$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Komórki szczotek należą do klasy komórek nabłonka chemosensorycznego, charakteryzujących się ekspresją receptorów gorzkiego smaku i maszynerią transdukcji receptorów smaku znajdującą się w komórkach kubków smakowych. W przeciwieństwie do komórek kubków smakowych, komórki nabłonka chemosensorycznego są rozproszone na powierzchniach nabłonka i są określane jako pojedyncze komórki chemosensoryczne (SCC) i komórki mikrokosmków w nabłonku nosa1,2, komórki szczoteczki w tchawicy3,4, a komórki kępkowe w jelicie5,6. Komórki nabłonkowe wyrażające receptory gorzkiego smaku i maszynerię transdukcji gorzkiego smaku znajdują się również w cewce moczowej7,8 i trąbce słuchowej9. Komórki szczoteczki dróg oddechowych pełnią unikalne funkcje w neurogennych i immunologicznych odpowiedziach dróg oddechowych. Są to komórki chemosensoryczne wytwarzające acetylocholinę, które wywołują ochronne odruchy oddechowe po aktywacji związkami gorzkimi i metabolitami bakteryjnymi, takimi jak substancje wyczuwające kworum10. Komórki szczoteczki do dróg oddechowych są również dominującym źródłem IL-25 w nabłonku dróg oddechowych, która reguluje wywołane przez alergeny wziewne zapalenie typu 2 w drogach oddechowych3.
Charakterystyka pełnego transkryptomu komórek szczoteczki dolnych dróg oddechowych i ich reakcji na bodźce środowiskowe została ograniczona przez ich niską liczbę w nabłonku tchawicy i bardzo ograniczoną liczbę poza dużymi oskrzelami10. Techniki stosowane do izolacji komórek chemosensorycznych z nabłonka jelitowego nie przyniosły proporcjonalnie wysokich liczb z tchawicy, prawdopodobnie z powodu intymnych kontaktów komórek szczoteczki tchawicy z zakończeniami nerwowymi10 lub innymi specyficznymi dla tkanek czynnikami błony śluzowej dróg oddechowych, takimi jak skład adherenów i białek połączeń ścisłych. Ostatnie doniesienia o udanej izolacji komórek szczoteczki tchawicy w większej liczbie do analizy sekwencjonowania RNA pojedynczej komórki wykorzystywały albo 2-godzinną inkubację z papainą, albo 18-godzinną inkubację z pronase11,12. Ponieważ dłuższa inkubacja z enzymami trawiennymi może zmniejszyć żywotność komórek i zmienić profil transkrypcyjny komórek z trawionych tkanek 13, może to zniekształcić analizę porównawczą z innymi populacjami nabłonka chemosensorycznego.
Tutaj przedstawiamy metodę izolacji komórek szczoteczki tchawicy do sekwencjonowania RNA3. Leczenie tchawicy dużą dawką dypazy oddziela nabłonek od błony podśluzowej. Późniejsze trawienie arkusza nabłonka za pomocą papainy pozwala na doskonałą regenerację tej komórki strukturalnej.