$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Pokazane tutaj są reprezentatywne wyniki zarówno dla silnego, jak i słabego protokołu kodowania opisanego przy użyciu transgenicznych samców transgenicznych szczurów z hydroksylazą tyrozyny (Th)-Cre13 ze szczepem Long-Evans skrzyżowanym wstecznie cztery razy z szczepem Lister Hooded i dzikim typem szczurów Lister Hooded. Wykorzystano transgeniczne szczury Th-Cre, ponieważ ta linia szczurów będzie wykorzystywana w przyszłych badaniach z udziałem optogenetyki. Za pomocą każdego protokołu testowano pamięć z opóźnieniami od 1 do 24 godzin. Testy po 1 godzinie wykazują pamięć krótkotrwałą, podczas gdy testy 24-godzinne wykazują pamięć długotrwałą. Wartość wykluczenia preferencji kodowania została obliczona zgodnie z opisem w protokole, przy użyciu połączonych danych z pięciu testów (silne i słabe protokoły kodowania) jako [50,8% ± (2×10,8%)]. Szczury, które miały preferencje kodowania powyżej i poniżej tych wartości, zostały wykluczone z analiz odpowiednich testów.
Do eksperymentów z silnym kodowaniem użyto 16 szczurów, a do eksperymentów ze słabym kodowaniem użyto 19 szczurów. Podczas prób silnego kodowania (kodowanie od 3 × 5 minut; Rysunek 4A), nie było znaczącej preferencji dla żadnego z obiektów (52,0 ± 1,9%, n = 16, t15 = 1,1, p = 0,29; test t dla jednej próby w porównaniu z poziomem szansy). Ten silny protokół kodowania doprowadził do preferowania obiektu w nowej lokalizacji, co wykazano pod względem średniego procentu eksploracji, który był znacznie wyższy niż poziom szansy (50%) w testach z opóźnieniami zarówno 1-godzinnymi, jak i 24-godzinnymi (pamięć 1-godzinna, 77,9 ± 2,4%, n = 8, t7 = 11,8, p < 0,001; pamięć 24-godzinna, 65,2 ± 5,3%, n = 8, t7 = 2,8, p = 0,025; test t dla jednej próby w funkcji poziomu szansy). Nie stwierdzono istotnej różnicy między pamięcią 1-godzinną a 24-godzinną (p = 0,056; niesparowany test t Welcha).
Podczas prób słabego kodowania (kodowanie 20 min; wyniki zebrane z czterech kontekstów; Rysunek 4B), nie było znaczącej preferencji dla żadnego z obiektów (51,1 ± 1,0%, n = 66, t65 = 1,2, p = 0,24; test t dla jednej próby w porównaniu z poziomem szansy). Ten słaby protokół kodowania spowodował znaczny wzrost preferencji dla obiektu w nowej lokalizacji w porównaniu z poziomem przypadkowości w testach z opóźnieniem 1-godzinnym, ale nie 24-godzinnym (połączone dane ze wszystkich czterech kontekstów; pamięć 1-godzinna, 66,7 ± 2,0%, n = 32, t31 = 8,2, p < 0,001; pamięć 24-godzinna, 49,6 ± 2,6%, n = 34, t33 = 0,16, p = 0,87; test t dla jednej próby w funkcji poziomu szansy). Stwierdzono istotną różnicę między wynikami w testach z opóźnieniami 1-godzinnymi i 24-godzinnymi (pamięć 1-godzinna: n = 32, pamięć 24-godzinna: n = 34, t61,5 = 5,2, p < 0,001; niesparowany test t Welcha).
Pamięć na poziomie grupy nie została zaobserwowana w teście 24-godzinnego opóźnienia jako indeksowana przez wydajność na poziomie przypadku, ale wykazywała indywidualne różnice. Ta wyższa zmienność w warunkach słabej pamięci lub braku pamięci (np. test 24-godzinny) była często obserwowana ze względu na bardziej losową eksplorację obiektów. Dlatego ważne jest, aby nie interpretować wydajności szczurów indywidualnie. Zamiast tego rozkład poszczególnych punktów danych może być używany wraz ze średnią grupową jako wiarygodny wynik testu. Im silniejsze kodowanie, tym bardziej jednolite staje się zachowanie szczurów i tym mniejsza liczba szczurów jest potrzebna do osiągnięcia istotności statystycznej, co można zaobserwować w Rysunek 4A dla protokołu silnego kodowania. W przeciwieństwie do tego, większe grupy są potrzebne do uzyskania wiarygodnych wyników dla słabych warunków (Rysunek 4B).

