Włączenie pochodnej cyklopropenu lizyny do przeciwciał pozwala na specyficzne dla miejsca, szybkie i efektywne połączenie cząsteczek zawierających tetrazynę w celu wytworzenia koniugatów przeciwciało-lek.
Artykuł metodologiczny
Włączenie pochodnej cyklopropenu lizyny do przeciwciał pozwala na specyficzne dla miejsca, szybkie i efektywne połączenie cząsteczek zawierających tetrazynę w celu wytworzenia koniugatów przeciwciało-lek.
Koniugaty przeciwciało-lek (ADC) używane obecnie w praktyce klinicznej to mieszaniny cząsteczek przeciwciał połączonych z różną liczbą toksyn w różnych pozycjach. Badania przedkliniczne wykazały, że indeks terapeutyczny tych tradycyjnych ADC może być poprawiony przez specyficzne dla miejsca wiązanie toksyn. Jednak obecne podejścia do produkcji jednorodnych ADC mają kilka ograniczeń, takich jak niska ekspresja białka i powolna kinetyka reakcji. W tym protokole opisujemy, jak skonfigurować system ekspresji w celu włączenia pochodnej cyklopropenu lizyny (CypK) do przeciwciał za pomocą ekspansji kodu genetycznego. Ten minimalny bioortogonalny uchwyt umożliwia szybką koniugację pochodnych tetrazyny poprzez cykloaddycję Dielsa-Aldera o odwrotnym zapotrzebowaniu. Opisany tutaj system ekspresji umożliwia łatwą produkcję i oczyszczanie trastuzumabu zawierającego CypK w każdym z łańcuchów ciężkich. Wyjaśniamy, jak połączyć przeciwciało z toksyną monometyloaurystatyną E i scharakteryzować immunokoniugat za pomocą chromatografii oddziaływań hydrofobowych i spektrometrii mas. Na koniec opisujemy testy oceniające stabilność w ludzkiej surowicy wiązania dihydropirydazynowego wynikającego z koniugacji oraz testujące selektywną cytotoksyczność ADC dla komórek raka piersi z wysokimi poziomami receptora HER2.
Koniugaty przeciwciało-lek (ADC) łączą w sobie selektywność bioterapeutyków i siłę działania małych cząsteczek cytotoksycznych. Większość ADC ma na celu zmniejszenie skutków ubocznych tradycyjnej chemioterapii poprzez ukierunkowanie leków wpływających na polimeryzację DNA lub mikrotubul na komórki nowotworowe1. ADC pierwszej generacji zatwierdzone przez Agencję ds. Żywności i Leków (FDA) opierają się na modyfikacji lizyn i cystein, która generuje mieszaniny cząsteczek zmodyfikowanych w różnych pozycjach o obniżonych właściwościach farmakokinetycznych 2. W przeciwieństwie do tego, specyficzna dla miejsca koniugacja leków z przeciwciałami może generować związki o ulepszonych właściwościach terapeutycznych3,4. Próbując sprostać wyzwaniu, jakim jest produkcja jednorodnych ADC, zgłoszono kilka selektywnych modyfikacji chemicznych i enzymatycznych1,5. Jednak obecne metody mogą celować tylko w określoną pozycję na przeciwciałie, cierpieć z powodu niskiej ekspresji białka, zapewniać łączniki o niskiej stabilności lub polegać na powolnych i mało wydajnych reakcjach.
