Ta praca opisuje użycie technologii edycji genomu CRISPR-Cas9 do wyeliminowania endogennego genu OsABCG15, a następnie zmodyfikowanego protokołu transformacji za pośrednictwem Agrobacterium w celu wytworzenia stabilnej męsko-sterylnej linii w ryżu.
Subskrypcja JoVE jest wymagana do oglądania tego materiału. Zaloguj się lub rozpocznij bezpłatny okres próbny.
Artykuł metodologiczny
* These authors contributed equally
Ta praca opisuje użycie technologii edycji genomu CRISPR-Cas9 do wyeliminowania endogennego genu OsABCG15, a następnie zmodyfikowanego protokołu transformacji za pośrednictwem Agrobacterium w celu wytworzenia stabilnej męsko-sterylnej linii w ryżu.
Męska bezpłodność jest ważną cechą agronomiczną dla produkcji nasion hybrydowych, która zwykle charakteryzuje się funkcjonalnymi wadami męskich organów rozrodczych/gamet. Najnowsze postępy w technologii edycji genomu CRISPR-Cas9 pozwalają na wysoką skuteczność edycji i oszczędność czasu w mutacjach nokautujących endogennych genów kandydujących w określonych miejscach. Ponadto transformacja genetyczna ryżu za pośrednictwem Agrobacterium jest również kluczową metodą modyfikacji genów, która została szeroko przyjęta przez wiele publicznych i prywatnych laboratoriów. W tym badaniu zastosowaliśmy narzędzia do edycji genomu CRISPR-Cas9 i z powodzeniem wygenerowaliśmy trzy męskie sterylne zmutowane linie poprzez ukierunkowaną edycję genomu OsABCG15 w odmianie japonica. Zastosowaliśmy zmodyfikowaną metodę transformacji ryżu za pośrednictwem Agrobacterium, która może zapewnić doskonały sposób na genetyczną kastrację w produkcji nasion hybrydowych ryżu. Rośliny transgeniczne można uzyskać w ciągu 2–3 miesięcy, a homozygotyczne transformanty poddano badaniom przesiewowym poprzez genotypowanie przy użyciu amplifikacji PCR i sekwencjonowania Sangera. Podstawową charakterystykę fenotypową męskiej sterylnej linii homozygotycznej przeprowadzono poprzez obserwację mikroskopową męskich narządów rozrodczych ryżu, analizę żywotności pyłku za pomocą barwienia jodkiem potasu (I2-KI) półcienkiego przekroju poprzecznego rozwijających się pylników.
Ryż jest najważniejszą rośliną uprawną, szczególnie w krajach rozwijających się, i stanowi podstawowe pożywienie dla ponad połowy światowej populacji. Ogólnie rzecz biorąc, popyt na ziarno ryżu rośnie i przewiduje się, że wzrośnie o 50% do 2030 r. i o 100% do 2050 r1,2. Przyszła poprawa plonów ryżu będzie musiała wykorzystać różnorodne zasoby molekularne i genetyczne, które sprawiają, że ryż jest doskonałym modelem do badań nad roślinami jednoliściennymi. Należą do nich wydajny system transformacji, zaawansowana mapa molekularna i publicznie dostępna baza danych wyrażonych znaczników sekwencji, które były generowane przez wiele lat3,4. Jedną ze strategii mających na celu poprawę plonów jest produkcja nasion hybrydowych5, której centralnym elementem jest możliwość manipulowania męską płodnością. Zrozumienie molekularnej kontroli płodności samców w uprawach zbóż może pomóc w przełożeniu kluczowej wiedzy na praktyczne techniki usprawniające produkcję nasion hybrydowych i zwiększające produktywność upraw6,7.
