$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Cytometria przepływu krwi pełnej jest idealnym podejściem do badania monocytów, ponieważ komórki są badane w warunkach zbliżonych do ich fizjologicznego mikrośrodowiska, co daje wgląd w ich rolę w infekcjach i stanach zapalnych. Co więcej, użycie świeżych (tj. nieprzetworzonych) próbek krwi minimalizuje zmiany lub transformacje komórek, które mogą wystąpić w wyniku przechowywania lub obchodzenia sięz 18,19, takich jak te, o których wiadomo, że występują w przypadku monocytów rozmrożonych w zamrażarce20. Zaleca się szybkie przygotowanie próbki, ponieważ niektóre markery są regulowane w górę, jeśli próbki są przechowywane w temperaturze pokojowej przed przetwarzaniem19. Optymalne stężenia markerów M1 i M2 określono przez miareczkowanie i należy to zrobić dla każdego nowego przeciwciała, aby ograniczyć niespecyficzne wiązanie, zapewniając jednocześnie, że stopień przesunięcia jest spowodowany ekspresją antygenu, a nie ograniczony przez brak przeciwciała. Usunięcie czerwonych krwinek i utrwalenie białych krwinek za pomocą roztworu do lizy jest ważnym krokiem w tym protokole, ponieważ obecność czerwonych krwinek może zakłócać cytometrię przepływową 21,22. Należy pamiętać, że chociaż niektóre roztwory do lizy są kompatybilne z barwieniem bez mycia, wyraźniejsze populacje są widoczne w naszych rękach, gdy używany jest etap mycia.
Prawidłowa konfiguracja cytometru przepływowego ma również kluczowe znaczenie przy porównywaniu ekspresji markerów monocytów. Zalecamy, aby badacze utrzymywali stałe docelowe intensywności fluorescencji kulek kontrolnych i przeprowadzali kontrolę jakości urządzenia, które ma być używane w celu zapewnienia spójnych wyników dla różnych próbek pobranych w różnych dniach. Oprócz tego kontrole izotypów są wykorzystywane do pomocy w interpretacji wszelkich niespecyficznych sygnałów tła generowanych przez niespecyficzne wiązanie przeciwciał. Monocyty mają wysoki poziom receptorów Fc11 i dlatego są podatne na niespecyficzne wiązanie. Warto zauważyć, że poziom niespecyficznego wiązania różni się dla różnych podzbiorów, a zatem użycie kontroli izotypu staje się ważne przy porównywaniu stopnia ekspresji markera między podzbiorami.
Innym ważnym kryterium, które należy wziąć pod uwagę, są zastosowane stopnie bramkowania. Niektóre badania sugerują, że kluczowe jest narysowanie szczelnej bramy wokół populacji monocytów na wykresie FSC(A)/SSC(A), aby pozbyć się większości niemonocytowych komórek CD16 dodatnich 23,24,25, ale może to prowadzić do utraty niektórych monocytów, ponieważ komórki niemonocytowe mogą nakładać się na monocyty na poletkach FSC/SSC 26. Raczej, aby wykluczyć wszelkie inne komórki krwi, które mogą zanieczyszczać monocyty, konieczne jest włączenie trzeciego markera monocytów oprócz CD14 i CD1626,27. Z tego powodu HLA-DR jest często stosowany i jest idealny, ponieważ nie ulega ekspresji przez komórki NK ani neutrofile17,28. Chociaż limfocyty (limfocyty B i limfocyty T) mogą wykazywać ekspresję HLA-DR, różnią się one od monocytów pod względem ekspresji CD14. Podczas gdy HLA-DR jest idealnym trzecim markerem, CD86 również został zarekomendowany 5,27,29, ale nie został tutaj zastosowany, ponieważ jest również markerem M1, a zatem oceniono jego stopień ekspresji w podzbiorach monocytów.
Walidacja zastosowanej strategii bramkowania ma kluczowe znaczenie. Podczas gdy wiadomo, że komórki NK nakładają się na nieklasyczne, jeśli nie są bramkowane28, zauważamy, że komórki B mogą również nakładać się na nieklasyczne (Figura 2B); To, czy tak jest w przypadku innych badań, może zależeć od wyboru fluorochromu, konfiguracji instrumentu, czułości detektora, a nawet badanego stanu chorobowego. W tym przypadku nakładające się na siebie komórki B wykazywały wysoką ekspresję HLA-DR i nie były bramkowane przez selekcję komórek HLA-DR dodatnich na rysunku 1D. Zamiast tego, aby usunąć limfocyty B, użyliśmy dodatkowego wykresu CD14 / HLA-DR, gdzie komórki B oddzielają się od nieklasycznych ze względu na ich wyższą ekspresję HLA-DR i niską ekspresję CD14.
