Tutaj prezentujemy protokół wykrywania białek za pośrednictwem przeciwciał fluorescencyjnych w całych preparatach zarodków i larw danio pręgowanego.
Subskrypcja JoVE jest wymagana do oglądania tego materiału. Zaloguj się lub rozpocznij bezpłatny okres próbny.
Artykuł metodologiczny
Tutaj prezentujemy protokół wykrywania białek za pośrednictwem przeciwciał fluorescencyjnych w całych preparatach zarodków i larw danio pręgowanego.
Immunohistochemia jest powszechnie stosowaną techniką do badania ekspresji i lokalizacji białek zarówno w normalnych stanach rozwojowych, jak i chorobowych. Chociaż wiele protokołów immunohistochemicznych zostało zoptymalizowanych pod kątem tkanek ssaków i skrawków tkanek, protokoły te często wymagają modyfikacji i optymalizacji dla organizmów modelowych innych niż ssaki. Danio pręgowany jest coraz częściej wykorzystywany jako system modelowy w badaniach podstawowych, biomedycznych i translacyjnych w celu zbadania molekularnych, genetycznych i biologicznych mechanizmów procesów rozwojowych komórek. Danio pręgowany oferuje wiele zalet jako system modelowy, ale wymaga również zmodyfikowanych technik w celu optymalnego wykrywania białek. W tym miejscu przedstawiamy nasz protokół immunohistochemii fluorescencji całej góry w zarodkach i larwach danio pręgowanego. Protokół ten dodatkowo opisuje kilka różnych strategii montażu, które można zastosować, oraz przegląd zalet i wad każdej strategii. Opisujemy również modyfikacje tego protokołu, aby umożliwić wykrywanie substratów chromogennych w całej tkance wierzchowca i wykrywanie fluorescencji w wyciętej tkance larwalnej. Protokół ten ma szerokie zastosowanie w badaniu wielu etapów rozwojowych i struktur embrionalnych.
Danio rerio (danio rerio) stał się potężnym modelem do badania procesów biologicznych z kilku powodów, w tym krótkiego czasu generacji, szybkiego rozwoju i podatności na techniki genetyczne. W rezultacie danio pręgowany jest powszechnie stosowany w wysokoprzepustowych badaniach przesiewowych małych cząsteczek do badań toksykologicznych i odkrywania leków. Danio pręgowany jest również atrakcyjnym modelem do badania procesów rozwojowych, biorąc pod uwagę, że pojedyncza samica może rutynowo wyprodukować 50-300 jaj na raz, a optycznie czyste zarodki rozwijają się zewnętrznie, co pozwala na efektywną wizualizację procesów rozwojowych. Jednak wczesne badania opierały się głównie na zaawansowanych badaniach genetycznych z użyciem N-etylo-N-nitrozomocznika (ENU) lub innych mutagenów ze względu na wyzwania związane z ustaleniem technik odwrotnej genetyki. Mniej więcej dwie dekady temu morpholinos zostały po raz pierwszy użyte u danio pręgowanego do niszczenia wybranych genów1. Morfoliny to małe oligonukleotydy antysensowne, które hamują translację docelowego mRNA po mikrowstrzyknięciu do zarodka we wczesnym stadium rozwoju. Główną słabością morfolinosów jest to, że są one rozcieńczane podczas podziału komórek i na ogół tracą skuteczność po 72 godzinach od zapłodnienia (hpf). Podczas gdy morfoliny pozostają potężnym narzędziem do zakłócania genów danio pręgowanego, nukleazy efektorowe podobne do aktywatora transkrypcji (TALEN), nukleazy palców cynkowych (ZFN) i zgrupowane, regularnie rozmieszczone krótkie powtórzenia palindromiczne (CRISPR) są ostatnio wykorzystywane do bezpośredniego celowania w genom danio pręgowanego2,3. Te odwrócone strategie genetyczne, w połączeniu z genetyką postępową i wysokowydajnymi badaniami przesiewowymi, sprawiły, że danio pręgowany stał się potężnym modelem do badania ekspresji i funkcji genów.