Włączenie aminokwasów niekanonicznych (ncAA) poprzez ekspansję kodu genetycznego umożliwia specyficzną dla danego miejsca instalację mnóstwa bioortogonalnych grup reaktywnych w białkach, potencjalnie pokonując ograniczenia innych metod używanych do generowania ADC. Kodowanie ncAA w odpowiedzi na kodon docelowy (stop) opiera się na parach syntetazy aminoacylo-tRNA/tRNA, które są ortogonalne do par endogennych, które zawierają aminokwasy kanoniczne6. Kilka ncAA zostało włączonych do przeciwciał w celu wytworzenia ADC. Jednak większość z nich cierpi z powodu różnych odpowiedzialności za zastosowania w koniugacji leków terapeutycznych. p-acetylofenyloalanina (pAcF)7,8 nie jest w pełni bioortogonalna, wymaga niskiego pH (4,5) i długiego czasu reakcji (> 60 h), podczas gdy azydki, takie jak p-azydofenyloalanina (pAzF)7,9,10, p-azydometylofenyloalanina (pAMF)11 oraz azydkowa pochodna lizyny (AzK)12,13 może być zredukowany w cell14, a miedź używana do katalizowania cykloaddycji Huisgen może indukować uszkodzenia oksydacyjne15.
Chociaż alternatywne ncAA oparte na trans-cyklooktenie (TCO), cyklooktynenie (SCO) i bicyklo[6.1.0]nonen (BCN) zostały ostatnio zakodowane w przeciwciałie do celów bioobrazowania, system ekspresji cierpi z powodu bardzo niskiej wydajności (0,5 mg/L)16. Co więcej, cyklookteny i cyklooktyny są dużymi i hydrofobowymi uchwytami, które mogą zwiększać podatność ADC na agregację -ładunki ADC są tradycyjnie hydrofobowe, a właściwości fizykochemiczne łącznika wykazały, że mają duży wpływ na farmakokinetykę i indeks terapeutyczny17. Natomiast cyklopropeny z podstawieniem 1,3-disubstytucji są małymi grupami reaktywnymi, które powinny powodować minimalne zmiany w strukturze białka i właściwościach fizykochemicznych18. Cyklopropeny selektywnie i szybko reagują z tetrazynami za pośrednictwem cykloaddycji Dielsa-Aldera o odwróconym zapotrzebowaniu na elektrony19. W tym protokole wykorzystujemy pochodną lizyny (CypK, Rysunek 1b) zawierającą metylocyklopropen, który jest mniej podatny na przeszkody steryczne niż większe napięte cykle nienasycone i ma stałą szybkość reakcji rzędu 1-30 M-1 s-1 w środowisku wodnym18,20.
Niedawno informowaliśmy, jak włączyć CypK do przeciwciał w celu wytworzenia ADC, reagując tym minimalnym uchwytem bioortogonalnym z cząsteczkami zawierającymi tetrazynę21. Tutaj opisujemy bardziej szczegółowo procedurę przygotowania ADC, kładąc nacisk na najtrudniejsze kroki. Włączenie CypK jest kierowane za pomocą pary syntetazy pirolizylo-tRNA (PylRS) / tRNACUA (PylT) w odpowiedzi na bursztynowy kodon wprowadzony do łańcucha ciężkiego przeciwciała (HC) < klasa sup = "xref">22. Tutaj używamy dwóch plazmidów do transfekcji przejściowej (Rysunek 1a), jeden kodujący ciężki łańcuch przeciwciała, a drugi kodujący łańcuch lekki (LC), oba zawierające kasetę PylRS / PylT. Alternatywnie, stabilna linia komórkowa, która umożliwia wyższą wydajność przeciwciał, może być wygenerowana za pomocą bardziej pracochłonnej procedury21.
Wyżej wymienione systemy ekspresji mogą wytwarzać terapeutyczny immunoglobulin 1 (IgG1) z CypK na podobnym poziomie jak przeciwciało typu dzikiego. Wybraliśmy pierwszą pozycję domeny CH1 na ciężkim łańcuchu do kodowania ncAA (HC-118TAG). Jest to najczęściej modyfikowana strona w ADCs23 i jest znana jako HC-118 (numeracja UE), ale jest również określana jako HC-121 (pozycja sekwencji) i HC-114 (numeracja Kabat)24. Ponieważ ta pozycja jest zachowana we wszystkich IgG1, te systemy ekspresji powinny być podatne na większość przeciwciał terapeutycznych.