Transformacja genetyczna jest kluczowym narzędziem dla badań podstawowych i rolnictwa komercyjnego, ponieważ umożliwia wprowadzanie obcych genów lub manipulowanie endogennymi genami w roślinach uprawnych, a także prowadzi do powstania genetycznie modyfikowanych linii. Odpowiedni protokół transformacji może pomóc w przyspieszeniu badań nad biologią genetyczną i molekularną w celu uzyskania podstawowego zrozumienia regulacji genów8. U bakterii transformacja genetyczna zachodzi naturalnie; Jednak u roślin jest to wykonywane sztucznie przy użyciu technik biologii molekularnej9,10. Agrobacterium tumefaciens to przenoszona przez glebę bakteria Gram-ujemna, która powoduje chorobę żółciową korony roślin poprzez przenoszenie T-DNA, regionu plazmidu Ti, do komórki roślinnej za pośrednictwem systemu wydzielania typu IV11,12. U roślin transformacja za pośrednictwem A. tumefaciens jest uważana za szeroko rozpowszechnioną metodę modyfikacji genów, ponieważ prowadzi do stabilnej i niskiej liczby kopii integracji T-DNA z genomem gospodarza13. Ryż transgeniczny został po raz pierwszy wygenerowany w wyniku transformacji genów za pośrednictwem Agrobacterium w połowie lat 90. XX wieku w odmianie japonica14. Korzystając z tego protokołu, w ciągu 4 miesięcy uzyskano kilka linii transgenicznych o wydajności transformacji 10%–30%. Badanie wykazało, że istnieją dwa kluczowe etapy udanej transformacji: jednym z nich jest indukcja embrionalnego kalusa z dojrzałych nasion, a drugim jest dodanie acetosyringonu, związku fenolowego, do kultury bakteryjnej podczas wspólnej hodowli, co pozwala na wyższą wydajność transformacji w roślinach14,15. Protokół ten był szeroko stosowany z niewielkimi zmianami w japonica16,17,18,19, a także w innych odmianach, takich jak indica20,21,22,23 i tropikalny japonica24,25. Rzeczywiście, ponad 80% artykułów opisujących transformację ryżu wykorzystuje transformację genów za pośrednictwem Agrobacterium jako narzędzie13. Do tej pory opracowano kilka protokołów transformacji genetycznej przy użyciu nasion ryżu jako materiału wyjściowego do indukcji kalusa16,17,18,19. Jednak bardzo niewiele wiadomo o młodych kwiatostanach jako eksplantatach do produkcji kalusa. Ogólnie rzecz biorąc, ważne jest ustanowienie szybkiego, powtarzalnego i wydajnego protokołu transformacji i regeneracji genów na potrzeby genomiki funkcjonalnej i badań nad ulepszaniem upraw.
W ostatnich latach postęp technologii CRISPR-Cas9 zaowocował precyzyjnym mechanizmem edycji genomu, który pozwala zrozumieć funkcję genów i dostarczyć agronomiczne ulepszenia dla hodowli roślin26,27. CRISPR jest również bardzo obiecujący w zakresie manipulacji rozwojem rozrodczym mężczyzn i produkcją hybryd. W tym badaniu wykorzystaliśmy system nokautu genów przy użyciu technologii CRISPR-Cas9 i połączyliśmy go z wydajnym protokołem transformacji genów ryżu przy użyciu młodych kwiatostanów jako eksplantatów, tworząc w ten sposób stabilne męskie sterylne linie do badania rozwoju reprodukcyjnego.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
1. budowa wektora ekspresji roślinnej sgRNA-CAS9 i transformacja za pośrednictwem Agrobacterium
2. Genetyczna transformacja ryżu i hodowla tkanek roślinnych
3. Identyfikacja genotypu
4. Obserwuj podstawowy fenotyp mutanta
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Przedstawiono tutaj zastosowanie technologii edycji genów w celu stworzenia linii męsko sterylnej do przyszłych badań poprzez transformację genetyczną ryżu za pośrednictwem Agrobacterium. Aby stworzyć linię męsko sterylną osabcg15, do konstrukcji wektora binarnego wykorzystano mutogenezę za pośrednictwem CRISPR-Cas9. sgRNA było sterowane przez promotor OsU3, natomiast kaseta ekspresyjna hSpCas9 była sterowana przez podwójny promotor 35S, a wektor pośredni został złożony w pojedynczym wektorze binarnym <...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Sztuczne genowe męskie, sterylne mutanty są tradycyjnie generowane przez losową mutagenezę fizyczną, chemiczną lub biologiczną. Chociaż są to potężne techniki, ich przypadkowa natura nie jest w stanie wykorzystać ogromnej ilości nowoczesnej wiedzy genomicznej, która ma potencjał, aby zapewnić dostosowane do potrzeb ulepszenia w hodowli molekularnej32. System CRISPR-Cas9 jest szeroko stosowany w roślinach ze względu na proste i niedrogie sposoby manipulowania i edycji DNA29,33
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Autorzy pragną podziękować Xiaofei Chen za dostarczenie młodych kwiatostanów ryżu i pomoc w przygotowaniu podłoża do hodowli tkanek ryżowych. Prace te były wspierane przez Chińską Narodową Fundację Nauk Przyrodniczych (31900611).
