$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Próbki krwi pełnej i szpiku kostnego zostały pobrane i przetworzone zgodnie z Deklaracją Helsińską z 1964 roku. Próbki krwi pełnej pobrano od zdrowych dawców po wyrażeniu świadomej zgody (ISPA), w ramach badania zatwierdzonego przez naszą instytucjonalną komisję etyki medycznej (Hospital Universitario Central de Asturias -HUCA-). Próbki szpiku kostnego pobrano z materiału odrzutowego aspiratu szpiku kostnego od pacjentów leczonych na Oddziale Hematologii Szpitala Clínico San Carlos (HCSC).

Rysunek 1: Schematyczne przedstawienie protokołu udokumentowanego w tym manuskrypcie. Wskazano pierwotne źródła ludzkie lub pierwotne kultury, w których można etapować różnicowanie MK za pomocą immunofenotypowania. Ta strategia immunofenotypowania może być zastosowana do badania procesu w różnych patologiach związanych z linią lub nowotworami złośliwymi w źródłach pierwotnych. Ponadto umożliwia sortowanie komórek MK i prekursorów za pomocą aktywowanego fluorescencją sortera komórek, co pozwala na dalszą analizę wzbogaconych frakcji. Wykorzystane obrazy są częścią Servier Medical Art (SMART) firmy Servier i są objęte licencją CC BY 3.0. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.
1. Przetwarzanie pełnej krwi i szpiku kostnego przed immunofenotypowaniem
- W przypadku stosowania krwi pełnej (WB) z donacji jako głównego źródła, opcjonalnie należy wyizolować składnik komórek jednojądrzastych krwi obwodowej (PBMC). Można to osiągnąć poprzez zastosowanie standardowego wirowania różnicowego w połączeniu z separacją komórek w gradimencie gęstości, jak opisano wcześniej15.
- Krótko mówiąc, odwirować krew w stężeniu 193 x g przez 15 minut (hamulec 3) w temperaturze pokojowej. Odrzuć górną frakcję osocza i zbierz pierścień buforowy. Rozcieńczyć w stosunku 1:1 buforem soli fizjologicznej (PBS)/dwuwodnego cytrynianu trisodowego (38 g/l, pH 7) i ostrożnie odpipetować objętość 25 ml na 15 ml roztworu gradientu gęstości (1,076 g/ml) w probówkach o pojemności 50 ml.
- Wirować przez 20 minut przy 1114 x g (akcelerator 3, hamulec 3, temperatura pokojowa). Odrzucić frakcję osocza i zebrać pierścień buforowy zawierający PBMC. Przemyć, dodając taką samą objętość PBS, odwirować przy 435 x g przez 5 minut i ponownie zawiesić w PBS do dalszego wykorzystania.
- Alternatywnie można użyć próbki WB (około 100 μl) do immunofenotypowania po lizie czerwonych krwinek (RBC) i dokładnym umyciu.
- Krótko mówiąc, rozcieńczyć 1:1 w lodowatym buforze lizującym RBC (4,15 g NH4Cl, 0,5 g KHCO3 i 18,5 mg EDTA (triplex III) do 500 ml H2O, pH 7,1-7,4). Poczekaj, aż zawiesina komórek stanie się przezroczysta na czerwoną (3-5 min).
- Odwirować przy 435 x g przez 5 minut, w temperaturze 4 °C i ponownie zawiesić komórki w PBS. Powtórz procedurę tyle razy, ile to konieczne, aby uzyskać osad z krwinek białych.
- Podobnie, próbki uzyskane ze szpiku kostnego (aspiracja) należy bezpośrednio przetworzyć buforem lizującym RBC (patrz punkt 1.2) i dokładnie przepłukać, tak aby rozpocząć od klarownej zawiesiny jednokomórkowej (Rysunek 1).
- Unikaj stosowania wirowania do mieszania próbek podczas przetwarzania, ponieważ może to uszkodzić delikatne MKs. Wymieszaj, przesuwając lub odwracając rurkę.