Pokazujemy, że trastuzumab(CypK)2 może być łatwo oczyszczony przez białko A, a następnie przez szybką chromatografię cieczową białek z kolumną do interakcji hydrofobowej (FPLC-HIC). Następnie przeciwciało jest kowalencyjnie łączone w ciągu 3 godzin z inhibitorem polimeryzacji mikrotubul, monometyloaurystatyną E (MMAE), który jest stosowany w zatwierdzonym przez FDA ADC Adcetris. Tutaj używamy benzylo-tetrazynowej pochodnej MMAE (tetrazine-vcMMAE) z łącznikiem składającym się z przekładki glutaranu i składnika proteazy walinowo-cytrulinowej, a następnie jednostki samospalnej p-aminobenzylalkoholu; ten łącznik jest rozszczepiany przez katepsynę B w lizosomie po internalizacji ADC, co powoduje bezśladowe uwalnianie toksyny25. Aby ukazać szeroki zakres reakcji, przeciwciało jest również powiązane z fluoroforem tetrametylorodaminą (TAMRA). Wyjaśniamy, jak zweryfikować tożsamość koniugatu za pomocą chromatografii cieczowej sprzężonej ze spektrometrią mas (LC-MS) oraz obliczyć stosunek leku do przeciwciał (DAR) za pomocą wysokosprawnej chromatografii cieczowej z kolumną oddziaływania hydrofobowego (HPLC-HIC).
Jako część charakterystyki działania przeciwciał, opisujemy, jak testować stabilność wiązania dihydropirydazyny w ludzkiej surowicy. Parametr ten jest łatwiejszy do oceny w przypadku trastuzumabu-TAMRA, ponieważ można go określić ilościowo za pomocą prostego testu ELISA, a interpretacja wyników nie jest skomplikowana ze względu na labilny składnik proteazy trastuzumabu(MMAE)2. Wreszcie, selektywność i siłę działania trastuzumabu (MMAE)2 ocenia się, porównując cytoksyczność ADC w liniach komórkowych wyrażających różne poziomy HER2. Test ten stanowi również funkcjonalny dowód stabilności ADC, gdy jest wykonywany po inkubacji immunokoniugatu w surowicy ludzkiej.
1. Wyprodukuj i scharakteryzuj przeciwciało
2. Sprzęgnij przeciwciało i scharakteryzuj ADC
3. Test stabilności wiązania dihydropirydazyny w trastuzumabie(TAMRA)2 w surowicy
4. Oceń cytotoksyczność ADC
Uwaga: Ten protokół jest oparty na wcześniej zgłoszonych testach23,26 z pewnymi modyfikacjami.
Opisany system ekspresji przejściowej (Rysunek 1a) pozwala na uzyskanie 22 ± 2 mg trastuzumabu(CypK)2 na litr pożywki hodowlanej, co stanowi 2/3 ilości przeciwciała typu dzikiego produkowanego w tych samych warunkach (Rysunek 1c). Stabilna linia komórkowa może zwiększyć tę wydajność do 31 ± 2 mg/L21.
Trastuzumab(CypK)2 można koniugować z tetrazyną-vcMMAE, co pozwala na otrzymanie quasi-homogenicznego trastuzumabu(MMAE)2 w ciągu 3 h w temperaturze 25 °C (Rycina 2). Wysoka hydrofobowość tej cytotoksyny wymaga dodania 10% acetonitrylu, gdy stosowane są 5 lub więcej ekwiwalentów molowych toksyny na CypK. Alternatywnie, cykloaddycja kończy się również w ciągu 20 h przy użyciu 2 ekwiwalentów tetrazyny-vcMMAE bez dodatku acetonitrylu (Rycina 2c). Trastuzumab(CypK)2 reaguje z tetrazyną-TAMRA w ciągu 2 h w temperaturze 25 °C, natomiast przy obniżeniu temperatury do 4 °C wymagane jest od 3 do 6 h (Rycina 3c).
