po trawieniu, heterogenna populacja komórek nerkowych, niecałkowicie strawione kanaliki oraz inne szczątki tkankowe o rozmiarze mniejszym niż 70 µm zostały wysiane na naczynie hodowlane w dniu izolacji. Przewiduje się, że zmiany od dnia 0 do dnia 1 po izolacji objawiają się zazwyczaj jedynie w stopniu przylegania komórek, a nie w ich wzroście. Po przeanalizowaniu pływającej heterogennej populacji stwierdzono, że w dniu 1 przyległo jedynie kilka komórek cewkowych (Rycina 1A). Ponowne zebranie komórek w dniu 1, wirowanie i ponowne wysianie pomogły usunąć lekkie zanieczyszczenia i osadzić małe fragmenty kanalików w celu uwolnienia komórek cewkowych. Od dnia 1 do dnia 3 oczekiwano nie tylko lepszego przylegania komórek, ale także wyraźnego wzrostu tempa ich namnażania, co zaobserwowano w postaci trzykrotnego zwiększenia gęstości komórek w porównaniu z dniem 1 (Rycina 1A). W początkowej fazie wzrostu komórki tworzyły kilka kolonii i zasiedlały obszary wokół nich. Od tego momentu izolowane komórki w pełni się zregenerowały i wykazywały prawidłową proliferację. Do 5. dnia komórki osiągnęły 80 - 90% konfluencji w szalce Petriego o średnicy 60 mm, pozostawiając pewne wolne przestrzenie między poszczególnymi komórkami oraz koloniami (Rycina 1A).
Subkultywacja i charakterystyka wyizolowanych komórek cewkowych:
Wyizolowane nabłonkowe komórki cewek nerkowych poddano subkultywacji w celu przeprowadzenia charakterystyki, zgodnie z krokami opisanymi w sekcji 4 powyższego protokołu.
Od 5. dnia komórki całkowicie regenerowały się po izolacji i zaczęły intensywnie proliferować. Tydzień po izolacji komórki osiągnęły konfluencję w szalce Petriego o średnicy 60 mm. Po 1 tygodniu hodowli w pasażu 0 komórki były gotowe do przesiania do pasażu 1, a następnie do kolejnych dwóch pasaży. Podobne wzorce wzrostu zaobserwowano w pasażu 1 i pasażu 2. Zazwyczaj komórki w pasażu 1 i 2 osiągają konfluencję niezbędną do dalszych pasażowań w czasie krótszym niż tydzień (Rycina 1B). Ciągła hodowla konfluentnych komórek od pasażu 0 do pasażu 2 wykazała rozległe tworzenie się kopułek23,24 (Rycina 1B), co sugeruje, że izolowane komórki zachowały prawidłowy stan fizjologiczny i wydzielały płyny w sposób zbliżony do warunków in vivo. Spowodowało to oddzielenie się monowarstwy komórek od płytki, przy jednoczesnym zachowaniu połączeń poprzez połączenia ścisłe.
Aby scharakteryzować komórki w hodowli, przeprowadzono barwienie immunofluorescencyjne w hodowanych komórkach od pasażu 1 do pasażu 4, a także w kontrolnej linii komórkowej – ludzkich komórkach nabłonka proksymalnego cewek nerkowych HK-2. Do badań charakterystyki wykorzystano markery kanalików proksymalnych: akwaporynę 1 (AQP1)25 i angiotensynogen (AGT)9, marker kanalików dystalnych: E-kadherynę25, marker nabłonkowy: aktynę mięśni gładkich (SMA)26,27,28, markery makrofagów: F4/8029 i CD6830 oraz marker kłębuszkowy: antygen różnicowania tymocytów 1 (Thy1/CD90)9. Białka kanalików proksymalnych AQP1 i AGT wykazywały konsekwentnie wysoką ekspresję w izolowanych komórkach kanalikowych od pasażu 1 do pasażu 4, a także w dodatniej kontroli w postaci proksymalnych komórek nabłonkowych HK-2 (Rycina 2A). Białko kanalików dystalnych, E-kadheryna, była wyrażana w izolowanych komórkach kanalikowych do pasażu 4 i była również obserwowana w komórkach HK-2 (Rycina 2A). SMA była obficie wyrażana w izolowanych komórkach kanalikowych oraz w kontrolnych komórkach HK-2, co jest zgodne z opublikowanymi doniesieniami26,27. Z kolei białko kłębuszkowe Thy1 oraz białko makrofagów F4/80 były nieobecne zarówno w izolowanych komórkach kanalikowych, jak i w kontrolnych komórkach HK-2 (Rycina 2A). CD68 wykazywało minimalną ekspresję w komórkach HK-2 oraz w izolowanych komórkach kanalikowych w pasażu 1 i pasażu 2, a następnie jego ekspresja stała się niewykrywalna od pasażu 3 do pasażu 4 (Rycina 2A). Wyniki sugerują, że komórki izolowane zgodnie z tym protokołem stanowią mieszaninę komórek kanalików proksymalnych i dystalnych. Aby porównać ekspresję tych białek markerowych in vivo, przeprowadzono barwienie w zamrożonych tkankach nerek. Markery kanalikowe, w tym AQP1, AGT i E-kadheryna, oraz białko kłębuszkowe Thy1 wykazywały wysoką ekspresję w nerkach pobranych od zdrowej myszy typu dzikiego (Rycina 2B). Niska ekspresja F4/80 i CD68 była obserwowana w nerkach typu dzikiego, natomiast szeroka ekspresja występowała w nerkach pobranych od myszy Col4a3-/-, u której rozwinęła się niewydolność nerek z infiltracją makrofagów20,31 (Rycina 2C).
