Białko jest ważnym elementem odżywczym i około 50% suchej masy ludzkiego ciała składa się z białek, które mają kilka biologicznych cech i funkcji1. W związku z tym synteza białek jest jednym z najbardziej energochłonnych zdarzeń, a zmiana metabolizmu białek jest silnie związana z rozwojem chorób, w tym chorób metabolicznych2,3,4. W wątrobie biosynteza białek odpowiada za około 20–30% całkowitego zużycia energii5,6. Ponadto białka funkcjonują nie tylko jako pasywne lub budulcowe wątroby, ale także jako aktywne czynniki pośredniczące w sygnałach wewnątrzkomórkowo lub zewnątrzkomórkowo w celu regulacji metabolizmu ogólnoustrojowego7. Na przykład, obniżony poziom albuminy surowicy, która jest syntetyzowana i wydzielana przez wątrobę i najobficiej występujące białko w osoczu8, zwiększa ryzyko rozwoju cukrzycy typu 29,10,11, podczas gdy wyższe stężenie albuminy surowicy chroni przed rozwojem zespołu metabolicznego12. Ponadto zaburzenie lub zaburzenie działania wydzielniczych lub błonowych białek wątrobowych, które modulują homeostazę cholesterolu, w tym lipoprotein, LDLR i LRP1, może prowadzić do rozwoju insulinooporności, hiperlipidemii lub miażdżycy13. Dlatego identyfikacja molekularnych mechanizmów patofizjologicznych, które są zaangażowane w zaburzenia metabolizmu białek w wątrobie i związane z tym powikłania metaboliczne, może być przydatna do odkrywania nowych podejść farmakologicznych do opóźniania początku lub leczenia chorób metabolicznych, takich jak insulinooporność, cukrzyca i niealkoholowe stłuszczenie wątroby.
Synteza białek jest ściśle związana ze statusem energii komórkowej (np. wytworzenie jednego wiązania peptydowego podczas etapu wydłużania syntezy białek wymaga 4 wiązań fosfodiestrowych14) i jest regulowana przez szlaki molekularne, które wykrywają między- i wewnątrzkomórkową dostępność składników odżywczych15,16. Kinaza białkowa aktywowana AMP (AMPK) jest jednym z wewnątrzkomórkowych czujników energii, które utrzymują homeostazę energetyczną17. Gdy AMPK jest aktywowany, gdy poziom energii komórkowej staje się niższy, AMPK i jego docelowe substraty działają w celu stymulowania szlaków katabolicznych i hamowania procesów anabolicznych, w tym syntezy białek18,19. W regulacji syntezy białek pośredniczy fosforylacja wielu czynników translacyjnych i białek rybosomalnych20. Warto zauważyć, że ssaczy cel kompleksu rapamycyny 1 (mTORC1), głównego czynnika napędzającego syntezę białek, jest jednym z głównych celów AMPK21. Aktywacja szlaku mTORC1 zwiększa wzrost i proliferację komórek poprzez stymulację translacji białek i autofagii20,21. Dlatego logiczne jest, że aktywacja AMPK może hamować syntezę białek za pośrednictwem mTORC122. Rzeczywiście, aktywacja AMPK przeciwdziała i bezpośrednio fosforyluje mTORC1 na resztę treoniny 2446 (Thr2446), prowadząc do jej inaktywacji23 i zahamowania biosyntezy białek24. Co więcej, AMPK może pośrednio hamować funkcję mTORC1 poprzez fosforylację i aktywację kompleksu stwardnienia guzowatego 2 (TSC2) 25, który jest regulatorem kaskady sygnalizacyjnej mTORC1. Krótko mówiąc, rozregulowanie tych szlaków w wątrobie jest często związane z rozwojem chorób metabolicznych i dlatego istnieje pilna potrzeba ustanowienia skutecznych narzędzi eksperymentalnych w celu zbadania roli tych szlaków w regulacji metabolizmu energii i białek w hepatocytach.