Oczekiwany DAR dla trastuzumab(MMAE)2 mierzony za pomocą HPLC-HIC wynosi 1,9 (Rysunek 2b). Pik początkowo obserwowany na chromatogramie w 8,0 min reprezentuje nie sprzężone przeciwciało (DAR 0) i powinien całkowicie zniknąć po zakończeniu reakcji. Frakcja o DAR 1 eluje w czasie 9,1-9,6 min i powinna mieć pole < 10% po 3 h; natomiast produkt docelowy o DAR 2 ma czas retencji 10,5-11,0 z oczekiwanym polem > 90%. Przesunięcie mobilności oraz fluorescencja w żelach SDS-PAGE potwierdzają wbudowanie TAMRA (Rysunek 3b), a tożsamość immunokoniugatów zostaje zweryfikowana za pomocą LC-MS (Rysunek 2d-e oraz Rysunek 3d).
Inkubacja trastuzumabu(TAMRA)2 przez 5 dni w ludzkiej surowicy i następująca po niej analiza metodą ELISA potwierdzają, że ładunek pozostaje przyłączony do przeciwciała (Rysunek 4b). W teście cytotoksyczności trastuzumab(MMAE)2 wykazuje wysoką aktywność w komórkach raka piersi SK-BR-3 (wysoka ekspresja HER2), z połową maksymalnego stężenia efektywnego (EC50) wynoszącą 55 ± 10 pM (Rysunek 4d). Trastuzumab(MMAE)2 zachowuje cytotoksyczność po 5 dniach inkubacji w ludzkiej surowicy (Rysunek 4c). Przeciwnie, gdy ADC jest testowany na komórkach MCF-7 (niska ekspresja HER2), wartość EC50 jest 200-krotnie niższa (Rysunek 4d). Przeciwciało typu dzikiego, trastuzumab(CypK)2 oraz tetrazyna-vcMMAE wykazują niezwykle niską toksyczność (Rysunki 4d i 4e), podczas gdy MMAE wykazuje wysoką nieselektywną cytotoksyczność w obu liniach komórkowych (Rysunek 4e).

Rycina 1: System ekspresji przejściowej. A. Istotne regiony plazmidów wykorzystanych do transfekcji przejściowej w komórkach HEK293. CMV: promotor cytomegalowirusa, WPRE: posttranskrypcyjny element regulacyjny wirusa zapalenia wątroby świstaka, PylT: tRNA pyrrolizyny, U6: promotor specyficzny, PylRS: syntetaza tRNA pyrrolizyny. > i B. Nε-[((2-metylocykloprop-2-en-1-ylo)metoksy)karbonylo]-L-lizyna (CypK). C. Wydajność ekspresji trastuzumabu typu dzikiego (WT) oraz trastuzumabu(CypK)2 pomiar wykonano metodą western blot po oczyszczaniu za pomocą białka A. Słupki błędu reprezentują odchylenie standardowe trzech powtórzeń biologicznych. Rycina została zmodyfikowana za zgodą Oller-Salvia i wsp. 201821. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ilustracji.

Rysunek 2: Koniugacja trastuzumabu(CypK)2 z tetrazyną-vcMMAE. A. Cykloaddycja Dielsa-Aldera z odwróconym zapotrzebowaniem na elektrony między resztą CypK w przeciwciałe a pochodną tetrazyny MMAE. Grupy reagujące są zaznaczone na czerwono, alkohol p-aminobenzylowy przedstawiono na zielono, a dipetyd walina-cytrulina na niebiesko. B. Chromatogramy HPLC-HIC pokazujące przebieg koniugacji przeciwciała. C. Stopień konwersji w stosunku do maksymalnego DAR wynoszącego 1,9 przy użyciu różnych stężeń odczynników. D-E. Dekonwolucyjne spektra mas pełnowymiarowego przeciwciała przed i po koniugacji. Trastuzumab(CypK)2 otrzymano z wykorzystaniem stabilnej linii komórkowej. Rysunek został zmodyfikowany za zgodą Oller-Salvia et al. 201821. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tego rysunku.

