$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
W barwieniu immunologicznym multipleksowym, bezpośrednie barwienie za pomocą sprzężonych przeciwciał pierwszorzędowych może dostarczyć pouczających wyników. Bez użycia przeciwciał drugorzędowych, metoda bezpośredniego barwienia wiąże się z niskim ryzykiem fałszywych sygnałów kolokalizacji z reaktywności krzyżowej przeciwciał. Jednak sprzężone reportery (fluorofor, enzymy) lub biotyna na pierwszorzędowym przeciwciałie ograniczają jego przyszłe zastosowanie. Alternatywnie, pośrednie barwienie immunologiczne zwykle zapewnia silniejsze sygnały przy użyciu niesprzężonego przeciwciała pierwszorzędowego z znakowanym przeciwciałem drugorzędowym. Idealnie byłoby, gdyby niesprzężone przeciwciała pierwszorzędowe stosowane w barwieniu immunologicznym multipleksowym pochodziły od różnych gatunków gospodarzy, aby uniknąć reaktywności krzyżowej przeciwciał. Jednak odpowiednia kombinacja przeciwciał pierwszorzędowych pochodzących od różnych gatunków gospodarzy nie zawsze jest dostępna.
Ustanowiono kilka metod mających na celu wyeliminowanie ryzyka reakcji przeciwciała drugorzędowego z niepożądanym przeciwciałem pierwotnym. Jedną z powszechnych metod jest użycie przeciwciała monomerycznego F(ab) w celu zablokowania wszelkich pozostałych epitopów wiążących na pierwszym pierwszorzędowym kompleksie przeciwciał przed barwieniem drugim pierwotnym przeciwciałem1. Usuwanie przeciwciał, które jest podobne do paska i reprobacji arkusza Western blot, usuwa wcześniej wybarwiony kompleks przeciwciał bez usuwania osadzania się wykrywalnych cząsteczek reporterowych, takich jak tetrachlorowodorek 3,3'-diaminobenzydyny (DAB)2 i fluorescencyjne osadzanie tyramidu3. Dzięki tej metodzie cząsteczki reporterowe w różnych kolorach mogą pokazać wynik multipleksu na tym samym szkiełku. Barwienie multipleksowe jest również możliwe do osiągnięcia poprzez całkowite usunięcie wcześniej zdeponowanych warstw przeciwciał i wyrównanie następnie uzyskanych obrazów z innych przeciwciał4,5. Wszystkie te metody dają wiarygodne wyniki, chociaż każda z nich ma swoje ograniczenia i wymaga skomplikowanych procedur lub specjalnego systemu obrazowania.
Obecny protokół pokazuje zastosowanie metody usuwania przeciwciał z wykorzystaniem powszechnie dostępnych. Protokół ten może być stosowany do wykonywania multipleksowego barwienia immunofluorescencyjnego na utrwalonych w formalinie odcinkach nadnerczy myszy zatopionych w parafinie (FFPE) za pomocą dwóch nieznakowanych przeciwciał pierwszorzędowych od tego samego gatunku gospodarza.