W niniejszym opracowaniu przedstawiono protokół wytwarzania in vitro unaczynionych ekwiwalentów ludzkiej skóry (VHSE) z wykorzystaniem keratynocytów unieśmiertelnionych za pomocą odwrotnej transkryptazy telomerazy (TERT) (N/TERT-120,59), dorosłych ludzkich fibroblastów skóry właściwej (hDF) oraz ludzkich mikro naczyniowych komórek śródbłonka (HMEC-1) (Rysunek 1). Dodatkowo, modyfikowalny charakter tego protokołu został podkreślony poprzez zademonstrowanie wytwarzania i stabilności VHSE przy zastosowaniu powszechnie dostępnych fibroblastów płucnych (IMR90) zamiast hDF. Wytwarzanie VHSE odbywa się w krokach 1-4, natomiast kroki 5-7 stanowią opcjonalne techniki przetwarzania końcowego i obrazowania, które zostały zoptymalizowane dla tych ekwiwalentów. Należy zauważyć, że VHSE mogą być przetwarzane zgodnie z konkretnymi pytaniami badawczymi, a kroki 5-7 nie są wymagane do wytworzenia konstruktu. W celu zademonstrowania metody analizy wolumetrycznej wykonano obrazowanie wolumetryczne, analizę oraz renderingi 3D. Te protokoły przygotowania i obrazowania konstruktów wolumetrycznych zachowują strukturę VHSE zarówno na poziomie mikroskopowym, jak i makroskopowym, umożliwiając kompleksową analizę 3D.
Charakterystyka naskórka i skóry właściwej wykazuje obecność odpowiednich markerów immunofluorescencyjnych dla ludzkiej skóry w konstruktach VHSE (Rysunek 2, 3). Cytokeratyna 10 (CK10) jest wczesnym markerem różnicowania keratynocytów, który zazwyczaj znakuje wszystkie warstwy nadbazalne w ekwiwalentach skóry18,30,68 (Rysunek 2). Inwolukryna i filagryna są późnymi markerami różnicowania w keratynocytach i znakują najwyższe warstwy nadbazalne w ekwiwalentach skóry12,30,68,69 (Rysunek 2). Do znakowania jąder komórkowych zarówno w naskórku, jak i skórze właściwej użyto dalekoczerwonego fluorescencyjnego barwnika jądrowego (patrz lista materiałów), natomiast Col IV znakował unaczynienie skóry właściwej (Rysunek 2, Rysunek 3, Rysunek 4). Składniki błony podstawnej (BM) naskórka nie zawsze są prawidłowo ekspresowane w kulturach HSE15,16; ponadto w tym protokole nie zaobserwowano spójnego barwienia BM dla Col IV. Badania skoncentrowane na składnikach i strukturze błony podstawnej wymagałyby dodatkowej optymalizacji pożywek, komórek oraz obrazowania14.
Chociaż obrazowanie konfokalne przez główną masę kultur VHSE często pozwala na uzyskanie obrazów o wysokiej rozdzielczości, wystarczających do analizy komputerowej skóry właściwej i naskórka, opisana metoda przejrzyszczania umożliwia obrazowanie głębszych warstw tkanki. Przejrzyszczanie poprawia głębokość penetracji laserów konfokalnych, a w przypadku próbek przejrzyszczonych skuteczne obrazowanie VHSE może osiągać głębokość ponad 1 mm (w porównaniu do ~250 µm dla próbek nieprzejrzyszczonych). Opisana technika przejrzyszczania (odwodnienie metanolem i salicylan metylu) zapewnia odpowiednie dopasowanie współczynnika załamania światła w całej tkance próbki VHSE61. Przejrzyszczenie VHSE umożliwiło bezpośrednie obrazowanie całej konstrukcji bez konieczności manipulacji (np. zmiana orientacji konstrukcji w celu oddzielnego obrazowania skóry właściwej i naskórka), (Rysunek 3).
