Komórki wykorzystują aktywny proces transportu do mobilizacji białek do określonych lokalizacji subkomórkowych i wywierają ścisłą czasoprzestrzenną regulację nad swoją funkcją1. Proces ten jest szczególnie ważny dla receptorów transbłonowych, ponieważ odpowiedzi komórkowe na różne bodźce środowiskowe opierają się na kaskadach wewnątrzkomórkowych wyzwalanych przez aktywację receptora. Komórki są w stanie modyfikować te odpowiedzi poprzez zmianę gęstości, lokalizacji i składu podjednostek receptorów wyrażających się na powierzchni komórki poprzez regulację transportu subkomórkowego receptora2. Wprowadzenie nowo zsyntetyzowanych receptorów do błony plazmatycznej, wraz z endocytozą i recyklingiem istniejących receptorów, to przykłady procesów transportowych, które określają pulę netto receptorów wyrażonych powierzchniowo2. Wiele mechanizmów molekularnych współpracuje w celu regulacji transportu białek, w tym interakcji białko-białko i modyfikacje potranslacyjne, takie jak fosforylacja, ubikwitynacja lub palmitoilacja2.
Regulacja transportu receptorów jest szczególnie wymagana w silnie spolaryzowanych komórkach o wysoce wyspecjalizowanych strukturach. Przykładem paradygmatycznym jest kontrola funkcji neuronów poprzez regulowany transport receptorów glutaminianu (GluRs)3,4. Glutaminian, główny neuroprzekaźnik pobudzający, wiąże i aktywuje GluR wyrażane powierzchniowo w celu kontrolowania podstawowych fizjologicznych funkcji neuronalnych, takich jak neurotransmisja synaptyczna i plastyczność synaptyczna. Fakt, że zmieniony transport GluR zaobserwowano w szerokim spektrum neuropatii, od zaburzeń neurorozwojowych po choroby neurodegeneracyjne, podkreśla znaczenie tego procesu5. W związku z tym zrozumienie zdarzeń molekularnych, które kontrolują transport GluR, jest interesujące w wielu obszarach badań.
W tym protokole, metoda oparta na podawaniu przeciwciał jest używana do ilościowego określenia poziomu GluR wyrażanych powierzchniowo w pierwotnych neuronach hipokampa, a także do oceny, jak zmiany w internalizacji i recyklingu skutkują obserwowaną ekspresją powierzchniową netto. Zastosowanie farmakologii i/lub nadekspresji receptorów egzogennych zawierających określone mutacje sprawia, że protokół ten jest szczególnie skutecznym podejściem do badania mechanizmów molekularnych leżących u podstaw adaptacji neuronów do różnych bodźców środowiskowych. Ostatnim przykładem użyteczności tego protokołu jest badanie, w jaki sposób wieloczynnikowe zmiany w środowisku (np. w modelach chorobowych) wpływają na transport GluR poprzez badanie ekspresji powierzchniowej w takich modelach.
Na konkretnych przykładach, początkowo pokazano, jak manipulacja farmakologiczna naśladująca fizjologiczną stymulację synaptyczną [chemiczną LTP (cLTP)] zwiększa powierzchniową ekspresję endogennej podjednostki GluA1 typu AMPA GluRs (AMPARs)6. Transportowanie nadeksprymowanej fosfo-mimetycznej formy podjednostki GluN2B GluR typu NMDA (NMDAR) jest również analizowane w celu zilustrowania, w jaki sposób protokół ten może być wykorzystany do badania regulacji transportu GluR przez określone modyfikacje potranslacyjne. Chociaż te konkretne przykłady są używane, protokół ten można łatwo zastosować do innych GluR oraz innych receptorów i białek, które posiadają antygenowe domeny zewnątrzkomórkowe. W przypadku, gdy nie ma dostępnych przeciwciał dla domen zewnątrzkomórkowych, nadekspresja białek znakowanych epitopami zewnątrzkomórkowymi (np. Flaga, Myc, GFP itp.) może pomóc w znakowaniu białek.
Obecny protokół zawiera instrukcje dotyczące ilościowego określania gęstości określonego podtypu GluR i transportu za pomocą specyficznych przeciwciał. Protokół ten można wykorzystać do badania 1) całkowitej ekspresji powierzchni GluR, 2) internalizacji GluR i 3) recyklingu GluR. Aby przestudiować każdy proces indywidualnie, zaleca się rozpoczęcie od sekcji 1 i 2, a następnie kontynuowanie w sekcji 3, 4 lub 5. We wszystkich przypadkach zakończ sekcjami 6 i 8 (Rysunek 1).