1 a dziś są wszechobecnymi symbiontami większości roślin2, dostarczając im niezbędnych składników mineralnych do wzrostu. Cienkie, nitkowate strzępki grzybów AM żerują na mineralnych składnikach odżywczych poza strefami zubożenia składników odżywczych w pobliżu korzeni, często napotykając i kolonizując systemy korzeniowe sąsiednich roślin w "wspólnej sieci mikoryzowej" (CMN). Wspólne sieci mikoryzowe mogą również powstawać, gdy zarazki grzybów dołączają do istniejących sieci3, lub gdy strzępki AM łączą się (anastomoza) ze strzępkami współgatunkowymi4,5,6,7. Zasięg tych zewnątrzrodnikowych strzępek w glebie jest ogromny, przy czym strzępki pozarodnikowe stanowią od 20% do 30% całkowitej biomasy mikrobiologicznej gleby na glebach preriowych i pastwiskowych8 i rozciągają się na 111 m·cm-3 na niezakłóconych użytkach zielonych9.
Powszechne sieci mikoryzowe rozdzielają mineralne składniki odżywcze między połączone ze sobą sąsiednie rośliny10,11,12,13. Rośliny mogą otrzymywać do 80% swojego fosforu i 25% swojego zapotrzebowania na azot od grzybów AM, dostarczając w zamian do 20% całkowitego związanego węgla do grzybów14. Niedawne badania in vitro nad hodowlą narządów korzeniowych wykazały, że CMN preferencyjnie wymieniają mineralne składniki odżywcze z korzeniami gospodarza, które dostarczają grzybom najwięcej węgla11,12. Co więcej, różne gatunki grzybów AM mogą różnić się jakością jako partnerzy symbiotyczni, przy czym niektóre grzyby wymieniają więcej fosforu za mniej węgla niż inne15. Chociaż hodowle narządów korzeniowych są korzystnymi modelami do badania symbiozy AM, ponieważ prezentują starannie kontrolowane środowisko i możliwość bezpośredniej obserwacji wzajemnych połączeń strzępkowych, nie obejmują pędów fotosyntetyzujących, które wpływają na ważne procesy fizjologiczne, takie jak fotosynteza, transpiracja i zmiany dobowe, a także stanowią pochłaniacze węgla i składników mineralnych.
W naturze, siewki najprawdopodobniej korzystają z już istniejących CMN. Do niedawna jednak naukowcy badali wpływ grzybów AM na odżywianie roślin tylko poprzez uprawę roślin z grzybami AM i bez nich, często z jednym gatunkiem grzyba AM. Chociaż praca ta była niezwykle pouczająca dla naszego zrozumienia mikoryzy arbuskularnej, metoda ta przeoczyła potencjalnie kluczową rolę, jaką CMN mogą odgrywać w interakcjach między połączonymi roślinami żywicielskimi. W szczególności rośliny, które są w dużym stopniu zależne od grzybów AM pod względem wzrostu, oddziałują minimalnie bez grzybów AM16,17, co może zakłócić naszą interpretację interakcji za pośrednictwem grzyba AM, gdy są używane jako "kontrole" dla odniesienia do punktu odniesienia.
Proponujemy podejście oparte na rotowanym rdzeniu do badania roli CMN w interakcjach roślinnych i strukturyzacji populacji. Nasze podejście naśladuje składniki symbiozy AM w naturze, ponieważ całe rośliny dołączają do ustalonych CMN, a wszystkie rośliny są uprawiane z grzybami AM. Usuwając interakcje korzeniowe, nasza metodologia koncentruje się w szczególności na interakcjach, w których pośredniczą grzyby AM, jednocześnie śledząc ruch mineralnych składników odżywczych w CMN. Nasze podejście opiera się na wcześniejszych pracach, w których wykorzystano obrócone rdzenie zarówno w terenie, jak i w szklarni, aby zrozumieć realistyczne funkcjonowanie AM.
Metoda rotowanego rdzenia została uznana w literaturze jako metoda manipulowania strzępkami pozarodnikowymi18,19,20,21, i w ciągu ostatnich dwóch dekad doczekała się kilku reinkarnacji w zależności od swojego przeznaczenia. Początkowo worki siatkowe lub bariery umożliwiające wrastanie strzępek były używane do zapewnienia przedziałów wolnych od korzeni w celu ilościowego określenia ilości arbuskularnych strzępek mikoryzowych w glebie22,23. Następnie rozwinęły się cylindryczne rdzenie gleby zamknięte w sztywnych rurach wodociągowych lub plastikowych rurkach ze szczelinami pokrytymi nylonową siatką, przez którą przenikały strzępki, ale nie korzenie. Można je łatwo obrócić, aby zakłócić działanie grzybni pozarodnikowej18,24,25. Obrócone rdzenie umieszczono między roślinami, a długości strzępek gleby na gram gleby18, 13strumieni C do grzybni pozarodnikowej24, lub określono ilościowo pobór fosforu z rdzeni wolnych od roślin18. Innym zastosowaniem takich rdzeni było hodowanie w nich roślin na polu, aby zmniejszyć kolonizację korzeni przez grzyby AM poprzez częste zakłócanie strzępek jako alternatywę dla sterylizacji lub stosowania fungicydów, z których oba mają pośredni wpływ na materię organiczną gleby i inne drobnoustroje18.
