Przedstawiono protokół do wizualizacji 3D mikroskopijnych struktur tkanek za pomocą metody barwienia specyficznego dla promieniowania rentgenowskiego, przeznaczonej do rentgenowskiej tomografii komputerowej.
Artykuł metodologiczny
* These authors contributed equally
Przedstawiono protokół do wizualizacji 3D mikroskopijnych struktur tkanek za pomocą metody barwienia specyficznego dla promieniowania rentgenowskiego, przeznaczonej do rentgenowskiej tomografii komputerowej.
Demonstrujemy laboratoryjną metodę łączącą mikrotomografię rentgenowską i nanoCT ze specyficznym barwieniem rentgenowskim, które celuje w cytoplazmę komórki. Opisany protokół jest łatwy w aplikacji, szybki i odpowiedni dla większych próbek tkanek miękkich. Przedstawiona metodologia umożliwia scharakteryzowanie kluczowych struktur tkankowych w trzech wymiarach i jest demonstrowana na całej nerce myszy. Podejście wieloskalowe pozwala na zobrazowanie całej nerki myszy i wspiera wybór dalszych interesujących nas objętości, które są pozyskiwane w wyższych rozdzielczościach w zakresie nanometrów. W ten sposób odtwarzana jest morfologia tkanek miękkich o podobnym poziomie szczegółowości, jak odpowiadające jej obrazy histologicznej mikroskopii świetlnej. Za pomocą metod histologicznych uzyskuje się głębszy wgląd w konfigurację 3D struktur tkankowych bez utrudniania dalszych badań.
Pełna charakterystyka próbek tkanek miękkich wymaga informacji o mikrostrukturze tkanek 3D. Obecnie złotym standardem w analizie próbek tkanek miękkich jest histopatologia. Morfologia tkanek i komórek próbki jest badana w 2D w wybranych obszarach zainteresowania (ROI) za pomocą mikroskopii optycznej1. Ta metoda ma jednak kilka wad. Przygotowanie próbki jest czasochłonne, skomplikowane, destrukcyjne i podatne na artefakty. Produkowane preparaty mikroskopowe dostarczają jedynie informacji 2D równolegle do płaszczyzny przekroju. Często liczba badanych sekcji histologicznych jest ograniczona ze względu na ograniczenia czasowe2,3.
W ostatnich latach dziedzina histologii 3D ewoluowała. Tutaj dostępne są wirtualne wycinki tkanek z dowolnej pożądanej płaszczyzny przestrzennej. Pozwala to na śledzenie struktur w całej próbce, co prowadzi do głębszego zrozumienia architektury tkanek 3D i zmian strukturalnych związanych z różnymi patologiami. Opracowano różne metody generowania danych objętościowych 3D. Obejmują one zarówno podejścia oparte na przekrojach seryjnych, które wykorzystują mikroskopię świetlną lub elektronową4,5,6,7,8, jak i metody obrazowania blokowego, takie jak episkopowe obrazowanie 3D lub skaningowa mikroskopia elektronowa7,8,9. Wszystkie wymienione metody polegają jednak na przecięciu lub całkowitym zniszczeniu próbki, co nie pozwala na dalsze badania. Uzyskana rozdzielczość jest w dużym stopniu zależna od tego, czy proces cięcia jest podatny na artefakty, jak opisano w konwencjonalnej histologii. Te metody cierpią również z powodu artefaktów wyrównania.
Techniki obrazowania rentgenowskiego 3D, takie jak mikroskopowa i nanoskopowa tomografia komputerowa (mikroCT i nanoCT) dążą do generowania danych 3D o wysokiej rozdzielczości bez niszczenia próbki tkanki. Do tej pory słaby kontrast tłumienia promieniowania rentgenowskiego tkanek miękkich i ograniczony dostęp do wysokich rozdzielczości w środowisku laboratoryjnym utrudniały ich wykorzystanie do wizualizacji 3D mikroskopijnych struktur tkankowych. Ostatnie postępy w kierunku laboratoryjnej tomografii komputerowej o wysokiej rozdzielczości pozwalają na uzyskanie rozdzielczości znacznie poniżej 1 μm10,11,12,13.
