Tutaj opisujemy prostą metodę, którą opracowaliśmy do analizy in vivo kontroli genów cytoarchitektury neuronów. Opierając się na inżynierii in vitro prekursorów neuronalnych, ich przeszczepieniu do mózgu noworodka i sparowanej ocenie morfometrycznej komórek "testowych" i "kontrolnych", pozwala w szybki i niedrogi sposób odkryć funkcjonalne implikacje genów testowych w precyzyjnej kontroli morfologii neuronów. Aby zbadać kontrolę genów in vivo nad architekturą neuronalną, należy zająć się trzema kluczowymi kwestiami technicznymi: (1) osiągnięciem odpowiednio wzorcowej ekspresji genu będącego przedmiotem zainteresowania (GOI) i dokładnej kontroli ilościowej tego zjawiska; (2) uzyskanie odpowiednio segmentowanej wizualizacji wyraźnych sylwetek neuronalnych; (3) Uzyskiwanie istotności statystycznej wyników przy wykorzystaniu ograniczonej liczby zwierząt.
Jeśli to możliwe, zmutowane linie myszy zawierające transgeny kontrolowane przez tetracyklinę (tet) mogą być najlepszym narzędziem do rozwiązania pierwszego problemu1. Alternatywnie można zastosować transgenezę somatyczną. W takich przypadkach transgen jest dostarczany za pomocą elektroporacji2 lub transdukcji wirusa3. Następnie jest zachowywany jako episom (np. po standardowej elektroporacji4) lub jest integrowany z genomem (losowo, za pomocą integrazy retrowirusowej5; lub w określonym miejscu, poprzez rekombinację homologiczną promowaną przez CRISPR (SLENDR)6).
Po drugie, wizualizację sylwetki neuronów można osiągnąć poprzez (a) rzadkie jednolite etykietowanie lub (b) gęste etykietowanie różnicowe. Jeśli chodzi o znakowanie rzadkie, można zastosować zaawansowane metodologie podobne do Golgiego7, wybrane minizestawy neuronalne można wypełnić biocytiną8, a znakowanie solą i pieprzem można uzyskać dzięki słabo wyrażonemu transgenowi. Taki transgen może wykazywać różnorodną transkrypcję (Thy-EGFP)9 lub może być aktywowany przez rekombinację stochastyczną (MORF)10. Jeśli chodzi o (b), najnowocześniejsze strategie obejmują stochastyczną rekombinację za pośrednictwem Cre w ramach wielofloksowej matrycy transgenów fluoroproteinowych (Brainbow)11, a także integrację genomową genów fluoroproteinowych opartą na piggyBac-transposazie, wcześniej dostarczaną przez transgenezę somatyczną (CLoNE)12.
Jeśli chodzi o trzecią kwestię, na wynik morfometryczny często wpływa duża losowa zmienność, wynikająca z różnic między zwierzętami i przypadkowości iniekcji komórkowych. Z tego powodu zwykle wykorzystuje się dużą liczbę zwierząt w celu osiągnięcia mocy statystycznej niezbędnej do oceny aktywności morfometrycznej rządu Indii.
Opisane wcześniej podejścia często opierają się na zaawansowanych umiejętnościach technicznych i wymagają znacznych środków finansowych, co może ograniczyć ich rozpowszechnienie w społeczności naukowej. Aby obejść te problemy, opracowaliśmy łatwy i prosty proces analizowania kontroli genów neuroarchitektury in vivo w szybki i niedrogi sposób. Jest to inspirowane podobnym projektem kotransplantacji, opracowanym wcześniej do szybkiej oceny in vivo aktywności transgenu przeciwblastycznego13.
Konkretnie, uważa się, że jednoczesna transplantacja "zielonych" prekursorów nerwowych (komórek testowych i "kontrolnych") do "czarnego" mózgu noworodka biorcy może jednocześnie rozwiązać trzy kluczowe problemy wymienione powyżej. W rzeczywistości, inżynieria lentiwirusowa prekursorów in vitro, w dobrze kontrolowanych warunkach, pozwala na utrzymanie zmienności ekspresji transgenu neuronalnego na minimalnym poziomie, znacznie niższym niż zwykle kojarzonym z manipulacjami somatycznymi in vivo (wykonanymi wcześniej14,15 i w naszych niepublikowanych wynikach). Uzyskana w ten sposób dokładna kontrola ekspresji genów jest porównywalna z tą osiągniętą przez modele transgeniczne kontrolowane przez tet. Jednak koszty tej procedury są znacznie niższe niż te wynikające z utrzymania linii myszy transgenicznych. Następnie, wstrzyknięcie komórek z wolnej ręki jest łatwe i wymaga minimalnego szkolenia. Co więcej, ilość znakowanych prekursorów wstrzykiwanych do każdego mózgu można łatwo dostosować, aby osiągnąć wystarczającą skumulowaną liczbę rzadko rozmieszczonych prekursorów, przy jednoczesnym utrzymaniu całkowitej liczby przeszczepionych zwierząt na minimalnym poziomie. Wreszcie, co nie mniej ważne, jednoczesne wstrzykiwanie różnie znakowanych fluorowo, "testowych" i "kontrolnych" prekursorów oraz późniejsza analiza statystyczna wyników parami przeciwdziałają skutkom zmienności doświadczalnej między zwierzętami, umożliwiając osiągnięcie istotności statystycznej wyników, nawet przy analizie ograniczonej liczby osobników13.
Należy podkreślić, że ta metoda, choć szybka i tania, ma dwie główne ograniczenia. Po pierwsze, ma on na celu zbadanie autonomicznej kontroli genów nad architekturą neuronów i nie jest właściwe zajmowanie się kontrolą środowiska. Po drugie, ponieważ przeszczepione prekursory neuronów osiągają swoją ostateczną lokalizację zgodnie z harmonogramem heterochronicznym, metoda ta jest preferowana do modelowania kontroli neuroarchitektonicznej zachodzącej po zakończeniu migracji.