Protokół ten opisuje zakażenie skóry powszechnie stosowanym wsobnym szczepem myszy C57BL/6 przez Malassezia spp. Dostosowanie tego protokołu do innych szczepów myszy o innym tle genetycznym (np. Balb/c) lub do genetycznie zmodyfikowanych szczepów myszy może wymagać dostosowania dawki infekcji, punktu czasowego analizy itp. Aby zapewnić odtwarzalność, grupy myszy powinny być zawsze w tym samym wieku i tej samej płci. Źródło pochodzenia myszy powinno być utrzymywane na stałym poziomie, ponieważ nawet niewielkie zmiany w tle genetycznym i różnice w mikrobiocie, które istnieją między dostawcami i mogą występować nawet między różnymi jednostkami w jednym obiekcie hodowlanym, mogą mieć nieprzewidywalny wpływ na przebieg zakażenia. Podczas tworzenia modelu zakażenia Malassezia opisanego w niniejszym protokole zaleca się przeprowadzenie badania pilotażowego w celu dokładnego monitorowania przebiegu infekcji, w tym zakresu kolonizacji, kinetyki usuwania grzybów oraz stopnia stanu zapalnego i patologii, które mogą zostać wywołane (np. jeśli skóra ucha jest naruszona barierowo przed zakażeniem) w celu określenia optymalnych warunków testu.
W celu zapewnienia odtwarzalności i wiarygodnego wykrycia różnic między grupami doświadczalnymi, liczba zwierząt wykorzystanych w danej grupie musi być obliczona na podstawie analizy statystycznej. Wielkość próby oblicza się na podstawie wielkości efektu, wskaźnika błędów i mocy, które uwzględniają różnice biologiczne i eksperymentalne (np. spowodowane zmiennością układu odpornościowego). Ze względów etycznych należy unikać wykorzystywania niepotrzebnie dużej liczby zwierząt. Jeśli chodzi o infekcję skóry Malassezia , nie zaleca się leczenia grzyba tylko jednego ucha i używania drugiego ucha jako kontroli w tej samej myszy, ponieważ myszy mogą rozprzestrzeniać grzyba na oba uszy podczas pielęgnacji. Jednak użycie 1/2 ucha do różnych odczytów metodologicznych, takich jak określenie obciążenia grzybami, izolacja komórek odpornościowych lub analiza histologiczna, jest często wystarczające i powoduje znaczne zmniejszenie liczby zwierząt wykorzystywanych do eksperymentów.
Do tej pory opisano 18 różnych gatunków Malassezia . Różnice między- i wewnątrzgatunkowe w obrębie rodzaju Malassezia mogą wpływać na interakcję z gospodarzem, czego dowiedzieliśmy się również z badań nad innymi grzybami chorobotwórczymi dla ludzi13. Różne gatunki i szczepy Malassezia różnią się pochodzeniem (np . M. pachydermatis jest najczęstszym gatunkiem izolowanym od zwierząt, podczas gdy M. restricta, M. globosa i M. sympodialis są najbardziej widocznymi członkami mikrobiomu grzybiczego skóry u ludzi ze zmiennym rozmieszczeniem tych gatunków w różnych obszarach skóry). Niektóre gatunki są związane z komensalizmem, podczas gdy inne uważa się za bardziej chorobotwórcze, chociaż szczegółowe dowody pozostają stosunkowo słabe. Co ważne, niektóre gatunki i odmiany są z natury trudniejsze w uprawie niż inne. W związku z tym decyzja o tym, który gatunek/szczep należy wykorzystać do infekcji, musi opierać się na pytaniu badawczym.
Eksperymentalne zakażenie skóry myszy niektórymi organizmami drobnoustrojami, takimi jak Candida albicans lub Staphylococcus aureus, wymaga przerwania bariery naskórkowej przed zakażeniem, np. za pomocą papieru ściernego 14,15,16. W przeciwieństwie do tego, opisany tutaj model infekcji Malassezia jest równie skuteczny z przerwaniem bariery i bez niego7. Stopień zapalenia wywołanego przez grzyba jest znacznie zwiększony, jeśli skóra zostanie zdjęta z taśmy przed infekcją7. W związku z tym to, czy skóra powinna być manipulowana przed zastosowaniem Malassezia, zależy od pytania badawczego. Istnieją różne modele przewlekłego i ostrego zapalenia skóry (np. modele nadwrażliwości typu opóźnionego (DTH) i nadwrażliwości kontaktowej (CHS)) oraz modele niedoboru bariery, które mogą być interesujące dla badania udziału drożdży komensalnych w patologiach skóry.
