Spektrometria mas w sprayu z liści to technika bezpośredniej analizy chemicznej, która minimalizuje przygotowanie próbki i eliminuje chromatografię, pozwalając na szybkie wykrywanie małych cząsteczek z tkanek roślinnych.
Artykuł metodologiczny
Spektrometria mas w sprayu z liści to technika bezpośredniej analizy chemicznej, która minimalizuje przygotowanie próbki i eliminuje chromatografię, pozwalając na szybkie wykrywanie małych cząsteczek z tkanek roślinnych.
Rośliny produkują tysiące małych molekuł, które różnią się pod względem właściwości chemicznych. Spektrometria mas (MS) jest potężną techniką analizy metabolitów roślinnych, ponieważ zapewnia masy cząsteczkowe o wysokiej czułości i swoistości. Spray do liści MS to technika jonizacji otoczenia, w której tkanka roślinna jest wykorzystywana do bezpośredniej analizy chemicznej za pomocą elektrorozpylania, eliminując chromatografię z procesu. Takie podejście do pobierania próbek metabolitów pozwala na jednoczesne wykrywanie szerokiego zakresu klas chemicznych z nienaruszonych tkanek roślinnych, minimalizując ilość potrzebnego przygotowania próbki. W przypadku stosowania z precyzyjną masą MS o wysokiej rozdzielczości, spray do liści MS ułatwia szybkie wykrywanie metabolitów będących przedmiotem zainteresowania. Za pomocą tej techniki możliwe jest również zbieranie danych o fragmentacji masy w tandemie, aby ułatwić identyfikację związku. Połączenie dokładnych pomiarów masy i fragmentacji jest korzystne w potwierdzaniu tożsamości związków. Technika opryskiwania liści MS wymaga jedynie niewielkich modyfikacji źródła jonizacji nanosprayu i jest użytecznym narzędziem do dalszego rozszerzania możliwości spektrometru masowego. Tutaj analizowana jest świeża tkanka liści Sceletium tortuosum (Aizoaceae), tradycyjnej rośliny leczniczej z Afryki Południowej; liczne alkaloidy mesembryny są wykrywane za pomocą sprayu do liści MS.
Rośliny zawierają szeroki zakres małych molekuł o różnych właściwościach chemicznych. MS jest potężną techniką analizy związków roślinnych, ponieważ może zapewnić kompozycje pierwiastkowe o wysokiej czułości i swoistości do wykrywania i identyfikacji metabolitów1. Najczęściej MS przeprowadza się na próbkach ekstrahowanych rozpuszczalnikiem, które są rozdzielane za pomocą chromatografii przed analizą MS1. Jednak zastosowanie chromatografii cieczowej (LC) wymaga długiego czasu analizy i często wiąże się z intensywnym przygotowaniem próbki1. W przeciwieństwie do tego, bezpośrednia analiza chemiczna nienaruszonych tkanek, która omija chromatografię, jest bardzo szybką techniką, wymagającą minimalnego przygotowania próbki2. Tak więc w przypadkach, w których można zrezygnować z etapów chromatograficznych, bezpośrednia analiza chemiczna może być bardzo korzystna.