Brak kontrastu w tkance miękkiej w konwencjonalnym obrazowaniu rentgenowskim opartym na tłumieniu jest kompensowany przez środki barwiące, które zwiększają kontrast tłumienia promieniowania rentgenowskiego. Często stosuje się środki barwiące znane z innych technik obrazowania, takie jak tetratlenek osmu (OsO4), jodek jodu potasu (IKI) czy kwas fosfowolframowy (PTA)14,15,16,17,18,19,20,21, 22,23,24,25. Środki barwiące, które pozwalają na (i) specyficzne ukierunkowanie biologiczne, (ii) jednorodne i całkowite barwienie, (iii) łatwą obsługę, (iv) szybką penetrację tkanki bez tworzenia artefaktów, takich jak pierścienie dyfuzyjne, (v) duże i gęste barwienie tkanek oraz (vi) pełną kompatybilność z histopatologią, są wymagane do ustanowienia rentgenowskiej tomografii komputerowej jako narzędzia do wizualizacji 3D mikroskopijnych struktur tkankowych. W tej pracy pokazujemy, w jaki sposób próbki tkanek miękkich są przygotowywane do obrazowania rentgenowskiego za pomocą specyficznego dla cytoplazmy barwienia rentgenowskiego na bazie eozyny, które spełnia wymagania określone powyżej26.
Podejście do obrazowania wieloskalowego zapewnia ocenę jakości barwienia poprzez przegląd pomiarów mikrotomografii komputerowej i wybór interesujących objętości (VOI) do dalszych badań w wysokiej rozdzielczości. Jakość barwienia jest analizowana, koncentrując się na parametrach barwienia, takich jak (i) kompletność, (ii) wygląd pierścieni dyfuzyjnych, (iii) wzmocnienie kontrastu, (iv) pojawienie się artefaktów CT, takich jak smugi i (v) jednorodność. Laboratoryjna matryca nanoCT, która wykorzystuje powiększenie geometryczne do osiągnięcia rozdzielczości do 100 nm, wizualizuje morfologię tkanek miękkich na poziomie (sub)komórkowym10,27. Analiza porównawcza wycinków nanoCT z odpowiadającymi im obrazami histologicznej mikroskopii świetlnej potwierdza odtworzenie architektury tkankowej z podobną szczegółowością na poziomie mikroskopowym w 2D, umożliwiając histopatologiczną charakterystykę próbki tkanki. Ten szczegółowy protokół wideo ma na celu zwiększenie świadomości i podkreślenie potencjału tej metodologii jako nieniszczącego narzędzia do obrazowania tkanek miękkich 3D, które jest przedmiotem zainteresowania szerokiej społeczności naukowej, takiej jak zoolodzy, biolodzy i pracownicy służby zdrowia.
Uwaga: Proszę zapoznać się ze wszystkimi odpowiednimi kartami charakterystyki substancji niebezpiecznej (MSDS) przed użyciem. Kilka substancji chemicznych użytych w protokole jest silnie toksycznych i rakotwórczych. Podczas wykonywania protokołu barwienia należy stosować wszystkie odpowiednie praktyki bezpieczeństwa, w tym stosowanie kontroli inżynieryjnych (dygestoria, komora podręczna) i środków ochrony osobistej (okulary ochronne, rękawice, fartuch laboratoryjny, spodnie na całej długości, buty z zakrytymi palcami).
Wykorzystane zwierzęta:
Hodowla zwierząt została przeprowadzona w Klinikum rechts der Isar Uniwersytetu Technicznego w Monachium zgodnie z wytycznymi Unii Europejskiej 2010/63. Pobranie narządów zostało zatwierdzone przez wewnętrzną komisję ochrony zwierząt w Klinikum rechts der Isar, Monachium, Niemcy (numer wewnętrzny 4-005-09). Wszystkie procedury były zgodne z odpowiednimi wytycznymi i przepisami. Wszystkie laboratoria są kontrolowane pod kątem zgodności z zasadami dobrej praktyki laboratoryjnej OECD.