UWAGA: Gradient gęstości w celu uzyskania PBMC może skutkować bogatszą i czystszą frakcją komórek w porównaniu z WB zmielonym RBC. Należy jednak pamiętać, że dojrzałe MK o dużej gęstości mogą zostać utracone we frakcji "neutrofilowej". Zostanie to omówione w reprezentatywnych wynikach.
2. Różnicowanie in vitro MK od PBMC
UWAGA: MK można odróżnić in vitro od wcześniejszych prekursorów, takich jak komórki CD34+, obecnych w różnych źródłach pierwotnych (np. WB/PBMCs, krew pępowinowa, szpik kostny) oraz od iPSC. W tym celu zastosowano różne protokoły. Tutaj używamy opracowanej przez nas metody hodowli, która pozwala na odróżnienie MK od PBMC, bez konieczności wzbogacania o prekursory CD34+15,19,20,21,22.
- Protokół ten składa się z trzech faz hodowli, w których stężenie trombopoetyny (TPO) stopniowo wzrasta kosztem czynników wzrostu sprzyjających proliferacji wcześniejszych prekursorów (tj. SCF, EPO), które stopniowo maleją (Rysunek 2) 15.
- Jako podłoże podstawowe należy użyć StemSpan SFEM uzupełnionego 0,4% mieszanki lipidów bogatych w cholesterol i 1% penicyliny/streptomycyny.
- W pożywce fazy I należy użyć pożywki podstawowej uzupełnionej SCF (100 ng/ml), erytropoetyną (EPO, 0,5 U/ml) i trombopoetyną (TPO, 30 ng/ml). Pożywka fazy II jest pożywką podstawową uzupełnioną o SCF (50 ng/ml), EPO (0,25 U/ml) i TPO (50 ng/ml). W przypadku pożywki fazy III należy użyć pożywki podstawowej uzupełnionej TPO (100 ng/ml).
- Hodowla PBMC w pożywce fazy I. W dniach 6-8 umieść PBMC w pożywce fazy II, a w dniu 9-12 umieść PBMC w pożywce fazy III.
- Zastąpić pożywkę przez odwirowanie komórek o stężeniu 435 x g przez 5 minut w temperaturze pokojowej od fazy I do fazy II i przy 95 x g przez 5 minut w temperaturze pokojowej od fazy II do fazy III i ponowne zawieszenie ich w świeżej pożywce.
- Hodowla komórek w inkubatorze w temperaturze 37 °C, 5% CO2 . W tych kulturach pierwotnych różnicowanie MK trwa 10-14 dni, a próbki można pobierać w różnych punktach czasowych przez cały okres hodowli, aby śledzić różnicowanie MK.

Rysunek 2: Schematyczne przedstawienie metody hodowli MK pochodzącej z PBMC. PBMC od zdrowych dawców hodowano zgodnie z opracowanym przez nas protokołem trójfazowym do generowania MK in vitro (schemat zaczerpnięty z Salunkhe i wsp.). 15 Pokazane są zdjęcia zrobione w 10 i 13 dniu kultury. Zdjęcia są robione obiektywem 20X. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.
- Pobieranie próbek: Umyć komórki, stosując wirowanie na niskiej prędkości przez 5 minut (95 x g) i ponownie zawiesić je w PBS lub PBS zawierającym 1% albuminy surowicy bydlęcej (BSA). Do immunofenotypowania idealna gęstość to 105-10 6 komórek/100 μl (patrz punkt 3.1). W zależności od stanu kultur (tj. obecności martwych komórek, szczątków itp.), może być konieczne 1 lub 2 płukania. Zbierz swoje komórki w interesujących punktach czasowych podczas hodowli.
3. Immunofenotypowanie różnicowania MK - inkubacja z panelem oznaczonych przeciwciał
- Inkubować próbki komórek z panelem znakowanych przeciwciał zgodnie ze standardowymi procedurami, zwracając uwagę na wirowanie z niską prędkością (95 x g) podczas przetwarzania megakariocytów. Zwykle inkubujemy próbki z 1% BSA w PBS w objętościach 100 μL w temperaturze 4 °C, 20 minut, w zakresie 105-10 6 komórek.