Obrazy wolumetryczne umożliwiają generowanie renderowania 3D w celu zmapowania naczyń krwionośnych w obrębie każdego konstruktu (Rycina 4). W skrócie, zestawy obrazów konfokalnych wykonano w orientacji od skóry właściwej do naskórka w kilku podobjętościach VHSE w celu wykrycia barwienia Kolagenu IV (oznaczającego ściany naczyń) oraz jąder komórkowych (oznaczonych dalekoczerwoną fluorescencyjną barwnikiem jądrowym). Stosy obrazów są ładowane do oprogramowania obliczeniowego (patrz lista materiałów), a do renderowania 3D i kwantyfikacji stosowany jest specjalny algorytm (oparty na tych źródłach 48,70,71,72,73,74,75) zgodnie z wcześniejszym opisem48. Algorytm ten automatycznie segmentuje komponent naczyniowy na podstawie barwienia Col IV. Wynik segmentacji wolumetrycznej jest przekazywany do algorytmu szkieletyzacji opartego na metodzie szybkich marszów (fast marching)75,76,77. Szkieletyzacja pozwala wyznaczyć dokładne centrum każdego naczynia oznaczonego Col IV, a uzyskane dane mogą służyć do obliczenia średnicy naczyń oraz frakcji naczyniowej (Rycina 4). Mikroskopia fluorescencyjna w szerokim polu jest dostępną alternatywą w przypadku braku mikroskopii skaningowej laserowej; sieć naczyniową oraz naskórek można obrazować za pomocą mikroskopii fluorescencyjnej w szerokim polu (Rycina dodatkowa 2). Kwantyfikacja trójwymiarowa jest możliwa przy użyciu obrazowania VHSE w szerokim polu zamiast mikroskopii skaningowej laserowej, choć może to wymagać intensywniejszego filtrowania i dekonwolucji obrazów ze względu na światło poza płaszczyzną ostrości.

Rysunek 1: Schematyczny harmonogram generowania unaczynionego ludzkiego ekwiwalentu skóry. A) Przedstawia przebieg modelu VHSE od 1) wysiewu komponentu dermalnego, 2) wysiewu keratynocytów na komponent dermalny, 3) stratyfikacji nabłonka poprzez interfejs powietrze-ciecz i utrzymanie hodowli. Przetwarzanie po hodowli oraz obrazowanie wolumetryczne mogą być wykonane w punkcie końcowym hodowli. B) Zdjęcia makrostruktury VHSE z hDF w insertach hodowlanych w punkcie końcowym hodowli, po 8 tygodniach. Różne stopnie kurczenia są typowe dla VHSE; kurczenie można ograniczyć zgodnie z opisem w protokole. (1 i 2) Próbki mniej skurczone. (3 i 4) Próbki bardziej skurczone, które nadal tworzą prawidłowe elementy skóry. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 2: Charakterystyka naskórka za pomocą markerów immunofluorescencyjnych. Wszystkie obrazy VHSE zostały wykonane za pomocą mikroskopii konfokalnej w 8. tygodniu hodowli. Odpowiednie metody barwienia opisano w kroku 6 protokołu. Odpowiednie markery nabłonkowe są obecne zarówno w hDF VHSE (lewa kolumna), jak i w IMR90 VHSE (prawa kolumna). Inwolukryna i filagryna są późnymi markerami różnicowania keratynocytów i wykazują, że naskórek jest w pełni warstwowy w obu typach VHSE. Cytokeratyna 10 jest wczesnym markerem różnicowania, który identyfikuje warstwy nadbazalne w VHSE. Jądra komórkowe przedstawiono w rzutach ortogonalnych na żółto. Obrazy en face oraz maksymalnej projekcji ortogonalnej zostały wygenerowane za pomocą oprogramowania komputerowego; obrazy są skalowane indywidualnie z odjęciem tła i filtrowaniem medianowym dla zwiększenia przejrzystości. Paski skali wynoszą 100 µm. (Przeciwciała pierwotne i wtórne wraz z recepturą wewnętrznego buforu blokującego podano w Tabeli 3). Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rycina 3: Porównanie nieklarowanego i klarowanego VHSE. Ten VHSE został wygenerowany z komórek IMR90, a obrazy wykonano za pomocą mikroskopii konfokalnej w 4. tygodniu hodowli. Kolagen IV pokazano w kolorze cyjanowym; jądra komórkowe pokazano w kolorze magenta; kolor magenta w renderingu 3D po klarowaniu reprezentuje zagęszczenie jąder w warstwie naskórkowej VHSE. Obraz nieklarowanego VHSE jest przykładem tłumienia wiązki laserowej w grubszych konstruktach VHSE; dzięki klarowaniu (metanol i salicylan metylu) cały konstrukt może być obrazowany przy niewielkim lub żadnym tłumieniu laserowym od strony skórnej konstruktu. Ustawienia obrazowania, w tym linia laserowa, wzmocnienie i otwór pinhole, zostały obniżone dla klarowanego VHSE, aby zredukować nadmierne nasycenie. Klarowanie i obrazowanie wykonano zgodnie z opisem w krokach 6 i 7 protokołu. Obrazy ortogonalnej projekcji maksymalnej oraz rendering 3D wykonano za pomocą oprogramowania komputerowego; rendering 3D wygenerowano z obrazów klarowanego konstruktu. Obrazy zostały skalowane indywidualnie z zastosowaniem odejmowania tła i filtrowania medianowego w celu zwiększenia przejrzystości. Paski skali wynoszą 100 µm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 4: Trójwymiarowa analiza unaczynienia w obrębie VHSE. Obrazy wolumetryczne uzyskane za pomocą mikroskopii konfokalnej umożliwiają ilościowe określenie parametrów naczyniowych w punktach końcowych hodowli poprzez komputerową analizę obrazu. W obrębie podobjętości VHSE detekcja barwienia Kolagenu IV (cyjan) oznacza ściany śródbłonka naczyń i pozwala na segmentację naczyń na podstawie lokalizacji kolagenu IV; dane z segmentacji są następnie poddawane szkieletyzacji, a następnie wyznacza się środek każdego naczynia (magenta). Przykłady szkieletyzacji 3D przedstawiono dla nieprzejrzystych próbek IMR90 VHSE w 4. i 8. tygodniu. Uzyskane dane z zestawu eksperymentalnego IMR90 VHSE wykorzystano do obliczenia średnic naczyń oraz frakcji naczyniowej dla czterech podobjętości (każda o grubości 250 µm w kierunku z) w obrębie każdego konstruktu; dane uśredniono dla każdego VHSE, a następnie uśredniono dla każdego punktu czasowego hodowli. Dane te wykazują homeostazę sieci naczyniowej w okresie 4 i 8 tygodni hodowli, z średnicami odpowiadającymi ludzkiej skórze in vivo78 oraz frakcją naczyniową zbliżoną do wartości dla ludzkiej skóry in vivo79 (wykazano, że frakcja naczyniowa w konstruktach kolagenowych może być dostosowana48 i mogłaby zostać dodatkowo zoptymalizowana w celu uzyskania wyższych wartości). Dane przedstawiono jako średnie ± błąd standardowy średniej (S.E.M); n = 3 dla każdego punktu czasowego. Aby zobaczyć powiększoną wersję tego rysunku, kliknij tutaj.
