Artykuł metodologiczny

Ekstrakcja, oczyszczanie i profilowanie gangliozydów

DOI:

10.3791/62385

12 marca 2021

* These authors contributed equally

W tym artykule

Podsumowanie

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Gangliozydy to glikosfingolipidy zawierające kwas sjalowy, których szczególnie dużo występuje w mózgu. Ich amfipatyczny charakter wymaga technik ekstrakcji i oczyszczania organicznego/wodnego, aby zapewnić optymalny odzysk i dokładne analizy. Ten artykuł zawiera omówienie ekstrakcji gangliozydów w skali analitycznej i preparatywnej, oczyszczania i analizy chromatografii cienkowarstwowej.

Streszczenie

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Gangliozydy to glikosfingolipidy, które zawierają jedną lub więcej reszt kwasu sjalowego. Znajdują się one we wszystkich komórkach i tkankach kręgowców, ale szczególnie obfite występują w mózgu. Ulegające ekspresji głównie na zewnętrznej ulotce błon plazmatycznych komórek, modulują aktywność białek powierzchniowych komórek poprzez asocjację boczną, działają jako receptory w interakcjach komórka-komórka i są celem dla patogenów i toksyn. Genetyczna dysregulacja biosyntezy gangliozydów u ludzi prowadzi do poważnych wrodzonych zaburzeń układu nerwowego. Ze względu na ich amfipatyczny charakter, ekstrakcja, oczyszczanie i analiza gangliozydów wymagają technik, które zostały zoptymalizowane przez wielu badaczy w ciągu 80 lat od ich odkrycia. W tym miejscu opisujemy laboratoryjne metody ekstrakcji, oczyszczania oraz wstępnych analiz jakościowych i ilościowych głównych gangliozydów z tkanek i komórek, które można wykonać w ciągu kilku godzin. Opisujemy również metody izolacji i oczyszczania głównych gatunków gangliozydów z mózgu na większą skalę. Łącznie metody te zapewniają analityczny i preparatywny dostęp do tej klasy cząsteczek bioaktywnych.

Wprowadzenie

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Gangliozydy są zdefiniowane jako glikosfingolipidy zawierające jedną lub więcej reszt kwasu sjalowego1. Są one wyrażane głównie na powierzchni komórki za pomocą hydrofobowego ugrupowania lipidowego ceramidów osadzonego w zewnętrznej płatku błony plazmatycznej i ich hydrofilowych glikanów rozciągających się do przestrzeni zewnątrzkomórkowej2. Chociaż są szeroko rozpowszechnione w komórkach i tkankach kręgowców, są szczególnie obfite w mózgu kręgowców 3, gdzie zostały po raz pierwszy odkryte i nazwane4.

Struktura glikanów gangliozydowych różni się i stanowi podstawę ich nomenklatury (Rysunek 1). Glikany gangliozydowe składają się z obojętnego rdzenia cukrowego o różnej liczbie i rozmieszczeniu kwasów sjalowych. Najmniejszy gangliozyd, GM4, ma tylko dwa cukry (kwas sjalowy związany z galaktozą)5. Większe, naturalnie występujące gangliozydy mogą zawierać znacznie więcej niż tuzin cukrów ogółem6 lub do siedmiu kwasów sjalowych na jednym neutralnym rdzeniu7. Ich ugrupowania lipidowe ceramidów również się różnią, mają różną długość sfingozyny i różne amidy kwasów tłuszczowych. W mózgu kręgowców przeważają cztery gatunki gangliozydów: GM1, GD1a, GD1b i GT1b. Ekspresja gangliozydów jest regulowana rozwojowo, specyficzna dla tkanki i typu komórki.