- Skalowanie w górę w razie potrzeby.
- Po inkubacji dodać 5 ml 1% BSA do PBS, odwirować z niską prędkością (95 x g), zassać supernatant i ponownie zawiesić próbkę w 2% BSA w PBS, aby zachować żywotność MK (2 ml). Dodaj 1-5 mM EDTA, aby rozbić agregaty komórka-komórka (które są naturalnie widoczne w kulturach MK).
- Przenieść próbki do probówki o okrągłym dnie (probówka FACS) o wymiarach 12 x 75 mm, trzymając je w ciemności do czasu analizy metodą cytometrii przepływowej lub sortowania komórek.
- Przygotowanie pojedynczych mieszanin przeciwciał i paneli przeciwciał; ustawienie cytometru przepływowego:
- Miareczkować przeciwciała przed ich użyciem w celu określenia optymalnego stężenia w panelach przeciwciał. Optymalne stężenie przeciwciał to najniższe stężenie, które oddziela komórki wyraźnie dodatnie od ujemnych (i pozwala na rozróżnienie pośrednich poziomów ekspresji). Na przykład większość przeciwciał stosuje się w rozcieńczeniu 1:200 (podstawowe 100 μg/ml), chyba że miareczkowano lub wskazano inaczej.
- Po ustaleniu miareczkowania przeciwciał należy przygotować 10-krotne rozcieńczenie każdego przeciwciała. Rozcieńczenia te stosuje się do jednokolorowych kontroli i do przygotowania mieszanek panelowych. Rozcieńczenia i mieszanki panelowe nadają się do użycia nawet miesiąc po przygotowaniu (przechowywane w temperaturze 4 °C, chyba że wskazania producenta wykluczają takie warunki przechowywania). Pozwala to na barwienie próbek tym samym panelem przez pewien okres czasu.
- Użyj 10 μl na 100 μl 10-krotnego rozcieńczenia zarówno do jednokolorowych kontroli, jak i do mieszanki panelowej.
- W przypadku jednokolorowych kontroli użyj kulek powinowactwa przeciwciał, które można bezpośrednio zmierzyć po dodaniu przeciwciała. Jednokolorowe kontrolki powinny być mierzone przy każdym eksperymencie, aby umożliwić odpowiednią regulację kompensacji (i precyzyjne dostrojenie po pomiarze za pomocą oprogramowania analitycznego).
- Alternatywnie wykonaj jednokolorowe kontrolki z próbkami komórek. Jednak kulki pozwalają na szybki pomiar danej liczby zdarzeń, które, w zależności od markera przeciwciała/powierzchni, mogą nie być możliwe do uzyskania na złożonych pierwotnych lub hodowanych źródłach komórek. Zalecamy również uruchomienie próbek komórek wybarwionych mieszankami panelowymi "Fluorescence Minus One" (FMO) w celu skonfigurowania odpowiednich ustawień kompensacji (przed rozpoczęciem eksperymentów). Jest to istotne dla dokładnej identyfikacji problemów z kompensacją, a zwłaszcza w przypadku hodowlanych MK, dla identyfikacji interferencji autofluorescencyjnej (która będzie obecna w przypadku użycia pożywki hodowlanej zawierającej czerwień fenolową).
- Przygotować wystarczającą objętość mieszanki panelowej, w zależności od liczby próbek, zawierającą przeciwciała zaprojektowanego panelu. Większość naszych paneli zawiera sześć przeciwciał (panele 6-kolorowe, patrz tabele 1-2).
- W przypadku tych paneli należy użyć laserów cytometru przepływowego o długości fali 488 nm i 633 nm, jednak panele można dostosować do innych scenariuszy technicznych. Co więcej, kwestie związane z kompensacją można uniknąć w przypadku korzystania z cytometrii przepływowej opartej na spektrometrii mas lub cytometrów z technologią akustycznego ogniskowania.