Istnieje większe podobieństwo między funkcjonalnymi właściwościami izolowanych pierwotnych hepatocytów i hepatocytów in vivo niż w przypadku in vitro linii komórkowych pochodzących z wątroby26,27,28. Wykazano, że pierwotne ludzkie hepatocyty mają 77% podobieństwo do biopsji wątroby, podczas gdy komórki HepG2, które są dobrze zróżnicowanymi komórkami raka wątroby i są szeroko stosowane do badania funkcji wątroby, wykazują mniej niż 48% w kontekście profili ekspresji genów29. Dlatego wykorzystanie pierwotnych hepatocytów, a nie unieśmiertelnionych komórek hodowlanych, ma kluczowe znaczenie w badaniu funkcji i fizjologii wątroby, a dostępnych jest kilka protokołów izolacji i hodowli pierwotnych hepatocytów, zwłaszcza od szczurów30,31. Podczas gdy hepatocyty szczurów są przydatne przy stosunkowo wyższej wydajności komórek, hepatocyty myszy mają większy potencjał w wielu aspektach naukowych ze względu na szeroką dostępność myszy modyfikowanych genetycznie. Istnieje jednak kilka wyzwań technicznych związanych z izolacją zdrowych i licznych hepatocytów pierwotnych od myszy w celu oceny komórkowej i molekularnej: po pierwsze, wprowadzenie kaniuli w celu perfuzji wątroby za pomocą odczynników buforowych jest bardzo trudne do wykonania ze względu na małą i cienką żyłę wrotną myszy lub żyłę główną dolną; po drugie, dłuższy czas manipulacji komórkami podczas izolacji może spowodować zmniejszenie liczby i jakości komórek; Po trzecie, nieenzymatyczne metody mechanicznego rozdzielania mogą powodować poważne uszkodzenia i powodować niską wydajność żywotnych izolowanych hepatocytów pierwotnych32,33. W latach osiemdziesiątych XX wieku wprowadzono technikę perfuzji kolagenazy do izolowania hepatocytów z wątroby zwierząt34. Metoda ta opiera się na perfuzji kolagenazy w wątrobie35,36,37, infuzja wątroby roztworem chelatora wapnia38,39, trawienie enzymatyczne i mechaniczna dysocjacja miąższu wątroby35. W pierwszym etapie wątroba myszy jest perfundowana wolnym buforem wapnia [Ca2+] zawierającym chelator [Ca2+] (kwas etylenodiaminotetraoctowy, EDTA). W drugim etapie wątroba myszy jest perfundowana buforem zawierającym kolagenazę w celu hydrolizy interakcji między macierzą komórkową a zewnątrzkomórkową. W przeciwieństwie do buforu użytego w kroku pierwszym, obecność jonów [Ca2+] w buforze drugiego etapu jest wymagana do efektywnej aktywności kolagenazy, po czym strawiona wątroba musi być dalej delikatnie i mechanicznie oddzielona za pomocą kleszczy między torebką wątrobową a tkanką miąższową. Na koniec tkanka łączna jest usuwana przez filtrowanie, a następnie odwirowanie oddziela żywotne hepatocyty zarówno od komórek niemiąższowych, jak i od nieożywionych hepatocytów za pomocą bufora gradientu gęstości40,41,42. W niniejszym badaniu pokazujemy zmodyfikowaną dwuetapową technikę perfuzji kolagenazy w celu wyizolowania pierwotnych hepatocytów z wątroby myszy w celu analizy syntezy białek.
Radioznakowanie białek jest powszechnie używane do ilościowego określania poziomów ekspresji, szybkości obrotu i określania biologicznej dystrybucji białek43 ze względu na wysoką czułość wykrywania radioaktywności44. Jednak użycie izotopów promieniotwórczych wymaga ściśle kontrolowanych warunków i procedur badawczych45. Opracowano alternatywne metody nieradioaktywne, które zyskują coraz większą popularność. Reakcja chemoselektywnej ligacji z metodą wykrywania białka tetrametylorodaminy (TAMRA) jest jedną z nich i opiera się na chemoselektywnej reakcji między grupami azydkowymi i alkinowymi46, które można wykorzystać do analizy zdarzeń komórkowych, takich jak wykrywanie powstającej syntezy białek i podklas glikoprotein zmodyfikowanych grupą azydkową. W celu powstającej syntezy białek, L-azydohomoalanina (L-AHA, aminokwas modyfikowany azydkiem) może być metabolicznie włączona do białek i wykryta za pomocą metody wykrywania białek TAMRA47. Stosując ten test w pierwotnych hepatocytach myszy, pokazujemy, że powstające tempo syntezy białek jest ściśle związane z dostępnością ATP z aktywacji mitochondriów i AMPK (Figura 1).
Podsumowując, wykorzystanie pierwotnych hepatocytów myszy jest kluczowe dla badania metabolizmu białek i energii, a ilościowe określenie powstającej syntezy białek jest cenne dla uzyskania wglądu w fizjologiczną rolę szlaków istotnych dla rozwoju i leczenia chorób związanych z hepatocytami.