Systemy wyświetlania mają na celu prezentację biologicznie aktywnych cząsteczek na powierzchni mikroorganizmów i znajdowanie zastosowań w różnych dziedzinach, od przemysłowych po medyczne i środowiskowe biotechnologie. Oprócz fagów1,2 oraz komórek różnych gatunków Gram-ujemnych i -dodatnich3,4,5,6,7, zarodniki bakterii zostały również zaproponowane jako systemy wyświetlania na dwa sposoby8,9.
Ze względu na swoją specyficzną strukturę, a mianowicie odwodnioną cytoplazmę otoczoną szeregiem warstw ochronnych10, zarodnik ma kilka zalet w porównaniu z systemami wyświetlania opartymi na fagach i komórkach8,9. Pierwszą zaletą jest wyjątkowa wytrzymałość i stabilność zarodników w warunkach, które byłyby szkodliwe dla wszystkich innych komórek10,11. Antygeny i enzymy wykazywane przez przetrwalniki są stabilne po długotrwałym przechowywaniu w temperaturze pokojowej12 i chronione przed degradacją przy niskim pH i wysokich temperaturach13. Drugą zaletą zarodników jest bezpieczeństwo wielu gatunków tworzących przetrwalniki. B. subtilis, B. clausii, B. coagulans i kilka innych gatunków są stosowane na całym świecie jako probiotyki i są dostępne na rynku do stosowania u ludzi lub zwierząt od dziesięcioleci14,15. Ten wyjątkowy rekord bezpieczeństwa jest oczywistym ogólnym wymogiem dla systemu wyświetlania powierzchniowego i ma szczególne znaczenie, gdy system jest przeznaczony do użytku przez ludzi lub zwierzęta16. Trzecią, ważną zaletą systemu wyświetlania opartego na zarodnikach jest to, że nie ma ograniczeń co do wielkości cząsteczki, która musi być wystawiona. W systemach opartych na fagach duże białko heterologiczne może wpływać na strukturę kapsydu, podczas gdy w systemach opartych na komórkach może wpływać na strukturę błony lub może ograniczać/upośledzać etap translokacji błony17. Warstwy ochronne otaczające zarodnik składają się z ponad 70 różnych białek10 i są wystarczająco elastyczne, aby przyjąć duże obce białka bez żadnych widocznych wad strukturalnych lub upośledzenia funkcjonalnego8. Ponadto, w przypadku obu systemów wyświetlania opartych na przetrwalnikach, translokacja błonowa białka heterologicznego nie jest wymagana8,9. Rzeczywiście, białka heterologiczne są albo wytwarzane w cytoplazmie komórki macierzystej i składane na zarodniku, który tworzy się w tej samej cytoplazmie, albo adsorbowane na dojrzałym zarodniku 8,9.
Wyświetlanie zarodników zostało początkowo uzyskane poprzez opracowanie systemu genetycznego do inżynierii powierzchni zarodników18. Ten system genetyczny opierał się na i) budowie fuzji genów między genem kodującym białko płaszcza przetrwalnikowego (używanym jako nośnik) a genem kodującym białko, które ma być wyświetlane - obecność sygnałów transkrypcyjnych i translacyjnych genu endogennego będzie kontrolować ekspresję fuzji, oraz ii) integracji genu chimerycznego z B. subtilis chromosomu, aby zapewnić stabilność genetyczną. To podejście rekombinacyjne wykazało różnorodność antygenów i enzymów, wykorzystując różne białka powierzchniowe zarodników jako nośniki i dążąc do różnych potencjalnych zastosowań, od szczepionki śluzówkowej po biokatalizator, bioczujnik, bioremediację lub narzędzie bioanalityczne8,13.
Ostatnio opracowano inne podejście do wyświetlania zarodników19. Ten drugi system jest nierekombinowany i opiera się na spontanicznej i niezwykle ścisłej adsorpcji cząsteczek na powierzchni zarodników9. Antygeny19,20 i enzymy13,21 zostały skutecznie wyświetlone i wykazały, że ta metoda jest znacznie bardziej efektywna niż metoda rekombinowana. To nierekombinowane podejście pozwala na wyświetlanie białek w formie natywnej20 i może być również używane z autoklawowanymi zarodnikami śmierci19. Molekularny mechanizm adsorpcji nie został jeszcze w pełni wyjaśniony. Ładunek ujemny i hydrofobowość zarodnika zostały zaproponowane jako właściwości istotne dla adsorpcji13,19,22. Ostatnio wykazano, że białko modelowe, czerwone białko autofluorescencyjne (mRFP) koralowca Discosoma, po adsorpcji do zarodnika, było w stanie przeniknąć przez warstwy powierzchniowe zlokalizowane w powłoce wewnętrznej23. Jeśli okaże się to prawdą w przypadku innych białek, wewnętrzna lokalizacja heterologicznych białek może wyjaśnić ich zwiększoną stabilność po adsorpcji do zarodników23.
W niedawnym badaniu, dwa enzymy katalizujące dwa kolejne etapy szlaku degradacji ksylanu były niezależnie wyświetlane na zarodnikach B. subtilis i, gdy były inkubowane razem, były w stanie przeprowadzić oba etapy degradacji21. Zarodniki zebrane po reakcji były nadal aktywne i zdolne do kontynuowania degradacji ksylanu po dodaniu świeżego substratu21. Nawet jeśli w drugim procesie reaction21 zaobserwowano utratę około 15% produktu końcowego, to dodatkowym ważnym atutem systemu wyświetlania zarodników jest możliwość ponownego wykorzystania zaadsorbowanych enzymów w reakcjach jedno- jak i wieloetapowych.
Pan et al.24 opisali dodatkowe podejście do wyświetlania heterologicznych białek na powierzchni zarodników: heterologiczne białka (białko endoglukanazy i białko beta-galaktozydazy) wytwarzane w komórce macierzystej podczas zarodnikowania były spontanicznie zamknięte w tworzącej się otoczce zarodników, bez potrzeby stosowania nośnika. Ten dodatkowy system wyświetlania zarodników jest połączeniem dwóch opisanych do tej pory podejść. Rzeczywiście, jest rekombinowany, ponieważ heterologiczne białka zostały zaprojektowane tak, aby ulegały ekspresji w komórce macierzystej podczas zarodnikowania, podczas gdy ich składanie w płaszczu było spontaniczne, a zatem nierekombinowane24. Jednak skuteczność wyświetlania tego dodatkowego podejścia musi zostać przetestowana i porównana z pozostałymi dwoma podejściami przy użyciu tych samych białek heterologicznych.
Obecny protokół wyklucza procesy produkcji i oczyszczania zarodników, które zostały szczegółowo opisane gdzie indziej24. Obejmuje ona reakcję adsorpcji, ocenę skuteczności adsorpcji za pomocą mikroskopii punktowej i fluorescencyjnej oraz recykling zaadsorbowanych enzymów do dodatkowych rund reakcyjnych.