Tutaj prezentujemy jako przykład wydajny i stabilny system transformacji do analizy funkcjonalnej genu CcCIPK14, stanowiący techniczną podstawę do badania metabolizmu roślin niemodelowych.
Method Article
Tutaj prezentujemy jako przykład wydajny i stabilny system transformacji do analizy funkcjonalnej genu CcCIPK14, stanowiący techniczną podstawę do badania metabolizmu roślin niemodelowych.
Wydajny i stabilny system transformacji ma fundamentalne znaczenie dla badania funkcji genów i hodowli molekularnej roślin. W tym miejscu opisujemy zastosowanie systemu transformacji, w którym pośredniczy Agrobacterium rhizogenes, na grochu gołębim. Łodyga jest zakażona A. rhizogenes przenoszącym wektor binarny, który wywołał kalus po 7 dniach, a korzenie przybyszowe 14 dni później. Wygenerowany transgeniczny korzeń włochaty zidentyfikowano za pomocą analizy morfologicznej i genu reporterowego GFP. Aby jeszcze bardziej zilustrować zakres zastosowań tego systemu, CcCIPK14 (Calcineurin B-like protein-interacting protein kinases) przekształcono w groch gołębi przy użyciu tej metody transformacji. Rośliny transgeniczne potraktowano odpowiednio kwasem jasmonowym (JA) i kwasem abscysynowym (ABA) w celu zbadania, czy CcCIPK14 reaguje na te hormony. Wyniki wykazały, że (1) hormony egzogenne mogą znacznie zwiększać poziom ekspresjiCcCIPK14, zwłaszcza w roślinach z nadekspresją CcCIPK14 (OE); (2) zawartość genisteiny w liniach CcCIPK14-OE była istotnie wyższa niż w kontroli; (3) poziom ekspresji dwóch dalszych kluczowych genów syntazy flawonoidów, CcHIDH1 i CcHIDH2, był regulowany w górę w liniach CcCIPK14-OE; oraz (4) system transgeniczny owłosionych korzeni może być wykorzystany do badania metabolicznie funkcjonalnych genów w roślinach niemodelowych.
Transformacja to podstawowe narzędzie do oceny ekspresji genów egzogennych1,2. Wiele biologicznych aspektów roślin zasobowych jest wspólnych dla wszystkich roślin; w związku z tym badania funkcjonalne niektórych genów można przeprowadzić w roślinach modelowych (takich jak Arabidopsis)3. Jednak wiele genów w roślinach jest unikalnych pod względem funkcji i wzorców ekspresji, co wymaga badań na ich własnych lub blisko spokrewnionych gatunkach, zwłaszcza w przypadku roślin zasobowych3,4. Komórki roślinne mogą wyczuwać różne sygnały, które umożliwiają roślinom wykazywanie określonych zmian w ekspresji genów, metabolizmie i fizjologii w odpowiedzi na różne warunki stresu środowiskowego5,6,7. Flawonoidy odgrywają kluczową rolę w procesie sygnalizacji roślin, który reaguje na stresy środowiskowe5,8,9. Ponadto zawartość flawonoidów w roślinach ogrodniczych i leczniczych jest również ważnym wskaźnikiem oceny jakości10. Identyfikacja genów zaangażowanych w regulację syntezy flawonoidów w odpowiedzi na sygnały zewnętrzne ma kluczowe znaczenie dla zrozumienia mechanizmu syntezy flawonoidów w roślinach. Kilka badań wykazało, że stosowanie hormonów egzogennych może sprzyjać akumulacji flawonoidów6,11. Stabilny system transformacji i metoda walidacji funkcji genów są niezbędne do zademonstrowania funkcji genów i zrozumienia metabolizmu wtórnego w roślinach.
Transformacja za pośrednictwem Agrobacterium jest szeroko stosowana w insercji DNA5,8,9. Agrobacterium tumefacient może przenosić geny pierścieniowe do chromosomów komórek roślinnych, a egzogenne fitohormony indukują pojedyncze lub kilka komórek gospodarza, które mogą regenerować rośliny w celu uzyskania stabilnych transformantów12,13,14. Metody transformacji za pośrednictwem Agrobacterium są bardziej odpowiednie dla gatunków roślin nadających się do manipulacji in vitro, podczas gdy większość wieloletnich roślin drzewiastych ogranicza stosowanie tej metody ze względu na ich trudność w regeneracji4,15. A. rhizogenes jest również w stanie modyfikować genom komórek gospodarza16. W niniejszym badaniu opracowaliśmy wydajną i stabilną procedurę transformacji, w której pośredniczy A. rhizogenes. A. rhizogenes zawiera drugi plazmid binarny przenoszący nienaturalny gen T-DNA oprócz plazmidu Ri. Roślina żywicielska jest zainfekowana, a roślinę kompozytową można uzyskać z transgenicznymi owłosionymi korzeniami wyłaniającymi się z pędu dzikiego16,17. Systemy przemian za pośrednictwem A. rhizogenes nadają się do stosowania w badaniach roślin drzewiastych ze względu na ich szybką, tanią i niewymaganą regenerację roślin. Ponad 160 rodzajów roślin z powodzeniem wywołało owłosione korzenie, a większość z nich znajduje się w Solanaceae, Compositae, Cruciferae, Convolvulaceae, Umbelliferae, Leguminosae, Caryophyllaceae i Polygonaceae18,19. W porównaniu z A. tumefaciens, A. rhizogenes wykazał wyższą skuteczność w transformacji za pośrednictwem gołębi grochu17,20.
