W ostatnich latach dziedzina makropinocytozy szybko się rozwinęła. Makropinocytoza stała się centralnym mechanizmem, dzięki któremu wrodzone komórki odpornościowe utrzymują homeostazę i odporność organizmu. Jednocześnie, w przeciwieństwie do swojej roli homeostatycznej, może również napędzać różne patologie, w tym raka i infekcje wirusowe. W przeciwieństwie do innych trybów endocytozy, narzędzia opracowane do badania dojrzewania makropinosomów pozostają słabo rozwinięte. W tym miejscu protokół opisuje nowo opracowane narzędzia do badania środowiska redoks w świetle wczesnych i dojrzewających makropinosomów. Opisano metodyki wykorzystania ratiometrycznej mikroskopii fluorescencyjnej do oceny pH, produkcji reaktywnych form tlenu oraz zdolności degradacyjnej w świetle poszczególnych makropinosomów w żywych komórkach. Pomiary pojedynczych organelli mają tę zaletę, że ujawniają niejednorodność czasoprzestrzenną, która często jest tracona w przypadku podejść populacyjnych. Nacisk kładziony jest na podstawowe zasady podwójnej fluoroforowej mikroskopii ratiometrycznej, w tym wybór sondy, oprzyrządowanie, kalibrację oraz metody oparte na pojedynczych komórkach i populacji.