| Podłoża | Komponenty |
| Linia komórkowa ludzkich fibroblastów skórnych (hDF) | DMEM z wysokim stężeniem glukozy |
| 5% płodowa surowica bydlęca (FBS) |
| 1% penicylina/streptomycyna (P/S) |
| Linia komórkowa fibroblastów IMR90 | DMEM/HAM’S F12 50:50 |
| 10% FBS |
| 1% P/S |
| Linia komórkowa komórek śródbłonka HMEC-1 | Podłoże podstawowe MCDB131 |
| 10% FBS |
| 1% P/S |
| L-glutamina [10 mM] |
| czynnik wzrostu naskórka (EGF) [10 ng/mL] |
| Hydrokortyzon [10 µg/mL] |
| Linia komórkowa keratynocytów N/TERT-1 | baza pożywki K-SFM |
| 1% P/S |
| Ekstrakt z przysadki bydlęcej (BPE) [25 µg/mL], z zestawu suplementacyjnego K-SFM |
| Epidermal Growth Factor (EGF) [0,2 ng/mL], z zestawu suplementacyjnego K-SFM |
| CaCl2 [0,3 mM] |
| Różnicowanie ekwiwalentu ludzkiej skóry (HSE) | DMEM: Ham’s F12 w stosunku 3:1 |
| 1% P/S |
| 0.5 µM Hydrokortyzon |
| 0.5 µM Izoproterenol |
| 0.5 µg/mL Insulina |
Tabela 1: Składy pośrodków. Podano składy pośrodków do hodowli 2D ludzkich fibroblastów skórnych, fibroblastów IMR90, HMEC-1 oraz keratynocytów N/TERT-1. Składy te zostały wykorzystane do namnażania linii komórkowych przed wytworzeniem VHSE. Pośrodek różnicujący dla ekwiwalentu ludzkiej skóry (HSE) jest stosowany do generowania VHSE; podano skład bazowy, natomiast w określonych etapach hodowli w zanurzeniu i indukcji stratyfikacji należy dodawać malejące ilości FBS, zgodnie z opisem w kroku 3 protokołu. Skład HSE opracowany na podstawie źródeł 11,80.
| Stężenie roztworu zapasu kolagenu (Cs): | 8 | mg/mL | | |
| Pożądana objętość (Vf): | 1 | mL | | |
| Normalizująca korekta NaOH*: | 1 | X | | |
| *Każda partia kolagenu musi zostać przetestowana w celu ustalenia ilości NaOH potrzebnej do ustawienia pH na 7 - 7.4 |
| | Pożądane stężenie kolagenu (mg/mL) |
| 2 | 3 | 4 | 5 |
| 10X PBS (Vpbs) | 0.1 | 0.1 | 0.1 | 0.1 |
| Zapas kolagenu (Vs) | 0.25 | 0.375 | 0.5 | 0.625 |
| 1N NaOH (VNaOH) | 0.00575 | 0.008625 | 0.0115 | 0.014375 |
| Pożywka (Vmedia) | 0.64425 | 0.516375 | 0.3885 | 0.260625 |
Tabela 2: Tabela referencyjna do obliczeń ilości kolagenu. Tabela referencyjna przedstawia najczęściej pożądane stężenia kolagenu obliczone przy założeniu stężenia roztworu zapasu kolagenu 8 mg/mL i pożądanej objętości końcowej 1 mL; wszystkie wartości podano w mL. Równania służące do obliczenia tych ilości podano w kroku 2.2 protokołu. Ważne jest sprawdzenie pH dla każdego roztworu zapasu kolagenu; w razie potrzeby należy dodać odpowiednią ilość NaOH, aby uzyskać pH 7 - 7,4 (po dodaniu PBS, NaOH, roztworu zapasu kolagenu oraz pożywki). Protokół został zoptymalizowany dla VHSE przy użyciu stężenia kolagenu 3 mg/mL; w przypadku różnych linii komórkowych lub pożądanych wyników końcowych konieczne mogą być zmiany stężenia kolagenu48.
