Barwienie immunologiczne jest szeroko stosowane w badaniach biomedycznych, aby pokazać wzór ekspresji komórkowej danego białka. Multipleksowe barwienie immunologiczne umożliwia znakowanie przy użyciu wielu przeciwciał pierwszorzędowych. Aby zminimalizować reaktywność krzyżową przeciwciał, barwienie immunologiczne multipleksowe przy użyciu barwienia pośredniego wymaga nieznakowanych przeciwciał pierwszorzędowych od różnych gatunków gospodarzy. Jednak odpowiednia kombinacja przeciwciał różnych gatunków nie zawsze jest dostępna. W tym miejscu opisujemy metodę stosowania nieznakowanych przeciwciał pierwszorzędowych od tego samego gatunku gospodarza (np. W tym przypadku oba przeciwciała pochodzą od królika) do immunofluorescencji multipleksowej na mysich odcinkach nadnerczy zatopionych w parafinie (FFPE) utrwalonych w formalinie. Metoda ta wykorzystuje tę samą procedurę i odczynniki, które są używane na etapie pobierania antygenu, aby usunąć aktywność wcześniej wybarwionego pierwszorzędowego kompleksu przeciwciał. Preparaty barwiono pierwszym przeciwciałem pierwszorzędowym przy użyciu ogólnego protokołu barwienia immunologicznego, po którym nastąpił etap wiązania z biotynylowanym przeciwciałem drugorzędowym. Następnie zastosowano metodę wytwarzania sygnału peroksydazy awidyny-biotyny z fluoroforem-tyramidem jako substratem. Immunoaktywność pierwszego pierwszorzędowego kompleksu przeciwciał została usunięta przez zanurzenie w mikrofalowym wrzącym roztworze cytrynianu sodu na 8 minut. Nierozpuszczalne osadzanie się fluoroforu i tyramidu pozostało na próbce, co pozwoliło na zabarwienie szkiełka innymi przeciwciałami pierwszorzędowymi. Chociaż ta metoda eliminuje większość sygnałów fałszywie dodatnich, może pozostać pewne tło z reaktywności krzyżowej przeciwciał. Jeżeli próbki są wzbogacone endogenną biotyną, można zastosować przeciwciało drugorzędowe sprzężone z peroksydazą w celu zastąpienia biotynylowanego przeciwciała drugorzędowego, aby uniknąć wyników fałszywie dodatnich z odzyskanej endogennej biotyny.