$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Roślinna thigmomorfogeneza to termin ukuty przez Jaffe, MJ w 1973 roku1. Jest to tropizm roślinny, ale różni się od dobrze znanego fototropizmu lub grawitropizmu spowodowanego bodźcami światła słonecznego lub grawitacji2,3. Opisuje zmiany fenotypowe związane z okresowymi stymulacjami mechanicznymi, które były często obserwowane przez botaników we wcześniejszych czasach4,5. Krople deszczu, wiatr, dotyk roślinny, zwierzęcy i ludzki, a nawet ugryzienia zwierząt, są uważane za różne rodzaje bodźców mechano-bodźców, które wyzwalają sygnalizację siły w roślinach4,5. Cechy charakterystyczne tigmomorfogenezy roślin obejmują opóźnienie skręcania, krótszą łodygę, mniejszy rozmiar rozety/liścia u roślin zielnych i grubszą łodygę u roślin drzewiastych6,7,8. Jest to przeciwieństwo reakcji thigmonastycznej lub tigmotropowej często spotykanej w roślinie Mimosa lub innych genetycznie wrażliwych winoroślach, gdzie te szybkie reakcje dotykowe są łatwiejsze do zaobserwowania1,9,10. Z drugiej strony tigmomorfogeneza jest stosunkowo trudna do zaobserwowania ze względu na powolną reakcję wzrostu. Tigmomorfogenezę obserwuje się zwykle po tygodniach, a nawet latach ciągłej stymulacji siłowej. Ta unikalna natura reakcji roślin na dotyk sprawia, że trudno jest przeprowadzić badanie genetyczne przy użyciu stymulacji dotykowej ludzkiej ręki w celu wyizolowania mutantów odpornych na sygnalizację siły dotyku w solidny sposób.
Aby wyjaśnić szlaki transdukcji sygnału siły i mechanizmy molekularne leżące u podstaw thigmomorfogenezy6,11, w przeszłości przeprowadzono eksperymenty biologiczne molekularne i komórkowe6,12,13,14. Badania te sugerują, że receptory sygnału siły roślinnej składają się głównie z mechanowrażliwych kanałów jonowych (MSC) i uwiązanych kompleksów MSC złożonych z multimerycznych kompleksów białek obejmujących błonę11,14,15. Cytoplazmatyczny przejściowy kolec Ca2+ generowany w ciągu kilku sekund od pierwszego dotknięcia. Stymulacja wiatrem, deszczem lub grawitacją może wchodzić w interakcje z czujnikami wapnia w celu przekształcenia sygnałów siły na zdarzenia jądrowe14,16,17,18. Oprócz badań molekularnych i komórkowych, badanie genetyczne z ręcznym dotykaniem roślin palcami wykazało, że fitohormony i metabolity wtórne są zaangażowane w konsekwentną ekspresję genu indukowanego dotykiem (TCH) po obciążeniu dotykiem13,19. Na przykład, mutanty aos i opr320 zostały zidentyfikowane do tej pory z badań genetycznych. Jednak głównym problemem związanym z zastosowaniem genetyki postępowej w badaniach nad thigmomorfogenezą jest nadal intensywna praca wymagana do ilościowego określenia poziomu reakcji na dotyk i dotknięcia dużej populacji genetycznie zmutowanych pojedynczych roślin. Czasochłonny problem występuje również na ekranie mutantów opartym na dotyku dłoni14,20. Na przykład, aby ukończyć jedną rundę stymulacji siłą dotyku, osoba musi dotknąć 30-60 razy (jeden dotyk na sekundę) pojedynczej rośliny. Aby mieć wystarczającą liczbę roślin do statystycznej analizy fenotypu, zwykle potrzeba 20-50 pojedynczych roślin o tym samym genotypie do procesu obciążenia dotykiem. Ten reżim obciążenia dotykiem oznacza, że osoba musi powtarzalnie wykonać 600-3000 dotknięć jednego wybranego genotypu. Ten rodzaj dotyku zwykle należy powtarzać od 3 do 5 rund dziennie, co odpowiada około 1,800-15,000 dotknięć palcami lub wacikiem dziennie na genotyp roślin. Dobrze wyszkolona osoba jest zwykle zobowiązana do utrzymania siły i siły wielu dotknięć w pożądanym zakresie przez wiele rund powtórzeń w ciągu dnia, aby uniknąć dużej zmienności siły i siły. Jak powszechnie wiadomo, thigmomorfogeneza jest procesem nasyconym i zależnym od dawki6,21, siła/siła dotyku staje się kluczowa dla sukcesu w wywołaniu reakcji na dotyk rośliny.
