$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Światło jest niezbędne do fotosyntezy, wzrostu i rozwoju roślin. Jest to jeden z najbardziej dynamicznych czynników abiotycznych, ponieważ natężenie światła zmienia się nie tylko w ciągu pory roku lub dnia, ale także szybko i w nieprzewidywalny sposób w zależności od zachmurzenia. Na poziomie liści na natężenie światła wpływa również gęstość i charakter otaczającej roślinności oraz własny baldachim rośliny. Jednym z ważnych mechanizmów, który pozwala roślinom optymalizować przechwytywanie światła w zmiennych warunkach oświetleniowych, jest zdolność chloroplastów do poruszania się w odpowiedzi na bodźce światła niebieskiegoxref"1,2. W warunkach słabego oświetlenia chloroplasty rozprzestrzeniają się prostopadle do światła (wzdłuż ścian komórkowych peryklinalnych) w tak zwanej odpowiedzi akumulacji, maksymalizując przechwytywanie światła, a tym samym fotosyntezę. W warunkach silnego oświetlenia chloroplasty przemieszczają się w kierunku antyklinalnej ściany komórkowej w tak zwanej reakcji unikania, minimalizując przechwytywanie światła i niebezpieczeństwo fotoinhibicji. U wielu gatunków chloroplasty przyjmują również specyficzną ciemną pozycję, która różni się od pozycji akumulacji i unikania i często pośrednia między tymi dwoma3,4. Różne badania wykazały, że ruch chloroplastów jest ważny nie tylko dla krótkoterminowej tolerancji liści na stres5,6,7, ale także dla wzrostu i sukcesu reprodukcyjnego roślin, zwłaszcza w zmiennych warunkach oświetleniowych8,9.
Ruch chloroplastów można łatwo zaobserwować w czasie rzeczywistym u niektórych żywych okazów (np. glonów lub roślin o cienkich liściach, takich jak Elodea) za pomocą mikroskopii świetlnej1. Badanie ruchu chloroplastów w większości liści wymaga jednak wstępnej obróbki w celu wywołania ruchu chloroplastów, chemicznego utrwalenia i przygotowania przekrojów poprzecznych przed obejrzeniem próbek pod mikroskopem świetlnym10. Wraz z wprowadzeniem konfokalnej mikroskopii laserowej możliwe stało się również obrazowanie trójwymiarowego układu chloroplastów w nienaruszonych lub nieruchomych liściach4,11,12. Te techniki obrazowania znacznie pomagają w zrozumieniu ruchu chloroplastów, dostarczając ważnych informacji jakościowych. Kwantyfikacja pozycjonowania chloroplastów (np. jako procent chloroplastów w pozycjach peryklinalnych lub antyklinalnych na tych obrazach lub procent powierzchni pokrytej chloroplastami na całkowitą powierzchnię komórki) jest również możliwa, ale dość czasochłonna, zwłaszcza jeśli jest prowadzona w odstępach czasu niezbędnych do uchwycenia szybkich zmian w pozycjonowaniu10,8. Najprostszym sposobem pokazania, czy przystosowane do ciemności liście określonego gatunku lub mutanty są zdolne do przemieszczania się chloroplastów w reakcję unikania, jest pokrycie większości obszaru liścia, aby utrzymać chloroplasty w ciemności, jednocześnie wystawiając pasek liścia na działanie silnego światła. Po co najmniej 20 minutach ekspozycji na wysokie światło chloroplasty w odsłoniętym obszarze przesuną się do pozycji unikania, a odsłonięty pasek będzie widocznie jaśniejszy niż reszta liścia. Dotyczy to dzikiego typu A. thaliana, ale nie niektórych mutantów ruchu chloroplastów, opisanych bardziej szczegółowo w dalszej części 13. Ta metoda i jej modyfikacje (np. odwrócenie, które części liścia są odsłonięte, zmiana natężenia światła) są przydatne do badania przesiewowego dużej liczby mutantów i identyfikacji mutantów zerowych, które nie mają zdolności do wykazywania reakcji unikania lub akumulacji, lub obu. Nie dostarcza jednak informacji o dynamicznych zmianach w ruchu chloroplastów.