Myszy wsobne utrzymywane w określonych warunkach wolnych od patogenów (SPF) nie są (według naszej wiedzy) naturalnie skolonizowane Malassezia. W związku z tym eksperymentalne zastosowanie Malassezia na skórę ucha myszy stanowi pierwotne narażenie na grzyba, które wywołuje ostrą odpowiedź u gospodarza, co z kolei prowadzi do usunięcia grzybów w ciągu 1 - 2 tygodni7. Chociaż model opisany w tym protokole tylko częściowo odzwierciedla sytuację u immunokompetentnych ludzi lub innych organizmów gospodarza, które są trwale skolonizowane przez Malassezia, eksperymentalna infekcja daje szerokie okno możliwości zbadania odporności przeciwgrzybiczej oraz mechanizmów komórkowych i molekularnych, które leżą u podstaw tej odpowiedzi. Pozwala również na badanie różnic w reakcji na różne gatunki i szczepy Malassezia w różnych warunkach eksperymentalnych (np. z naruszeniem bariery skórnej i bez niej).
Badania nad interakcjami Malassezia - gospodarz były w przeszłości ograniczone do eksperymentów in vitro na izolowanych typach komórek w hodowlach (np. linie komórkowe keratynocytów, PBMC). Chociaż badania te rzuciły nieco światła na determinanty grzybów i gospodarza, które kształtują wzajemne oddziaływanie między Malassezia a gospodarzem17, nie pozwalają one na kompleksowe zrozumienie interakcji grzyb - gospodarz w złożonym środowisku skóry, które obejmuje wiele typów komórek, które są w ciągłej komunikacji, takich jak keratynocyty, fibroblasty i rezydujące w tkankach komórki odpornościowe, ale także populacje leukocytów, które infiltrują tkankę dopiero po kontakcie mikrobiologicznym ze skórą. Ta wielokomórkowa sieć nie może być w pełni odtworzona w modelach in vitro, nawet w przypadku najbardziej zaawansowanych systemów organoidowych. Tak więc eksperymentalne zakażenie myszy nadal stanowi złoty standard w badaniach nad immunologią i chorobami zakaźnymi, a dostępność opisanego tutaj modelu stanowi przełom w dziedzinie badań nad Malassezia . Co ważne, model ten opiera się na naskórkowym zastosowaniu Malassezia na niezakłóconą skórę ucha myszy i nie implikuje inokulacji grzyba przez wstrzyknięcie do tkanki, np. podskórnie lub dootrzewnowo,jak wykazały poprzednie badania, z których oba są bardziej odległe od sytuacji u naturalnie skolonizowanych gospodarzy.
Możliwość połączenia opisanego w tym protokole modelu infekcji Malassezia z innymi dostępnymi modelami myszy znacznie zwiększa zakres i elastyczność aplikacji. Te ostatnie obejmują różne modele określonych chorób skóry, takie jak model niedoboru bariery, który naśladuje ważne cechy atopowego zapalenia skóry, choroby związanej z Malassezia zarówno u ludzi, jak i psów. Co więcej, naskórkowe zakażenie skóry Malassezia można łatwo zastosować u myszy z wadami genetycznymi w genach gospodarza będących przedmiotem zainteresowania lub myszy, u których interesujący typ komórki jest genetycznie usunięty lub może być farmakologicznie zubożony (np. poprzez podawanie toksyny błoniczej myszom z ekspresją receptora toksyny błoniczej). Takie modele stanowią nieuniknione narzędzie do analizy odpowiedzi gospodarza na drobnoustroje komensalne i chorobotwórcze, w tym Malassezia, oraz do oceny roli tych genów i typu komórki w interakcji grzyb-gospodarz. Analizy interakcji skórnej Malassezia-gospodarz mogą być rozszerzone daleko poza to, co opisano w niniejszym protokole. Obejmują one analizy histologiczne (np. w celu określenia stopnia patologii skóry lub pogrubienia naskórka wywołanego przez grzyba), immunohistochemiczne lub barwienie immunofluorescencyjne skrawków tkanek przy użyciu przeciwciał skierowanych przeciwko markerom specyficznym dla typu komórki lub innym cząsteczkom będącym przedmiotem zainteresowania. Może również obejmować izolację komórek (np. podzbiorów leukocytów rezydujących w tkance lub naciekających tkanki) z zakażonej tkanki skórnej w celu dogłębnego zbadania polaryzacji, regulacji i dynamiki odpowiedzi immunologicznej na Malassezia .