figure-introduction-1
Rysunek 1: Główne gangliozydy mózgowe i ich biosyntetyczne prekursory. Struktury są wyświetlane przy użyciu nomenklatury symboli dla glikanów11. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Gangliozydy funkcjonują na poziomie molekularnym poprzez angażowanie i modulowanie białek w ich własnych błonach (regulacja cis) lub poprzez angażowanie białek wiążących glikany w środowisku zewnątrzkomórkowym, w tym toksyn bakteryjnych i lektyn na innych komórkach (rozpoznawanie trans)3. Specyficzne wiązanie gangliozydów z białkami regulatorowymi i/lub samoasocjacja z innymi cząsteczkami w tratwy lipidowe powoduje zmiany w zachowaniu komórek, które wpływają na strukturę i funkcję układu nerwowego, progresję raka, metabolizm, stan zapalny, proteinopatie neuronalne i choroby zakaźne8. Ze względu na ich różnorodne role komórkowe, metody ich izolacji i analizy mogą zapewnić lepszy wgląd w regulację procesów fizjologicznych i patologicznych. W tym miejscu przedstawiono sprawdzone metody szybkiej ekstrakcji i analizy na małą skalę oraz preparatywnej izolacji gangliozydów z mózgu. Omówiono możliwości i wyzwania związane z zastosowaniem do innych tkanek.

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Protokół

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Pobieranie tkanek zostało przeprowadzone na warunkach zatwierdzonych przez Johns Hopkins Animal Care and Use Committee.

1. Ekstrakcja gangliozydów na małą skalę i częściowe oczyszczanie

UWAGA: Używaj odpowiedniej wentylacji podczas pracy z lotnymi i toksycznymi rozpuszczalnikami. Unikaj plastiku przez cały czas; Rozpuszczalniki będą wydobywać składniki chemiczne z wielu tworzyw sztucznych, które zakłócają późniejsze analizy. Politetrafluoroetylen (PTFE) jest wyjątkiem; Do zakręcania szklanych fiolek do przechowywania należy używać zakrętek wyłożonych PTFE.

  1. wydobywanie
    1. Zważyć pojedynczy świeży lub rozmrożony mózg myszy (lub strzałkowy półmózg, ~ 0,2-0,5 g) i umieścić w homogenizatorze Potter-Elvehjem wstępnie schłodzonym w wiadrze z lodem.
      UWAGA: Wcześniej zamrożone mózgi można wykorzystać po rozmrożeniu w temperaturze 0-4 °C.
    2. Dodać 4,1 ml na g mokrej masy tkanki wody i homogenizować za pomocą 10 pociągnięć.
      UWAGA: Dokładne proporcje rozpuszczalników są kluczem do optymalnej ekstrakcji i podziału, celem jest chloroform-metanol-wodny (4:8:3), zakładając, że tkanka mózgowa jest w 80% wodnista.
    3. Dodać 13 ml na g mokrej masy tkanki metanolu, zmienić temperaturę na temperaturę otoczenia (22 °C) i wymieszać.
      UWAGA: Roztwór będzie wyglądał na mętny. Dodanie metanolu na tym etapie, bez chloroformu, optymalizuje wytrącanie białek. Wszystkie kolejne kroki odbywają się w temperaturze otoczenia (22 °C).
    4. Przenieść do grubościennej szklanej rurki z nakrętką wyłożoną PTFE w temperaturze otoczenia (22 °C) i dokładnie wymieszać. Dodać 6,5 ml na g mokrej masy tkanki chloroformu, nakrętkę i dokładnie wymieszać. Wirować przy 450 x g przez 15 min. Przenieść klarowny supernatant do świeżej probówki z nakrętką i zmierzyć objętość, "objętość odzyskanego ekstraktu".
  2. partycja
    1. Dodać 0,173x "odzyskaną objętość ekstraktu" wody do klarownego supernatantu, zakryć, energicznie odwirować i odwirować zgodnie z opisem w kroku 1.1.4.
      UWAGA: Celem jest uzyskanie chloroformu-metanolu-wodnego w stosunku 4:8:5,6. Mieszanina będzie mętna i rozpadnie się na dwie fazy: górną fazę bogatą w wodę i dolną fazę bogatą w chloroform w stosunku ~ 4:1. Odczekaj 60 minut lub odwiruj przy 450 x g przez 15 minut, aby całkowicie oddzielić fazy.
    2. Przenieś górną fazę, która zawiera gangliozydy, do świeżej szklanej rurki z nakrętką wyłożoną PTFE.
  3. Chromatografia kartridżowa z odwróconymi fazami
    1. Za pomocą szklanej strzykawki o pojemności 5 ml umyć wkład ekstrakcyjny tC18 do fazy stałej (400 mg) 3 ml metanolu, a następnie 3 ml chloroformu, metanolu i wody (2:43:55). Załaduj górną fazę z kroku 1.2.2 na wkład tC18 za pomocą tej samej szklanej strzykawki, zbierz przepływ i ponownie załaduj go do kolumny, aby zoptymalizować adsorpcję.
    2. Za pomocą szklanej strzykawki przemyć wkład 3 ml chloroformu-metanolu-wody (2:43:55), a następnie 3 ml metanolu-wody (1:1).
    3. Usunąć gangliozydy za pomocą 3 ml metanolu do świeżej zakręcanej probówki. Odparować do sucha pod delikatnym strumieniem azotu w temperaturze ≤ 45 °C. Rozpuścić w metanolu w ilości 1 ml na g pierwotnej mokrej masy tkanki.