- Barwniki do pomiaru żywotności mogą dawać fałszywe informacje na temat MK, zwłaszcza gdy dojrzeją. MK są bardzo aktywnymi komórkami wychwytującymi, a dodatni wynik w przypadku Hoechst, 7-AAD lub PE nie zawsze musi odzwierciedlać rzeczywistą śmierć komórki. Alternatywą (jeśli wymagany jest pomiar śmierci komórki) może być zastosowanie barwników mitochondrialnych (CMX Ros) lub barwników reagujących aminami (barwniki Zombie lub Ghost).
Tabela 1: Uwagi na temat markerów powierzchni komórek linii megakariocytów Kliknij tutaj, aby pobrać tę tabelę.
Tabela 2: Panele przeciwciał Kliknij tutaj, aby pobrać tę tabelę.
4. Analiza ploidalna w połączeniu z 6-kolorowymi panelami
- W przypadku analizy ploidalnej, w połączeniu z 6-kolorowym panelem przeciwciał, należy przystąpić do utrwalania i przepuszczalności komórek po inkubacji z panelem przeciwciał. Strategia ta pozwoli na zachowanie barwienia markerów powierzchniowych, umożliwiając jednocześnie barwienie DNA komórek. Do barwienia DNA używamy Hoechst 33342, ponieważ można go uwidocznić za pomocą dostępnego fioletowego lasera o długości fali 405 nm.
- Dla 105-10 6 komórek, po inkubacji z panelem przeciwciał, odwirować komórki (95 x g przez 5 min), ponownie zawiesić w 200 μl buforu utrwalającego i inkubować 10 minut w temperaturze pokojowej (RT).
- Odwirować komórki, jak wskazano powyżej, zawiesić po raz drugi w buforze utrwalającym o objętości 200 μl i inkubować przez kolejne 10 minut w temperaturze pokojowej.
- Przygotować bufor permeabilizacyjny, zawierający 0,1% Triton X-100, 200 mg/ml RNazy i 20 mg/ml Hoechst 33342 (przepuszczalność Hoechst MIX).
- Odwirować komórki jak wyżej, zawiesić je ponownie w 300 μl przepuszczalnego Hoechst MIX i inkubować przez 30 minut w temperaturze 37 °C. Ten krok jest bardzo ważny, ponieważ, aby uzyskać czysty pomiar ploidalności, RNA musi zostać zdegradowany.
- Po upływie czasu inkubacji należy zmierzyć próbki bezpośrednio za pomocą cytometru przepływowego. W przeciwnym razie próbki należy przechowywać w temperaturze 4 °C, w ciemności. Zmierz je szybko. Ponieważ jednak próbki te są stałe, pomiar może być opóźniony nawet o 24-48 godzin. Upewnij się, że próbka jest dokładnie strzepnięta przed pomiarem lub przepuszczona przez sitko do komórek, aby zapewnić zawieszenie pojedynczej komórki.
- Parametry morfometryczne, takie jak rozproszenie do przodu i boczne, nie są zachowywane po utrwaleniu komórek. Wykres punktowy do przodu/z boku pokaże skurczenie się rozkładu komórek po fiksacji. Jednak barwienie markerem powierzchniowym jest w większości zachowane, a strategia bramkowania jest prawie niezmieniona, co pozwala na analizę statusu ploidalności na różnych etapach różnicowania zdefiniowanych przez kombinacje znaczników powierzchniowych.
5. Analiza różnicowania MK
UWAGA: Zauważyliśmy, że kombinacja CD31/CD71 pozwala na ustawienie liczby bramek, które odpowiadają różnym etapom różnicowania MK. Dalsze bramkowanie wsteczne za pomocą markerów specyficznych dla MK pozwala na oddzielenie dojrzałych i niedojrzałych MK. Ponadto, w świeżych próbkach, bramkowanie wsteczne w celu sprawdzenia obecności innych użytych markerów lub umieszczenia populacji w osiach rozproszenia przód/bok, udoskonala ocenę etapów różnicowania MK i pozwala na odrzucenie innych typów komórek, które mogą być obecne w tych samych populacjach.