Rycina 3: Koniugacja trastuzumabu(CypK)2 z tetrazyną-TAMRA. A. Cykloaddycja Dielsa-Aldera z odwróconym zapotrzebowaniem elektronowym pomiędzy resztą CypK w przeciwciałach a pochodną tetrazyny TAMRA. B. Żele SDS-PAGE wykazujące zmianę mobilności oraz fluorescencję w żelu wynikającą z koniugacji TAMRA. C. Kinetyka koniugacji w dwóch różnych temperaturach. D. Dekonwolucyjne widmo mas trastuzumabu(TAMRA)2. Trastuzumab(CypK)2 został otrzymany z wykorzystaniem stabilnej linii komórkowej. Rycina została zmodyfikowana za zgodą Oller-Salvia et al. 201821. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 4: Stabilność w surowicy i cytotoksyczność koniugatów trastuzumabu. A. Schemat wyróżniający cechy pożądane w internalizującym ADC. B. Stabilność trastuzumab(TAMRA)2 w ludzkiej surowicy zmierzona za pomocą testu ELISA. C. Test żywotności komórek z zastosowaniem trastuzumab(MMAE)2 po 5 dniach w ludzkiej surowicy (+ serum, czarny). W tym samym teście uwzględniono próbkę kontrolną inkubowaną w PBS zamiast surowicy (- serum, czerwony). D. Test żywotności komórek z zastosowaniem świeżo rozcieńczonych próbek przeciwciał. E. Test żywotności komórek z zastosowaniem świeżo rozcieńczonych pochodnych MMAE. Słupki błędów reprezentują błąd standardowy średniej z 3 niezależnych eksperymentów. Rycina została zmodyfikowana za zgodą Oller-Salvia et al. 201821. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.
Procedura ekspresji przejściowej w celu wytworzenia trastuzumabu(CypK)2 opisana w tym protokole jest prosta i pozwala na wysoką modułowość. Uzyskane plony mieszczą się w zakresie oczekiwanym w środowisku akademickim27 i można wygenerować stabilne linie komórkowe, aby jeszcze bardziej zwiększyć wydajność produkcji21. Podczas ekspresji stężenia CypK niższe niż 5 mM mogą skutkować mniejszą inkorporacją ncAA, a większe ilości mogą wpływać na wzrost komórek i zmniejszać wydajność przeciwciał. CypK jako wolny aminokwas ma niską rozpuszczalność w wodzie, dlatego należy go najpierw rozpuścić w 100 mM w 0,1 M NaOH, a następnie dodać do pożywki hodowlanej. Po rozcieńczeniu CypK w pożywce i przed dodaniem go do komórek, konieczne jest zneutralizowanie pożywki HCl i przefiltrowanie w celu sterylizacji. Następnie użycie odczynników do transfekcji określonych w niniejszym protokole i przestrzeganie czasów inkubacji zalecanych przez producenta jest ważne dla uzyskania wysokowydajnej ekspresji. Aby uzyskać więcej informacji na temat przejściowej ekspresji ludzkich przeciwciał, czytelnik jest odsyłany do innych opublikowanych protokołów31,32.
Gdy przeciwciało jest oczyszczane, wymagany jest duży nadmiar żywicy białkowej A, jak wskazano, aby zapewnić pełne pobranie przeciwciał z supernatantu. Aby zapobiec wytrącaniu się trastuzumabu podczas elucji, zaleca się stosowanie roztworu o dużej pojemności buforowej, natychmiastowe rozcieńczenie PBS i wymianę buforu, unikając nadmiernego stężenia. Zawsze utrzymuj przeciwciało <5 mg/ml.