Aby usunąć zależne od człowieka obciążenie dotykiem i utrzymać mechaniczne zastosowanie w akceptowalnym zakresie błędów14, dlatego zaprojektowaliśmy automatyczną maszynę do ładowania siły dotyku, która zastąpi ręcznie manipulowane dotknięcia. Maszyna posiada zbudowane 4 ruchome ramiona, z których każde wyposażone jest w jedną szczotkę do włosów ludzkich. Ta wersja została nazwana Modelem K1, aby określić jej cechę obciążenia siłą dotyku ludzkich włosów. Jeśli 4 genotypy są mierzone ilościowo pod kątem ich tigmomorfogenezy lub reakcji na dotyk pod jedną maszyną, można zmierzyć 40-48 osobników na genotyp. Każda runda powtarzania dotyku (mniej niż 60 razy na roślinę) trwa mniej niż 5 minut przy użyciu ramienia robota z regulacją prędkości ruchu. W ten sposób rośliny na maszynie dotykowej Model K1 mogą być stymulowane mechanicznie przez wiele rund dziennie, albo przy stałym obciążeniu siłą dotyku, albo przy różnych poziomach siły, jak początkowo zaprogramowano.
Arabidopsis thaliana, modelowy organizm roślinny, został zatem wybrany jako docelowy gatunek rośliny do testowania w pełni automatycznego zastosowania maszyny do ładowania włosów metodą dotykową. Ze względu na to, że dostępnych jest kilka dużych banków nasion do pobierania różnych plazm zarodkowych mutantów i wielkości kwitnienia, Arabidopsis dobrze wpasowuje się w przestrzeń dostępną na półce wzrostowej zamontowanej za pomocą maszyny dotykowej Model K1.
Automatyczna maszyna dotykowa Model K1 składa się z trzech głównych elementów: (1) metalowego stojaka w kształcie litery H składającego się z dwóch napędzanych paskiem siłowników liniowych, (2) metalowych ramion robotycznych wyposażonych w szczotki do włosów, oraz (3) kontrolera. W przypadku niestandardowej maszyny dotykowej Model K1 każdy moduł osi X / Y składa się z jednej szyny prowadzącej napędzanej pasem, dwóch bloków ślizgowych (czerwonych) i jednego silnika krokowego 57 (wstępnie zainstalowanego i demontowalnego) (Rysunek 1A,B). Górny siłownik poziomy umożliwia metalowemu ramieniu robota poruszanie się w lewo i w prawo w poziomie, dolny pionowy siłownik liniowy napędzany pasem umożliwia ruchowi metalowego ramienia robota w górę iw dół w pionie (Rysunek 1B, Rysunek 2A). Na siłowniku pionowym zainstalowano cztery demontowalne ramiona robotyczne (Rysunek 1C, Rysunek 2B). Cztery szczotki z ludzkich włosów były przywiązane odpowiednio do czterech ramion robota (Rysunek 1C, Rysunek 2B). Wszystkie części mechaniczne potrzebne do budowy maszyny dotykowej Model K1 pogrubioną czcionką poniżej są oznaczone w Rysunek 1C (patrz również Tabela Materiałów).