Analiza bioenergetyki mitochondriów w izolowanych pierwotnych komórkach kanalikowych:
Kroki analizy oddychania mitochondrialnego opisano w sekcji 5 protokołu przedstawionego powyżej.
Oddychanie mitochondrialne wyizolowanych pierwotnych komórek cewkowych mierzy się za pomocą zewnątrzkomórkowej analizy strumienia szybkości zużycia tlenu (OCR) przy różnych gęstościach wysiewu. Aby dobrać odpowiednią gęstość wysiewu, dzień przed (około 20 h przed) zewnątrzkomórkowym pomiarem strumienia (Ryc. 3A) na 96-dołkową mikropłytkę XF96 wysiano odpowiednio 20 000, 30 000 i 40 000 pierwotnych TEC na dołek. Po przeprowadzeniu zewnątrzkomórkowej analizy strumienia pomiary OCR znormalizowano do liczby komórek poprzez kwantyfikację barwienia Hoechstem. Wysiew TEC w gęstości 20 000, 30 000 lub 40 000 komórek/dołek skutkował średnim podstawowym OCR wynoszącym odpowiednio 25, 45 lub 50 pmol/min (Ryc. 3A). Ponadto obrazy mikroskopowe wysianych komórek wykazały, że gęstość 40 000 komórek/dołek lepiej pokrywała całą powierzchnię dna dołków mikropłytki niż pozostałe gęstości wysiewu (Ryc. 3B). Mimo że maksymalny OCR przy użyciu 40 000 komórek nie wzrósł w porównaniu do gęstości 30 000 komórek, zalecamy gęstość komórek na poziomie około 40 000 komórek/dołek dla optymalnych oddziaływań między komórkami a związkami.
Ponadto w naszych eksperymentach wykazano, że optymalne stężenia związków hamujących/odsprzęgających wynoszą 1 µM oligomycyny, 1 µM FCCP oraz 2 µM rotenonu/antymycyny-A (protokoły analizy przepływu zewnątrzkomórkowego oraz wstrzykiwania przez porty zamieszczono w Tabeli 1; eksperymenty optymalizacyjne nie zostały przedstawione). Zaleca się jednak wszystkim użytkownikom przeprowadzenie wstępnego testu z różnymi stężeniami tych związków, najlepiej niższymi i wyższymi od wartości opublikowanych, aby zapewnić uzyskanie najlepszych wyników.
Analiza przepływu zewnątrzkomórkowego dostarcza szeregu istotnych parametrów do oceny bioenergetyki nerkowych TEC. Przykładowo, ponieważ wykazano, że utlenianie kwasów tłuszczowych jest specyficznie zaburzone w TEC, zastosowanie pożywek zawierających substrat w postaci kwasu tłuszczowego (palmitanu) wraz z inhibitorem glikolizy (2DG) może służyć jako użyteczne narzędzie do bezpośredniej oceny utleniania kwasów tłuszczowych w TEC w pasażach 1 i 2 (Rycina 3C). W przypadku włóknienia nerek oczekuje się, że całkowita wydolność oddechowa komórek będzie niższa niż w zdrowej nerce, nawet jeśli pożywki oparte na glukozie nie wykażą żadnych różnic.