Podejście oparte na barierze z siatki strzępkowej zostało użyte do zbadania podziału składników odżywczych i interakcji roślin między CMN, ale w prostokątnych mikrokosmosach, a nie z obróconymi rdzeniami. Walder et al.26 badali interakcje między Linum usitatissimum (len) a Sorghum bicolor (sorgo), śledząc mineralne składniki odżywcze do wymiany węgla przy użyciu izotopów w CMN jednego z grzybów AM Rhizophagus irregularis lub Funneliformis mosseae26. Mikrokosmosy w ich badaniu składały się z przedziałów roślinnych oddzielonych barierami siatkowymi, przedziałów strzępek dostępnych tylko dla strzępek mikoryzowych oraz oznakowanych przedziałów strzępkowych, które zawierały radioaktywne i stabilne izotopy. Jako grupę kontrolną w badaniu zastosowano zabiegi bez grzybów mikoryzowych. Song et al.27 zastosowali podobne podejście, aby odkryć, że sygnały roślinne mogą być przenoszone tylko wśród ustalonych CMN F. mosseae, gdy jedna roślina została zainfekowana patogenem grzybowym. Ponadto, podobnie jak Walder et al.26, Merrild et al.28 hodowali rośliny w indywidualnych przedziałach oddzielonych siatką, aby zbadać wydajność roślin siewek Solanum lycopersicum (pomidora) połączonych CMN z dużą rośliną Cucumis sativus (ogórek), która stanowiła obfite źródło węgla. Zastosowali również zabiegi bez grzybów mikoryzowych zamiast odcinania CMNs28. W drugim, powiązanym eksperymencie, węgiel do wymiany fosforu został zbadany przy użyciu worków siatkowych oznaczonych 32P. Mikrokosmosy z barierami z siatki strzępkowej i odcinanie CMN jako leczenie zostały użyte przez Janos et al.29, którzy badali konkurencyjne interakcje między siewkami gatunku drzewa sawanny Eucalyptus tetrodonta a przeszczepami drzewa lasu deszczowego, Litsea glutinosa. W tym badaniu Janos i in.29 podnieśli przedziały zawierające sadzonki o kilka centymetrów, przesuwając warstwy siatki względem siebie, aby przerwać połączenia strzępkowe29.
Ostatnim krokiem w ewolucji metody obracanego rdzenia było hodowanie roślin wewnątrz rdzeni, które znajdują się w doniczkach lub mikrokosmosach20,30. Wyss30 użył obróconych rdzeni, aby ustalić, czy pozarodnikowa grzybnia AM może skolonizować siewki Pinus elliottii podczas rozprzestrzeniania się z dawcy lub "pielęgniarki" rośliny żywicielskiej AM, Tamarindus indica, i jak pozarodnikowa grzybnia grzybów ektomikoryzowych wpływa na wydajność siewek. Duże komercyjne rurowe pojemniki na sadzonki (Tabela materiałów) w mikrokosmosach były albo z litego tworzywa sztucznego (bez CMN), albo ze szczelinami i pokryte hydrofobową membraną. Pojemniki na sadzonki ze szczelinami albo nie były obracane (nienaruszone CMN), albo obracane w celu przecięcia ustalonych CMN. Obrócone rdzenie z różnymi rozmiarami barier siatkowych zostały użyte przez Babikova et al.20 do zbadania sygnalizacji podziemnej przez CMN wśród roślin Vicia faba (fasola). W ich badaniach centralna roślina dawcza w mezokosmosach o średnicy 30 cm była ze sobą połączona albo za pomocą korzeni i strzępek (bez bariery), albo tylko za pomocą CMN ustanowionych za pomocą siatki 40 μm. Centralne rośliny zostały odcięte od interakcji z sąsiednimi roślinami poprzez rotację rdzeni otoczonych siatką, lub CMN były zapobiegane przez drobną siatkę 0,5 μm otaczającą rdzeń.
Tutaj prezentujemy metodę, która łączy aspekty wcześniejszych podejść z rdzeniem rotacyjnym w celu zbadania wpływu CMN na bezpośrednie interakcje roślinne w połączeniu ze śledzeniem stabilnych izotopów. Nasza metoda wykorzystuje podejście "rośliny docelowej", w którym centralna roślina będąca przedmiotem zainteresowania jest otoczona przez sąsiednie rośliny. Rośliny są uprawiane w obrotowych pojemnikach na sadzonki, które są szczelinowe i pokryte nylonową siatką sitodrukową, membraną hydrofobową lub są wykonane z niemodyfikowanego litego tworzywa sztucznego. Wspólne sieci mikoryzowe są przerywane raz w tygodniu lub utrzymywane w stanie nienaruszonym, a stabilne izotopy 15N śledzą ruch azotu z obróconych rdzeni sąsiadów do centralnej rośliny docelowej. Porównując wielkość rośliny z mineralnymi składnikami odżywczymi i stabilnym pobieraniem izotopów, oceniamy, które rośliny mogą czerpać korzyści lub cierpieć z powodu CMN w interakcjach między roślinami żywicielskimi.