Ten protokół wprowadza standardową procedurę laboratoryjną do testowania diagnostycznego antygenów wirusa lyssa u nietoperzy na Tajwanie.
Artykuł metodologiczny
Ten protokół wprowadza standardową procedurę laboratoryjną do testowania diagnostycznego antygenów wirusa lyssa u nietoperzy na Tajwanie.
Wirusy z rodzaju Lyssavirus są patogenami odzwierzęcymi, a co najmniej siedem gatunków lyssawirusów jest związanych z ludzkimi przypadkami. Ponieważ nietoperze są naturalnymi rezerwuarami większości lyssawirusów, od 2008 roku na Tajwanie prowadzony jest program nadzoru nad nietoperzami lyssawirusem, aby zrozumieć ekologię tych wirusów u nietoperzy. W ramach tego programu pozarządowe organizacje zajmujące się ochroną nietoperzy i lokalne centra kontroli chorób zwierzęcych współpracowały w celu zbierania martwych nietoperzy lub nietoperzy umierających z osłabienia lub choroby. Tkanki mózgowe nietoperzy uzyskano w procesie sekcji zwłok i poddano bezpośredniemu testowi fluorescencyjnemu na przeciwciała (FAT) oraz reakcji łańcuchowej polimerazy z odwrotną transkrypcją (RT-PCR) w celu wykrycia antygenów wirusa lizy i kwasów nukleinowych. W przypadku FAT zaleca się co najmniej dwa różne koniugaty rozpoznające wściekliznę. W przypadku RT-PCR stosuje się dwa zestawy starterów (JW12/N165-146, N113F/N304R) w celu amplifikacji częściowej sekwencji genu nukleoproteiny wirusa lyssa. Ten program nadzoru monitoruje lyssawirusy i inne czynniki odzwierzęce u nietoperzy. Tajwański lyssawirus nietoperzy został znaleziony w dwóch przypadkach pipistrellus abramus (Pipistrellus abramus) w latach 2016–2017. Odkrycia te powinny informować społeczeństwo, pracowników służby zdrowia i naukowców o potencjalnych zagrożeniach związanych z kontaktem z nietoperzami i innymi dzikimi zwierzętami.
Wirusy z rodzaju Lyssavirus są patogenami odzwierzęcymi. Istnieje co najmniej siedem gatunków lyssawirusów związanych z przypadkami u ludzi1. Oprócz 16 gatunków z tego rodzaju1,2,3, tajwański wirus lyssa nietoperzy (TWBLV)4 i Kotalahti bat lyssavirus5 zostały niedawno zidentyfikowane u nietoperzy, ale ich statusy taksonomiczne nie zostały jeszcze określone.
Nietoperze są naturalnymi gospodarzami większości lyssawirusów, z wyjątkiem Mokola lyssavirus i Ikoma lyssavirus, które nie zostały jeszcze zidentyfikowane w żadnym z bats1,2,3,6. Informacje na temat lyssawirusów u nietoperzy azjatyckich są nadal ograniczone. Zgłoszono dwa niescharakteryzowane lyssawirusy u nietoperzy azjatyckich (jeden w Indiach, a drugi w Tajlandii)7,8. Jeden przypadek wścieklizny u ludzi związany z ugryzieniem nietoperza w Chinach został zgłoszony w 2002 roku, ale diagnozę postawiono tylko na podstawie obserwacji klinicznej9. W Azji Środkowej wirus Aravan lyssavirus został zidentyfikowany u małego nietoperza usznego (Myotis blythi) w Kirgistanie w 1991 roku, a wirus Khujand lyssavirus został zidentyfikowany u nocka wąsatego (Myotis mystacinus) w Tadżykistanie w 2001 roku10. W Azji Południowej lyssawirus nietoperzy Gannoruwa został zidentyfikowany u lisa indyjskiego latającego (Pteropus medius) na Sri Lance w 2015 roku3. W Azji Południowo-Wschodniej kilka badań serologicznych na nietoperzach na Filipinach, w Tajlandii, Bangladeszu, Kambodży i Wietnamie wykazało zmienną seroprewalencję11,12,13,14,15. Chociaż lyssawirus Irkut został zidentyfikowany u nocka grubonosego (Murina leucogaster) w prowincji Jilin w Chinach w 2012 roku16, dokładne gatunki i lokalizacje lyssawirusów w populacjach nietoperzy Azji Wschodniej pozostają nieznane.
Aby ocenić obecność wirusa lyssa w populacjach tajwańskich nietoperzy, zainicjowano program nadzoru wykorzystujący zarówno bezpośredni FAT, jak i RT-PCR. Tajwański lyssawirus nietoperzy został zidentyfikowany w dwóch przypadkach pipistrellus abramus (Pipistrellus abramus)4 w latach 2016–2017. W niniejszym artykule przedstawiono standardową laboratoryjną procedurę operacyjną do nadzoru populacji nietoperzy na Tajwanie za pomocą wirusa lyssa. Schemat blokowy diagnostyki lyssawirusa nietoperzy w naszym laboratorium jest przedstawiony na Rysunek 1.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
1. Środki ostrożności podczas obchodzenia się z lyssawirusami
2. Pobieranie próbek
3. Sekcja zwłok nietoperzy
4. Test przeciwciał fluorescencyjnych (FAT)
5. Ekstrakcja kwasów nukleinowych
6. RT-PCR i analiza filogenetyczna
UWAGA: Opublikowano kilka zestawów starterów do wykrywania wszystkich znanych lyssawirusów lub specyficznych lyssawirusów. Opisany tutaj protokół jest przykładem wykorzystywanym przez nasze laboratorium i może nie spełniać wszystkich potrzeb eksperymentalnych. Wybierz odpowiednie podkłady zgodnie z potrzebami laboratorium.
