Danio pręgowany jest ważnym modelem do zrozumienia rozwoju nerek. W tym przypadku protokół hybrydyzacji in situ jest zoptymalizowany pod kątem wykrywania ekspresji genów u larw danio pręgowanego i osobników młodocianych podczas rozwoju mesonephros.
Subskrypcja JoVE jest wymagana do oglądania tego materiału. Zaloguj się lub rozpocznij bezpłatny okres próbny.
Artykuł metodologiczny
Danio pręgowany jest ważnym modelem do zrozumienia rozwoju nerek. W tym przypadku protokół hybrydyzacji in situ jest zoptymalizowany pod kątem wykrywania ekspresji genów u larw danio pręgowanego i osobników młodocianych podczas rozwoju mesonephros.
Danio pręgowany tworzy dwie struktury nerkowe w ciągu swojego życia. Nercze (nerka zarodkowa) tworzy się podczas rozwoju embrionalnego i zaczyna funkcjonować po 2 dniach od zapłodnienia. Składa się tylko z dwóch nefronów, przednercze służy jako jedyna nerka podczas życia larwalnego, dopóki nie będzie wymagana większa funkcja nerek ze względu na rosnącą masę ciała. Aby poradzić sobie z tym wyższym zapotrzebowaniem, mesonephros (dorosła nerka) zaczyna tworzyć się podczas metamorfozy. Nowe nefrony pierwotne łączą się z przednerczymi i tworzą połączone światła. Następnie nefrony wtórne łączą się z pierwotnymi (i tak dalej), tworząc rozgałęziającą się sieć w mezonach. Zdecydowana większość badań koncentruje się na przednerczach ze względu na łatwość wykorzystania zarodków. W związku z tym istnieje potrzeba opracowania technik badania starszych i większych larw oraz młodych ryb, aby lepiej zrozumieć rozwój mesonephros. W tym przypadku protokół hybrydyzacji in situ do analizy ekspresji genów jest zoptymalizowany pod kątem penetracji sondy, mycia sond i przeciwciał oraz wybielania pigmentów w celu lepszej wizualizacji śródnercza. Linia transgeniczna Tg (lhx1a-EGFP) służy do znakowania komórek progenitorowych i dystalnych kanalików powstających nefronów. Protokół ten wypełnia lukę w badaniach nad mesonephros. Jest to kluczowy model pozwalający zrozumieć, w jaki sposób powstają nowe tkanki nerkowe i integruje się z istniejącymi nefronami, a także dostarcza informacji na temat terapii regeneracyjnych.
Zarodek danio pręgowanego jest ważnym modelem do badania rozwoju tkanek ze względu na jego mały rozmiar, przezroczystość, dostępne narzędzia i możliwość przetrwania bez karmienia przez okres do pięciu dni1,2. Znacząco przyczynił się do zrozumienia rozwoju nerek i ochrony między danio pręgowanym a ssakami3,4,5. Nerki odgrywają istotną rolę w utrzymaniu homeostazy płynów, filtrowaniu krwi i wydalaniu odpadów6. Nefron, jednostka funkcjonalna nerki, składa się z filtra krwi połączonego z długim kanalikiem. U danio pręgowanego przez całe życie tworzą się dwie struktury nerkowe. Przednercze (tymczasowa nerka embrionalna) tworzy się jako pierwsze we wczesnym okresie rozwoju. Składa się z dwóch nefronów biegnących wzdłuż osi przednio-tylnej i staje się funkcjonalny po około 2 dniach od zapłodnienia (dpf). Użyteczność przednercza polega na jego prostocie, ma tylko dwa nefrony, które są w większości liniowe i łatwe do wizualizacji (chociaż bliższy kanalik kręty zaczyna się zwijać przy trzech dpf)3. Ułatwiło to nie tylko badania nad jego wczesnym rozwojem od mezodermy pośredniej, ale także nad wzorcem segmentacji i naprawą kanalików7,8.
Użyteczność zebry staje się ograniczona po pięciu dpf, kiedy żółtko jest zmniejszone, a larwy polegają na żerowaniu w systemie wodnym9. W wieku około 2 tygodni larwy przechodzą metamorfozę w młode, gdzie tworzą się nowe tkanki, a stare tkanki są tracone i/lub reorganizowane9. Jest to również moment, w którym tworzy się mesonephros (stała dorosła nerka) class<="xref">10,11,12. Pierwszy dorosły nefron tworzy się w pobliżu szóstego somitu i łączy się z dystalnym wczesnym kanalikiem przednercza. Dodatkowe nefrony są początkowo dodawane z tyłu tej pozycji, ale później także w kierunku przedniej. Pierwotne nefrony w tej pierwszej fali łączą się z kanalikami przednerczy i dzielą wspólne światło, aby zdeponować swoje odpady. Nefrony wtórne tworzą się w następnej fali i łączą się z nefronami pierwotnymi. Ten powtarzający się proces tworzy mesonephros, który jest rozgałęziony, nieco podobny do nerki ssaków. Przypuszczalnie przednercze ostatecznie traci swoją tożsamość kanalików i staje się dwoma głównymi kanałami zbiorczymi, w których wszystkie nefrony odprowadzają swoje odpady13.
Przed powstaniem pierwszego dorosłego nefronu, pojedyncze komórki progenitorowe zaczynają pojawiać się w larwach ~4 mm (całkowitej długości) (~10 dpf). Komórki te, które są oznaczone w linii transgenicznej Tg(lhx1a-EGFP), przylegają do przednerczy i wydają się migrować do przyszłych miejsc nefrogenezy. Pojedyncze komórki łączą się w klastry, które różnicują się w nowe nefrony12. Nie jest jasne, gdzie znajdują się te komórki ani jakie geny wyrażają przed rozpoczęciem mezonfrogenezy.
