Przedstawiono tutaj reprezentatywne wyniki dla protokołów kodowania silnego i słabego, opisanych z użyciem samców szczurów transgenicznych tyrozynohydroksylazy (Th)-Cre13 szczepu Long-Evans, wstecznie skrzyżowanych czterokrotnie ze szczepem Lister Hooded, oraz szczurów typu dzikiego Lister Hooded. Wykorzystano szczury transgeniczne Th-Cre, ponieważ linia ta będzie stosowana w przyszłych badaniach z zakresu optogenetyki. W każdym protokole pamięć testowano z opóźnieniem 1 i 24 h. Testy po 1 h obrazują pamięć krótkotrwałą, natomiast testy po 24 h obrazują pamięć długotrwałą. Wartość wykluczająca dla preferencji kodowania została obliczona zgodnie z opisem w protokole, na podstawie połączonych danych z pięciu testów (protokoły kodowania silnego i słabego) jako [50,8% ± (2×10,8%)]. Szczury, których preferencja kodowania znajdowała się powyżej lub poniżej tych wartości, zostały wykluczone z analiz odpowiednich testów.
Do eksperymentów z silnym kodowaniem wykorzystano 16 szczurów, a do eksperymentów ze słabym kodowaniem 19 szczurów. Podczas prób silnego kodowania (kodowanie 3 × 5 min; Rysunek 4A) nie stwierdzono istotnej preferencji dla żadnego z obiektów (52,0 ± 1,9%, n = 16, t15 = 1,1, p = 0,29; test t dla jednej próby względem poziomu przypadku). Ten protokół silnego kodowania doprowadził do preferencji obiektu w nowej lokalizacji, co objawiło się średnią procentową eksploracją, która była istotnie wyższa od poziomu przypadku (50%) w testach z opóźnieniem 1 h oraz 24 h (pamięć 1-h, 77,9 ± 2,4%, n = 8, t7 = 11,8, p < 0,001; pamięć 24-h, 65,2 ± 5,3%, n = 8, t7 = 2,8, p = 0,025; test t dla jednej próby względem poziomu przypadku). Nie stwierdzono istotnej różnicy między pamięcią 1-h a 24-h (p = 0,056; nieparzysty test t Welcha).
Podczas prób z słabym kodowaniem (kodowanie przez 20 min; wyniki z czterech kontekstów połączone; Rysunek 4B) nie stwierdzono istotnej preferencji dla żadnego z obiektów (51,1 ± 1,0%, n = 66, t65 = 1,2, p = 0,24; test t dla jednej próby względem poziomu przypadkowego). Ten protokół słabego kodowania spowodował istotny wzrost preferencji dla obiektu w nowej lokalizacji w porównaniu z poziomem przypadkowym w testach z opóźnieniem 1 h, ale nie w testach z opóźnieniem 24 h (połączone dane z wszystkich czterech kontekstów; pamięć 1-h, 66,7 ± 2,0%, n = 32, t31 = 8,2, p < 0,001; pamięć 24-h, 49,6 ± 2,6%, n = 34, t33 = 0,16, p = 0,87; test t dla jednej próby względem poziomu przypadkowego). Stwierdzono istotną różnicę między wynikami w testach z opóźnieniem 1 h i 24 h (pamięć 1-h: n = 32, pamięć 24-h: n = 34, t61,5 = 5,2, p < 0,001; nieparzysty test t Welcha).
Pamięci na poziomie grupy nie zaobserwowano w teście z 24-godzinną przerwą, co wskazywały wyniki na poziomie przypadku, jednak odnotowano różnice międzyosobnicze. Tak większa zmienność w warunkach słabej lub braku pamięci (np. test po 24 h) jest powszechnie obserwowana ze względu na bardziej losową eksplorację obiektów. Dlatego ważne jest, aby nie interpretować wyników poszczególnych szczurów indywidualnie. Zamiast tego, rozkład indywidualnych punktów danych można wykorzystać wraz ze średnią grupową jako wiarygodny wynik testu. Im silniejsze kodowanie, tym bardziej jednorodne staje się zachowanie szczurów i tym mniejsza liczba zwierząt jest potrzebna do osiągnięcia istotności statystycznej, co można zaobserwować na Rysunku 4A dla protokołu silnego kodowania. W przeciwieństwie do tego, w przypadku warunków słabych niezbędne są większe grupy w celu uzyskania wiarygodnych wyników (Rysunek 4B).

