$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Wykrywanie analitów biomolekularnych na poziomie pojedynczej cząsteczki może odbywać się za pomocą nanoporów i pomiaru modulacji prądu jonowego. Zazwyczaj nanopory dzielą się na dwie kategorie w zależności od ich wytwarzania: biologiczne (samoorganizujące się z białka lub origami DNA)1,2,3, lub półprzewodnikowe (np. wyprodukowane za pomocą narzędzi do przetwarzania półprzewodników)4,5. Podczas gdy nanopory w stanie stałym sugerowano jako potencjalnie bardziej wytrzymałe fizycznie i mogą być stosowane w szerokim zakresie warunków roztworu, nanopory białkowe do tej pory oferowały większą czułość, większą odporność na zanieczyszczenia, większą szerokość pasma, lepszą selektywność chemiczną i większy stosunek sygnału do szumu.
Różnorodne kanały jonów białkowych, takie jak ten utworzony przez Staphylococcus aureus α-hemolizynę (αHL), mogą być używane do wykrywania pojedynczych cząsteczek, w tym jonów (np. H+ i D+)2,3, polinukleotydy (DNA i RNA)6,7,8, uszkodzone DNA9, polypeptides10, białka (złożone i rozłożone)11, polimery (glikol polietylenowy i inne)12,13,14, nanocząstki złota15,16,17,18,19 i inne syntetyczne cząsteczki20.
Niedawno pokazaliśmy, że nanopory αHL mogą również łatwo wykrywać i charakteryzować klastry metali, polioksometalany (POM), na poziomie pojedynczej cząsteczki. POM to dyskretne anionowe klastry tlenu z metalu anionowego w nanoskali, które zostały odkryte w 182621 i od tego czasu zsyntetyzowano wiele innych typów. Różne rozmiary, struktury i składy pierwiastkowe polioksometalanów, które są obecnie dostępne, doprowadziły do szerokiego zakresu właściwości i zastosowań, w tym chemii22,23, katalizy24, materiałoznawstwo25,26 oraz badania biomedyczne27,28,29.
Synteza POM to proces samoorganizacji, zazwyczaj przeprowadzany w wodzie, poprzez mieszanie wymaganych stechiometrycznie ilości monomerycznych soli metali. Po uformowaniu POM wykazują dużą różnorodność rozmiarów i kształtów. Na przykład struktura polianionowa Keggin, XM12O40q- składa się z jednego heteroatomu (X) otoczonego czterema tlenami, tworząc czworościan (q jest ładunkiem). Heteroatom jest centralnie umieszczony w klatce utworzonej przez 12 oktaedrycznych jednostek MO6 (gdzie M = metale przejściowe na wysokim stopniu utlenienia), które są połączone ze sobą sąsiednimi wspólnymi atomami tlenu. Podczas gdy struktura polioksometalanów wolframu jest stabilna w warunkach kwaśnych, jony wodorotlenkowe prowadzą do hydrolitycznego rozszczepienia wiązań metal-tlen (M-O) 30. Ten złożony proces powoduje utratę jednej lub więcej podjednostek oktaedrycznych MO6, co prowadzi do powstania gatunków jednowakantowych i trójwakantowych, a ostatecznie do całkowitego rozkładu POM. Nasza dyskusja tutaj ograniczy się do produktów częściowego rozkładu kwasu 12-fosfatungstycznego o pH 5,5 i 7,5.
Celem tego protokołu jest wykrywanie dyskretnych klastrów tlenu metalowego na granicy pojedynczej cząsteczki za pomocą biologicznej platformy elektronicznej opartej na nanoporach. Metoda ta pozwala na wykrycie skupisk metalicznych w roztworze. Wiele gatunków w roztworze można rozróżnić z większą czułością niż konwencjonalne metody analityczne33. Dzięki niemu można wyjaśnić subtelne różnice w strukturze POM i to w stężeniach znacznie niższych niż te wymagane do spektroskopii NMR. Co ważne, takie podejście pozwala nawet na dyskryminację form izomerycznych Na8HPW9O341.