1. Protokół barwienia eozyny
2. Obrazowanie rentgenowskie mikrotomografii
komputerowejUWAGA: Pomiary rentgenowskie mikroCT zostały wykonane za pomocą skanera mikroCT, który oferuje przegląd pomiarów CT (możliwość obrazowania całej próbki w polu widzenia (FOV)) oraz wykonywanie pomiarów CT o wysokiej rozdzielczości (możliwość skupienia się na jednej pożądanej objętości zainteresowania (VOI) tej samej próbki) do 1 μm.
3. Obrazowanie rentgenowskie nanoCT
UWAGA: Skaner rentgenowski nanoCT został opracowany wewnętrznie. Przyrząd bez soczewek jest wyposażony w nanoogniskowe źródło promieniowania rentgenowskiego i detektor zliczający pojedyncze fotony. Można generować dane 3D o rozdzielczości do 100 nm10. Ogólnie rzecz biorąc, systemy nanoCT, w tym te z optyką rentgenowską, są dostępne na rynku i nie ograniczają się do opisywanego skanera nanoCT.
Rysunek 1 przedstawia przekroje tomograficzne i wizualizację objętościową danych mikrotomografii niskiej rozdzielczości, ukazującą wzmocnienie kontrastu po barwieniu. Rysunek 2 przedstawia przekroje tomograficzne i wizualizację objętościową danych mikrotomografii wysokiej rozdzielczości uzyskanych z tomografii lokalnej całych nerek myszy. Rysunek 3 przedstawia przekroje tomograficzne danych nanoCT w porównaniu z odpowiadającymi im sekcjami histologicznymi. Rysunek 4 przedstawia przekrój tomograficzny i wizualizację objętościową danych nanoCT, podkreślając szczegóły strukturalne na poziomie komórkowym. Pomiar mikrotomografii niskiej rozdzielczości pozwala na obejrzenie całego organu i pomaga zidentyfikować objętości zainteresowania (VOI) do pomiaru mikrotomografii wysokiej rozdzielczości. Dzięki temu podejściu wieloskalowemu wyznacza się VOI do nanoCT. NanoCT umożliwia bardzo szczegółowy obraz próbek tkanek miękkich na poziomie komórkowym. Badanie porównawcze z odpowiadającymi sekcjami histologicznymi podkreśla pełną zgodność z histopatologią. W tym przypadku wielomodalne podejście obrazowe potwierdza wyniki uzyskane za pomocą obu metod.

Rycina 1. Przekroje CT i renderowanie objętościowe danych mikrotomografii niskiej rozdzielczości. (a,b) Obrazy przeglądowe tej samej nerki myszy przed i po kontrastowaniu, odpowiednio, z uwypukleniem efektu zwiększenia kontrastu uzyskanego po zastosowaniu protokołu barwienia na bazie eozyny. Obie serie danych mikrotomografii uzyskano przy użyciu identycznych parametrów akwizycji. Wielkość wokseli w obu zestawach danych wynosi 12 µm. Poprawa kontrastu osiągnięta na obrazie (b) umożliwia identyfikację następujących anatomicznych obszarów strukturalnych: Kora (I), rdzeń zewnętrzny (II), dalsze podzielenie na paski zewnętrzne rdzenia zewnętrznego (IIa) i paski wewnętrzne rdzenia zewnętrznego (IIb), rdzeń wewnętrzny (III), brodawka (IV) oraz miedniczka nerkowa (V). (c) Renderowanie objętościowe danych mikrotomografii przedstawiające wirtualny przekrój strzałkowy przez całą nerkę myszy. Rycina została zmodyfikowana z pracy Busse i Müller et al.26 Kliknij tutaj, aby obejrzeć powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 2. Przekrój CT i renderowanie objętościowe danych mikro-CT o wysokiej rozdzielczości uzyskanych z tego samego nerkowca po zastosowaniu opracowanego protokołu barwienia na bazie eozyny. (a) W lewym rogu pokazano obraz ogólny mikro-CT z zaznaczonym obszarem zainteresowania (niebieskie pole), dla którego przedstawiono obraz o wysokiej rozdzielczości. Można rozróżnić następujące anatomiczne struktury: Kora (I), rdzeń zewnętrzny (II) z dalszym podziałem na paski zewnętrzne rdzenia zewnętrznego (IIa) i paski wewnętrzne rdzenia zewnętrznego (IIb), rdzeń wewnętrzny (III), mała miedniczka (IV) oraz naczynia (V i VI). (b) Renderowanie objętości zainteresowania na podstawie danych mikro-CT o wysokiej rozdzielczości uzyskanych przy rozmiarze wokseli 3,3 µm. Pokazano region rdzenia oraz przekrój wirtualny przez naczynie uzyskany z tomografii lokalnej całej nerki. Rycina została zmodyfikowana na podstawie pracy Busse i Müller et al.26. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej rycin.