Rycina 4: Wydajność pamięci po silnym i słabym kodowaniu. (A) Próba silnego kodowania (kodowanie 3 × 5 min), po której nastąpiły próby testowe po 1 h lub 24 h. Podczas prób kodowania nie stwierdzono istotnej preferencji żadnego z obiektów (n = 16). Silne kodowanie spowodowało istotny wzrost preferencji obiektu w nowym miejscu w testach z opóźnieniem 1 h oraz 24 h w porównaniu do poziomu przypadkowego (pamięć 1 h i 24 h: n = 8 w każdej grupie). Nie stwierdzono istotnych różnic między grupami. (B) Próba słabego kodowania (kodowanie 20 min), po której nastąpiły próby testowe po 1 h lub 24 h. Podczas prób kodowania nie stwierdzono istotnej preferencji żadnego z obiektów w skali grupy (n = 66). Słabe kodowanie spowodowało istotny wzrost preferencji obiektu w nowym miejscu w teście z opóźnieniem 1 h, ale nie 24 h, w porównaniu do poziomu przypadkowego (pamięć 1 h: n = 32; pamięć 24 h: n = 34). Stwierdzono istotną różnicę w wynikach testów z opóźnieniem 1 h i 24 h. Wyniki zostały połączone z czterech kontekstów. Pojedyncze punkty danych przedstawiono jako kropki. Wszystkie słupki przedstawiają procent eksploracji obiektu w nowym miejscu jako średnia ± SEM. *p < 0.05, ***p < 0.001; jednopróbkowy test t względem poziomu przypadkowego (50%, linia przerywana). ###p < 0.001; ns, brak istotności; nieparzysty test t Welcha. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.
Istotną zaletą tego ugruntowanego protokołu jest możliwość jego przeprowadzenia czterokrotnie w czterech różnych kontekstach (Rysunek 1C) z wykorzystaniem tej samej grupy szczurów. Wyniki przedstawione na Rysunku 5 obrazują jeden z możliwych sposobów zastosowania kontrbalansowania z dwiema grupami eksperymentalnymi (grupy z pamięcią 1-h i 24-h). Dwie grupy zostały poddane kontrbalansowaniu w obrębie dwóch kontekstów (konteksty 1 i 2), a następnie powtórzono tę procedurę w dwóch dodatkowych kontekstach (konteksty 3 i 4; Rysunek 5A). Wyniki z czterech kontekstów zaprezentowano pojedynczo na Rysunku 5B,D, gdzie pamięć każdej grupy eksperymentalnej oceniano poprzez porównanie preferencji z poziomem przypadkowym w każdym kontekście (pamięć 1-h: Kontekst 1, 69,9 ± 3,6%, n = 9, t8 = 5,5, p < 0,001; Kontekst 2, 65,6 ± 3,9%, n = 9, t8 = 4,0, p = 0,004; Kontekst 3, 65,2 ± 3,8%, n = 7, t6 = 4,0, p = 0,007; Kontekst 4, 65,3 ± 5,6%, n = 7, t6 = 2,7, p = 0,035; pamięć 24-h: Kontekst 1, 45,1 ± 6,4%, n = 9, t8 = 0,77, p = 0,46; Kontekst 2, 49,1 ± 4,9%, n = 9, t8 = 0,18, p = 0,86; Kontekst 3, 57,2 ± 4,1%, n = 8, t7 = 1,7, p = 0,12; Kontekst 4, 47,6 ± 4,7%, n = 8, t7 = 0,52, p = 0,62; jednopróbkowy test t względem poziomu przypadkowego).
W kontekstach 1, 2 i 4 porównanie międzyosobnicze grup wykazało istotne różnice między pamięcią 1-h a 24-h (pamięć 1-h kontra pamięć 24-h: Kontekst 1, t12.7 = 3.4, p = 0.005; Kontekst 2, t15.2 = 2.6, p = 0.019; Kontekst 3, t13.0 = 1.4, p = 0.17; Kontekst 4, t12.2 = 2.4, p = 0.032; nieparzysty test t Welcha). Aby uzyskać lepszą reprezentację i umożliwić porównanie wewnątrzobiektowe danych, połączono wyniki z dwóch zrównoważonych kontekstów (Rysunek 5C,E). Połączone grupy eksperymentalne ponownie porównano indywidualnie z poziomem przypadkowym (połączone Konteksty 1 i 2: pamięć 1-h, 67.8 ± 2.6%, n = 18, t17 = 6.7, p < 0.001; pamięć 24-h, 47.1 ± 3.9%, n = 18, t17 = 0.74, p = 0.47; połączone Konteksty 3 i 4: pamięć 1-h, 65.3 ± 3.3%, n = 14, t13 = 4.7, p < 0.001; pamięć 24-h, 52.4 ± 3.2%, n = 16, t15 = 0.73, p = 0.48; jednopróbkowy test t względem poziomu przypadkowego). Następnie porównano ze sobą grupy eksperymentalne.