2. Ekstrakcja i oczyszczanie gangliozydów na dużą skalę

UWAGA: Podczas pracy z lotnymi rozpuszczalnikami, używaj mieszadeł odpornych na wybuch. Nie używaj tworzyw sztucznych z wyjątkiem PTFE. Tetrahydrofuran, chloroform i eter etylowy są toksycznymi lotnymi związkami organicznymi. Pracować pod wyciągiem z rękawicami ochronnymi i okularami ochronnymi.

  1. wydobywanie
    1. Zamrożony móżdżek bydlęcy rozmrażać w temperaturze 4 °C przez kilka godzin. Wypreparuj istotę szarą z opon mózgowych i istoty białej.
      UWAGA: Poniższa procedura jest opisana dla 100 ± 20 g izolowanej istoty szarej mózgu i jest skalowalna.
    2. Umieścić 100 g istoty szarej mózgu w blenderze i dodać 1 ml na g mokrej masy mózgu schłodzonego 10 mM buforu fosforanu potasu o pH 6,8. Homogenizować na niskim poziomie przez 20 s. Dodaj 8 ml tetrahydrofuranu na g mokrej masy mózgu i homogenizuj na małym ogniu przez 10 sekund. Przelać do szklanych butelek wirówkowych i odwirować przy 5 000 x g przez 15 minut w temperaturze otoczenia (22 °C).
    3. Zebrać supernatant, zmierzyć jego objętość i przenieść do szklanego lejka rozdzielającego. Dodać 0,3 ml eteru etylowego na ml supernatantu. Wstrząśnij energicznie, a następnie pozostaw na 30 minut, podczas których rozdzielają się dwie fazy, górna faza eterowa i dolna faza wodna. Zbierz dolną fazę, która zawiera gangliozydy, do szklanej butelki z nakrętką wyłożoną PTFE.
    4. Do górnej fazy (eteru) pozostałej w rozdzielaczu dodać 0,1 ml wody na ml oryginalnego supernatantu (krok 2.1.3). Wstrząśnij energicznie, poczekaj, aż fazy się rozdzielą, zbierz dolną (wodną) fazę i połącz z poprzednią dolną fazą. Odparować połączone dolne fazy na suchy proszek i zważyć.
  2. zmydlanie
    1. Dodać 10 ml 100 mM wodnego roztworu NaOH na g proszku do szczelnie zamkniętej probówki. Wymieszać i inkubować w temperaturze 37 °C przez 3 godziny. Pozostawić do ostygnięcia i dostosować do pH 4,5 przez kroplowe dodawanie 100 mM wodnego roztworu HCl. Zmierzyć objętość i przenieść do szklanego lejka separatora.
      UWAGA: Kwasy sjalowe są kwasotrwałe; unikać zakwaszania poniżej pH 4,5.
    2. W oparciu o objętość roztworu wodnego dodać 2,67 objętości metanolu, delikatnie wymieszać, a następnie dodać 1,33 objętości chloroformu, aby uzyskać jednofazowy roztwór chloroformu-metanolu-wodnego roztworu (4:8:3). Dobrze wymieszaj.
    3. W oparciu o pierwotną objętość roztworu wodnego dodać 2,6 objętości wody, aby doprowadzić mieszaninę do stanu chloroform-metanol-wodny w stosunku 4:8:5,6. Wstrząśnij energicznie, a następnie pozostaw w spokoju, aby oddzielić dwie fazy, polarną górną fazę zawierającą gangliozydy i niepolarną dolną fazę. Zbierz górną fazę do szklanej butelki z nakrętką wyłożoną PTFE.
