Przedstawiliśmy szczegółowe instrukcje krok po kroku dotyczące szybkiej i łatwej metody przejścia od nowej linii komórkowej do jej analizy. Proces rozpoczynamy od nadekspresji fluorescencyjnego znacznika przy użyciu lentiwirusowej kasety nadekspresyjnej (kroki 3 i 4). Następnie przeprowadzamy przygotowanie komórek w celu zapewnienia jak najmniejszej martwej objętości podczas wstrzykiwania, co pozwala na podanie wysokiej liczby komórek zarówno do doC, jak i do przestrzeni zaocznej (kroki 6 i 7). W dalszej kolejności wykonujemy półwysokoprzepustową akwizycję danych z wykorzystaniem mikroskopii stereofluorescencyjnej oraz konfokalnej mikroskopii o większym powiększeniu w celu jakościowej analizy rozsiewu komórek nowotworowych w całym organizmie (Rycina 2 oraz kroki 10, 11 i 12). Podczas pozyskiwania danych należy zachować ostrożność, aby zapewnić powtarzalność obrazowania w mikroskopii stereoskopowej i konfokalnej; w tym celu określono ogólne ustawienia i standaryzację (kroki 11 i 12). Omówiono analizę danych (z wykorzystaniem oprogramowania ImageJ/Fiji). 16oraz standaryzacja z wykorzystaniem makr ImageJ (krok 13).
W kroku 3 wspomnieliśmy o przejściowym znakowaniu komórek (nowotworowych) w celu przeprowadzenia szybkiego wstępnego przesiewu pozwalającego ocenić potencjał tumorigenny nowej linii komórek rakowych. Jednym z istotnych zastrzeżeń jest fakt, że mimo łatwości użycia i długotrwałości, opisane tutaj barwienie przejściowe może prowadzić do powstawania artefaktów (tj. należy zachować ostrożność, aby upewnić się, że fragmenty komórek można odróżnić od całych komórek, co zostało szczegółowo wykonane przez Fiora i współpracowników 9). W naszym doświadczeniu powstawanie tych artefaktów jest bezpośrednio powiązane z ekstremalną stabilnością barwnika i jego jasnością (nawet po śmierci komórki), w wyniku czego fragmenty komórek ulegają rozproszeniu i są pochłaniane przez komórki odpornościowe, co mogłoby prowadzić do błędnego wniosku, że pochodzą one z aktywnej przerzutowości.
W obu opisanych modelach – zarówno w przypadku systemowego wszczepienia poprzez kanał doprzeczułkowy (doC), jak i miejscowego wszczepienia w przestrzeń zaoczną – kluczowe znaczenie ma dokładna analiza larw w dniu następującym po iniekcji. Jak pokazano w Rysunek 2B Należy usunąć wszystkie larwy, u których stwierdzono mechaniczne przemieszczenie przeszczepionych komórek do obszaru głowy (poza miejsce zaoczno-orbitalne) w modelu zaoczno-orbitalnym oraz komórki w pęcherzyku żółtkowym, a także larwy wykazujące obrzęk w puli wstrzykniętej do krążenia (doC). Wszystkie negatywnie wyselekcjonowane fenotypy przedstawiono jako wysokorozdzielcze obrazy mozaikowe z mikroskopu konfokalnego w Rysunek 2ale można je łatwo dostrzec i usunąć podczas obserwacji pod stereomikroskopem.
Z czasem komórki będą migrować oraz proliferować. W modelu zaoczno-orbitalnym zaobserwowano naciekanie do sąsiednich tkanek w przypadku CRMM1, natomiast w przypadku CRMM2 odnotowano mniejszą proliferację. Uderzające było zaobserwowanie przerzutów odległych pojawiających się między 2. a 4. dniem po iniekcji (dpi) u niektórych osobników (20%), gdzie zmierzono istotną różnicę w 6. dniu po iniekcji, co przedstawiono na Rysunku 4. Dla obu linii komórkowych przebadano potencjał proliferacyjny po wstrzyknięciu w oba miejsca. Dla CRMM1 stwierdzono istotny (p<0.0001) wzrost liczby komórek nowotworowych w miejscach wstrzyknięcia lub w ich pobliżu, przy przedstawieniu wyników jako znormalizowane obciążenie komórkami nowotworowymi, z normalizacją do pierwszego dnia dla każdego modelu (wzrost 7,8-krotny, ±3,2 dla modelu RO oraz wzrost 15-krotny ±8,8 dla modelu doC). CRMM2 nie wykazało istotnego wzrostu po normalizacji do pierwszego dnia dla każdego indywidualnego modelu (wzrost 2,4-krotny, ±1,9- oraz wzrost 2,3-krotny, ±1,14 dla RO i doC). Stwierdzono, że CRMM1 łatwo proliferuje zarówno w tkance zaoczno-orbitalnej, jak i w ogonowej tkance krwiotwórczej po przeszczepieniu. Linia komórkowa CRMM2 wykazywała mniejszą zdolność do proliferacji w obu modelach, lecz interesujące jest to, że okazała się zdolna do tworzenia przerzutów odległych po wstrzyknięciu do przestrzeni zaoczno-orbitalnej, co pokazano na Rysunku3B,C.
Po przesiewaniu wstrzykniętych larw w 1 dpi i losowym przydzieleniu osobników do grup badawczej lub kontrolnej, ryby były leczone przez 6 dni, przy jednoczesnej wymianie wody zawierającej Vemurafenib (inhibitor ten można łatwo zastąpić jakimkolwiek innym miareczkowanym związkiem przeciwnowotworowym). Postanowiliśmy rozszerzyć wcześniej opublikowany model rozsiewania krwiopochodnego czerniaka spojówki poprzez przeszczepienie CRMM114, testując skuteczność Vemurafenibu w przypadku ortotopowego przeszczepienia CRMM1. W przypadku CRMM1 odnotowano silny i istotny statystycznie spadek w grupie z ectopicznym przeszczepieniem leczonej Vemurafenibem (P<0.0001) oraz ograniczoną, lecz istotną odpowiedź w modelu z przeszczepieniem ortotopowym (p<0.05), co przedstawiono na Rysunku 4.