W obu parach kontekstów odnotowano istotne różnice między grupami, co wykazały porównania wewnątrzobiektowe (pamięć po 1 h versus pamięć po 24 h: połączone konteksty 1 i 2, t16 = 3.5, p = 0.003; połączone konteksty 3 i 4, t13 = 2.4, p = 0.032; parowy test t). Podobne wyniki uzyskano również u szczurów rasy Lister Hooded typu dzikiego w protokole słabego kodowania, wykorzystując konteksty 1 i 4 w dwóch zrównoważonych sesjach (dane nie przedstawiono). Powtarzalność i wiarygodność wyników potwierdzono, porównując każdy zestaw danych za pomocą jednoczynnikowej analizy wariancji ANOVA. Nie wykryto istotnych różnic pomiędzy czterema kontekstami (pamięć po 1 h: F3,28 = 0.31, p = 0.81; pamięć po 24 h: F3,30 = 0.99, p = 0.41). Zatem test lokalizacji przedmiotu można powtarzać w sposób wiarygodny przy minimalnym wpływie powtórzeń, pod warunkiem przestrzegania instrukcji zawartych w niniejszym protokole.

Rycina 5: Różne sposoby prezentacji i analizy wyników protokołu słabego kodowania z dwiema grupami eksperymentalnymi zrównoważonymi w ramach dwóch sesji. (A) Schemat eksperymentalny dla zrównoważenia z dwiema grupami eksperymentalnymi (grupy pamięci 1-h i 24-h) w ramach dwóch sesji (konteksty 1 i 2). Zrównoważenie powtórzono w dwóch dodatkowych sesjach (konteksty 3 i 4). (B i D) Wyniki z każdego kontekstu i grup eksperymentalnych porównywano indywidualnie z poziomem przypadkowym oraz względem siebie. We wszystkich czterech kontekstach preferencja obiektu w nowej lokalizacji w testach z opóźnieniem 1-h była znacząco zwiększona w porównaniu z poziomem przypadkowym [Kontekst 1 i 2: n = 9 na grupę (B); Kontekst 3 i 4: n = 7 na grupę (D)]. W testach z opóźnieniem 24-h preferencja obiektu w nowej lokalizacji nie różniła się od poziomu przypadkowego (Kontekst 1 i 2: n = 9 na grupę; Kontekst 3 i 4: n = 8 na grupę). Porównanie międzyosobnicze wykazało istotną różnicę między preferencjami grup eksperymentalnych w kontekstach 1, 2 i 4, ale nie w kontekście 3. *p < 0.05, **p < 0.01, ***p < 0.001; test t dla jednej próby względem poziomu przypadkowego (50%, linia przerywana). #p < 0.05; ##p < 0.01; ns, brak istotności; nieparowany test t Welcha. (C i E) Wyniki przedstawiono po połączeniu grup eksperymentalnych z dwóch zrównoważonych kontekstów [Konteksty 1 i 2 połączone, n = 17 na grupę (C); Konteksty 3 i 4 połączone, n = 14 na grupę (E)]. Preferencja obiektu w nowej lokalizacji była znacząco zwiększona w porównaniu z poziomem przypadkowym w testach z opóźnieniem 1-h, ale nie 24-h, w obu parach kontekstów. Porównanie wewnątrzobiektowe grup eksperymentalnych wykazało istotne różnice między preferencjami obiektu w nowej lokalizacji w testach z opóźnieniem 1-h i 24-h w obu parach kontekstów. ***p < 0.001; test t dla jednej próby względem poziomu przypadkowego (50%, linia przerywana). #p < 0.05, ##p < 0.01; parowy test t. Pojedyncze punkty danych przedstawiono jako kropki. Wszystkie słupki wskazują procent eksploracji obiektu w nowej lokalizacji jako średnia ± SEM. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.