Sucha zgnilizna korzeni (DRR) jest jedną z ekonomicznie istotnych chorób ciecierzycy1,2. Jest to choroba specyficzna dla korzeni wywoływana przez Rhizoctonia bataticola (teleomorf, Macrophomina phaseolina). Zainfekowane rośliny nie mają korzeni bocznych i mają kruche korzenie palowe oraz żółte liście1,3. Doniesiono, że DRR w warunkach stresu związanego z suszą stanowi nowe zagrożenie dla uprawy ciecierzycy1,2,3. Co więcej, częstość występowania DRR nasila się pod wpływem stresu suszy w warunkach polowych1,2,3. DRR jest bardziej rozpowszechniony na obszarach deszczowych niż na nawadnianych polach4. Wykorzystanie odpornych odmian jest sposobem na pokonanie choroby i obejście stosowania fungicydów1,13. Ponieważ plazma zarodkowa ciecierzycy dostępna na całym świecie zawiera zmienność genetyczną dla cechy 5, badania przesiewowe i identyfikacja odpornych/podatnych genotypów mają kluczowe znaczenie dla hodowli molekularnej w celu poprawy upraw.
Solidne, łatwe i opłacalne testy chorób są niezbędne do zbadania wzorców infekcji R. bataticola u ciecierzycy. Podstawowym testem choroby stosowanym do obserwacji odpowiedzi genotypów ciecierzycy na zakażenie R. bataticola jest technika bibuły1,4. Jest to prosta technika i może być wykonana przy użyciu płynnego inokulum grzybów, sadzonek z korzeniami i sterylnej bibuły. Jednak technika ta nie została wykorzystana w maksymalnym stopniu, ponieważ w literaturze nie jest dostępny żaden protokół krok po kroku.
Tymczasem, technika chorego garnka polega na przygotowaniu potencjalnej choroby i nałożeniu stresu związanego z suszą. Biorąc pod uwagę, że stres związany z suszą nasila występowanie choroby DRR3, konieczne jest zbadanie interakcji roślina-patogen w warunkach stresu związanego z suszą6,7. Technika chorej doniczki stanowi platformę dla takich jednoczesnych badań, promując lepsze możliwości badań przesiewowych plazmy zarodkowej i zrozumienia mechanistycznych podstaw interakcji. Zmiany patomorfologiczne, takie jak zwiększenie długości korzenia i zmniejszenie liczby korzeni bocznych - nieodłącznie związane z chorobą DRR - można rozwiązać za pomocą techniki chorego garnka1,3,7.
Tutaj przedstawiono szczegółowy protokół dla technik bibuły i garnków do bibuły, który może być wykorzystany do badania interakcji między ciecierzycą a R. bataticola i plazmą zarodkową ciecierzycy. Szczegółowe informacje na temat materiałów wykorzystanych w badaniu znajdują się w Tabeli Materiałów.