Typowy LC-MS dla produktów naturalnych i badań metabolomicznych opiera się na długotrwałych, masowych ekstrakcjach suszonych lub mrożonych materiałów roślinnych zawierających wiele tkanek i typów komórek3. Alternatywnie, bezpośrednia analiza chemiczna, taka jak wykrywanie metabolitów z tkanki roślinnej przez MS, może wyizolować typy komórek i uniknąć artefaktów przygotowania4. Spray do liści MS, określany również jako tissue-spray5,6, to technika bezpośredniej jonizacji MS w otoczeniu, która zasadniczo nie wymaga przygotowania próbki5,7. Spray do liści MS jest ściśle spokrewniony z MS w sprayu papierowym, techniką jonizacji otoczenia o cechach jonizacji elektrorozpylającej, która pozwala na wykrywanie analitów osadzonych na papierze7. Pomimo nazwy, spray do liści MS ma zastosowanie do różnych typów tkanek roślinnych, nie tylko liści, i został zademonstrowany między innymi na owocach, nasionach, korzeniach, tkankach kwiatowych i bulwach6,8,9,10,11,12. Technika ta ułatwia jonizację endogennych fitochemikaliów bezpośrednio z materiałów roślinnych do spektrometru mas w celu detekcji8. Spray do liści MS może również dostarczyć informacji o przestrzennym rozmieszczeniu substancji chemicznych w różnych typach tkanek w roślinach13. Gdy oprysk do liści MS zostanie porównany z ekstrakcją rozpuszczalnikiem i LC-MS, wyniki sugerują, że oprysk do liści MS pozwala na szybkie wykrycie metabolitów powierzchniowych z unikalnych typów komórek, takich jak trichomy13. Rysunek 1 ilustruje eksperymentalną konfigurację MS z opryskiem do liści. Bezpośrednia jonizacja elektronrozpylania następuje już po niewielkich modyfikacjach źródła. Wysokie napięcie jest przykładane do tkanki roślinnej za pomocą metalowego zacisku, wytwarzając rozpylanie silnie naładowanych kropelek tworzących stożek Taylora, który przenosi jony do wlotu jonów MS. Jonizacja elektronatryskowa następuje z naturalnej cieczy rośliny lub z rozpuszczalnika nałożonego na powierzchnię rośliny. Spiczasta końcówka na tkance ułatwia elektrorozpylanie i może występować naturalnie lub powstać w wyniku cięcia.
Spray do liści MS to szybka metoda jakościowej i półilościowej analizy nienaruszonych tkanek roślinnych, która znalazła zastosowanie w szerokiej gamie zastosowań. Na przykład technika ta została wykorzystana do wykrywania związków endogennych w celu rozróżnienia spokrewnionych gatunków, a nawet do oceny zmian w tych samych gatunkach uprawianych w różnych warunkach. Wcześniejsze badania wykazały to podejście poprzez pomiar metabolitów w borówkach piękności (Callicarpa L.)12 i żeń-szeń amerykański (Panax quinquefolium L.)6. W tym ostatnim przykładzie ginsenozydy, aminokwasy i oligosacharydy można było wykryć po zwilżeniu surowej tkanki żeń-szenia. Dziki i uprawiany żeń-szeń amerykański został odróżniony od plastrów bulw6. Integralność bulw żeń-szenia została zachowana po oprysku z liści MS, co pozwoliło na późniejszą kontrolę morfologiczną i mikroskopową6. Ponadto można również wykryć związki egzogenne w próbkach roślin. Na skórkach lub miąższu owoców i warzyw wykryto szereg pestycydów (acetamipryd, difenyloamina, imazalil, linuron i tiabendazol) na skórkach lub miąższu owoców i warzyw9. Chociaż te i wiele innych badań wykazały przydatność sprayu do liści MS do różnych konkretnych celów, szczegółowy protokół nie został wcześniej zgłoszony.
Tutaj opis protokołu nie będzie skupiał się na optymalizacji metody dla konkretnej tkanki lub związku. Wykrywanie alkaloidów mesembryny z Sceletium tortuosum (L.) N.E.Br. (Aizoaceae) służy raczej jako przykład do omówienia niezbędnych środków optymalizacyjnych, które należy podjąć podczas przygotowywania eksperymentu z opryskiem do liści MS dla gatunku, tkanki lub związku (związków) po raz pierwszy. S. tortuosum jest soczystym gatunkiem endemicznym dla półpustynnego regionu Karroo w Republice Południowej Afryki. Tradycyjna medycyna ludów San i Khoi Khoi, była używana do tłumienia apetytu i pragnienia, a także ze względu na swoje działanie psychotropowe i przeciwbólowe14,15. Obecnie standaryzowane ekstrakty są stosowane w leczeniu zaburzeń neuropsychiatrycznych i neuropsychologicznych16,17. Do głównych interesujących związków należy alkaloid mesembryna i jej pochodne, z których wiele znajduje się również w pokrewnych gatunkach Sceletium15. Zarówno dzikie, jak i uprawne populacje S. tortuosum mają zmienne stężenia alkaloidów mesembryny, co stanowi wyzwanie dla kontroli jakości18. Metoda szybkiego wykrywania alkaloidów mesembryny, takich jak spray do liści MS, może być przydatna w monitorowaniu produktów Sceletium. Ponieważ wcześniej nie istniał szczegółowy wizualny protokół eksperymentalny dla techniki opryskiwania liści MS, zilustrujemy metodę na przykładzie S. tortuosum i opiszemy: modyfikację źródła nanoaerozolu, selekcję i przygotowanie tkanek roślinnych, pozyskiwanie danych, interpretację wyników, oraz optymalizacja parametrów MS.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
1. Modyfikacje źródła Nanospray dla sprayu do liści MS
2. Przygotowanie systemu MS do opryskiwania liści MS
3. Przygotowanie instrumentu, rozpuszczalników i tkanek roślinnych
UWAGA: Zawsze noś rękawiczki i nie używaj tkanki roślinnej, która została wykonana gołymi rękami. W przeciwnym razie jony zanieczyszczające, takie jak glikol polietylenowy, zdominują widma.