Koniugacja trastuzumabu(CypK)2 z tetrazyną-vcMMAE jest szybsza niż większość reakcji zgłaszanych w przypadku innych bioortogonalnych uchwytów dla ADC. Co więcej, cykladdycja ta zachodzi w bardzo łagodnych warunkach: temperaturze pokojowej lub niższym i fizjologicznym pH. Ważne jest, aby rozcieńczyć roztwory podstawowe DMSO reagentów acetonitrylem przed dodaniem PBS i przeciwciała; W przeciwnym razie pochodne tetrazyny wytrącą się. Acetonitryl jest wymagany tylko ze względu na wysoką hydrofobowość MMAE i TAMRA, ale mniej hydrofobowe cząsteczki mogą nie wymagać dodawania współrozpuszczalnika. Alternatywnie, tetrazyna-vcMMAE może być sprzężona bez acetonitrylu i tylko 2 molowych odpowiedników tetrazyny-vcMMAE w ciągu 20 godzin. Ta niewielka ilość toksyny może wiązać się ze znacznym obniżeniem kosztów produkcji ADC w porównaniu z obecnymi technologiami opartymi na ncAA. Trastuzumab(CypK)2 jest w pełni reaktywny przez co najmniej 4 miesiące, gdy jest przechowywany w temperaturze 4 °C.
HPLC-HIC umożliwia dokładne oznaczenie DAR, ponieważ MMAE jest wysoce hydrofobowy i zapewnia doskonałą rozdzielczość pików odpowiadających koniugatom przeciwciał z toksynami 0, 1 i 2. Nieprzereagowany tetrazyna-vcMMAE wymywa się około 13,7 min i jest wykrywany przy 280 nm. Ta technika wymaga materiału wyjściowego o wysokiej czystości. Ponadto nie zaleca się wygaszania reakcji z innymi cząsteczkami reagującymi z tetrazyną, takimi jak BCN-OH, ponieważ mogą one zmieniać czas retencji i kształt pików. Istotne jest, aby stężenie soli w próbkach odpowiadało stężeniu w fazie ruchomej na początku gradientu, aby uzyskać dobrą separację, zwłaszcza jeśli wstrzykuje się więcej niż 10-20 μl.
Jeśli chodzi o analizę LC-MS, deglikozylacja próbek przeciwciał jest wymagana w celu uzyskania pojedynczego piku po dekonwolucji surowego widma. Dokładność całkowitej masy przeciwciał i ADC może się różnić w zależności od kalibracji instrumentu. Stąd, aby obliczyć masę do modyfikacji, odejmij masę uzyskaną dla niezmodyfikowanych przeciwciał od masy uzyskanej dla ADC. Nowoczesne spektrometry mas o wysokiej rozdzielczości powinny zapewniać błąd względny poniżej 1:10000. Chociaż LC-MS można również wykorzystać do obliczenia stosunku między różnymi gatunkami, wartość ta jest zwykle zawyżona, ponieważ modyfikacja może wpłynąć na zdolność jonizacji generowanych gatunków, a niewielkie ilości zanieczyszczeń mogą nie zostać wykryte.
Stabilność łącznika w ADC ma kluczowe znaczenie, ponieważ przedwczesne uwalnianie leku powoduje wyższą toksyczność i niższą skuteczność; Wolna cytotoksyna uszkadza zdrowe tkanki, a nagie przeciwciało konkuruje z uzbrojonym o docelowe miejsca wiązania na chorych komórkach. Należy spodziewać się uwolnienia poniżej 5%, co mieści się w zakresie zmienności testu stabilności.
Wreszcie, selektywność ADC ukierunkowanego na HER2, takiego jak trastuzumab (MMAE) 2 można ocenić, porównując cytotoksyczność w komórkach SK-BR-3 (wysoki HER2) i komórkach MCF-7 (niski HER2), ponieważ te ostatnie wyrażają 15 razy mniej receptorów HER2 niż pierwsze28. Oczekuje się, że immunokoniugat spowoduje, że żywotność komórki będzie co najmniej o 2 rzędy wielkości niższa w SK-BR-3 w porównaniu z MCF-7. EC50 w SK-BR-3 powinien znajdować się w dwucyfrowym zakresie nanomolowym, co odzwierciedla wysoką moc tego ADC29,30. Niezmodyfikowane przeciwciało, trastuzumab(MMAE)2 lub trastuzumab, nie powinno wykazywać toksyczności w tym teście. Tetrazyna-vcMMAE powinna mieć efekt o 3 rzędy wielkości mniejszy niż ADC, ponieważ łącznik usuwa aktywność toksyny peptydomimetycznej. I odwrotnie, ponieważ MMAE jest w stanie przenikać przez błonę komórkową30, powinien mieć podobną toksyczność do ADC, ale nie wykazywać dyskryminacji między liniami komórkowymi o wysokiej i niskiej zawartości HER2. Ponadto, jeśli test ten jest wykonywany po 5-dniowej inkubacji ADC w surowicy, można go użyć do dostarczenia funkcjonalnego dowodu stabilności łącznika: uwolnienie toksyny spowodowałoby albo spadek wydajności ADC w SK-BR-3, jeśli MMAE zostałby uwolniony wraz z częścią łącznika, albo zmniejszenie selektywności, gdyby łącznik został rozszczepiony w sposób bezśladowy.