      UWAGA: Niesjalizowane lipidy nie pojawią się na płytkach chromatografii cienkowarstwowej (TLC) barwionych przy użyciu rezorcyny, ale pojawią się przy użyciu barwienia aldehydem p-aniszowym. Celem tego zmydlania jest usunięcie związków O-acetylowanych, takich jak fosfolipidy.
  3. Chromatografia z odwróconymi fazami
    1. Umyć wstępnie duży (10 g) wkład do ekstrakcji tC18 do fazy stałej, przepuszczając 50 ml każdego z następujących trzech rozpuszczalników przez kolumnę za pomocą podciśnienia lub ciśnienia (<1 min każde płukanie): metanol, metanol-woda (1:1), a następnie chloroform-metanol-woda (2:43:55). Załaduj górną fazę z kroku 2.2.3 na kolumnę za pomocą podciśnienia lub ciśnienia, zbierz przepływ, ponownie załaduj i zbierz przepływ.
    2. Przemyć kolumnę 30 ml chloroformu-metanolu-wody (2:43:55), następnie 30 ml metanolu-wody (1:1), następnie wymyć gangliozydy 50 ml metanolu i ponownie 10 ml metanolu, zbierając oddzielnie każde przepłukanie i każdą elucję. Stosując TLC (poniżej) potwierdzić, że gangliozyd jest nieobecny w przepływie i przemywa się i eluuje w pierwszej elucji (50 ml metanolu). Odparować eluowane gangliozydy na suchy proszek i zważyć.
      UWAGA: Celem chromatografii tC18 jest oddzielenie gangliozydów zarówno od mniejszych, jak i bardziej polarnych zanieczyszczeń. Wydajność mieszanych gangliozydów mózgowych po zmydleniu wynosi ~ 120 mg na g suchego ekstraktu z mózgu (krok 2.1.4). Pojawienie się gangliozydów przez TLC w przepływie lub płukaniu wskazuje, że kolumna ekstrakcyjna do fazy stałej była nasycona. Po elucji metanolu kolumna może być dalej eluowana chloroformem-metanolem (1:1) w celu wychwycenia mniej polarnych lipidów.
  4. Oczyszczanie HPLC poszczególnych gangliozydów
    1. Przygotować HPLC Rozpuszczalnik A: acetonitryl-5 mM wodny bufor fosforanu sodu o pH 5,6 (83:17) i rozpuszczalnik B: acetonitryl-20 mM bufor fosforanu sodu, pH 5,6 (1:1). Odgazować oba rozpuszczalniki przez 5 minut.
    2. Wstępnie zrównoważyć kolumnę HPLC (kolumna 20 x 250 mm wypełniona kulkami krzemionkowymi związanymi aminami (NH2), o średnicy 5 μm, wielkości porów 100 A) ze 100% rozpuszczalnikiem A przez 20 minut przy 5 ml / min. Ustawić detektor ścieków kolumny UV HPLC na 215 nm.
    3. Rozpuścić proszek gangliozydu z eluatu fazy odwrotnej w wodzie o stężeniu 5 mg/ml. Wstrzyknąć 0,5 ml mieszaniny gangliozydów do HPLC i uruchomić gradient rozpuszczalnika (Tabela 1) z prędkością 5 ml/min, zbierając frakcje. Gangliozydy pojawią się jako piki A215 z czasami retencji (główne gangliozydy mózgu) 25-70 min: GM1 ≈ 28 min; GD1a ≈ 38 min; GD1b ≈ 46 min; GT1b ≈ 65 min. Ponownie zrównoważyć 20 minut rozpuszczalnikiem A po każdym przebiegu. Analiza frakcji metodą chromatografii cienkowarstwowej.
szt. szt. szt. szt.
Czas (min)%A%B
01000
71000
12Rozdział 6337
Rozdział 8254 Rozdział 54Rozdział 46
82.010100
Rozdział 920100

Tabela 1: Gradient rozpuszczalnika dla HPLC.