Rycina 3. Przekroje CT danych nanoCT (a,b) w porównaniu z przekrojami histologicznymi (c,d) pochodzącymi z tego samego nerkowego próbki myszy po zastosowaniu opracowanego protokołu barwienia na bazie eozyny. (a) Obraz nanoCT tej samej próbki nerki myszy po barwieniu, dysekcji i krytycznym suszeniu (CPD) pokazuje szczegółową strukturę regionu (IIb) widocznego na Rycinie 1 i Rycinie 2. Struktury te są znane jako grube wstępujące odcinki pętli Henlego. (b) Przekrój z minimalną projekcją intensywności pochodzący z tego samego zestawu danych nanoCT pokazanego na (a), o wirtualnej grubości przekroju wynoszącej około 7 µm, umożliwiający wyraźną wizualizację jąder komórkowych. (c) Reprezentatywny przekrój histologiczny przedstawiający grube wstępujące odcinki pętli Henlego z wyraźną wizualizacją jąder komórkowych i granicą szczoteczkową. Przekrój histologiczny ma grubość około 7 µm i został uzyskany z tej samej próbki nerki myszy po zastosowaniu barwienia eozyną i utrwaleniu w bloku parafinowym. (d) Reprezentatywny przekrój histologiczny z zastosowaniem barwnika kontrastującego hematoksyliny, podkreślającego jądra komórkowe na fioletowo. Przygotowanie przekroju histologicznego blisko położonego do przekroju pokazanego na (c) o przybliżonej grubości 7 µm. Rycina została zmodyfikowana z pracy Busse i Müller et al.26 Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 4. Przekrój tomografii i renderowanie objętościowe danych nanoCT. (a) Obraz nanoCT tego samego próbnika nerki myszy, pokazujący struktury znane jako grube wstępujące ramiona pętli Henlego. Jest to szczegółowy widok obszaru (IIb) widocznego na Rycinie 1 i Rycinie 2, uzyskany z małego fragmentu nerki przy rozmiarze wokseli wynoszącym około 400 nm. Przygotowanie próbnika obejmowało barwienie, mikrotomowanie i suszenie krytycznopunktowe (CPD). (b) Renderowanie objętościowe danych nanoCT wizualizujące trójwymiarową strukturę grubszych wstępujących ramion pętli Henlego. Rycina została zmodyfikowana na podstawie prac Busse i Müllera i wsp.26 Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tego obrazu.
Obecnie eozyna jest stosowana jako standardowy protokół histologiczny do znakowania cytoplazmy komórki. Środek barwiący nakłada się w postaci 0,1% (w/v) roztworu wodnego na mikroskopijne wycinki tkanek miękkich (zwykle cięte o grubości 2-10 μm)33. Zastosowanie tego znormalizowanego protokołu histologicznego do próbek tkanek 3D, takich jak cała nerka myszy, nie powoduje uzyskania obrazu CT ze wzmocnieniem kontrastu tłumienia. Z jednej strony można to przypisać niskim właściwościom tłumienia wewnętrznego tkanek miękkich dla zwykle stosowanych energii promieniowania rentgenowskiego w laboratoryjnych systemach mikrotomografii komputerowej. Zwykle tkanka miękka składa się głównie z węgla, wodoru, tlenu i azotu34, a zatem nie powoduje wzmocnienia kontrastu. Z drugiej strony, czynnikiem ograniczającym było niskie stężenie eozyny używanej do barwienia. Mimo że jedna cząsteczka eozyny zawiera cztery atomy bromku (pierwiastek bromu o wysokiej liczbie atomowej o Z = 3534), poziomy czułości wymagane do obrazowania rentgenowskiego TK nie zostały spełnione.