Istnieje również wiele różnych sposobów, w jakie bramy dla samych monocytów zostały narysowane w literaturze; Należą do nich ćwiartki (podzbiory są oddzielone znacznikami kwadrantów) oraz prostokątne lub trapezowe pola13 (z osobnymi ramkami narysowanymi dla każdego podzbioru), które ponadto różnią się rozmieszczeniem, wyznaczając, gdzie kończy się jeden podzbiór, a zaczyna drugi. Różnice te prawdopodobnie odzwierciedlają fakt, że monocyty istnieją jako kontinuum komórek, różnicujących się od klasycznych do nieklasycznych, a nie jako wyraźnie odrębne populacje. Ponieważ jednak różnice w technikach identyfikacji samych podzbiorów mogą prowadzić do różnic w obliczonych proporcjach podzbiorów monocytów, ważne jest, aby metoda bramkowania była w miarę obiektywna, a nie subiektywna, ponieważ dzięki temu metoda będzie bardziej solidna i odtwarzalna. W niektórych badaniach stosuje się kontrolę izotypu dla CD16 w celu określenia granicy między podzbiorami klasycznymi i pośrednimi30. Z drugiej strony, w celu zdefiniowania separacji między półproduktami i nieklasycznymi, zaproponowano, aby granica odcięcia była pionowa lub ukośna, przy czym wybór należy do badaczy, z zastrzeżeniem, że powinna być odtwarzalna, ale zalecono bramkę prostokątną w celu ułatwienia porównań między badaniami 13,30,31. W tym przypadku większą obiektywność uzyskano poprzez wykreślenie danych na wykresie zebry i zastosowanie obiektywnych reguł wizualnych, ponieważ wykresy zebry zapewniają dodatkową wskazówkę wizualizacyjną poprzez mieszanie gradientu kolorów do każdego równego przedziału prawdopodobieństwa w porównaniu z tradycyjnym wykresem konturowym. Prawa granica klasycznego podzbioru została narysowana w taki sposób, że populacja była równomiernie rozłożona wokół mediany populacji. Podział na półprodukty i nieklasyczne został również ustandaryzowany poprzez wyrównanie podstawy półproduktów z dolną częścią koncentrycznych okręgów w populacji klasycznej (tj. populacja pośrednia wyraźnie wyraża wysokie poziomy CD14, zgodnie ze standardową nomenklaturą1).
Podczas gdy niektóre badania sugerowały użycie dodatkowych markerów, takich jak receptor chemokiny C-C typu 2 (CCR2) lub 6-sulfoLacNAc (SLAN) w celu uzyskania pomyślnego zliczenia monocytów i ujawnienia ich znaczenia klinicznego32,33, w naszych rękach poziom ekspresji wielu markerów funkcjonalnych monocytów różni się znacznie u poszczególnych osób14. Taka zmienność może ograniczać przydatność tych markerów do definiowania podzbiorów na podstawie ich wyrażenia. Zautomatyzowane podejścia obliczeniowe zostały również wykorzystane do wizualizacji i grupowania podzbiorów monocytów, w tym wizualnego interaktywnego osadzania stochastycznego sąsiada (viSNE), osadzania stochastycznego sąsiada z rozkładem t (tSNE) lub analizy progresji drzewa rozpinającego zdarzeń znormalizowanych gęstości (SPADE)34,35, które mogą zapewnić wizualną reprezentację komórek na podstawie zestawu użytych wielu markerów. Chociaż wykazano, że zwiększa to dokładność strategii bramkowania w klasyfikacji podzbiorów monocytów, uznaje się, że wadą jest wymagana liczba przeciwciał (i odpowiadających im kanałów fluoroforowych). Jego przydatność będzie zależeć od zadawanych pytań; Dodatkowa złożoność może nie być uzasadniona, na przykład w badaniach wyliczeniowych.
Monocyty bramkowane naszą techniką wykazują proporcje zgodne z literaturą, a ekspresję markerów powierzchniowych przez trzy podzbiory można łatwo określić. Ogólnie rzecz biorąc, opisana tutaj technika i metodologia zapewnia ustandaryzowaną i prostą metodę liczenia proporcji podzbioru monocytów i oceny ekspresji markerów powierzchniowych, które można rozszerzyć na inne markery, potwierdzając w ten sposób ich funkcjonalne role w różnych innych warunkach.