3. Analiza gangliozydów metodą chromatografii cienkowarstwowej (TLC)

UWAGA: Chloroform jest toksycznym lotnym związkiem organicznym. Pracować pod wyciągiem z rękawicami ochronnymi i okularami ochronnymi.

  1. Przygotowanie rozpuszczalnika i płytki TLC
    1. Przygotować bieżący rozpuszczalnik chloroformu, metanolu o stężeniu 0,25% KCl (60:35:8 objętościowo). Wlać do szklanej studzienki TLC o wymiarach 10 cm x 10 cm z pokrywą ze stali nierdzewnej tak, aby głębokość rozpuszczalnika wynosiła ~ 0,5 cm. Przykryć i pozostawić do zrównoważenia w miejscu wolnym od prądów powietrza przez >10 min.
      UWAGA: Aby odizolować komorę TLC od prądów powietrza, można zbudować lub zakupić akrylowe 5-stronne pudełko ( Rysunek 2). Nie używaj bibuły filtracyjnej nasączonej rozpuszczalnikiem wewnątrz komory.
    2. Umieścić wysokowydajną płytkę TLC o wymiarach 10 cm x 10 cm lub 5 cm x 10 cm, pokrytą żelem krzemionkowym, w suszarce w temperaturze 125 °C na 10 minut. Pozostawić do ostygnięcia. Użyj stępionego ołówka #2, aby narysować 5-milimetrowe linie punktowe z 2-milimetrowymi odstępami wzdłuż linii 1 cm nad dnem płytki i co najmniej 1 cm z każdej strony (Rysunek 3). Unikaj naruszania warstwy krzemionki podczas znakowania.
    3. Przygotować wzorcową mieszaninę czystych gangliozydów w metanolu zawierającą 100 μM GM1, po 50 μM GD1a i GD1b oraz 33 μM GT1b.
      UWAGA: Ta mieszanina zawiera 100 pmol gangliozydu kwasu sjalowego na μl dla każdego z czterech gangliozydów, ilość, która zapewnia silny sygnał kolorymetryczny poprzez barwienie rezorcyną, które jest zależne od kwasu sjalowego.
  2. Rozdzielczość gangliozydów
    1. Umyj 10-μl strzykawkę Hamiltona za pomocą skośnej igły z metanolem. Pobrać 1 μl metanolu do szklanej strzykawki w celu napełnienia martwej objętości igły, a następnie 1 μl próbki lub wzorca. Umieścić próbkę równomiernie na zaznaczonych liniach o średnicy 5 mm, aż w strzykawce pozostanie <1 μl rozpuszczalnika (metanolu). Pozostawić płytkę do wyschnięcia w temperaturze otoczenia (22 °C) po wykryciu wszystkich próbek.
      UWAGA: Umyć strzykawkę metanolem między załadowaniem próbki. Nieogrzewana dmuchawa powietrza ustawiona na niskim poziomie może być użyta do przyspieszenia suszenia.
    2. Umieść nakrapianą i wysuszoną płytkę w komorze TLC ze wstępnie zrównoważoną krawędzią zanurzoną w działającym rozpuszczalniku, przykryj i chroń przed prądami powietrza (Rysunek 2). Pozwól, aby płynący rozpuszczalnik przesuwał się w górę płytki poprzez działanie kapilarne, aż czoło rozpuszczalnika znajdzie się w odległości 1 cm od górnej części płytki. Usunąć ołówkiem czoło rozpuszczalnika na krawędzi płytki i oznaczyć go wodą. Pozwól, aby rozpuszczalniki całkowicie odparowały, bez zakłóceń lub pod łagodnym przepływem powietrza.

figure-protocol-1
Rysunek 2: Sprzęt do TLC z gangliozydem i konfiguracja. Podwójna komora rynnowa jest wypełniona po obu stronach do ≈ 0,5 cm bieżącym rozpuszczalnikiem. Płytkę umieszcza się z jednej strony, a koniec początkowy jest zanurzony w pracującym buforze. Komora pokryta jest akrylową skrzynką, aby uniknąć prądów powietrza. Panel A, widok z boku przed włożeniem blachy. Poziom rozpuszczalnika jest widoczny kilka mm powyżej dna komory; Panel B, widok z przodu podczas projektowania. Czoło rozpuszczalnika jest widoczne w około 40% wysokości płytki. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

