Trójwymiarowe (3D) systemy hodowli lepiej podsumowują interakcje między komórkami i otaczającą je macierzą zewnątrzkomórkową (ECM) w tkankach natywnych niż ich dwuwymiarowe (2D) odpowiedniki1,2. Postępy w inżynierii tkankowej zaowocowały zaawansowanymi platformami hodowli 3D, które umożliwiają kontrolowane badania 1) tego, w jaki sposób chemiczne i fizyczne składniki mikrośrodowiska macierzy wpływają na zachowanie komórek oraz 2) skuteczności nowych strategii terapeutycznych w wielu chorobach, w tym nowotworach2. Chociaż modele in vitro nie mogą uwzględniać czynników ogólnoustrojowych, takich jak sygnały endokrynologiczne i immunologiczne, a zatem nie mogą całkowicie zastąpić modeli in vivo, zapewniają one szereg korzyści, w tym odtwarzalność, kontrolę eksperymentalną, przystępność cenową i szybkość. W tym miejscu opisujemy zastosowanie hydrożeli naśladujących mózg, w których hodowle 3D komórek guza mózgu pochodzących od pacjenta rejestrują wiele aspektów fizjologii guza, w szczególności dynamikę nabywania oporności na leczenie3. W porównaniu z innymi metodami in vitro, hodowle te lepiej reprezentują modele nowotworów in vivo i obserwacje kliniczne3.
Glejak wielopostaciowy (GBM) jest najczęstszym i najbardziej śmiertelnym nowotworem wywodzącym się z mózgu, z medianą przeżycia wynoszącą zaledwie 1-2 lata4,5. W ostatnich latach wiele badań koncentrowało się na wpływie środowiska macierzy nowotworowej na GBM6,7,8. Doniesiono, że unikalny ECM mózgu wpływa na migrację komórek GBM, proliferację i oporność terapeutyczną6,7,8,9,10,11,12. Kwas hialuronowy (HA) jest obficie występującym glikozaminoglikanem (GAG) w mózgu, gdzie oddziałuje z innymi GAG i proteoglikanami, tworząc hydrożelową siatkę13. Wiele badań wykazało nadekspresję HA w guzach GBM i jej późniejszy wpływ na progresję raka8,9,13,14,15,16,17. Inne komponenty ECM również wpływają na wzrost i inwazję guza GBM6,7,15,18. Na przykład fibronektyna i witronektyna, które są zwykle nadmiernie eksprymowane w GBM, indukują heterodimeryzację receptorów integryny na powierzchni komórki poprzez wiązanie się z sekwencją "RGD" i inicjują złożone kaskady sygnałowe, które sprzyjają przeżyciu guza19,20,21. Oprócz wpływów biochemicznych, właściwości fizyczne macierzy tkankowej wpływają również na progresję GBM22,23.
Ciągłe nabywanie oporności na terapie jest jednym z głównych czynników wpływających na śmiertelność GBM4. Leki wykazujące obiecujące wyniki w modelach 2D lub glejakowych zawiodły w kolejnych badaniach na zwierzętach i przypadkach klinicznych3, co wskazuje, że wpływ czynników mikrośrodowiskowych znacząco przyczynił się do odpowiedzi guza GBM1. Podczas gdy modele zwierzęce mogą zapewnić fizjologicznie odpowiednie mikrośrodowisko 3D dla ksenoprzeszczepowanych komórek pacjenta i generować klinicznie istotne wyniki24,25, złożoność mikrośrodowiska mózgu in vivo sprawia, że trudno jest określić, które cechy, w tym interakcje komórka-macierz, są kluczowe dla określonych wyników biologicznych. Identyfikacja nowych celów terapeutycznych będzie korzystna dzięki zastosowaniu uproszczonych platform hodowlanych, w których zdefiniowane zostaną właściwości biochemiczne i biofizyczne.
W przeciwieństwie do wcześniej opisywanych modeli biomateriałowych mikrośrodowiska guza GBM26,27, które nie osiągnęły prawdziwej ortogonalnej kontroli nad indywidualnymi biochemicznymi i fizycznymi cechami ECM, opisana tutaj platforma biomateriałów umożliwia rozdzielenie udziału wielu niezależnych cech w fenotypie komórki GBM. W tym miejscu prezentujemy oparty na HA, ortogonalnie przestrajalny, hydrożelowy system do hodowli 3D komórek GBM pochodzących od pacjenta. Hydrożele powstają z dwóch składników polimerowych: 1) biologicznie aktywnego HA i 2) biologicznie obojętnego glikolu polietylenowego (PEG). PEG jest szeroko stosowanym biokompatybilnym i hydrofilowym materiałem o niskiej adsorpcji białek i minimalnej immunogenności28. W tym przypadku około 5% ugrupowań kwasu glukuronowego na łańcuchach HA jest funkcjonalizowanych grupami tiolowymi, aby umożliwić sieciowanie z dostępnym na rynku 4-ramiennym PEG zakończonym maleimidami poprzez addycję typu Michaela. W swojej najpowszechniejszej postaci w organizmie kwas hialuronowy występuje w łańcuchach o dużej masie cząsteczkowej (HMW). W tym przypadku niski stopień modyfikacji HA HMW (500-750 kDa) pomaga zachować natywne interakcje HA i jego receptorów komórkowych, w tym CD4429. Poprzez zastąpienie tiolu PEG tiolem HA, przy jednoczesnym zachowaniu stałego stosunku molowego całkowitych tioli do maleimidów, stężenie HA można oddzielić od właściwości mechanicznych otrzymanych hydrożeli. Co więcej, kontrole stechiometryczne mogą być stosowane do koniugacji peptydów zakończonych cysteiną do określonej średniej liczby ramion zakończonych maleimidem na każdym 4-ramiennym PEG. Włączenie peptydów adhezyjnych pochodzących z ECM umożliwia interakcje z integrynami na hodowanych komórkach, przez które transdukowane są sygnały biochemiczne i chemiczne1. Addycja maleimidu i tiolu zachodzi bardzo szybko w warunkach fizjologicznych, minimalizując czas potrzebny do enkapsulacji komórek i maksymalizując przeżycie komórek pochodzących od pacjenta. Co więcej, kultury hydrożelowe mogą być traktowane jak typowa próbka tkanki i są kompatybilne ze standardowymi technikami charakteryzacji, w tym Western blotting, cytometrią przepływową i barwieniem immunofluorescencyjnym. Poniższy protokół opisuje procedury wytwarzania hydrożeli, ustanawiania kultur 3D komórek GBM pochodzących od pacjenta oraz techniki analizy biochemicznej.