Wykorzystanie wielokomórkowych modeli sferoidalnych w biologii nowotworów ma już kilkadziesiąt lat1,2, ale w ostatnich latach nabrało znacznego rozpędu. W dużej mierze odzwierciedla to zwiększoną świadomość tego, jak silnie fenotyp komórek nowotworowych jest zależny od ich mikrośrodowiska i określonych warunków wzrostu. Mikrośrodowisko w guzach litych zasadniczo różni się od tego w odpowiadających im normalnych tkankach. Obejmuje to warunki fizykochemiczne, takie jak pH, ciśnienie tlenu, a także ciśnienie śródmiąższowe, gradienty stężeń rozpuszczalnych czynników, takich jak składniki odżywcze, produkty przemiany materii i wydzielane związki sygnałowe (czynniki wzrostu, cytokiny). Ponadto obejmuje organizację macierzy zewnątrzkomórkowej (ECM), interakcje komórka-komórka i sygnalizację międzykomórkową, a także inne aspekty szczególnej trójwymiarowej (3D) architektury nowotworu3,4,5,6. Specyficzne warunki mikrośrodowiskowe, w których żyją komórki nowotworowe, głęboko wpływają na ich profil ekspresji genów i właściwości funkcjonalne, i jasne jest, że w porównaniu z komórkami hodowanymi w 2D, fenotyp sferoidów 3D znacznie bardziej naśladuje guzy in vivo7,8,9,10,11. Modele 2D, nawet jeśli wykorzystują niedotlenienie, kwaśne pH i wysokie stężenia mleczanu do naśladowania znanych aspektów mikrośrodowiska guza, nadal nie są w stanie uchwycić gradientów parametrów fizykochemicznych powstających w obrębie guzów, a także ich architektury 3D. Z drugiej strony, modele zwierzęce są kosztowne, powolne i etycznie problematyczne, a także mają braki w swojej zdolności do rekapitulacji ludzkich stanów nowotworowych. W związku z tym sferoidy 3D zostały zastosowane jako model o średniej złożoności w badaniach szerokiego zakresu właściwości większości nowotworów litych9,11,12,13,14,15,16,17.
Szeroko stosowanym zastosowaniem sferoid 3D jest badanie przesiewowe skuteczności terapii przeciwnowotworowej9,18,19,20. Odpowiedzi na leczenie są szczególnie wrażliwe na mikrośrodowisko guza, odzwierciedlając zarówno wpływ krętości, ograniczonej dyfuzji, wysokiego ciśnienia śródmiąższowego i kwaśnego pH środowiska na dostarczanie leku, jak i wpływ niedotlenienia i innych aspektów mikrośrodowiska na odpowiedź na śmierć komórki9,17. Ponieważ środowisko w sferoidach 3D z natury rozwija wszystkie te właściwości7,8,9,10,11, zastosowanie hodowli komórkowych 3D może znacznie poprawić translację wyników na warunki in vivo, umożliwiając jednocześnie wydajne i niedrogie wysokoprzepustowe badania przesiewowe wzrostu netto. Jednak zdecydowana większość badań nad odpowiedzią komórek nowotworowych na leki jest nadal prowadzona w warunkach 2D. Prawdopodobnie odzwierciedla to fakt, że podczas gdy niektóre testy można stosunkowo łatwo wdrożyć w hodowlach komórek 3D, wiele z nich, takich jak testy żywotności, western blotting i analiza immunofluorescencyjna, jest znacznie wygodniej wykonywanych w 2D niż w 3D.
Celem obecnej pracy jest dostarczenie łatwo dostępnych testów i precyzyjnych protokołów do analiz wpływu leczenia lekami przeciwnowotworowymi na żywotność i przeżycie komórek rakowych w warunkach 3D naśladujących guz. W szczególności przedstawiamy i porównujemy trzy różne metody tworzenia sferoidów, a następnie metody jakościowych i ilościowych analiz wzrostu, żywotności i odpowiedzi na leki.