  1. Barwienie gangliozydowe
    UWAGA: Plamy odczynników są toksyczne. Kwas solny jest i toksyczny. Przygotuj i rozpyl odczynniki w dygestoriach z rękawicami ochronnymi i okularami ochronnymi.
    UWAGA: Płytkę można obrazować w celu jakościowej analizy obrazu lub przechowywać po zdjęciu zacisków i zabezpieczeniu pokrywy na miejscu przezroczystą taśmą. Analizę ilościową można przeprowadzić, mierząc densytometrię wzorców gangliozydów wykrytych na sąsiednich pasach ruchu.
    1. Przygotuj odczynnik w sprayu rezorcyny do wykrywania gangliozydów na podstawie ich kwasów sjalowych. Rozpuścić 6 g rezorcyny w 100 ml wody, aby uzyskać 6% zapas rezorcyny. Rozpuść 1 g CuSO4 w 100 ml wody, aby uzyskać 1% bulionu. Do 64,7 ml wody dodaj 5 ml 6% bulionu rezorcyny, 0,31 ml 1% bulionu CuSO4, a następnie powoli dodaj 30 ml stężonego HCl i delikatnie wymieszaj. Może być przechowywany w temperaturze 4 °C przez miesiąc.
    2. W okapie oparowym umieść płytkę TLC z rozwiązanymi gangliozydami, początkowo do góry, w wyciętym kartonowym pudełku, aby chronić ścianki okapu przed rozpryskami kwasu. Umieść odczynnik do rozpylania rezorcyny w szklanym opryskiwaczu TLC, podłącz do źródła azotu pod ciśnieniem i lekko spryskaj płytkę po przekątnej w kierunku pionowym i poziomym. Spryskać powierzchnię sorbentu TLC równomiernie, ale lekko.
    3. Natychmiast przykryj płytkę czystą, suchą szklaną pokrywą o tych samych wymiarach i zabezpiecz pokrywę na miejscu za pomocą spinaczy do segregatorów (Rysunek 3). Podgrzewać przykrytą płytę w temperaturze 125 °C przez 20 min. Gangliozydy będą ciemnofioletowe na białym tle.
      UWAGA: Płyta nie powinna wydawać się mokra po zakończeniu natryskiwania. Pokrywy można kształtować poprzez zeskrobywanie sorbentu z wcześniej używanych płytek TLC za pomocą jednoostrzowej żyletki.
      UWAGA: Krzemionka w proszku jest toksyczna dla płuc. Użyj maski i wyrzuć krzemionkę do szczelnie zamkniętego pojemnika.

figure-protocol-2
Rysunek 3: Płytka TLC z rozdzielonym mieszanym gangliozydem. Płytka TLC z rozłożonymi mieszanymi wzorcami gangliozydów (lewe pasie) i oczyszczonymi mieszanymi gangliozydami istoty szarej bydła (prawa droga) po barwieniu rezorcynolem i ogrzewaniu z zaciśniętą szklaną płytką pokrywy. Standardowe gangliozydy (od góry do dołu) to GM3, GM2, GM1, GD3, GD1a, GD1b, GT1b i GQ1b. Po schłodzeniu płytkę można zobrazować i/lub przykleić pokrywę taśmą do przechowywania. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

  1. Ogólne barwienie lipidów pod kątem gangliozydów i fosfolipidów.
    UWAGA: Kwas siarkowy jest toksyczny i. Dodawanie stężonego kwasu do etanolu jest egzotermiczne i musi odbywać się powoli. Przygotować odczynnik barwiący w dygestoriach z rękawicami ochronnymi i okularami ochronnymi.
    1. Przygotować barwnik p-aldehydowy, powoli dodając 15 ml stężonego kwasu siarkowego do 500 ml etanolu. Mieszaj przez 30 minut, aby roztwór ostygł przed kontynuowaniem. Dodaj 15 ml aldehydu p-aniżowego i delikatnie wymieszaj. Lek może być przechowywany w temperaturze pokojowej (22 °C) do sześciu miesięcy.
    2. W chemicznym okapie oparowym zanurzyć płytkę TLC z rozwiązanymi gangliozydami, początkowym końcem do dołu, w zlewce zawierającej barwnik p-aldehydu aniżowego. Zanurz się w czole jezdnym na ≥ 2 s. Usuń TLC z plamy i pozwól mu spłynąć. Podgrzej płytkę TLC na płycie grzejnej w niskiej temperaturze, aby się rozwinąć.
      UWAGA: Lipidy będą ciemne na fioletowym tle. Roztwór barwiący można odzyskać do wielokrotnego użycia.

