$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Neurony pochodzące z ludzkich pluripotencjalnych komórek macierzystych (hiPSC) są coraz bardziej istotne w obszarach badań podstawowych, rozwoju leków i medycyny regeneracyjnej. Przepływy pracy i procedury mające na celu optymalizację ich hodowli i utrzymania oraz poprawę efektywności różnicowania w określone podtypy neuronów szybko ewoluują1,2. Aby poprawić użyteczność i opłacalność neuronów pochodzących z ludzkich komórek macierzystych jako systemów modelowych podatnych na analizy o wysokiej zawartości w procesie odkrywania leków i walidacji celów, przydatne jest skrócenie czasu hodowli wymaganego do wygenerowania dojrzałych, funkcjonalnych neuronów, przy jednoczesnym zachowaniu maksymalnej odporności, odtwarzalności i istotności fenotypu. Chociaż trójwymiarowe hodowle organoidów są motorem przełomu w badaniach nad neurorozwojem3, 2-wymiarowe hodowle jednowarstwowe są szczególnie kompatybilne z aplikacjami opartymi na zautomatyzowanym obrazowaniu ze względu na ich minimalną grubość tkanki.
Jednak adaptacja metod badań przesiewowych opartych na obrazowaniu do modeli ludzkich chorób neurologicznych i neurorozwojowych stoi przed poważnym wyzwaniem. Wydłużone ramy czasowe, w których ludzki układ nerwowy dojrzewa in vivo, wymagają wydłużenia czasu w hodowli, aby dostosować się do naturalnych programów ekspresji genów i osiągnąć dojrzałość neuronalną.
Jedną z praktycznych konsekwencji długotrwałego programu różnicowania neuronów jest to, że utrzymanie kultur jednowarstwowych pochodzących z hiPSC musi być utrzymywane przez wiele tygodni, aby osiągnąć odpowiednią dojrzałość synaps. W tym czasie neuronalne komórki progenitorowe, które pozostają niezróżnicowane, nadal się dzielą. Mogą one szybko przerosnąć kulturę i przywłaszczyć sobie zawartość składników odżywczych niezbędną do utrzymania żywotnych neuronów postmitotycznych. Energicznie dzielące się nerwowe komórki progenitorowe (NPC) mogą również konkurować z neuronami o substrat wzrostu. Może to spowodować, że takie kultury będą narażone na problemy ze słabą adhezją, co jest stanem nieodpowiednim do testów opartych na obrazowaniu. Co więcej, wielu badaczy stwierdza, że im mniejsza objętość hodowli, tym większa trudność w utrzymaniu zdrowych populacji zróżnicowanych neuronów wystarczająco długo, aby zaobserwować późne stadia różnicowania neuronów. Innymi słowy, testy dojrzewania synaps przy użyciu metod badań przesiewowych o wysokiej zawartości (HCS) mogą być bardzo trudne dla neuronów pochodzenia ludzkiego.
Aby obejść niektóre z tych problemów, zastosowano procedurę ponownego zawieszania i ponownego powlekania wcześniej zróżnicowanych neuronów pochodzących z hiPSC. Po pierwsze, pozwala na badanie wzrostu neurytów (a dokładniej ich regeneracji) w populacji w pełni zaangażowanych neuronów. Po drugie, ponowne rozszczepienie wcześniej zróżnicowanych neuronów z formatu o dużej objętości (np. płytki 10 cm lub większej) do formatów o małej objętości (takich jak 96- lub 384-dołkowe płytki mikromiareczkowe zgodne z HCS) umożliwia znaczne skrócenie całkowitego czasu hodowli w warunkach małej objętości. Ułatwia to badanie montażu i dojrzewania synaps w kolejnych tygodniach in vitro.
Jednak ponowne tworzenie dojrzałych neuronów, które już mają długie neuryty i złożoną sieć połączeń, stanowi kilka wyzwań, jednym z nich jest czasami wysokie i zmienne tempo śmierci komórek. W tym miejscu opisujemy procedurę ponownego powlekania, która skutkuje doskonałą przeżywalnością i odtwarzalnością komórek. Zwykle neurony są wystawione na działanie enzymów proteolitycznych przez krótkie okresy inkubacji (zwykle ~ 3-10 min) w celu odłączenia komórek od substratu przed roztarciem. Ten krótki czas proteolizy jest zwyczajowo używany do ponownego zawieszania i przechodzenia wielu typów dzielących się komórek, w tym komórek nieneuronalnych i niezróżnicowanych komórek progenitorowych4,5,6. Jednak w przypadku zróżnicowanych neuronów zawierających długie, połączone ze sobą neuryty, konieczne jest nie tylko oderwanie komórek od substratu, ale także przerwanie sieci dendrytycznej i aksonalnej w celu wyizolowania pojedynczych komórek przy jednoczesnej minimalizacji uszkodzeń. Rzeczywiście, gruba siatka neuronów zwykle ma tendencję do odrywania się od podłoża jako pojedynczy arkusz, a nie jako pojedyncze komórki. Jeśli nie zadba się o rozluźnienie gęstej sieci neurytów, neurony nie tylko ulegają nieodwracalnemu uszkodzeniu podczas trituracji, ale wiele z nich nie przechodzi przez filtr używany do usuwania grudek, co skutkuje słabą wydajnością komórek. Poniżej opisujemy prostą modyfikację szeroko stosowanej procedury inkubacji proteazy, aby przeciwdziałać tym trudnościom.
