W tym artykule opisano, jak generować eksplantaty blastodermy danio pręgowanego i omówiono dwa praktyczne zastosowania tych eksplantatów w rozwiązywaniu roli węzłowej sygnalizacji morfogennej w gastrulacji. Ta metoda cięcia i hodowli eksplantatów zapewnia czystą kartę naiwnych komórek, którymi można manipulować za pomocą zastrzyków RNA i leczenia związkami małocząsteczkowymi w celu zbadania interesującego szlaku molekularnego.
Kroki krytyczne
W tym protokole są cztery kroki, które są szczególnie krytyczne dla jego sukcesu. Pierwszym z nich jest wstrzyknięcie do zarodków odpowiedniej ilości węzła chłonnego. Protokół ten zaleca 10 pg ndr2 RNA i chociaż zakres dawek sprzyja przedłużeniu, zbyt duża lub zbyt mała ilość Nodal uniemożliwi optymalne wydłużenie eksplantatu20. Drugim krokiem jest dechorionacja zarodków. Jeśli zarodki pozostaną w pronazie zbyt długo, żółtka pękną, a zarodki nie będą zdolne do cięcia. Jeśli nie znajdują się w pronasie wystarczająco długo, kosmówka nie zostanie rozluźniona przez mycie i zamiast tego będzie wymagała czasochłonnej ręcznej dechorionacji. Trzecim krytycznym krokiem jest wycięcie eksplantatów. Zaleca się wciskanie 3x roztworu Danieau, ponieważ niższa zawartość soli w 0,3x roztworze Danieau lub wodzie jajecznej nie sprzyja gojeniu i przetrwaniu eksplantatów.
Dodatkowo eksplantaty muszą być przycięte mniej więcej w połowie wysokości blastodermy, aby zapewnić naiwność komórek. Jeśli zostaną przecięte zbyt blisko żółtka, będą zawierały sygnały z brzegu (w tym endogennego węzła węzłowego), które sprzyjają specyfikacji tkanek i morfogenezie. Czwartym i ostatnim krytycznym krokiem jest uzdrowienie chimerycznych eksplantatów. Dwa eksplantaty nie połączą się, tworząc chimery, chyba że ich przycięte krawędzie zostaną delikatnie ściśnięte natychmiast po ich przecięciu.
Modyfikacje i rozwiązywanie problemów
Krytyczne kroki opisane powyżej dają możliwość rozwiązywania problemów. Poniżej przedstawiono kilka typowych problemów i proponowane rozwiązania.
Jeśli eksplantaty nie rozciągają się w obecności sygnalizacji węzłowej, istnieje kilka możliwych rozwiązań. (A) Wstrzyknąć zarodki w stadium pojedynczej komórki, aby zapewnić równomierne rozproszenie RNA w całym zarodku. (B) Należy unikać wstrzykiwania zbyt dużej ilości węzłowego RNA, upewniając się, że wstrzyknięta objętość jest prawidłowa za pomocą mikrometru do pomiaru bolusa do wstrzykiwania. (C) Unikaj wstrzykiwania zbyt małej ilości węzłowego RNA, mierząc jego stężenie, aby upewnić się, że nie uległ degradacji. (D) Zachowaj kilka nienaruszonych rodzeństwa w tym samym wieku, aby wywnioskować równoważny etap eksplantatów. Eksplantaty osiągają maksymalne wydłużenie, gdy nienaruszone rodzeństwo osiąga stadium 2-5 somitów. Jeśli eksplantaty zostaną zebrane zbyt wcześnie, optymalne przedłużenie nie zostanie osiągnięte.
Jeśli żółtka pękają po dechorionacji, a zarodki nie są zdolne do cięcia, usuń zarodki z roztworu pronazy, gdy kosmówka zacznie się marszczyć, a 1-2 zarodki zrzucą kosmówkę. Następnie natychmiast spłucz w wodzie jajecznej.
Jeśli eksplantaty wydają się bąbelkowe na krawędziach, istnieje kilka rozwiązań. (A) Ścinaj eksplantaty tylko w określonych ramach czasowych rozwoju. Chociaż eksplantaty cięte na dowolnym etapie od 128 do 1000 komórek mogą przetrwać i rozwijać się w hodowli, te cięte w stadiach od 256 do 512 komórek są zwykle najbardziej wytrzymałe. (B) Upewnij się, że eksplantaty są pokrojone w 3x roztworze Danieau, aby zapewnić prawidłowe gojenie. (C) Pokrój eksplantaty czysto, ale delikatnie. Unikaj rozciągania lub rozrywania komórek podczas procesu cięcia.
Jeśli niewstrzyknięte eksplantaty kontrolne rozszerzają się, eksplantaty prawdopodobnie przycinały się zbyt blisko żółtka. Aby eksplantaty były naiwne, upewnij się, że nacięcia są wykonane w połowie odległości między żółtkiem a górną częścią blastodermy.