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Wyniki

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Metody opisane w sekcji 1 (mała skala) dostarczają gangliozydów w wystarczającej ilości i czystości do jakościowego i ilościowego określenia głównych gangliozydów mózgu. Odzysk z mózgu myszy wynosi ~ 1 μmol gangliozydu na g mokrej masy mózgu (1 nmol/μl), gdy jest przygotowany zgodnie z opisem. Rozdzielczość TLC wynosząca 1 μL (1 nmol) przy użyciu sekcji 3 zapewnia wystarczającą ilość materiału do wykrywania rezorcyny i rozwiązuje wszystkie główne gangliozydy mózgowe, jak pokazano dla myszy typu dzikiego i genetycznie zmo...

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Dyskusja

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Opisane tutaj metody ekstrakcji i izolacji gangliozydów na małą i dużą skalę nie są unikalne - istnieje wiele różnych podejść do ekstrakcji i oczyszczania rozpuszczalnikiem, które zapewniają doskonałe wyniki12. Opisane tutaj metody oczyszczania mózgu na małą skalę, opracowane przez Fredmana i Svennerholma13, wykazały, że optymalizują regenerację i okazały się solidne i proste przez wiele lat w naszym laboratorium. Izolację i oczyszczanie odpowiednie dla TLC i SM można łatwo...

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Oświadczenia

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Autorzy twierdzą, że nie ma sprzecznych interesów.

Podziękowania

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Ta praca była wspierana przez grant National Institutes of Health (NIH) Common Fund for Glycoscience U01CA241953. MJP był wspierany przez Chemistry-Biology Interface Program na Uniwersytecie Johnsa Hopkinsa (T32GM080189).

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Materiały

Lista materiałów użytych w tym artykule
NazwaFirmaNumer katalogowyKomentarze
Mózg bydlęcy, pozbawionyPelFreez57105-1
Wzorce gangliozydoweMatreyaGM1, 1061; GD1a, 1062; GD1b, 1501; GT1b, 1063
Szklana butelka z nakrętką wyłożoną PTFEFisher Scientific02-911-739
Szklana butelka wirówkowaFisher Scientific05-586B
Szklane probówki hodowlane, 16 x 125 mmVWR60825-430do zbierania frakcji HPLC
Szklany lejek separacyjny (2 L)Pyrex6400-2L
Strzykawka iniekcyjna - Hamilton 1750 gazoszczelne 500 i mikro; lHamilton81265
p-Aldehyd anusowy, 98%Sigma-Aldrich  A88107
Homogenizator Potter-ElvhjemFisher Scientific08-414-14AWybierz odpowiednią opcję objętości
Reprosil 100 NH2 10µ m Kolumny ochronne 5x4mmAnalytics-ShopAAVRS1N-100540-5
Reprospher 100 NH2, 5 μ m, 250 mm x 20 mm Kolumna HPLCAnalytics-Shoppakowane na zamówieniedostępne inne rozmiary
RezorcinolSigma-Aldrich30752-1
Parownik obrotowyBuchiR-300
Pętla próbki do wtryskiwacza model 7725 (5 ml)Sigma-Aldrich57632
Sep-Pak tC18 Cartidges Vac 35 cc (10 g)WodyWAT043350
Sep-Pak tC18 Plus Krótki wkład, 400 mgwodyWAT036810
strzykawka do plam - Hamilton 701N 10 µ lHamilton80300
Grubościenne probówki o średnicy 13 mm z nakrętkami wyłożonymi PFTEFisher Scientific14-933A
Gwintowane fiolki 2 ml z nakrętkami wyłożonymi PFTEFisher Scientific14-955-323Do przechowywania gangliozydów
Płytki TLC, HPTLC Żel krzemionkowy 60 F254 MultiformatFisher ScientificM1056350001Impregnacja fluorescencyjna (F254) stabilizuje sorbent powierzchniowy
odczynnik TLCFisher Scientific05-723-26A
Komora jezdna TLC do płytek 10 x 10 cmCamag22.5155
Waring 1-litrowy blender przeciwwybuchowy ze stali nierdzewnejWaringE8520