Aby sprostać temu wyzwaniu, jakim jest kontrast o niskim tłumieniu, zbadano kilka stężeń eozyny. Ograniczeniem jest tutaj maksymalna rozpuszczalność eozyny w wodzie, która wynosi 30% (w/v) w roztworze wodnym. Najlepsze wzmocnienie kontrastu tłumienia w obrębie tkanek miękkich zaobserwowano przy najwyższym stężeniu eozyny, którego oczekiwano zgodnie z prawem Lamberta-Beera. W związku z tym przeprowadzono końcowy protokół barwienia z najwyższym stężeniem.
Na pytanie, jak optymalnie przygotować tkankę miękką na poziomie molekularnym do procedury barwienia, aby jeszcze bardziej poprawić wzmocnienie kontrastu, odpowiedziano poprzez dostosowanie pH. W tym przypadku kluczowe okazało się zakwaszenie próbki tkanek miękkich podczas utrwalania lub przed barwieniem. Zostało to również wykazane przez Hong i wsp.35. Większą akumulację czynnika barwiącego w cytoplazmie komórki przez kwas osiągnięto dzięki poprawie oddziaływań jonowych, które były wynikiem protonowania łańcuchów bocznych aminokwasów białek i peptydów obecnych w cytoplazmie komórki. Reprezentatywny wynik podkreślający wzmocnienie kontrastu w porównaniu z niebarwioną próbką tkanek miękkich przedstawiono na rysunku 1a,b. W tym przypadku uzyskano przegląd strukturalny całej nerki myszy, wizualizujący kluczowe obszary anatomiczne, takie jak kora, rdzeń, brodawka i miedniczka nerkowa.
Prezentowany protokół barwienia jest prosty w aplikacji i składa się tylko z trzech kroków. Wymagane odczynniki są łatwo dostępne. Całkowity czas barwienia wynoszący 24 godziny jest szybki w przypadku barwienia całego narządu, co umożliwia wizualizację 3D próbek tkanek miękkich (Rysunek 1c, Rysunek 2b i Rysunek 4b) w środowisku laboratoryjnym w wielu skalach aż do poziomu komórkowego. Należy zauważyć, że całkowity czas barwienia i objętość potrzebnego roztworu barwiącego mogą wymagać pewnych dostosowań w zależności od charakteru próbki. Niemniej jednak protokół barwienia oparty na eozynie nadaje się do barwienia całych narządów, co umożliwia obrazowanie całych narządów za pomocą mikrotomografii komputerowej o wysokiej rozdzielczości. Nie zaobserwowano artefaktów skurczu spowodowanych rozpuszczalnikiem etanolem, który był używany do utrzymywania wilgoci próbki podczas pomiarów mikrotomografii komputerowej. W przypadku obrazowania nanoCT, które pozwala na badanie mniejszych fragmentów tkanek pobranych z oryginalnej próbki, wymagane są dodatkowe etapy przygotowawcze. Jeśli chodzi o przyszłe zastosowania histopatologiczne, skany przeglądowe dostarczą cennych informacji na temat zmienionych regionów i struktur anatomicznych, co pozwoli na określenie ROI, jak pokazano na rycinie 2a. Można je badać w 3D za pomocą mikrotomografii komputerowej (ryc. 1c i ryc. 2b) lub nanotomografii komputerowej (ryc. 4b) i oceniać w 2D z histologią (ryc. 3).