- Użyj panelu przeciwciał, który zawiera wczesne markery prekursorowe (KIT, CD34), popularne markery prekursorowe (CD31, CD71) i markery linii, niektóre z nich są specyficzne (CD42A/CD42B, CD49B, CD41/CD61, CLEC2, GPVI itp.) (patrz tabele 1-2). Zastosowanie koktajlu Lineage (Lin) (CD3, CD14, CD16, CD19, CD20 i CD56) pozwala również na "odfiltrowanie" dojrzałych komórek krwiotwórczych, które mogą dodać szum do analizy (przy wyborze populacji Lin-). Jako przykład przejdziemy przez analizę MK w PBMC, szpiku kostnym oraz poprzez hodowle komórkowe pochodzące z PBMC w reprezentatywnych wynikach.
6. Sortowanie komórek MK i MK prekursorowych
UWAGA: Barwione komórki były analizowane i sortowane na aktywowanym fluorescencyjnie sorterze komórek FACS Aria IIu wyposażonym w standardowe lasery na ciele stałym 488 nm i 633 nm przy użyciu oprogramowania FACSDiva; dane były dodatkowo analizowane i prezentowane za pomocą oprogramowania FlowJo i Cytobank (analiza viSNE). Czystość sortowanych frakcji potwierdzono analizą cytometrii przepływowej każdej z sortowanych frakcji (czystość powyżej 85%).
- Sortowanie komórek należy przeprowadzić tak szybko, jak to możliwe lub w ciągu 1 godziny po inkubacji przeciwciał, aby uniknąć degradacji komórek.
- Przefiltrować próbkę za pomocą sitka do komórek o wielkości 100 μm, aby zapewnić zawiesinę pojedynczej komórki i integralność dużych komórek MK.
- Użyj dyszy ceramicznej 130 μm, ciśnienia w osłonie ustawionego na 11 funtów na cal kwadratowy (PSI) i częstotliwości napędu kroplowego ustawionej na 12 kHz, aby rozbić strumień na krople.
- Przed sortowaniem wysterylizuj dyszę, osłonę i linie próbek, wykonując 30-minutową akwizycję penicyliną/streptomycyną rozcieńczoną 1:5 w sterylnej wodzie, a następnie 10-minutową akwizycję sterylną wodą w celu usunięcia pozostałego odkażenia.
- Gdy strumień się ustabilizuje, dostosuj opóźnienie upuszczania za pomocą zalecanych koralików, aby posortować w trybie precyzyjnego dostrojenia ponad 97,5% odbitych kropli przy natężeniu przepływu 400-1200 zdarzeń na sekundę.
- Przygotować probówki do zbierania FACS zawierające 500 μl 2% BSA w PBS. Procent BSA można zwiększyć do 5-10%.
- Wygeneruj szablon eksperymentu z odpowiednimi parametrami macierzy wynagrodzeń.
- Załaduj probówkę FACS do cytometru.
- Wykonaj pomiar próbki, aby ustawić pożądane bramki i czystość docelowych populacji komórek. Utrzymuj rekord aktywowany, aby wyświetlić do 200 000 zdarzeń w wybranych bramkach populacji podczas sortowania komórek.
- FACS Aria IIu pozwala na separację do 4 różnych populacji komórek w tym samym czasie. Utwórz nowy układ sortowania i wybierz urządzenie do pobierania (4 probówki) oraz odpowiedni tryb precyzyjny (zalecana jest pośrednia maska czystości i odzysku). Na koniec dodaj interesujące populacje do każdego pola lokalizacji sortowania (Rysunek 3).