W tym badaniu, groch gołębi został użyty jako przykład do wprowadzenia procesu przemiany, w którym pośredniczy A. rhizogenes. Od zaszczepienia do ukorzenienia eksperymenty trwały 5 tygodni. Zidentyfikowaliśmy transformację korzenia przybyszowego poprzez morfologię i gen reporterowy GFP, a wydajność transformacji wyniosła aż 75%. Ponadto potraktowaliśmy roślinę kompozytową JA i ABA, a także wykryliśmy transkrypty i metabolity wtórne za pomocą ilościowego PCR na żywo i HPLC (wysokosprawna chromatografia cieczowa). Potwierdzono, że poziom ekspresji CcCIPK14 odpowiada nie tylko na JA i ABA, ale także wpływa na biosyntezę flawonoidów. System ten jest odpowiedni do badania genów funkcjonalnych związanych z metabolizmem wtórnym. Zapewnia również nowe podejście do badania roślin niemodelowych w przypadku braku wystarczającego stabilnego systemu transformacji17,21,22.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
UWAGA: Groch gołębi to diploidalna roślina strączkowa należąca do rodziny bobowatych (Fabaceae). Nasiona grochu gołębiego użyte w tym eksperymencie pochodzą z Północno-Wschodniego Uniwersytetu Leśnictwa w Chinach i są oznaczone kodem 87119. Podstawowe kroki tego protokołu są zilustrowane w Rysunek 1A. Inkubację sadzonek przeprowadzono w środowisku o wysokiej wilgotności w temperaturze 25 °C pod lampami fluorescencyjnymi przy 50 μmol fotonów na m-2 s-1 w fotoperiodze trwającym 16 godzin. W laboratorium zachowały się szczepy A. rhizogenes K599 (NCPPB2659). Przechowywano je w pożywce drożdżowo-mannitolowej (YEP) z 15% glicerolem w temperaturze -80 °C. Protokół opisany w tej pracy został oparty na protokole Meng et al.21.
UWAGA: Umieść wszystkie genetycznie zmodyfikowane bakterie i rośliny w odpowiednim pojemniku na odpady. Używaj wszystkich niebezpiecznych chemikaliów w dygestoriach i wyrzucaj je do pojemnika na odpady niebezpieczne.
1. Przygotowanie sadzonek grochu gołębiego
2. Aktywacja A. rhizogenes
UWAGA: Szczepem używanym do przemiany A. rhizogenes był K599 zachowany w temperaturze -80 °C. Wektor binarny pROK2 (pBIN438; http://www.biovector.net/product/428388.html) zawiera białko zielonej fluorescencji (GFP) jako gen wskaźnikowy oraz gen oporności na kanamycynę jako selektywny marker do transformacji A. rhizogenes.
3. Transformacja roślin za pomocą A. rhizogenes
UWAGA: Wybierz zdrowe rośliny, aby zainfekować A. rhizogenes, korzystając z następującej procedury iniekcji. Zabieg ten powoduje przekształcenie owłosionych korzeni. Aby przeanalizować funkcję genu CcCIPK14, potrzebna jest kontrola. Roztwory A. rhizogenes z pustym wektorem lub plazmidami CcCIPK14-pROK2 wstrzyknięto do siewek w celu wywołania owłosionych korzeni.
4. Identyfikacja przekształconych owłosionych korzeni
UWAGA: Przekształcone owłosione korzenie można zidentyfikować na podstawie morfologii i poziomu genów. Procedura ta koncentruje się przede wszystkim na teście identyfikacji genu reporterowego (GFP).
5. Leczenie hormonami egzogennymi
UWAGA: Rośliny z dodatnim wynikiem kompozytu zostały potraktowane egzogennymi hormonami w celu zbadania wpływu CcCIPK14 na metabolizm. Złożone rośliny indukowane przez A. rhizogenes podzielono na trzy grupy: grupę traktowaną przez JA, grupę traktowaną ABA i grupę kontrolną (Figura 3A).