| Przeciwciało pierwotne | Proszę podać tekst źródłowy do tłumaczenia. | Stężenie | Zastosowanie |
| Przeciwciało monoklonalne mysie IgG przeciwko filagrynie (AKH1) | Santa Cruz;
sc-66192 (200 µg/mL) | [1:250] | Marker późnej dyferencjacji15 |
| Królicze przeciwciało poliklonalne IgG przeciwko inwolukrynie | Proteintech;
55328-1-AP (30 µg/150 µL) | [1:250] | Marker późnego różnicowania terminalnego15 |
| Cytokeratyna 10 (DE-K10) mysi IgG, supernatant | Santa Cruz;
sc-52318 | [1:350] | Marker nadbazalny naskórka14,36,59 |
| Królicze przeciwciało poliklonalne przeciwko kolagenowi IV | Proteintech;
55131-1-AP | [1:500] | Śródledka ściany naczyniowej67 |
| DRAQ 7 | Sygnalizacja komórkowa; 7406 (0,3 mM) | [1:250] | Marker jądrowy |
| Przeciwciało wtórne | Proszę podać tekst źródłowy do tłumaczenia. | Stężenie | Zastosowanie |
| Przeciwciało kozie przeciwko króliczemu IgG sprzężone z DyLight™ 488 | Invitrogen; 35552 (1 mg/mL) | [1:500] | przeciwciało wtórne przeciwko kolagenowi IV |
| Przeciwciało anty-królicze IgG (H&L) Przeciwciało (GOAT) koniugowane z DyLight™ 549 | Rockland Immunochemicals; 611-142-002 | [1:500] | przeciwciało wtórne przeciwko inwolukrinowi |
| Kozie przeciwciała anty-mysie IgG (H&L), DyLight™ 488 | Thermo Scientific; 35502 (1 mg/mL) | [1:500] | Przeciwciało wtórne przeciwko filagrynie lub cytokeratynie 10 |
| BUFOR BLOKUJĄCY (500 ml) | |
| Odczynnik | Ilość | | |
| ddH2O | 450 ml | | |
| 10x PBS | 50 ml | | |
| albumina surowicy bydlęcej (BSA) | 5 g | | |
| Tween 20 | 0,5 ml | | |
| Żelatyna rybia rozpuszczalna w zimnej wodzie | 1 g | | |
| Azydek sodu (10% azydku sodu w diH2O) | 5 ml (stężenie końcowe 0,1%) |
Tabela 3: Przeciwciała pierwotne i wtórne oraz przepis na bufor blokujący. Wymienione przeciwciała i barwniki chemiczne zostały wykorzystane do barwień przedstawionych na Rysunku 2, Rysunku 3, Rysunku 4. Barwienie przeprowadzono zgodnie z krokiem 6 protokołu, stosując podany tutaj przepis na bufor blokujący. W zależności od wybranych technik hodowli i linii komórkowych może być wymagana optymalizacja stężeń barwników oraz czasu trwania procedury.
Tabela uzupełniająca 1: Lista skrótów.Lista skrótów zamieszczona dla wygody czytelnika. Kliknij tutaj, aby pobrać tę tabelę.
Materiały uzupełniające Rycina 1Pomoc techniczna VHSE w zakresie obsługi. Obsługa VHSE jest problematyczna, zwłaszcza podczas utrwalania, przetwarzania i barwienia. A-D odpowiada instrukcjom w krokach 5–7. A przedstawia techniczną procedurę usuwania membrany porowatej z insertu hodowlanego w celu zapewnienia prawidłowego barwienia. B pokazuje, jak utrzymać każdy VHSE w zanurzeniu podczas barwienia i przechowywania. C przedstawia najbezpieczniejszy i najłatwiejszy sposób przenoszenia konstruktów do studzienek obrazujących z PDMS. D przedstawia VHSE umieszczony w studzience obrazowej z PDMS: studzienka z PDMS jest przyklejona do szkiełka przedmiotowego na spodzie, tworząc okno do obrazowania, natomiast na górze umieszczono szkiełko przedmiotowe w celu utrzymania wilgotności podczas długotrwałych sesji obrazowania. Proszę kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Rycina uzupełniająca 2: Standardowa fluorescencyjna mikroskopia szerokopolowa może być wykorzystywana do oceny VHSE. Obrazowanie szerokopolowe może służyć do obrazowania wolumetrycznego w ramach rutynowej oceny, gdy mikroskopia skaningowa laserem nie jest dostępna. Jako przykład przedstawiono obrazy VHSE z perspektywy apikalnej i basolateralnej w formie projekcji maksymalnych en face oraz ortogonalnych (Ortho.). (Góra) Naskórek obrazowano z wykorzystaniem markerów takich jak inwolukryna i jądra komórkowe. (Dół) Unaczynienie skóry właściwej obrazowano z wykorzystaniem kolagenu IV jako markera. Dla zwiększenia przejrzystości z obrazów odjęto tło. Światło spoza płaszczyzny ogniskowania prowadzi do powstania artefaktów w postaci „smug” lub „odblasków”, widocznych w widokach ortogonalnych. Obrazowanie szerokopolowe może być stosowane do ilościowej analizy, lecz może wymagać bardziej zaawansowanego przetwarzania obrazu. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.