Zdolność do badania funkcji genów zazwyczaj wymaga oceny czasoprzestrzennego rozkładu ekspresji genów lub produktów genowych. Dwie najczęściej stosowane techniki wizualizacji takich wzorców ekspresji we wczesnym okresie rozwoju to hybrydyzacja in situ (ISH) i immunohistochemia całego wierzchowca (IHC). Hybrydyzacja in situ została po raz pierwszy opracowana w 1969 roku i opiera się na użyciu znakowanych antysensownych sond RNA do wykrywania ekspresji mRNA w organizmie4. Natomiast znakowane przeciwciała są używane w immunohistochemii do wizualizacji ekspresji białek. Pomysł znakowania białek do wykrywania sięga lat 30-tych XX wieku5, a pierwszy eksperyment IHC został opublikowany w 1941 roku, kiedy przeciwciała znakowane FITC zostały użyte do wykrywania bakterii chorobotwórczych w zakażonych tkankach6. ISH i IHC ewoluowały i znacznie się poprawiły w ciągu kolejnych dziesięcioleci i są obecnie rutynowo stosowane w molekularnym i diagnostycznym laboratorium badawczym7,8,9,10,11. Chociaż obie techniki mają zalety i wady, IHC oferuje kilka zalet w porównaniu z ISH. W praktyce IHC jest znacznie mniej czasochłonny niż ISH i jest generalnie tańszy w zależności od kosztu przeciwciała pierwotnego. Ponadto ekspresja mRNA nie zawsze jest wiarygodnym wskaźnikiem ekspresji białka, ponieważ wykazano u myszy i ludzi, że tylko około jednej trzeciej zmienności obfitości białka można wyjaśnić obfitością mRNA12. Z tego powodu IHC jest ważnym uzupełnieniem do potwierdzania danych ISH, gdy tylko jest to możliwe. Wreszcie, IHC może dostarczyć dane subkomórkowe i kolokalizacyjne, których nie można określić za pomocą ISH13,14,15. W tym miejscu opisujemy krok po kroku metodę niezawodnego wykrywania białek za pomocą immunohistochemii w całych zarodkach i larwach danio pręgowanego. Celem tej techniki jest określenie przestrzennej i czasowej ekspresji białka będącego przedmiotem zainteresowania w całym zarodku. Technologia ta wykorzystuje przeciwciała pierwszorzędowe specyficzne dla antygenu i fluorescencyjnie znakowane przeciwciała drugorzędowe. Protokół można łatwo dostosować do stosowania na szkiełkowych skrawkach tkanek oraz do stosowania z podłożami chromogennymi zamiast fluorescencji. Korzystając z tego protokołu, wykazujemy, że rozwijające się mięśnie szkieletowe danio pręgowanego wyrażają jonotropowe receptory glutaminianu oprócz receptorów acetylocholiny. Podjednostki receptora glutaminianu typu NMDA są wykrywalne na mięśniu podłużnym przy 23 hpf.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Procedury pracy z dorosłymi osobnikami i embrionami hodowli danio pręgowanego opisane w tym protokole zostały zatwierdzone przez Instytucjonalną Komisję ds. Opieki i Użytkowania Zwierząt na Uniwersytecie Stanowym Murray.
1. Pobieranie i utrwalanie zarodków
2. Przygotowanie zarodków
3. Inkubacja przeciwciał pierwotnych
4. Inkubacja przeciwciał wtórnych
Opcjonalne kroki
5. Wybielanie
6. Sekcja zarodków i usuwanie żółtka
7. Płaski montaż na prowadnicach
8. Montaż w Agarozie
9. Montaż na prowadnicach mostkowych
10. Barwienie DAB
UWAGA: Ta sekcja zaczyna się po kroku 4.2 powyżej i zastępuje resztę kroku 4.
11. Zmodyfikowany protokół barwienia wyciętej tkanki zamontowanej na szkiełkach
12. Dokumentacja
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Immunohistochemia całego preparatu wykorzystuje przeciwciała do wykrywania przestrzennego wzorca ekspresji białka w nienaruszonym organizmie zwierzęcia. Podstawowy schemat pracy w immunohistochemii (przedstawiony na Rysunku 1) obejmuje hodowlę rybek danio-przełomowych, wychów i przygotowanie embrionów, blokowanie nieswoistych antygenów, zastosowanie swoistego przeciwciała pierwszorzędowego w celu ukierunkowania na badane białko, wykrycie przeciwciała pierwszo...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Immunohistochemia jest wszechstronnym narzędziem, które można wykorzystać do scharakteryzowania czasoprzestrzennej ekspresji praktycznie każdego białka będącego przedmiotem zainteresowania w organizmie. Immunohistochemia jest stosowana w odniesieniu do szerokiej gamy tkanek i organizmów modelowych. Protokół ten został zoptymalizowany do stosowania u danio pręgowanego. Immunohistochemia u różnych gatunków może wymagać różnych technik utrwalania i obchodzenia się z nimi, roztworów blokujących w zależności od gatunku i obec...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Autorzy nie mają żadnych informacji do ujawnienia.
