Utlenianie β kwasów tłuszczowych jest niezbędnym procesem w metabolizmie lipidów, zapewniając kataboliczny szlak równoważący syntezę kwasów tłuszczowych i ich przyjmowanie z diety. Proces ten generuje energię dla wielu narządów, w tym mięśnia sercowego, kory nerkowej i wątroby na czczo, i wykorzystuje kwasy tłuszczowe uzyskane z diety, lipolizy tkanki tłuszczowej i wewnętrznych zapasów trójglicerydów1,2.
Utlenianie kwasów tłuszczowych poprzez szlak β-oksydacji powoduje sekwencyjne skrócenie tłuszczowego łańcucha acylowego o dwa atomy węgla na raz, uwalniane jako acetylo-CoA, a proces ten zachodzi zarówno w mitochondriach, jak i w peroksysomach. Podczas gdy większość kwasów tłuszczowych ulega tylko β-oksydacji, niektóre są utleniane przy różnych atomach węgla przed wejściem na ten szlak. Na przykład kwasy tłuszczowe podstawione 3-metylem, takie jak kwas fitanowy, ulegają usunięciu jednego węgla przez α-utlenianie w peroksysomach przed wejściem na szlak β-utleniania. Podobnie, niektóre kwasy tłuszczowe są najpierw przekształcane w dikarboksylowe kwasy tłuszczowe przez utlenianie końcowej grupy metylowej (ω-oksydacja) w retikulum endoplazmatycznym, zanim zostaną preferencyjne utlenione w peroksysomach przez β-oksydację3.
Niezależnie od konkretnych organelli, kwas tłuszczowy musi najpierw zostać przekształcony w tioester koenzymu A (CoA) lub acylo-CoA, który ma zostać utleniony przez szlak β-oksydacji. β-Utlenianie długołańcuchowych acylo-CoA w macierzy mitochondrialnej wymaga transportu karnitynowego do ich translokacji, gdzie palmitoilotransferaza karnityny 1 (CPT1) katalizuje przemianę acylo-CoA do acylokarnityny i jest enzymem ograniczającym szybkość w tym procesie4. Po translokacji do macierzy mitochondrialnej, acylo-CoA są ponownie formowane i służą jako substraty dla maszynerii utleniania β mitochondriów. W stanie na czczo acetylo-CoA wytwarzany w wyniku β-oksydacji w mitochondriach wątrobowych jest przede wszystkim kierowany do ketogenezy. Peroksysomy służą jako główne miejsce β-utleniania bardzo długołańcuchowych, rozgałęzionych i dikarboksylowych kwasów tłuszczowych. Peroksysomy nie wymagają transportu karnityny do importu substratów kwasów tłuszczowych, zamiast tego importują odpowiedni acylo-CoAs poprzez aktywność transporterów kasety wiążącej ATP (ABC) ABCD1-35. W peroksysomach acylo-CoA są następnie utleniane przez dedykowany zestaw enzymów, różniący się od maszynerii utleniania mitochondrialnych kwasów tłuszczowych β. Zarówno mitochondria, jak i peroksysomy wymagają również dostarczania NAD + i wolnego CoA do utleniania tłuszczowych łańcuchów acylowych. Wykazano, że poziom CoA w wątrobie wzrasta w odpowiedzi na post, co wspiera zwiększone tempo utleniania kwasów tłuszczowych, które występuje w tym stanie6. Ponadto zwiększona degradacja CoA w peroksysomach powoduje selektywny spadek utleniania peroksysomalnych kwasów tłuszczowych7. Dlatego proces utleniania kwasów tłuszczowych w komórce jest regulowany przez poziomy ekspresji i aktywność enzymów biorących udział w aktywacji, transporcie i utlenianiu kwasów tłuszczowych, a także stężenia kofaktorów i innych metabolitów w wielu przedziałach subkomórkowych.
Procedury wykorzystujące homogenaty tkankowe do pomiaru utleniania kwasów tłuszczowych niszczą architekturę komórkową regulującą i wspierającą ten proces, prowadząc do zbierania danych, które nie odzwierciedlają dokładnie metabolizmu in vivo. Podczas gdy techniki wykorzystujące posiane hepatocyty pierwotne zachowują ten system, hodowla izolowanych komórek przez dłuższy czas powoduje utratę profilu ekspresji genów in vivo, który był obecny w komórkach, gdy nadal żyły w obrębie zwierzęcia8,9. Poniższy protokół opisuje metodę izolowania pierwotnych hepatocytów i oznaczania ich zdolności do utleniania β kwasów tłuszczowych bezpośrednio po izolacji i w zawiesinie, przy użyciu kwasu [1-14C]palmitynowego. Test opiera się na pomiarze promieniotwórczości związanej z metabolitami rozpuszczalnymi w kwasie (ASM) lub produktami, takimi jak acetylo-CoA, wytwarzanymi w wyniku β-utleniania kwasu palmitynowego [1-14C]kwasu palmitynowego10,11.