W opisanym poniżej protokole, neurony są inkubowane przez 40-45 minut z łagodną proteazą, taką jak enzym proteolityczny (np. Accutase). W ciągu pierwszych 5-10 minut po dodaniu enzymu sieć neuronalna unosi się z podłoża w postaci arkusza. Inkubacja z proteazą trwa dodatkowe 30-40 minut, a następnie przechodzi do delikatnego rozcierania i filtrowania. Ten dodatkowy czas inkubacji pomaga zapewnić, że trawienie materiału rozluźnia sieć międzykomórkową, zapewniając w ten sposób, że późniejsze trituration wytwarza zawieszenie poszczególnych komórek. Ta procedura maksymalizuje jednorodność rozmieszczenia komórek po ponownym posiewaniu, jednocześnie minimalizując śmierć komórki. Z powodzeniem zastosowaliśmy tę metodę remembraningu do kultur neuronalnych pochodzących z hiPSC generowanych przez różne protokoły różnicowania7,8 oraz z różnych linii hiPSC. Procedura jest nominalnie odpowiednia do stosowania z większością lub wszystkimi liniami neuronów pochodzących z komórek macierzystych. Zaobserwowaliśmy, że wydłużony czas inkubacji proteazy nie jest absolutnie niezbędny do ponownego posiewu kultur z płytek małoformatowych (np. o średnicy 35 mm); Jednak, jak pokazujemy tutaj, zapewnia to znaczące korzyści podczas ponownego powlekania z płytek o dużej średnicy (np. o średnicy 10 cm lub większej), prawdopodobnie dlatego, że neuryty w takich płytkach mogą rozciągać bardzo długie procesy i tworzyć gęsto połączony układ.
Tutaj demonstrujemy tę metodę i krótko ilustrujemy jej zastosowanie w testach wczesnej neurytogenezy i dojrzewania synaps, które obejmują grupowanie białek pre- i postsynaptycznych wzdłuż dendrytów i aksonów, a następnie ich późniejszą kolokalizację w miejscach synaptycznych. Przykłady te podkreślają korzyści, jakie oferuje ten protokół w zakresie zachowania żywotności i odtwarzalności komórek. Po pierwsze, pozwala badaczom badać wczesne etapy neurytogenezy człowieka. Warunki eksperymentalne są podobne do powszechnie stosowanych pierwotnych kultur neuronów korowych lub hipokampowych gryzoni, w których komórki są ekstrahowane z mózgu późnego płodu lub wczesnego okresu poporodowego, dysocjowane przez triturację po delikatnym leczeniu proteazą i pozwalają na inicjację neurytów lub regenerację neurytów, które zostały odcięte w procedurze9,10. Podobnie jak w przypadku takich pierwotnych neuronów gryzoni, neurony pochodzące z hiPSC zaczynają tworzyć lub regenerować swoje neuryty w ciągu kilku godzin po ponownym posiewaniu, umożliwiając obrazowanie stożków wzrostu i morfologii neurytów w środowisku optymalnym dla obrazowania w czasie o dużej liczbie otaczających niezróżnicowanych komórek. Zaobserwowaliśmy, że wzrost neurytów jest bardziej zsynchronizowany w porównaniu ze zmiennymi opóźnieniami i różnymi wskaźnikami wzrostu obserwowanymi, gdy neurony po raz pierwszy zaczynają różnicować się od populacji progenitorowej. Ponadto ponowne powlekanie umożliwia testowanie neuronów wyrażających markery podtypu neuronalnego, które zwykle pojawiają się później w rozwoju neuronalnym, takie jak czynnik transkrypcyjny warstwy korowej 5/6 CTIP2 (białko oddziałujące z czynnikiem transkrypcyjnym promotora białka 2 w warstwie kurzej) lub marker panneuronalny NeuN11. Szczególnie przydatną cechą podejścia opartego na posiewach jest to, że synaptogeneza przebiega w ramach czasowych zgodnych z HCS.