Finansowanie z grantu NIH 8P20GM103436 14.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| Agarose | Fisher Scientific | BP160-100 | |
| Folia aluminiowa, wytrzymała | Kirkland | Każda marka może być podstawiona | |
| Przeciwciało anty-NMDA | Millipore Sigma | MAB363 | |
| Anty-fosfo-histon H3 (Ser10), klon RR002 | Milipore Sigma | 05-598 | |
| Receptor anty-pan-AMPA (GluR1-4) | Millipore Sigma | ||
| Albumina surowicy bydlęcej (BSA) | Fisher Scientific | BP1600-100 | |
| Azotan wapnia [Ca(NO3)2] | Sigma Aldrich | C4955 | |
| Probówki wirówkowe, 1,5 ml | Axygen | MCT150C | |
| Bezbarwny lakier do paznokci | Sally Hanson | Można zastąpić | |
| dowolny lakier do paznokci lub utwardzaczSzkiełko depresyjne (wklęsłe) | Elektronowa miskroskopia Sciences | 71878-01 | |
| Diaminobenzydyna | Thermo Scientific | 1855920 | |
| Pożywka zarodkowa, Danieau, 30% | 17,4 mM NaCl, 0,21 mM KCl, 0,12 mM MgS04, 0,18 mM Ca(NO3)2, 1,5 mM HEPES w ultraczystej wodzie. | ||
| Pożywka zarodkowa, E2 | 7,5 mM NaCl, 0,25 mM KCl, 0,5 mM MgSO4, 75 μ M KH2PO4, 25 uM Na2HPO4, 0.5 mM CaCl2, 0.35 mM NaHCO3, 0.5 mg/L błękit metylenowy | ||
| Pływający uchwyt rurki | Thermo Scientific | 59744015 | |
| Mikroskop fluorescencyjny Leica | Biosystems | DMi8 | |
| Stereomikroskop fluorescencyjny | Leica Biosystems | M165-FC | |
| Szkiełka nakrywkowe szklane 18 mm x 18 mm | Corning | 284518 | |
| Szkiełka nakrywkowe szklane 22 mm x 60 mm | Thermo Scientific | 22-050-222 | |
| Szkiełka | Fisher Scientific | 12-544-4 | |
| Glicerol | Fisher Scientific | BP229-1 | |
| Kozioł anty-mysi IgG Alexa 488 | Invitrogen | A11001 | |
| Roztwór HEPES | Sigma Aldrich | H0887 | |
| Komora wilgotna z pokrywą | Simport | M920-2 | |
| Nadtlenek wodoru, 30% | Fisher Scientific | H325-500 | |
| Immunedge Pap pen | Vector labs | H-4000 | |
| Szpilki do owadów, rozmiar 00 | Stoelting | 5213323 | |
| Siarczan magnezu (MgSO4 · 7H2O) | Sigma Aldrich | 63138 | |
| Sitko siatkowe | Oneida | Można zastąpić dowolną markę | |
| Metanol | Sigma Aldrich | 34860 | |
| Błękit metylenowy | Sigma Aldrich | M9140 | |
| Blokada nasadki mikrorurki | Research Products International | 145062 | |
| Kuchenka mikrofalowa | Toastmaster | ||
| Mysz IgG | Sigma Aldrich | I8765 | |
| Normalna surowica kozia | Millipore Sigma | S02L1ML | |
| Mikser nutujący | Fisher Scientific | 88-861-044 | |
| Paraformaldehyd | Fisher Scientific | 04042-500 | |
| Pipety Pasteura | Fisher Scientific | 13-678-20C | |
| PBTriton | 1% TritonX-100 w 1x PBS | ||
| Podłoże montażowe Permount | Fisher Chemical | SP15-500 | |
| szalka Petriego (szkło) | Pyrex | 3160100 | |
| szalka Petriego (plastikowa) | Fisher Scientific | FB0875713 | |
| 1-fenylo 2-tiomocznik | Acros Organics | 207250250 | |
| Solanka fizjologiczna buforowana fosforanami (PBS), 10x, pH 7,4 | Gibco | 70011-044 | |
| Solanka fizjologiczna buforowana fosforanami (PBS), 1x | 1x wykonana z 10x bulionu rozcieńczonego w dH2O | ||
| Chlorek potasu (KCl) | Sigma Aldrich | P9333 | |
| Wodorotlenek potasu (KOH) | Fisher | P250-500 | |
| Fosforan potasu jednozasadowy (KH2PO4) | Sigma Aldrich | P5655 | |
| Pronaza | Sigma Aldrich | 10165921001 | |
| Proteinaza K | Invitrogen | AM2544 | |
| Chlorek sodu (NaCl) | Sigma Aldrich | S7653 | |
| Fosforan sodu dwuzasadowy (Na2HPO4) | Sigma Aldrich | S7907 | |
| Zbiornik tarłowy z pokrywą i wkładem | Aquaneering | ZHCT100 | |
| SuperBlock PBS | Thermo Scientific | 37515 | |
| Superfrost + zjeżdżalnie | Fisher Scientific | 12-550-15 | |
| Superglue żel | 3M Scotch | ||
| TNT | 100 mM Tris, pH 8,0; 150 mM NaCl; 0,1% Tween20; wykonane z dH2O | ||
| Pipeta transferowa | Fisher | 13-711-7M | |
| Kwas trichlorooctowy (Cl3CCOOH) | Sigma Aldrich | T6399 | |
| Tris Base | Fisher Scientific | S374-500 | |
| TritonX-100 | Sigma Aldrich | T9284 | |
| Tween20 | Fisher Scientific | BP337-500 | |
| Ultracienkie kleszcze | Fisher Scientific | 16-100-121 | |
| Woda, ultraczysta/podwójnie destylowana | Fisher Scientific | W2-20 |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.