Rycina 2. Ocena fenotypowa i przesiew po wstrzyknięciu. A) Schematyczna prezentacja generowania zszywanych obrazów konfokalnych ksenoprzeszczepów u rybek zebrafish, co pozwala na uzyskanie bezszwowych obrazów o wysokiej rozdzielczości po integracji kolejnych projekcji konfokalnych. Tutaj ksenoprzeszczepy zebrafish są zatopione w 1% niskotopliwym agarozie i zamontowane na szklanej płytce konfokalnej (opisano w kroku 11.3). B) Przedstawiono wszystkie możliwe wyniki przeszczepienia do przestrzeni zaocznej oraz do przewodu Cuviera, wykonanego u rybek zebrafish z reporterem naczyń krwionośnych wykazującym zieloną fluorescencję (TG:fli:GFP), z komórkami barwionymi poprzez lentiwirusową nadekspresję tdTomato). Wskazano prawidłowy przeszczep w 1 dpi (panel RO) oraz niepożądane fenotypy (zarówno wyciek do mózgu, jak i wyciek do naczyń krwionośnych). Te dwie ostatnie populacje muszą zostać usunięte, aby upewnić się, że nie wpłyną one na późniejsze wyniki eksperymentalne. C) Niepożądane fenotypy dla przeszczepu hematogennego przez przewód Cuviera (doC) są zaznaczone, gdzie larwy z obrzękiem serca (Cardiac edema) oraz larwy z komórkami wyciekającymi do pęcherzyka żółtkowego (Yolk injection) muszą zostać usunięte, aby zapobiec zakłóceniom w dalszych pomiarach. Prawidłowo wstrzyknięte larwy są przydzielane do grup eksperymentalnych zgodnie z opisem w kroku 7.1. (Wszystkie obrazy pozyskano w 1 dpi za pomocą mikroskopu konfokalnego, paski skali 200 µm. Żółte ramki wskazują miejsca przerzutów odpowiednio dla przeszczepów RO (region głowy) i doC (tkanka krwiotwórcza ogonowa)). Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 3. Analiza porównawcza linii komórkowych czerniaka spojówki CRMM1 i CRMM2 wykazuje różną zdolność do przerzutowania i wzrostu. A) Schematyczny opis modeli wstrzykiwania: modelu zaocznego (RO) oraz modelu engraftingu krwiopochodnego (doC); użyte ryby to reportery zielonych naczyń krwionośnych TG(fli:GFP), a komórki nadmiernie ekspresujące tdTomato są zaznaczone na czerwono. B) Reprezentatywne fenotypy ryb z przeszczepionymi liniami CRMM1 i CRMM2; CRMM1 wykazuje efektywny engrafting (zarówno RO, jak i doC) oraz niewielką inwazję do tkanki otaczającej miejsce engraftingu RO (RO, żółte groty strzałek). CRMM2 wykazuje znacznie niższą efektywność engraftingu dla obu modeli, ale wykazuje przerzuty odległe po wstrzyknięciu zaocznym (jak pokazano w RO, zaznaczone grotami strzałek). (Wszystkie obrazy wykonano w 6 dpi przy użyciu mikroskopu konfokalnego, paski skali 200 µm. Żółte groty strzałek wskazują miejsca przerzutów dla engraftingu RO i doC, odpowiednio w regionie głowy i w ogonowej tkance krwiotwórczej). C) Wykresy kinetyki engraftingu dla CRMM1 i CRMM2; porównując oba modele engraftingu do dnia 1 (normalizacja do dnia 1), obserwuje się istotny (p<0,0001) wzrost znormalizowanego obciążenia nowotworowego dla linii komórkowej CRMM1 (między 1 dpi a 6 dpi), podczas gdy dla CRMM2 widoczna jest (nieistotna) tendencja wzrostowa. CRMM1 wykazuje istotną różnicę między wzrostem w modelu RO a doC, gdzie model doC wykazuje wyższą stopę ekspansji guza (około 2-krotnie wyższą dla larw z engraftingiem doC). Wykresy przedstawiają średnią i błąd standardowy średniej (SEM). Wszystkie grupy zostały znormalizowane do 1 dpi dla każdego indywidualnego stanu. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 4. Inhibitor BRAF V600E, vemurafenib, znacząco hamuje wzrost w szczepionych larwach zebrafish w modelach RO i doC czerniaka spojówki. A) Schematyczny przedstawienie fenotypów rybek zebrafish, modele RO i doC. B) Larwy szczepione w obu modelach (RO i doC), w które wstrzyknięto linię komórkową czerniaka spojówki CRMM1, wykazują znaczną redukcję znormalizowanego obciążenia nowotworowego (odpowiednio p<0.05 i P<0.001). Modele zebrafish szczepione doC wskazują na zwiększoną odpowiedź na lek oraz zależność hamowania niezależną od dawki, co sugeruje możliwe nasycenie inhibicji. Wykresy przedstawiają średnią i błąd standardowy średniej (SEM). Wszystkie grupy zostały znormalizowane względem kontroli dla każdej poszczególnej linii komórkowej. Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tego rysunku.
| Odczynnik | Tom |
| psPAX2 | 1,71 pmol (12.14µg) |
| pMD2.G | 0,94 pmol (3.66µg) |
| Plazmid transferowy | 1,64 pmol (obliczyć dokładną objętość) |
Tabela 1.