7. Izolacja wirusa
UWAGA: Przeprowadź izolację wirusa, gdy 1) FAT lub 2) RT-PCR wskazują na pozytywność.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Od 2014 do maja 2017 roku zebrano 332 tusze nietoperzy z 13 gatunków do nadzoru. Dwa z nich dały wynik pozytywny. W pierwszym przypadku nietoperzy wycisk mózgu dał wynik ujemny przy użyciu FAT z jednym z komercyjnych przeciwciał przeciw wściekliźnie sprzężonych z FITC (Figura 2), podczas gdy RT-PCR wykorzystujące każdy z dwóch zestawów starterów (JW12 / N165-146, N113F / N304R) dały pozytywne wyniki ( 3). Uzyskano sekwencję amplikonu o długości 428 pz (amplifikowaną przez N113F/N30...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Ta laboratoryjna standardowa procedura operacyjna (SOP) zapewnia seryjny proces testowania próbek nietoperzy na obecność antygenów wirusa lyssa na Tajwanie. Kluczowe kroki obejmują zastosowanie FAT i RT-PCR. Ważny jest również dobór odpowiednich próbek i skuteczna izolacja wirusa. Ponadto podczas monitorowania lyssawirusów nietoperzy przeprowadzono pewne rozwiązywanie problemów. Główną różnicą były zwierzęta docelowe. Początkowo (2008–2009) zwierzętami docelowymi obserwacji pod kątem wirusa lyssa nietoperzy były żywe nie...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Nie zgłasza się konfliktu interesów.
Dziękujemy Tien-Cheng Li, Yi-Tang Lin, Chia-Jung Tsai i Ya-Lan Li za pomoc podczas tego badania. Badanie to było wspierane przez grant nr 107AS-8.7.1-BQ-B2 (1) z Biura Inspekcji i Kwarantanny Zdrowia Zwierząt i Roślin, Rady Rolnictwa, Executive Yuan, Tajwan.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| 2,5% Trypsyna (10x) | Gibco | 15090046 | Trypsyna |
| 25 cm2 | kolba Greiner bio-one | 690160 | |
| Aceton | Honeywell | 32201-1L | |
| Agaroza I | VWR Life Science | 97062-250 | |
| Alkoholowy | odczynnik NIHON SHIYAKU | NS-32294 | |
| Odwrotna transkryptaza AMV | Promega | M5101 | |
| Antybiotyk-Antybiotyk (100X) | Gibco | 15240-062 | MEM-10 |
| Ostrze | Braun | BA215 | |
| Wirówka | eppendorf | 5424R | |
| System chemiluminescencji | TOP BIO CO. | MGIS-21-C2-1M | |
| Rurka zbiorcza | Qiagen | 990381 | |
| Probówka zbiorcza | SSI | 2341-SO | |
| Prowadnica pokrywy | Muto Pure chemical Co., LTD. | 24505 | |
| Analizator DNA | Applied Biosystems | 3700XL | |
| Surowica bydlęca | płodu Gibco | 10437028 | MEM-10 |
| FITC Przeciw wściekliźnie Monoklonalna globulina | Fujirebio Diagnostic Inc. | 800-092 | Przeciwciała przeciw wściekliźnie sprzężone z FITC: odczynnik B |
| Czterodołkowe szkiełko szklane pokryte teflonem | Thermo Fisher Scientific | 30-86H-WHITE | |
| System do elektroforezy żelowej | Major Science | MJ-105-R | |
| HBSS (1x) | trypsyny | Gibco | 14175095 |
| ASTEC | SCA-165DS | ||
| Olympus | IX71 | ||
| L-Glutamina 200 mM (100x) | Gibco | A2916801 | MEM-10 |
| DIAGNOSTYKA ŚWIATŁA Odczynnik przeciwko wściekliźnie Odczynnik przeciwko wściekliźnie | EMD Millipore Corporation | 5100 | Przeciwciała przeciw wściekliźnie sprzężone z FITC: odczynnik A |
| MagNA Pure Compact Instrument | Roche | 03731146001 | |
| Zestaw izolacyjny MagNA Pure Compact NA 1 | Roche | 03730964001 | |
| MEM (10x) | Gibco | 11430030 | MEM-10 |
| MEM NEAA (100x) | Gibco | 11140050 | MEM-10 |
| MEM roztwór witaminowy | Gibco | 11120052 | MEM-10 |
| NaHCO3 | Merck | 1.06329.0500 | MEM-10 |
| Igła | Terumo | NN*2332R9 | |
| PBS | Medicago | 09-8912-100 | |
| Synteza starterów | Mission Biotech | ||
| RNasin inhibitor rybonukleazy | Promega | N2111 | |
| Usługa sekwencjonowania | Mission Biotech | ||
| Slide | Thermo Scientific | AA00008032E00MNT10 | |
| Pirogronian sodu (100 mM) | Gibco | 11360070 | MEM-10 |
| Koraliki ze stali nierdzewnej | QIAGEN | 69989 | |
| Sterylna wkładka chłonna | 3M | 1604T-2 | |
| Filtr strzykawkowy | Nalgene | 171-0045 | |
| Polimeraza Taq | JMR Holdings | JMR-801 | |
| Termocykler | Applied Biosystems | 2720 | |
| TissueLyser II | QIAGEN | 85300 | |
| Depresor języka | HONJER CO., LTD. | ||
| Pęseta | Tennyson Instrument medyczny rozwijający CO., LTD. | A0601 | |
| Winian tylozyny | Sigma | T6271-10G | MEM-10 |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Poproś o pozwolenie na ponowne wykorzystanie tekstu lub ilustracji tego artykułu JoVE
Poproś o pozwolenie