Jeśli chimeryczne eksplantaty nie zrośnią się, jest to prawdopodobnie spowodowane tym, że eksplantaty w roztworze 3x Danieau po przecięciu mają tendencję do zaokrąglania i gojenia się na krawędzi cięcia. Aby upewnić się, że dwie blastodermy goją się do siebie, a nie do siebie, ściśnij je razem natychmiast po przecięciu. Użyj kleszczy, aby delikatnie wywrzeć nacisk na nowo połączone blastodermy w studni agarozy, aby zachęcić je do wspólnego gojenia.
Ograniczenia
Chociaż te eksplantaty są cennym narzędziem do badania roli danego morfogenu (lub innej cząsteczki będącej przedmiotem zainteresowania) we względnej izolacji, obserwacje dokonane w dowolnym modelu ex vivo muszą być interpretowane z ostrożnością. Eksplantaty wykazują morfogenezę C&E, która jest bardzo podobna do tej obserwowanej in vivo20, ale nie podsumowują wszystkich aspektów gastrulacji, na przykład ruchów epibolicznych. Brakuje im również wielu innych czynników regulacyjnych i cząsteczek sygnałowych, które są obecne w nienaruszonym zarodku. Chociaż jest to znacząca zaleta eksperymentalna eksplantatów, może również prowadzić do wniosków, które nie są prawdziwe in vivo. Na przykład, ponieważ eksplantaty, które nie otrzymują egzogennych ligandów węzłowych, nie wykazują ekspresji markerów neuroektodermy, można wywnioskować z samych eksplantatów, że sygnalizacja węzłowa jest wymagana do specyfikacji neuroektodermy. Jednak neuroektoderma powstaje w nienaruszonych zarodkach pozbawionych wszystkich sygnałów węzłowych23,24, co wskazuje na istotną rolę innych cząsteczek sygnałowych w specyfikacji neuronalnej32. Eksplantaty mogą nam powiedzieć, do czego zdolny jest morfogen w odizolowanym środowisku. Mimo to wszystkie takie wyniki powinny zostać potwierdzone lub porównane z nienaruszonymi zarodkami, aby wyniki mogły być dokładnie zinterpretowane. Innymi słowy, eksplantaty nie mogą zastąpić rozwijającego się zarodka. Zamiast tego są dodatkowym narzędziem do identyfikacji roli i związku morfogenu z otoczeniem. Mając na uwadze te ograniczenia, eksplantaty blastodermy danio pręgowanego są cennym narzędziem dla wielu pytań badawczych.
Znaczenie w odniesieniu do istniejących metod
Wraz z ponownym zainteresowaniem embriologią syntetyczną, regularnie stosuje się kilka podejść ex vivo i in vitro do modelowania aspektów rozwoju embrionalnego. Na przykład, 2- i 3-wymiarowe gastruloidy złożone z mysich lub ludzkich embrionalnych / indukowanych pluripotencjalnych komórek macierzystych można nakłonić, poprzez zastosowanie egzogennych cząsteczek sygnałowych, do podsumowania niektórych wzorców i / lub zdarzeń morfogenetycznych gastrulacji, segmentacji i neurulacji 33,34,35,36,37 . Chociaż metody te są skuteczne, wymagają pracochłonnych i długotrwałych metod hodowli, zarówno w celu ciągłego utrzymywania pluripotencjalnych komórek macierzystych, jak i hodowania gastruloidów, które potrzebują wielu dni, aby osiągnąć stadium gastrulacji. Natomiast eksplantaty danio pręgowanego nie wymagają utrzymywania kultur komórek macierzystych, ponieważ zarodki są po prostu pobierane w razie potrzeby. Są stosunkowo łatwe do wygenerowania i osiągają stadium gastrulacji w ciągu kilku godzin, tak samo jak zarodki danio pręgowanego. Podkreśla to kolejną zaletę eksplantatów danio pręgowanego, ich nienaruszony zegar rozwojowy. Ponieważ wiek rozwojowy embrionalnych i indukowanych pluripotencjalnych komórek macierzystych może być zmienny i wysoce dyskusyjny, embrionalne eksplantaty są być może lepiej przystosowane do badania czasowej regulacji rozwoju. Wreszcie, podczas gdy eksplantaty peskoidów danio pręgowanego (które zawierają margines embrionalny) podobnie rozciągają się w hodowli12,13, robią to w odpowiedzi na endogenne centra sygnalizacyjne. Zamiast tego, opisane tutaj eksplantaty umożliwiają naukowcom badanie interesujących cząsteczek przy stosunkowo niewielkiej interferencji ze strony takich sygnałów embrionalnych.
Potencjalne przyszłe zastosowania
W tym przypadku zastosowano eksplantaty, aby wykazać, że sygnalizacja węzłowa jest niezbędna i wystarczająca do morfogenezy C&E. Mimo to przewiduje się, że mogą one być i będą wykorzystywane do rozpoznawania roli wielu różnych cząsteczek w wielu innych procesach rozwojowych, na przykład w regulacji ekspresji genów, gradientach sygnałowych i dodatkowych programach morfogenetycznych. Dodatkowo, ponieważ te eksplantaty są żywotne do co najmniej 24 hpf19, można oczekiwać, że ich użyteczność wykracznie poza gastrulację i obejmie procesy takie jak segmentacja i organogeneza, każdy proces, w którym naukowcy pragną rozwojowej czystej karty.