$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Przeprogramowanie serca zostało opracowane jako alternatywne podejście do generowania nowych kardiomiocytów za pośrednictwem komórek macierzystych. Biorąc pod uwagę, że nie przechodzi przez stan komórek macierzystych, ma wysoki potencjał do ominięcia niektórych dziedzicznych ograniczeń w podejściach za pośrednictwem komórek macierzystych. Wykazano, że infekcja wirusowa co najmniej trzech lub czterech kardiogennych czynników transkrypcyjnych do fibroblastów może przekształcić fibroblasty w kierunku losu serca poprzez eliminację programów genów fibroblastów i odbudowę kardiogennych sieci transkrypcyjnych w fibroblastach1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17.
Od czasu pierwszego przełomowego badania demonstrującego przeprogramowanie serca in vitro1, protokół przeprogramowania serca został zoptymalizowany przez liczne badania3,5,6,7,9,11,12,13,14,15,16,18. Powszechnymi podejściami technicznymi do oceny fenotypów serca w fibroblastach po przeprogramowaniu serca były analiza cytometrii przepływowej w celu ilościowego określenia komórek wyrażających określone markery kardiomiocytów oraz immunocytochemia do wizualizacji tych komórek na poziomie pojedynczej komórki. Chociaż oba eksperymenty (tj. cytometria przepływowa i immunocytochemia) mają wykazać ekspresję markerów kardiomiocytów przy użyciu tych samych przeciwciał, muszą być przeprowadzone oddzielnie. Ponadto cytometria przepływowa wymaga stosunkowo większej liczby komórek, zwiększając w ten sposób ilość odczynników potrzebnych do eksperymentu. Alternatywnie, komórki dodatnie pod względem markerów kardiomiocytów można określić ilościowo przez ręczne liczenie zgodnie z immunocytochemią. Jest to jednak bardzo pracochłonne i zwykle mniej dokładne.
Celem tego protokołu jest opisanie metody, która może określić ilościowo i uwidocznić iCM za pomocą pojedynczego eksperymentu immunologicznego przy użyciu automatycznej analizy obrazowania o wysokiej zawartości. Wymaga stosunkowo niewielkiej liczby komórek wyjściowych, ponieważ protokół ten jest wykonywany w studzience z 24-dołkową płytką. W tym samym czasie można używać aż trzech różnych markerów. Pojedyncze, podwójne i potrójnie dodatnie komórki mogą być automatycznie oznaczane ilościowo. Oprócz kwantyfikacji komórek wybarwionych immunologicznie, analiza obrazowania o wysokiej zawartości zapewnia wysokiej jakości obrazy obiektywów 2-100x. W razie potrzeby te same komórki wybarwione immunologicznie, które są używane w analizie obrazowania o wysokiej treści, można ponownie wykorzystać do dalszych badań obrazowych, takich jak mikroskopia konfokalna. Główną zaletą tego protokołu jest to, że zapewnia on nie tylko bezstronną kwantyfikację iCM przy znacznie mniejszej liczbie komórek, ale także wizualizację iCM. Co więcej, protokół ten może być wykorzystany do oceny przeprogramowania linii niesercowych (np. przeprogramowania iPSC, neuronów i hepatocytów).