6. Pobieranie i przechowywanie próbek
UWAGA: Po 3 godzinach leczenia hormonami egzogennymi, zebrano materiały roślinne z różnych grup leczenia.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
A. rhizogenes -pośredniczyła przemiana owłosionego korzenia na grochu gołębi
W badaniu tym opisano krok po kroku protokoły transformacji genetycznej owłosionych korzeni, w której pośredniczy A. rhizogenes, co ma znaczenie w dziedzinie cząsteczek roślinnych. Potrzeba było około 5 tygodni, aby uzyskać owłosione korzenie z korzeni grochu gołębiego zainfekowanego przez A. rhizogenes. Rysunek 1A pokazuje przegląd ca...
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Szybka charakterystyka funkcji genów jest wspólnym celem w badaniu większości gatunków i jest szczególnie ważna dla rozwoju roślin zasobowych. Transformacja, w której pośredniczy A. rhizogenes, jest szeroko stosowana w kulturach owłosionych korzeni. Kultura owłosionych korzeni (HRC), jako unikalne źródło produkcji metabolitów, odgrywa kluczową rolę w inżynierii metabolicznej 18,28. Zastosowanie tej technologii ogranicza się głównie do funkcji genów i...
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Autorzy oświadczają, że nie są im znane żadne konkurencyjne interesy finansowe ani powiązania osobiste, które mogłyby mieć wpływ na pracę opisaną w tym artykule.
Autorzy dziękują za wsparcie finansowe ze strony Narodowej Fundacji Nauk Przyrodniczych Chin (31800509, 31922058), Outstanding Young Talent Fund in Beijing Forestry University" (2019JQ03009), Funduszy Badań Podstawowych dla Uniwersytetów Centralnych (2021ZY16), Beijing Municipal Natural Science Foundation (6212023) oraz National Key R&D Program of China (2018YFD1000602,2019YFD1000605-1) oraz Beijing Advanced Innovation Center for Tree Breeding by Projekt molekularny. Pragnę podziękować Zhengyang Hou za jego wskazówki podczas pisania artykułu oraz profesorowi Meng Dong za wskazówki dotyczące idei artykułu.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| Probówka qPCR 0,1 ml z 8 paskami (z nasadkami optycznymi) | KIRGEN, Szanghaj, Chiny | KJ2541 | |
| ABA | Solarbio Life Science, Pekin, Chiny | A8060 | |
| Agar w proszku | Solarbio Life Science, Pekin, Chiny | A8190 | |
| Wirówka | Osterode am Harz, Niemcy | d37520 | |
| Moduł optyczny CFX Connect TW | Bio-rad, USA | 1855200 | |
| inkubator stałotemperaturowy | Szanghaj Boxun Przemysł i Commerce Co., Ltd, Szanghaj, Chiny | BPX-82 | |
| Jednorazowa szalka Petriego | Corning, amerykańska | ||
| sucha kąpiel | Gingko Bioscience Company/Coyote bioscience, Chiny | H2H3-100C | |
| Eastep Total RNA Extraction Kit50 | Promega, Pekin, Chiny | LS1030 | |
| Waga elektroniczna | Tianjin, Chiny | TD50020 | |
| Papa | filtracyjnaHangzhou wohua Filter Paper Co., Ltd, Chiny | ||
| FiveEasy Plus | Mettler Toledo, Szanghaj, Chińska Republika Ludowa | 30254105 | |
| Doniczka 9*9 | Chiny | ||
| JA | Solarbio Life Science, Pekin, Chiny | J8070 | |
| Kan | Solarbio Life Science, Pekin, Chiny | K8020 | |
| MagicSYBR Mixture | CWBIO, Pekin, Chiny | ||
| Mini mikrowirówka | Scilogex, Pekin, Chiny | S1010E | |
| NaCl | Solarbio Life Science, Pekin, Chiny | S8210 | |
| NanPhotometer N50 Touch | IMPLEN GMBH, Niemcy | T51082 | |
| Purelab untra | |||
| Rifampicin | Solarbio Life Science, Pekin, Chiny | R8010 | |
| Skrzynka na sadzonki 30*200 | China | ||
| Thermal Rowerzysta PCR | Bio-rad, oscylator | T100 | |
| Donglian Beijing Donglian Har Instrument Manufacture Co., Ltd, Chiny | DLHE-Q200 | ||
| Tomy Autoclave | Tomy, Japonia | SX-500 | |
| Tryptone | Solarbio Life Science, Pekin, Chiny | LP0042 | |
| UEIris II RT-PCR System do syntezy pierwszej nici cDNA (z dsDNazą) | US Everbright INC, Jiangsu, Chiny | R2028 | |
| Ekstrakt drożdżowy w proszku | Solarbio Life Science, Pekin, Chiny | LP0021 |
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request Permission