Opisana w niniejszym dokumencie technologia ADC pozwala na skuteczne i specyficzne dla danego miejsca włączenie cyklopropenowej pochodnej lizyny do IgG1. Po łatwym oczyszczeniu przeciwciała mogą być szybko sprzężone z cząsteczkami zawierającymi tetrazynę, dając jednorodne produkty. Ze względu na mały rozmiar i wysoką reaktywność minimalnego uchwytu cyklopropenu, metoda ta powinna umożliwić koniugację ładunków z utrudnieniami sterycznymi. Powstałe immunokoniugaty są stabilne w surowicy i są bardzo silne i selektywne. Ogólnie rzecz biorąc, CypK umożliwia szybkie, specyficzne dla miejsca i stabilne wiązanie bioortogonalne dla przeciwciał i innych koniugatów białkowych, które można wykorzystać w terapii lub diagnostyce.
Autorzy nie mają nic do ujawnienia.
Ta praca była wspierana przez Radę Badań Medycznych w Wielkiej Brytanii. B.O.-S. posiada stypendium EMBO (ATLF 158-2016) i jest wdzięczny H. Pelhamowi i J.W. Chinowi za wsparcie, a także G. Kymowi, C. W. Morganowi i O. Perisicowi za pomoc i rady.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| Expi293F | ThermoFisher Scientific | A14527 | HEK Zawiesina |
| Expi293 Expression Medium | ThermoFisher Scientific | A1435101 | Expression Pożywka |
| antybiotykowo-przeciwgrzybicza | ThermoFisher Scientific | 15240062 | Penicylina-streptomycyna-amfoterycyna B |
| 125 ml Poliwęglanowa kolba Erlenmeyera z nasadką odpowietrzającą | Corning | 431143 | Wstrząsnąć kolbami |
| Inkubator Brunswick S41i | Eppendorf | S41I230011 | inkubator CO2 z wytrząsarką |
| Wodorotlenek sodu 4 mol/l (4 N) w roztworze wodnym | VWR | 191373M | |
| Cyklopropen lizyna | Sichem | SC-8017 | W tym badaniu zsyntetyzowano go zgodnie z opisem Elliota i wsp. 2014 |
| Steriflip-GP, 0,22 i mikro; m, polieterosulfon, napromieniowany promieniami gamma | Merck Millipore | SCGP00525 | |
| Opti-MEM, Pożywka o obniżonej surowicy | ThermoFisher Scientific | 31985070 | Zredukowana pożywka surowicy |
| Zestaw do transfekcji ExpiFectamine 293 | ThermoFisher Scientific | A14525 | Odczynnik do transfekcji |
| 5810 R | Eppendorf | 5811000460 | |
| Filtr strzykawkowy Millex-GP, 0,22 i mikro; m, polieterosulfon, 33 mm, sterylizowany promieniami gamma | Merck Millipore | SLGP033RS | |
| Żywica białkowa A | Sino Biological | 10600-P07E-RN-25 | |
| Kolumny chromatograficzne Poly-Prep, opakowanie 50 | sztuk Bio-Rad | 7311550 | Kolumna chromatografii polipropylenowej |
| Lejek kolumnowy | Econo-Rad 7310003 | ||
| Cytrynian sodu | Fluka | 71635 | |
| Ä KTA explorer FPLC | GE Healthcare | ||