Bibliografia

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Schnaar, R. L. The Biology of Gangliosides. Advances in Carbohydrate Chemistry and Biochemistry. 76, 113-148 (2019).
  2. DeMarco, M. L., Woods, R. J. Atomic-resolution conformational analysis of the GM3 ganglioside in a lipid bilayer and its implications for ganglioside-protein recognition at membrane surfaces. Glycobiology. 19 (4), 344-355 (2009).
  3. Schnaar, R. L. Gangliosides of the vertebrate nervous system. Journal of Molecular Biology. 428, 3325-3336 (2016).
  4. Klenk, E. Über die Ganglioside, eine neue Gruppe von zuckerhaltigen Gehirnlipoiden [About gangliosides, a new group of sugar-containing brain lipids]. Hoppe-Seyler's Zeitschrift für Physiologische Chemie. 273, 76-86 (1942).
  5. Uemura, S., Go, S., Shishido, F., Inokuchi, J. Expression machinery of GM4: the excess amounts of GM3/GM4S synthase (ST3GAL5) are necessary for GM4 synthesis in mammalian cells. Glycoconjugate Journal. 31 (2), 101-108 (2014).
  6. Nimrichter, L., et al. E-selectin receptors on human leukocytes. Blood. 112 (9), 3744-3752 (2008).
  7. Saito, M., Kitamura, H., Sugiyama, K. A novel heptasialosyl c-series ganglioside in embryonic chicken brain: its structure and stage-specific expression. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics. 1571 (1), 18-26 (2002).
  8. Todeschini, A. R., Hakomori, S. I. Functional role of glycosphingolipids and gangliosides in control of cell adhesion, motility, and growth, through glycosynaptic microdomains. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics. 1780 (3), 421-433 (2008).
  9. Sturgill, E. R., et al. Biosynthesis of the major brain gangliosides GD1a and GT1b. Glycobiology. 22, 1289-1301 (2012).
  10. Cavdarli, S., Delannoy, P., Groux-Degroote, S. O-Acetylated gangliosides as targets for cancer immunotherapy. Cells. 9 (3), (2020).
  11. Varki, A., et al. Symbol nomenclature for graphical representations of glycans. Glycobiology. 25 (12), 1323-1324 (2015).
  12. Schnaar, R. L. Isolation of glycosphingolipids. Methods in Enzymology. 230, 348-370 (1994).
  13. Svennerholm, L., Fredman, P. A procedure for the quantitative isolation of brain gangliosides. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics. 617, 97-109 (1980).
  14. Tettamanti, G., Bonali, F., Marchesini, S., Zambotti, V. A new procedure for the extraction, purification and fractionation of brain gangliosides. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics. 296, 160-170 (1973).
  15. Gazzotti, G., Sonnino, S., Ghidoni, R. Normal-phase high-performance liquid chromatographic separation of non-derivatized ganglioside mixtures. Journal of Chromatography. 348, 371-378 (1985).
  16. Schnaar, R. L., Needham, L. K. Thin-layer chromatography of glycosphingolipids. Methods in Enzymology. 230, 371-389 (1994).
  17. Ledeen, R. W., Yu, R. K. Gangliosides: structure, isolation, and analysis. Methods in Enzymology. 83, 139-191 (1982).
  18. Lopez, P. H., et al. Mice lacking sialyltransferase ST3Gal-II develop late-onset obesity and insulin resistance. Glycobiology. 27 (2), 129-139 (2017).

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Przedruki i uprawnienia

Poproś o pozwolenie na ponowne wykorzystanie tekstu lub ilustracji tego artykułu JoVE

Poproś o pozwolenie

Tagi

Ganglioside ExtractionGanglioside PurificationGanglioside ProfilingThin Layer ChromatographySolid Phase ExtractionBrain GangliosidesLipid StainingSaponification MethodHPLC ResolutionMass Spectrometric Analysis

Powiązane artykuły