Rysunek 3: Schematyczne przedstawienie zasady sortowania komórek aktywowanych fluorescencją (FACS). Cząstki przechodzą przez dyszę 130 μm i są zmuszane do rozpadu na strumień regularnych kropel w wyniku działania wibracji na dyszę. Następnie kropelki są badane przez laser (punkt analizy), a sygnały są przetwarzane w celu podjęcia "decyzji sortowania" poprzez przyłożenie ładunku do tych kropel. Gdy kropla ładunku przechodzi przez pole elektrostatyczne wysokiego napięcia (płytka detekcyjna), jest odchylana i zbierana do odpowiedniej rurki zbiorczej. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.
- Załaduj probówki zbiorcze i zacznij sortować populacje docelowe.
- Odwirować probówki zbiorcze przez 5 minut przy 95 x g i ponownie zawiesić osad komórkowy w odpowiedniej objętości 2% masy ciała w PBS.
- Ponownie zmierzyć ułamek każdej posortowanej próbki, aby obliczyć czystość.
- Przechowuj komórki w odpowiedni sposób do dalszego wykorzystania. Posortowane komórki mogą być wykorzystywane do analiz cytologicznych i molekularnych lub mogą być ponownie hodowane w celu zbadania procesu różnicowania wybranej populacji komórek.
7. Przygotowanie próbki po sortowaniu
- Przygotowanie cytospinów do analizy cytologicznej za pomocą cytowirówki
- Doprowadź posortowane komórki do łatwej w obsłudze objętości roboczej 100-200 μl. Należy wziąć pod uwagę, że gęstość komórek będzie zależeć od wydajności posortowanej populacji w każdym przypadku.
- Umieść czysty szkiełko na metalowym uchwycie i umieść górną część filtra. Pamiętaj, aby oznaczyć szkiełko i filtr, aby uniknąć mieszania próbek.
- Dodaj 100 μl PBS na otwór filtra przylegający do szkiełka, aby filtr został nawilżony na krawędzi otworu.
- Umieść lejek, zamknij metalowy uchwyt i umieść go na swoim miejscu w wirówce.
- Dodać próbkę (100-200 μl) do lejka.
- Wirować przy 36 x g przez 5 minut. Szkiełka cytospinowe można pozostawić do wyschnięcia na powietrzu w temperaturze pokojowej (odpowiednio przykryte, aby zapobiec kurzowi) i można je przechowywać w temperaturze pokojowej przez 1 tydzień przed barwieniem immunologicznym lub histochemią.
- Do barwienia immunologicznego
- Utrwalić szkiełka w 2% paraformaldehydzie (PFA) rozcieńczonym w PBS i inkubować przez 5 minut.
- Można stosować zakres 0,5-4% PFA w PBS. W naszych rękach zużywamy 4%, aby uzyskać prawidłowe utrwalenie tkanek lub niektórych typów komórek, a 0,5% PFA w PBS wystarcza dla płytek krwi. Podczas konfigurowania tej techniki odpowiedni procent PFA wymaga optymalizacji dla każdego typu/źródła ogniwa.
- Inkubować 5 minut w PBS.
- Inkubować 5 minut w 50% etanolu (EtOH).
- Inkubować 5 minut w 70% EtOH.
- Przechowywać w 70% EtOH w temperaturze -20ºC.
- Podczas wykonywania barwienia immunologicznego należy ponownie nawodnić i postępować zgodnie ze standardowymi procedurami (przepuszczalność, mycie, blokowanie, inkubacja przeciwciał pierwotnych i wtórnych, konserwacja itp.).
- Do cytochemii:
UWAGA: Szkiełka można barwić farbą May-Grünwald Giemsa lub wygodnym barwieniem do każdego celu.
- Do natychmiastowego badania morfologicznego
- Dodać jedną kroplę pożywki montażowej na miejsce zawierające komórkę cytospiny i umieścić szkiełko nakrywkowe.
- Szkiełka należy przechowywać w temperaturze 4 °C nie dłużej niż tydzień, chyba że są szczelnie zamknięte, co pozwala na długotrwałe przechowywanie nawet w temperaturze pokojowej. Mocowanie podłoża umożliwia długotrwałe przechowywanie w temperaturze pokojowej.