4. Ocena jakości danych
5. Fragmentacja masy tandemowej
6. Przypuszczalna identyfikacja na podstawie dokładnej fragmentacji masy i tandemu
7. Analiza danych
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Po 10 tygodniach od wykiełkowania, świeżo zebrane liście S. tortuosum wyhodowane w szklarni zostały przeanalizowane za pomocą oprysku do liści MS. Eksperymentalny proces wykrywania metabolitów z liści S. tortuosum za pomocą sprayu do liści MS jest zilustrowany na Rysunek 2. Wybrano liść, pocięto go na cienki pasek ze zwężającym się końcem, aby utworzyć punkt, i zaciśnięto za pomocą aparatu do zaciskania drutu MS w sprayu do liści. Tkankę roś...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Skuteczne zastosowanie tego protokołu opiera się na optymalizacji różnych etapów dla gatunku rośliny, typu tkanki i związku docelowego (związków) będących przedmiotem zainteresowania. Dobrym punktem wyjścia są parametry opisane w protokole. Należy podjąć i przetestować następujące decyzje eksperymentalne: czy użyć (1) przeciętej lub nieprzeciętej tkanki oraz (2) rozpuszczalnika lub jego braku, (3) jakiego rozpuszczalnika użyć i w jakiej objętości, (4) jaka powinna być odległość tkanki od wlotu jonów oraz (5) amplitudy na...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Autorzy nie mają nic do ujawnienia.
Ta praca została sfinansowana przez grant Programu Badań nad Genomem Roślinnym NSF IOS-1238812 oraz Stypendium Podoktorskie z Biologii IOS-1400818. Praca została również sfinansowana przez Monsanto Graduate Student Fellowship dla Katherine A. Sammons. Fulbright African Researcher Scholars Program (2017-2018) dziękuje za dofinansowanie przyznane Nokwandzie P. Makunga. Jesteśmy bardzo wdzięczni za darowiznę źródła nanosprayu od Jessiki Prenni i ośrodka Proteomiki i Metabolomiki na Uniwersytecie Stanowym Kolorado.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| Pin połączeniowy | Pin Digi-Key elctronics | WM2563CT-ND | pin zostanie włożony do źródła Thermo Scientific, aby zapewnić napięcie |
| mały zacisk | Digi-Key elctronics | 314-1018-ND | CLIP MICRO ALIGATOR COPPER 5A |
| duży zacisk | Digi-Key elctronics | 290-1951-ND | KROKODYLKOWY WĄSKI NIKIEL 5A |
| Koszulka termokurczliwa | Digi-Key elctronics | Q2Z1-KIT-ND | do pokrywa złącza lutownicze |
| NSI źródło Nanospray Źródło jonów | Thermo scientific | NA | Inna marka będzie działać, jeśli nie używasz instrumentu Thermo |
| Q Exactive - hybrydowy kwadrupol Orbitrap | Thermo scientific | NA | Inna marka będzie działać, jeśli nie używasz instrumentu |
| Thermo Tune Software | Thermo scientific | Inna marka będzie działać, jeśli nie używasz instrumentu Thermo | |
| Xcalibur Software | Thermo scientific | ||
| Zakład zainteresowania - S. tortousum |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Poproś o pozwolenie na ponowne wykorzystanie tekstu lub ilustracji tego artykułu JoVE
Poproś o pozwolenie