Podsumowując, analiza strumienia zewnątrzkomórkowego, szczególnie w celu oceny zdolności do utleniania kwasów tłuszczowych, może być wykorzystana jako informacyjna metoda oceny stanu energetycznego nerkowych komórek TEC, w których zmiany patologiczne wpływające na profil bioenergetyczny odgrywają kluczową rolę w włóknieniu nerek i progresji do niewydolności nerek.
| Kroki | Czas (min) |
| Kalibrować | |
| Równoważyć: | 00:12:00 |
| Pomiar 1 | 3 pętle |
| Wymieszaj | 00:02:00 |
| Czekaj | 00:02:00 |
| Pomiar | 00:03:00 |
| Wymieszać | 00:02:00 |
| Czekaj | 00:02:00 |
| Pomiar | 00:03:00 |
| Wymieszaj | 00:02:00 |
| Czekaj | 00:02:00 |
| Pomiar | 00:03:00 |
| Wstrzyknij do portu A (1 μM Oligomycyna) | 2 pętle |
| Wymieszaj | 00:02:00 |
| Czekaj | 00:02:00 |
| Pomiar | 00:03:00 |
| Wymieszaj | 00:02:00 |
| Czekaj | 00:02:00 |
| Pomiar | 00:03:00 |
| Wstrzyknij przez port B (1 μM FCCP) | 2 pętle |
| Wymieszać | 00:02:00 |
| Czekaj | 00:02:00 |
| Pomiar | 00:03:00 |
| Wymieszać | 00:02:00 |
| Czekaj | 00:02:00 |
| Pomiar | 00:03:00 |
| Wstrzyknąć do portu C (2 μM Rotenon/Antymycyna) | 2 pętle |
| Wymieszać | 00:02:00 |
| Czekać | 00:02:00 |
| Pomiar | 00:03:00 |
| Wymieszać | 00:02:00 |
| Czekaj | 00:02:00 |
| Pomiar | 00:03:00 |
Tabela 1. Zstandardyzowany protokół analizy strumienia zewnątrzkomórkowego dla optymalnych pomiarów OCR w pierwotnych komórkach cewkowych.

Rysunek 1. Hodowla komórkowa izolowanych pierwotnych komórek kanalikowych. (A) Izolowane pierwotne komórki kanalikowe przytwierdzają się wcześnie, w 1 dniu, i intensywnie rosną od 3 do 5 dnia. Obrazy wykonano przy użyciu obiektywów 10X i 20X. (B) Ten panel przedstawia subkulturę izolowanych pierwotnych komórek kanalikowych od pasażu 0 do pasażu 3. Obrazy wykonano przy użyciu obiektywów 10X i 20X w celu obrazowania kopułek komórkowych oraz obiektywu 40X w celu ukazania zmian morfologicznych w kolejnych pasażach. Pasek skali = 100 µm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 2. Charakterystyka wyizolowanych pierwotnych komórek cewkowych. (A) Immunobarwienie przeciwciałami przeciwko białkom cewek bliższych (AQP1, AGT), białku czewki dalszej (E-kadheryna), białku nabłonkowemu (SMA), białku mezangialnemu (Thy1) oraz białkom makrofagów (F4/80, CD68) wykazuje, że wyizolowane pierwotne komórki cewkowe i późniejsze subkultury są czystymi komórkami cewek bliższych i dalszych. (B) Ten panel przedstawia barwienie białek cewki bliższej, cewki dalszej i białek mezangialnych w tkankach nerkowych zdrowej myszy typu dzikiego jako kontrolę dodatnią oraz kontrolę ujemną bez przeciwciał pierwszorzędowych. (C) Ten panel przedstawia barwienie białek makrofagów F4/80 i CD68 w tkance nerkowej pobranej od myszy Col4a3-/- jako kontrolę dodatnią. Pasek skali = 20 µm. DAPI pokazano w kolorze niebieskim. Białka markerowe pokazano w kolorze zielonym. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 3. Analiza przepływu zewnątrzkomórkowego w wyizolowanych pierwotnych komórkach kánicozek przy różnych gęstościach wysiewu. (A) Zwiększenie gęstości wysiewu komórek podnosi podstawowy poziom respiracji w pierwotnych komórkach kánicozek, badanych w trzecim pasażu. (B>) Ten panel przedstawia obrazy mikroskopowe pierwotnych komórek kánicozek hodowanych na mikropłytce XF96 z wysiewem o gęstości 20 000, 30 000 i 40 000 komórek/studzienkę. Pasek skali = 100 µm. (C>) Ten panel przedstawia analizę przepływu zewnątrzkomórkowego w pierwotnych komórkach kánicozek w pasażach 2 i 1, opartą na kwasach tłuszczowych lub glukozie. Dane przedstawiono jako średnia ± SEM. Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tego rysunku.