Ludzki gruczoł krokowy zawiera nabłonek świetlny z funkcją wydzielniczą i komórki podstawne leżące pod nim wraz z niezwykłym składnikiem komórek neuroendokrynnych. Komórki nabłonkowe, w tym przypadku, są generowane z rzadkiej populacji komórek macierzystych prostaty, które są stosunkowo spokojne in vivo i działają jako system naprawczy w celu utrzymania homeostazy gruczołów przez całe życie1. Pomimo wielu postępów, identyfikacja i funkcjonalna izolacja komórek macierzystych gruczołu krokowego pozostaje głównym wyzwaniem w tej dziedzinie. Biomarkery komórek macierzystych, w tym metodologie oparte na markerach powierzchniowych komórek w połączeniu z cytometrią przepływową, są powszechnie stosowane w badaniach nad komórkami macierzystymi2,3,4. Jednak wyniki wzbogacania i izolacji różnią się znacznie w zależności od kombinacji markerów i swoistości przeciwciał5,6, co rodzi pytania o tożsamość izolowanych komórek. Innym szeroko stosowanym podejściem do wzbogacania komórek macierzystych jest trójwymiarowa (3D) hodowla sferoidalna2,3,4. Podczas gdy rezydentne komórki macierzyste są stosunkowo spokojne in vivo z ograniczeniami niszowymi, przechodzą podział komórek w hodowli matrycowej 3D (zarówno symetrycznej, jak i asymetrycznej), generując zarówno komórki macierzyste, jak i progenitorowe, które szybko rozmnażają się w kierunku zobowiązania linii7,8. Utworzone sferoidy są niejednorodną mieszaniną zawierającą zarówno komórki macierzyste, jak i komórki progenitorowe na różnych etapach zaangażowania w linię, w tym komórki progenitorowe we wczesnym i późnym stadium. W związku z tym testy z wykorzystaniem całych sferoid nie są przeznaczone wyłącznie dla komórek macierzystych, co sprawia, że identyfikacja unikalnych właściwości komórek macierzystych jest niejednoznaczna. Dlatego tak ważne jest stworzenie testów w celu identyfikacji i oddzielenia komórek macierzystych prostaty od ich potomnych przodków. W tym celu celem obecnego protokołu jest ustanowienie systemu testów, który pozwoli na skuteczną identyfikację i izolację komórek macierzystych z tkanek ludzkiej prostaty, a następnie dogłębną analizę ich funkcji biologicznych.
Długoterminowe przechowywanie znaczników 5-bromo-2'-deoksyurydyny (BrdU) jest szeroko stosowane do śledzenia linii komórkowych in vivo i in vitro na podstawie ich przedłużonego czasu podwojenia9,10. Obecne podejście do identyfikacji i izolacji komórek macierzystych gruczołu krokowego opisane w niniejszym dokumencie opiera się na ich względnej charakterystyce spoczynkowej i właściwościach zatrzymywania etykiet w mieszanej populacji nabłonkowej. Ponadto, w oparciu o hipotezę nieśmiertelnej nici DNA, tylko komórki macierzyste mogą ulegać asymetrycznemu podziałowi komórkowemu. Komórka macierzysta reprezentuje komórkę potomną, która zawiera starsze rodzicielskie DNA, podczas gdy komórka progenitorowa, która jest zaangażowaną komórką potomną, otrzymuje nowo zsyntetyzowane DNA. Opisana powyżej unikalna właściwość komórek macierzystych jest wykorzystywana do znakowania BrdU w rodzicielskich komórkach macierzystych w hodowlach pierwotnych, a następnie śledzenia ich etykiety po wypłukaniu BrdU po przeniesieniu do hodowli sferoidalnej 3D bez kotwicy. Podczas gdy większość pierwotnych komórek nabłonka prostaty zachowuje fenotyp podstawowy i amplifikujący tranzyt w hodowli 2D, istnieje również rzadka populacja multipotencjalnych komórek macierzystych, które uzupełniają i utrzymują homeostazę nabłonka, o czym świadczy tworzenie sferoidów lub w pełni zróżnicowanych organoidów z odpowiednimi pożywkami hodowlanymi po przeniesieniu do systemów 3D3,12. W naszym obecnym protokole, używając sferoidów prostaty HPrEC lub testów retencji BrdU, CFSE lub Far Red opartych na prostasferze, a następnie sortowania komórek aktywowanych fluorescencją (FACS), identyfikujemy komórki macierzyste zachowujące znaczniki w sferoidach na poziomie pojedynczej komórki13.
Co ważne, dodatkowo potwierdziliśmy cechy komórek macierzystych komórek zachowujących etykietę we wczesnych stadiach sferoid w porównaniu z komórkami progenitorowymi z zaangażowaniem w linię. Należą do nich asymetryczny podział komórek macierzystych, zdolność do tworzenia sferoidów in vitro i zdolność do regeneracji tkanek in vivo, podwyższona aktywność autofagii, zwiększona biogeneza rybosomów i zmniejszona aktywność metaboliczna. Następnie przeprowadzono analizę RNAseq. Zaobserwowano geny o zróżnicowanej ekspresji w komórkach sferoidalnych zachowujących etykiety, które mogą służyć jako nowe biomarkery dla ludzkich komórek macierzystych prostaty. To oparte na sferoidach podejście do zachowywania etykiet może mieć zastosowanie do próbek nowotworów w celu podobnej identyfikacji niewielkiej liczby nowotworowych komórek macierzystych, zapewniając w ten sposób możliwości translacyjne do zarządzania populacjami opornymi na leczenie13. Poniżej przedstawiono test retencji znaczników oparty na prostasferze na przykładzie ludzkich pierwotnych komórek nabłonka prostaty (HPrEC).