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| Kwas 1-naftalenooctowy | Sigma-Aldrich | N0640 | |
| 2, Kwas 4-dichlorofenoksyoctowy | Sigma-Aldrich | D7299 | |
| 6-benzyloaminopuryna (6-BA) | Sigma-Aldrich | B3408 | |
| Acetosyringon | Sigma-Aldrich | D134406 | |
| Agar | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10000561 | |
| Siarczan amonu | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10002918 | |
| Chlorowodorek aneuryny | Sigma-Aldrich | T4625 | |
| Bezwodny etanol | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10009218 | |
| Pepton bakteriologiczny | Sangon Biotech | A100636 | |
| Ekstrakt z wołowiny | Sangon Biotech A600114 | ||
| Kwas borowy | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10004808 | |
| Chlorek wapnia dwuwodny | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 20011160 | |
| Hydrolizat kwasu kazeinowego | Pekin XMJ Scientific Co., Ltd | C184 | |
| Sześciowodny chlorek kobaltu(II) | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10007216 | |
| Penwodzian siarczanu miedzi(II) | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10008218 | |
| D(+)-glukoza bezwodna | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 63005518 | |
| D-sorbitol | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 63011037 | |
| EDTA, sól disodowa, dihydrat | Sigma-Aldrich | E5134 | |
| EOS Cyfrowe lustrzanki jednoobiektywowe i kompaktowe aparaty systemowe | Canon | EOS 700D | |
| Formaldehyd | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10010018 | |
| W pełni zautomatyzowany mikrotom obrotowy | Leica Biosystems | Leica RM 2265 | |
| Lodowaty kwas octowy | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10000208 | |
| Glycine | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 62011516 | |
| Hygromycyna | Pekin XMJ Scientific Co., Ltd | H370 | |
| Inozytol | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 63007738 | |
| Jod | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10011517 | |
| Siarczan żelaza(II) siedmiowodny | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10012116 | |
| Kanamycine | Beijing XMJ Scientific Co., Ltd | K378 | |
| Kinetin | Sigma-Aldrich | K0753 | |
| L-arginina | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 62004034 | |
| Kwas L-asparaginowy | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 62004736 | |
| L-glutamina | Pekin XMJ Scientific Co., Ltd | G229 | |
| L-prolina | Pekin XMJ Scientific Co., Ltd | P698 | |
| Siarczan magnezu siedmiowodny | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10013018 | |
| Monohydrat siarczanu manganu | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10013418 | |
| Mikroskopy | NIKON | Eclipse 80i | |
| MS | Phytotech | M519 | |
| Kwas nikotynowy | Sigma-Aldrich | N0765 | |
| Phytagel | Sigma-Aldrich | P8169 | |
| Chlorek potasu | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10016308 | |
| Diwodorofosforan potasu | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10017608 | |
| jodek potasu | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10017160 | |
| Azotan potasu | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 1001721933 | |
| Chlorowodorek pirydoksyny (B6) | Sigma-Aldrich | 47862 | |
| Ryfampicyna | Pekin XMJ Scientific Co., Ltd | R501 | |
| Wodorotlenek sodu | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10019718 | |
| Dwuwodny molibdenian sodu | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10019816 | |
| Mikroskopy stereoskopowe | Leica Microsystems | Leica M205 A | |
| Sacharoza | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10021418 | |
| Zestawy do zatapiania Technovit 7100 | Heraeus Teknovi, Niemcy | 14653 | |
| Timentin | Beijing XMJ Scientific Co., Ltd | T869 | |
| Toluidine Blue O | Sigma-Aldrich | T3260 | |
| Kąpiel wodna do sekcji parafinowych | Leica Biosystems | Leica HI1210 | |
| Ekstrakt drożdżowy | Sangon Biotech | A515245 | |
| Siarczan siedmiowodny | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10024018 |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.