Rysunek 4: Wydajność pamięci po silnym i słabym kodowaniu. (A) Próba silnego kodowania (kodowanie 3 × 5 minut), po której następują próby testowe 1-godzinne lub 24-godzinne. Nie stwierdzono istotnej preferencji dla żadnego z obiektów podczas prób kodowania (n = 16). Silne kodowanie spowodowało znacznie zwiększoną preferencję dla obiektu w nowej lokalizacji w testach z opóźnieniami zarówno 1-godzinnymi, jak i 24-godzinnymi w porównaniu z poziomem przypadkowym (pamięć 1-godzinna i 24-godzinna: n = 8 w każdej grupie). Nie stwierdzono istotnej różnicy między grupami. (B) Próba słabego kodowania (kodowanie 20 min), po której następują 1-godzinne lub 24-godzinne próby testowe. Nie stwierdzono istotnej preferencji dla żadnego z obiektów jako grupy podczas prób kodowania (n = 66). Słabe kodowanie spowodowało znacznie zwiększoną preferencję dla obiektu w nowym miejscu w teście z 1-godzinnym, ale nie 24-godzinnym opóźnieniem, w porównaniu z poziomem przypadkowym (pamięć 1-godzinna: n = 32; pamięć 24-godzinna: n = 34). Wystąpiła znacząca różnica między wydajnością w testach z opóźnieniami 1 i 24 godzinnymi. Wyniki połączono w czterech kontekstach. Poszczególne punkty danych są prezentowane jako kropki. Wszystkie słupki pokazują procent eksploracji obiektu w nowej lokalizacji jako średnią ± SEM. *p < 0,05, ***p < 0,001; Test t dla jednej próby w funkcji poziomu szansy (50%, linia przerywana). ###p < 0,001; ns, nieznaczące; niesparowany test t-Welcha. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.
Istotną zaletą tego uznanego protokołu jest to, że można go wykonać cztery razy przy użyciu czterech różnych kontekstów (Rysunek 1C) z tą samą kohortą szczurów. Wyniki pokazane w Rysunek 5 pokazują jeden z możliwych sposobów użycia równoważenia z dwiema grupami eksperymentalnymi (1-godzinne i 24-godzinne grupy pamięci). Obie grupy były równoważone w dwóch kontekstach (konteksty 1 i 2), co zostało powtórzone w dwóch dodatkowych kontekstach (konteksty 3 i 4; Rysunek 5A). Wyniki z czterech kontekstów są prezentowane indywidualnie w Rysunek 5B,D, gdzie pamięć dla każdej grupy eksperymentalnej została oceniona, porównując preferencję do poziomu szansy w każdym kontekście (pamięć 1-godzinna: Kontekst 1, 69,9 ± 3,6%, n = 9, t8 = 5,5, p < 0,001; Kontekst 2, 65,6 ± 3,9%, n = 9, t8 = 4,0, p = 0,004; Kontekst 3, 65,2 ± 3,8%, n = 7, t6 = 4,0, p = 0,007; Kontekst 4, 65,3 ± 5,6%, n = 7, t6 = 2,7, p = 0,035; Pamięć 24-godzinna: Kontekst 1, 45,1 ± 6,4%, n = 9, t8 = 0,77, p = 0,46; Kontekst 2, 49,1 ± 4,9%, n = 9, t8 = 0,18, p = 0,86; Kontekst 3, 57,2 ± 4,1%, n = 8, t7 = 1,7, p = 0,12; Kontekst 4, 47,6 ± 4,7%, n = 8, t7 = 0,52, p = 0,62; test t dla jednej próby w funkcji poziomu szansy).
W kontekstach 1, 2 i 4, międzyobiektowe porównanie grup ujawniło znaczące różnice między pamięcią 1-godzinną a 24-godzinną (pamięć 1-godzinna kontra pamięć 24-godzinna: Kontekst 1, t12,7 = 3,4, p = 0,005; Kontekst 2, t15,2 = 2,6, p = 0,019; Kontekst 3, t13,0 = 1,4, p = 0,17; Kontekst 4, t12,2 = 2,4, p = 0,032; niesparowany test t-Welcha). Aby uzyskać lepszą reprezentację i porównanie danych w obrębie obiektu, połączono wyniki z dwóch równoważonych kontekstów (Rysunek 5C,E). Połączone grupy eksperymentalne ponownie porównano indywidualnie z poziomem szansy (Konteksty 1 i 2 łącznie: pamięć 1-godzinna, 67,8 ± 2,6%, n = 18, t17 = 6,7, p < 0,001; pamięć 24-godzinna, 47,1 ± 3,9%, n = 18, t17 = 0,74, p = 0,47; Konteksty 3 i 4 łącznie: pamięć 1-godzinna, 65,3 ± 3,3%, n = 14, t13 = 4,7, p < 0,001; Pamięć 24-godzinna, 52,4 ± 3,2%, n = 16, t15 = 0,73, p = 0,48; test t dla jednej próby w funkcji poziomu szansy). Następnie grupy eksperymentalne porównano ze sobą.