| HiTrap HIC Zestaw selekcyjny | GE Healthcare | 28-4110-07 | Zawiera HiTrap 1 mL Butyl HP |
| Siarczan amonu | VWR | 2133.296 | |
| Isopropanol | Honywell | 34863-2.5L | |
| Dimetylosulfotlenek | Sigma-Aldrich | D8418-50ML | |
| Tetrazyna-vcMMAE | ChemPartner | - | Costum syntetyzowany |
| Tetrazine-5-TAMRA | Jena Bioscience | CLK-017-05 | |
| NuPAGE 4-12% Bis-Tris Gel 1,0 mm x 10 dołków | ThermoFisherScientific | NP0321BOX | |
| Xcell SureLock Mini-Cell | ThermoFisherScientific | EI0001 | |
| UltiMate 3000 HPLC | ThermoFisherScientific | ||
| Thermo Scientific MAbPac, HIC-20, 4,6 x 100 mm, 5 i mikro; m | ThermoFisherScientific | 088553 | |
| PNGase F | New England BioLabs | P0704S | |
| NanoAcquity | Waters | ||
| C4 BEH 1-5 & mikro; m Kolumna UPLC 1,0 x 100 mm | Wody | ||
| 96-dołkowe mikropłytki do hodowli komórkowych | ThermoFisherScientific | 156545 | |
| Surowica ludzka | Sigma-Aldrich | H4522-20mL | |
| Inkubator CO2 | Panasonic | ||
| HER2 ECD | Sino Biological | 10004-HCCH | |
| Anti-TAMRA | Abcam | an171120 | |
| Anti-mouse HRP | Santa Cruz | sc-2005 | |
| TMB | BioLengend | 421101 | |
| Kwas siarkowy | Sigma-Aldrich | 84727-500ML | |
| PHERAstar FS | BMG Labtech | Czytnik płytek | |
| DMEM | Sigma-Aldrich | D5671-500ML | |
| SK-BR-3 | ATCC | HTB-30 | |
| MCF-7 | ATCC | Test HTB-22 | |
| CellTiterGlo 2.0 | Promega | G9242 | Test żywotności komórek oparty na pomiarze ATP uwalnianego po lizie komórek. Sygnałem wyjściowym jest luminescencja. |
| Monomethyl Auristatin E | Cayman Chemical | 16267 | |
| NanoDrop 2000 | ThermoFisherScientific | Spektrofotometr mikroobjętościowy | |
| Ludzka IgG ELISA Quantificaiton Set | Bethyl | E80-104 | |
| MaxEnt1 w wodach MassLynx | Aplikacja | programowa do dekonwolucji widma masowego | |
| IntantBlue | Expedeon | ISB1L | Bejca na bazie Coomassie |
| Nienaruszony zestaw MMAE-ADC ELISA (test kanapkowy) | Epitope Diagnostics, Inc. | KTR 782 | |
| Rurka 50 mL, 114x28mm, PP | Sarstedt | 62.547.254 | Rurka stożkowa |
| Filtry odśrodkowe Amicon Ultra-15 50 000 NMWL | Merck | UFC905024 | Koncentrator filtracji odśrodkowej (po wycofaniu białka A) |
| Filtry odśrodkowe Amicon Ultra-4 50 000 NMWL | Merck | UFC805024 | Koncentratory filtracji odśrodkowej (po oczyszczeniu FPLC lub HPLC) |
| Kolumny odsalające Zeba Spin, 7K MWCO, 0,5 ml | ThermoFisherScientific | 89882 | Wykluczające rozmiar kolumny wirowe |
| Probówka PCR 0,2 ml Płaska czapka | Thistle Scientific Ltd | Probówki do PCR AX-PCR-02-C-CS | |
| Nunc MaxiSorpª płaskodenne | ThermoFisherScientific | 44-2404-21 | Płytki do ELISA |