Kolejną mocną stroną protokołu jest pełna zgodność z histopatologią w odniesieniu do procedury barwienia H&E. Zastosowanie procedury barwienia na bazie eozyny do próbek zbiorczych nie utrudnia dalszych badań histologicznych (ryc. 3), mimo że zastosowane stężenie eozyny jest znacznie wyższe w porównaniu z roztworem do barwienia histologicznego. Wycinek nanoCT o wirtualnej grubości około 400 nm (ryc. 3a) wypada już bardzo dobrze w porównaniu z przekrojem histologicznym (ryc. 3c), który pochodził z odpowiedniej próbki tkanek miękkich. Biorąc pod uwagę przybliżoną grubość przekroju histologicznego wynoszącą 7-10 μm, wygenerowanie warstw projekcji o minimalnej intensywności danych nanoCT (rysunek 3b), które odpowiadają wirtualnej grubości około 7 μm, pozwala na lepsze porównanie z przekrojem histologicznym (rysunek 3c). W tym przypadku jądra komórkowe są wyraźnie widoczne jako obszar nieatenuacyjny, ponieważ eozyna specyficznie barwi białka i peptydy w cytoplazmie komórki33.
Możliwe jest zastosowanie dalszego barwienia przeciwstawnego standardowymi metodami histologicznymi, nawet jeśli kolejność barwienia w porównaniu ze standardową procedurą barwienia histologicznego została odwrócona. Rozpoczęcie od opracowanego protokołu barwienia opartego na eozynie do tomografii komputerowej, a następnie barwienie przeciwstawne tych histologicznych skrawków opartych na eozynie za pomocą hematoksyliny, pozwala na pełną kompatybilność i skutkuje wysokiej jakości barwieniem wykazującym oczekiwaną formę wyglądu. Specyficzne dla jąder komórkowych barwienie kwaśną hematoksyliną Mayera zastosowano do przekroju histologicznego, podkreślając jądra komórkowe na fioletowo (ryc. 3d). Stosowanie histologicznego barwienia przeciwstawnego jest obecnie ograniczone do barwienia H. Należy ocenić inne standardowe histologiczne barwienia przeciwstawne, takie jak kwas periodyczny, zasada Schiffa, Elastica van Gieson lub srebro Gomori, a także przetestować zgodność z technikami immunohistologicznymi.
Protokół barwienia oparty na eozynie pozwala na (i) celowanie specyficzne dla cytoplazmy komórek, (ii) jednorodne i całkowite barwienie, (iii) łatwą implementację, (iv) szybką penetrację tkanki bez tworzenia artefaktów, takich jak pierścienie dyfuzyjne, (v) barwienie dużych i gęstych próbek tkanek miękkich oraz (vi) pełną zgodność z histopatologią w odniesieniu do barwienia H&E. Wymagania te są ważne, aby umożliwić wizualizację tkanek miękkich za pomocą tomografii komputerowej o wysokiej rozdzielczości aż do poziomu komórkowego. W połączeniu z niedawno opracowanymi urządzeniami nanoCT 12,36,37 możliwe jest nieniszczące generowanie wirtualnych wycinków histologicznych, które są porównywalne pod względem kontrastu i rozdzielczości z konwencjonalnymi danymi histologicznymi. To połączone podejście umożliwi ustanowienie tomografii rentgenowskiej jako cennego narzędzia do wizualizacji 3D mikroskopijnych struktur tkankowych.
Autorzy nie mają nic do ujawnienia.