W obu parach kontekstowych wystąpiły znaczące różnice między grupami, co ujawniły porównania wewnątrzobiektowe (pamięć 1-godzinna kontra pamięć 24-godzinna: Konteksty 1 i 2 połączone, t16 = 3,5, p = 0,003; Konteksty 3 i 4 łącznie, t13 = 2,4, p = 0,032; sparowany test t). Porównywalne wyniki uzyskano również u szczurów z kapturem Lister typu dzikiego w słabym protokole kodowania przy użyciu kontekstów 1 i 4 dla dwóch przeciwzrównoważonych sesji (dane nie pokazane). Powtarzalność i wiarygodność wyników zweryfikowano poprzez porównanie każdego zestawu danych przy użyciu jednoczynnikowej analizy ANOVA. Nie stwierdzono istotnej różnicy między czterema kontekstami (pamięć 1-godzinna: F3,28 = 0,31, p = 0,81; pamięć 24-godzinna: F3,30 = 0,99, p = 0,41). W związku z tym test lokalizacji obiektu można niezawodnie powtórzyć przy minimalnym wpływie powtórzeń, pod warunkiem, że przestrzegane są instrukcje zawarte w tym protokole.

Rysunek 5: Różne sposoby prezentacji i analizy wyników protokołu słabego kodowania z dwiema grupami eksperymentalnymi równoważonymi przez dwie sesje. (A) Eksperymentalny projekt równoważenia z dwiema grupami eksperymentalnymi (grupy pamięci 1-godzinnej i 24-godzinnej) w dwóch sesjach (konteksty 1 i 2). Przeciwwaga została powtórzona w dwóch dodatkowych sesjach (konteksty 3 i 4). (B i D) Wyniki z każdego kontekstu i grup eksperymentalnych zostały indywidualnie porównane pod względem poziomu szansy i między sobą. We wszystkich czterech kontekstach preferencja dla obiektu w nowej lokalizacji w testach z 1-godzinnym opóźnieniem była znacznie zwiększona w porównaniu z poziomem szansy [Kontekst 1 i 2: n = 9 na grupę (B); Kontekst 3 i 4: n = 7 na grupę (D)]. W 24-godzinnych testach opóźnienia preferencja dla obiektu w nowej lokalizacji nie różniła się od przypadku (Kontekst 1 i 2: n = 9 na grupę; Kontekst 3 i 4: n = 8 na grupę). Stwierdzono istotną różnicę między preferencjami grup eksperymentalnych w kontekstach 1, 2 i 4, ale nie w kontekście 3, co ujawniło porównanie między osobami. *p < 0,05, **p < 0,01, ***p < 0,001; Test t dla jednej próby w funkcji poziomu szansy (50%, linia przerywana). #p < 0.05; ##p < 0,01; ns, nieznaczące; niesparowany test t-Welcha. (C i E) Wyniki przedstawiono po połączeniu grup eksperymentalnych z dwóch równoważonych kontekstów [Konteksty 1 i 2 łącznie, n = 17 na grupę (C); Konteksty 3 i 4 łącznie, n = 14 na grupę (E)]. Preferencja dla obiektu w nowej lokalizacji była znacznie zwiększona w porównaniu z poziomem szansy w testach z 1-godzinnym, ale nie 24-godzinnym opóźnieniem, w obu parach kontekstów. Wewnątrzobiektowe porównanie grup eksperymentalnych ujawniło istotne różnice między preferencjami dla obiektu w nowej lokalizacji w testach z 1-godzinnym i 24-godzinnym opóźnieniem w obu parach kontekstów. p < 0,001; Test t dla jednej próby w funkcji poziomu szansy (50%, linia przerywana). #p < 0,05, ##p < 0,01; sparowany test t. Poszczególne punkty danych są prezentowane jako kropki. Wszystkie słupki pokazują procent eksploracji obiektu w nowej lokalizacji jako średnią ± SEM. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.