Candida albicans jest oportunistycznym, polimorficznym patogenem grzybiczym, który zwykle jest komensalny, ale może ulec zmianie morfologicznej do postaci zjadliwej, zdolnej do wywoływania zagrażających życiu infekcji u osób z obniżoną odpornością1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13. C. albicans jest główną przyczyną ogólnoustrojowych zakażeń szpitalnych, ze śmiertelnością 40-60% nawet przy leczeniu przeciwgrzybiczym2,14,15. Chociaż C. albicans zamieszkuje różne nisze żywicielskie, w tym żeński układ rozrodczy16,17, jama ustna zdrowych osobników18 i przewód pokarmowy (GI)19,20, większość zakażeń ogólnoustrojowych pochodzi z przewodu pokarmowego, a ponadto często potwierdza się, że źródłem infekcji ogólnoustrojowej jest przewód pokarmowy21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32, 33,34. Na patogenność C. albicans w przewodzie pokarmowym wpływa wiele czynników; Jednak główną cechą niezbędną do zjadliwości jest przejście od morfologii komórek drożdży do morfologii zjadliwych komórek strzępkowych35,36,37,38,39,40,41,42,43,44. Przyczepianie się i rozprzestrzenianie C. albicans z przewodu pokarmowego podczas infekcji jest silnie związane z jego zdolnością do przekształcania się z drożdży komensalnych w zjadliwe strzępki, co pozwala grzybom na wywołanie choroby inwazyjnej44,45,46,47,48,49,50,51,52,53.
Różne czynniki w jelitach, w tym n-acetyloglukozamina, regulują tworzenie strzępek przez C. albicans. Dlatego tak ważne jest zawężenie luki w wiedzy na temat morfogenezy strzępek tego patogenu grzybowego w przewodzie pokarmowym 54,55,56. Najnowsze dowody wskazują, że różne metabolity jelitowe w różny sposób kontrolują morfogenezę strzępek C. albicans in vitro57,58,59,60. Jednak ograniczenia techniczne stwarzają problemy przy próbie zbadania tworzenia strzępek C. albicans w próbkach jelit in vivo, zwłaszcza barwienia komórek drożdży i strzępek oraz ilościowej analizy rozwoju strzępek. Aby zrozumieć morfogenezę strzępek C. albicans w przewodzie pokarmowym, opracowano metodę ex vivo z wykorzystaniem rozpuszczalnych ekstraktów o homogenizowanej zawartości jelitowej od myszy w celu zbadania wpływu metabolitów na morfogenezę strzępek grzybów. Wykorzystując próbki jelit od myszy, które są oporne i podatne na zakażenie C. albicans, metoda ta pomoże zidentyfikować i zbadać wpływ metabolitów, antybiotyków i ksenobiotyków na morfogenezę strzępek grzybów w przewodzie pokarmowym.