Dziękujemy Dr. Enkenowi Drecollowi za dyskusje histologiczne i niezwykle pomocny zespół z Excillum AB, Szwecja. Dziękujemy za wsparcie finansowe za pośrednictwem Klastra Doskonałości DFG, Monachijskiego Centrum Zaawansowanej Fotoniki (MAP) oraz Programu DFG im. Gottfrieda Wilhelma Leibniza. Ponadto projekt badawczy uzyskał dofinansowanie z programu Unii Europejskiej w zakresie badań naukowych i innowacji Horyzont 2020 w ramach umowy o udzielenie dotacji "Maria Skłodowska-Curie" nr H2020-MSCA-IF-2015-703745-CONSALT.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| 50-ml probówka wirówkowa firmy Falcon | VWR | 734-0453 | |
| Roztwór formaldehydu, 37% | Carl Roth | CP10.2 | bezkwasowy, stabilizowany ~10% MeOH |
| Lodowaty kwas octowy | Alfa Aesar | 36289.AP | |
| Sól disodowa eozyny Y | Sigma-Aldrich | E4382 | certyfikowany przez Biological Stain Commission |
| Sól fizjologiczna buforowana fosforanami (PBS) | Merck | L1825 | Forma Dulbecco, bez wapnia i magnezu |
| Probówki na próbki firmy Nalgene | Carl Roth | ATK5.1 | |
| Wytrząsarka na biegunach ST5 | CAT | 60281-0000 | |
| Bibułka celulozowa | VWR | 115-0600 | |
| Kleszcze, firmy USBECK Laborgerä Te | VWR | 232-0096 | |
| Probówki do mikrowirówek firmy Eppendorf | VWR | 211-2120 | Safe-lock, 2,0 ml |
| Absolut etanolu firmy Baker Analizowane | VWR | 80252500 | |
| jednorazowego użytku firmy Aesculap | VWR | ||
| szalka Petriego firmy Sterilin | VWR | 391-2019 | |
| Plastikowa pipeta Pasteura | Carl Roth | EA68.1 | z podziałką, 1 ml |
| Eksykator firmy Duran | VWR | SCOT247826954 | |
| Smar silikonowy firmy Bayer | Sigma-Aldrich | 85404 | wysokopróżniowy |
| Butla na dwutlenek węgla ze stojakiem | Linde | 3700113 | 10 kg, krótki |
| mikroporowata kapsułka zabiegowa | PLANO GmbH | 4614 | wielkość porów 78 i mikro; m (B) |
| Bal-Tec CPD 030 | Bal-Tec AG | CO2 jako środek osuszający | |
| Mikroskop stereoskopowy Stemi 2000-C z wyświetlaczem LCD KL 1500 | Zeiss | ten mikroskop stereoskopowy został zaktualizowany(1) | |
| Zeiss Xradia Versa 500 | Zeiss | ten skaner mikroCT został zaktualizowany(2) | |
| Avizo Fire 8.1 | Thermo Fisher Scientific | ||
| Detektor PILATUS jako część skanera nanoCT | Detektor zliczania pojedynczych fotonów Dectris (4,5) dostępne na rynku systemy nanoCT (6,7) | ||
| wysokostrumieniowa lampa transmisyjna promieniowania rentgenowskiego nanofokus(3); dostępne na rynku systemy nanoCT (6,7) | |||
| >(1) Niemcy, Z. Informacje o produkcie ZEISS: Mikroskopy stereoskopowe ZEISS https://www.micro-shop.zeiss.com/de/de/system/Stereomikroskope/1006> (06 września 2019 r.). | |||
| (2) Niemcy, Z. Informacje o produkcie ZEISS: ZEISS Xradia 510 Versa https://www.zeiss.com/microscopy/int/products/x-ray-microscopy/zeiss-xradia-510-versa.html> (10 kwietnia 2019 r.). | |||
| (3) Nachtrab, F. et al. Opracowanie detektora opartego na Timepix dla projektu NanoXCT. Dziennik Oprzyrządowania 10 (11), C11009, (2015). | |||
| (4) Kraft, P. i wsp. Wydajność modułów detektora PILATUS zliczających pojedyncze fotony. Dziennik Promieniowania Synchrotronowego 16 (3), 368-375, (2009). | |||
| (5) Kraft, P. i wsp. Charakterystyka i kalibracja detektorów PILATUS. IEEE Transactions on Nuclear Science 56 (3), 758-764, (2009). | |||
| (6) Niemcy, Z. Informacje o produkcie ZEISS: ZEISS Xradia 810 Ultra https://www.zeiss.com/microscopy/int/products/x-ray-microscopy/xradia-810-ultra.html> (9 kwietnia 2019 r.). | |||
| (7) Firma, GE Informacje o produkcie: Phoenix nanotom m, https://www.gemeasurement.com/sites/gemc.dev/files/geit-31344en_nanotom_m_0517.pdf> (10 kwietnia 2019 r.). |