Dla kontrastu, opisana tutaj metoda pozwala na ilościowe określenie ruchu chloroplastów w nienaruszonych liściach przy użyciu zmian w transmisji światła przez liść jako wskaźnika dla ogólnego ruchu chloroplastów: w warunkach, gdy chloroplasty są rozproszone w komórkach mezofilu w odpowiedzi akumulacji, mniej światła jest przepuszczane przez liść niż gdy wiele chloroplastów jest w reakcji unikania, ustawiając się wzdłuż antyklinalnych ścian komórkowych. W związku z tym zmiany w transmisji mogą być używane jako wskaźnik zastępczy dla ogólnego ruchu chloroplastów w liściach14. Szczegóły dotyczące instrumentu są opisane w innym miejscu (patrz Plik Uzupełniający), ale zasadniczo instrument wykorzystuje niebieskie światło do wyzwalania ruchu chloroplastów i mierzy, ile czerwonego światła jest przepuszczane przez ten liść w określonych odstępach czasu. Niedawno opisano modyfikację tego systemu, która wykorzystuje zmodyfikowany 96-dołkowy czytnik mikropłytek, niebieską diodę LED, komputer i inkubator z kontrolowaną temperaturą15.
Opcja użycia kombinacji metod, w tym optycznej oceny liści do badań przesiewowych, a następnie pomiaru dynamicznych zmian w transmisji i użycia mikroskopii, znacznie pomogła nam zrozumieć zarówno podstawowe mechanizmy, jak i fizjologiczne/ekologiczne znaczenie ruchu chloroplastów. Na przykład doprowadziło to do odkrycia i scharakteryzowania różnych mutantów, które są upośledzone w określonych aspektach swoich ruchów. Na przykład mutanty A. thaliana phot 1 nie mają zdolności do gromadzenia swoich chloroplastów w słabym świetle, podczas gdy mutanty phot 2 nie mają zdolności do przeprowadzania reakcji unikania. Te fenotypy są spowodowane upośledzeniem dwóch odpowiednich receptorów światła niebieskiego16,17,18. W przeciwieństwie do tego, mutanty chup1 nie mają zdolności do tworzenia odpowiednich włókien aktynowych wokół chloroplastów, które są niezbędne do przeniesienia chloroplastów do pożądanej pozycji w komórce11,19. Oprócz badań nad mutantami, naukowcy ocenili wpływ różnych inhibitorów na ruch chloroplastów, aby wyjaśnić mechanistyczne aspekty tego procesu. Na przykład substancje chemiczne, takie jakH2O2i różne przeciwutleniacze, zostały użyte do zbadania wpływu tej cząsteczki sygnałowej na ruch chloroplastów20. Zastosowano różne inhibitory, aby wyjaśnić rolę wapnia w ruchu chloroplastów21. Oprócz pomocy w odkryciu mechanizmów ruchu chloroplastów, metody te mogą być wykorzystane do porównania ruchu chloroplastów u różnych gatunków lub mutantów hodowanych w różnych warunkach w celu zrozumienia ekologicznego i ewolucyjnego kontekstu tego zachowania. Na przykład wykazano, że zakres skutków różnych mutacji w szlaku ruchu chloroplastów zależy od warunków wzrostu7,9, oraz że rośliny przystosowane do słońca nie wydają się zbytnio poruszać swoimi chloroplastami. Z kolei ruch jest bardzo ważny w przypadku roślin zacieniających10,22,23.
Ten artykuł o metodach, skupiający się na modelowej roślinie A. thaliana, opisuje, jak korzystać z urządzenia transmisyjnego, które jest zaktualizowaną wersją wcześniej opracowanego instrumentu9. Chociaż instrument ten nie jest dostępny na rynku, osoby z podstawową wiedzą na temat elektroniki lub pomocą kolegów i studentów z dziedziny inżynierii lub fizyki będą w stanie zbudować instrument przy użyciu niedrogich części i postępując zgodnie ze szczegółowymi instrukcjami (patrz Plik uzupełniający). Platforma open-source użyta do zbudowania instrumentu ma szerokie wsparcie internetowe i forum społecznościowe, które oferuje pomoc w przypadku wystąpienia problemów24.
Protokół skupia się na tym, jak używać instrumentu do określania zmian w transmisji liści w standardowym przebiegu eksploracyjnym, który wystawia liść na szeroki zakres warunków świetlnych i rejestruje reakcje ciemności, akumulacji i unikania A. thaliana. Przebiegi te mogą być modyfikowane w zależności od celu eksperymentu i mogą być stosowane w przypadku większości gatunków roślin. W artykule przedstawiono przykłady danych transmisyjnych dzikiego typu A. thaliana i kilku mutantów oraz pokazano, jak można dalej analizować dane.