Zrozumienie rozwoju mesonephros dostarcza wglądu w nerki ssaków w sposób, w jaki nie mogą tego zrobić przednercze. Obejmują one tworzenie agregatów nefrogennych z pojedynczych komórek progenitorowych, funkcjonalną integrację nowych nefronów z istniejącymi oraz rozgałęziającą się morfogenezę. Istnieją jednak ograniczenia w badaniu rozwoju postembrionalnego. Larwy są mniej przezroczyste ze względu na większy rozmiar i pigmentację. Oś czasu rozwoju nie jest synchroniczna między poszczególnymi zwierzętami i jest silnie zależna od czynników środowiskowych, takich jak karmienie i zatłoczenie9,14. Chociaż istnieją odczynniki knockdown, są one mniej skuteczne u larw w porównaniu do embryos15. W tym protokole opisano metodę hybrydyzacji in situ w celu określenia ekspresji genów podczas rozwoju mesonephros danio pręgowanego. Zoptymalizowano kilka kroków w celu zwiększenia wizualizacji śródnercza oraz penetracji i mycia sondy i przeciwciała. Linia transgeniczna Tg (lhx1a-EGFP) jest używana wraz z sondą do EGFP do znakowania pojedynczych komórek progenitorowych, agregatów nefrogennych i dystalnych kanalików powstających nefronów. Metoda ta zapewni głębsze zrozumienie rozwoju śródnerki i wgląd w terapie regeneracyjne.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Wykorzystanie larw danio pręgowanego i osobników młodocianych jest zatwierdzone przez IUP IACUC (protokół #02-1920, #08-1920). Szczegółowe informacje na temat zawartości rozwiązania znajdują się w Tabeli materiałów.
1. Hodowla larw
UWAGA: Potrzeba do 21 dni lub więcej, aby doprowadzić larwy i młode osobniki do etapu zainteresowania.
2. Dzień 1 - 2: Naprawianie larw
3. Dzień 3: Pomiar larw
4. Dzień 3 - 4: Odwodnienie
5. Dzień 5: Nawodnienie
6. Dzień 5: Trawienie proteinazy K
7. Dzień 5: Wybielanie
8. Dzień 5: Prehybrydyzacja
UWAGA: W przypadku czynności wykonywanych w temperaturze 70 °C, ważne jest, aby pracować szybko, aby zminimalizować wychładzanie się fiolki.
9. Dzień 6: Hybrydyzacja sondy
10. Dzień 7: Mycie sondy
11. Dzień 7: Blokowanie
12. Dzień 8 - 9: Inkubacja przeciwciał
13. Dzień 10 - 11: Mycie przeciwciał
14. Dzień 12: Barwienie
15. Dzień 12: Obrazowanie
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Wykorzystując linię transgeniczną Tg(lhx1a-EGFP) wykazano, że niniejszy protokół hybrydyzacji in situ jest skuteczny w znakowaniu komórek progenitorowych nerek oraz różnych struktur nefronu podczas rozwoju mezonephros. Zgodnie z oczekiwaniami, w tej linii transgenicznej znakowany jest również ośrodkowy układ nerwowy (niepokażano). Pierwszy nefron mezonephros tworzy się przy długości około 5,2 mm, grzbietowo względem pronephros (Rycina 2A), a cewka dystalna tego nefronu jest...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Opisana tutaj metoda hybrydyzacji in situ ma na celu badanie rozwoju mesonephros. Można go jednak zastosować do badania rozwoju innych tkanek i narządów podczas metamorfozy, takich jak jelita, układ nerwowy, łuski i pigmentacja14. Można generować sondy dla genów endogennych lub markerów fluorescencyjnych w liniach transgenicznych.
Bardzo ważne jest, aby larwy pozostały nienaruszone, aby można było obserwować narządy i tkanki w ich naturalnym kontekście. Aby zac...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Autorzy nie pozostają w konflikcie interesów.
Finansowanie zostało zapewnione przez Pennsylvania Academy of Science, Commonwealth of Pennsylvania Biologists oraz Indiana University of Pennsylvania (School of Graduate Studies and Research, Department of Biology oraz Cynthia Sushak Undergraduate Biology Fund for Excellence). Linia transgeniczna Tg(lhx1a-EGFP) została dostarczona przez dr Neila Hukriede (University of Pittsburgh).
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| Przeciwciało antyfluoresceinowe | Roche/Sigma-Aldrich | 11426338910 | |
| Roztwór | 0,8% KOH, 0,9% H2O2 w PBST | ||
| Odczynnik blokujący | Roche/Sigma-Aldrich | 11096176001 | Stosować do roztworu blokującego, przygotować zgodnie z instrukcją producenta |
| Sitko do komórek | Fisher Scientific | 22-363-549 | 100 μ m |
| E3 medium | 5 mM NaCl, 0,33 mM CaCl2, 0,33 mM MgSO4, 0,17 mM KCl, 0,0001% błękit metylenowy | ||
| Manipulator rzęs | Fisher Scientific | NC1083208 | Służy do manipulowania larwami |
| Roztwór | 4% paraformaldehydu, 1% DMSO w PBS; ciepło w 65° C wstrząsając, aż proszek się rozpuści, a następnie dodać DMSO po ostygnięciu | ||
| Synteza sondy fluoresceinowej | Che/Sigma-Aldrich | 11685619910 | |
| Fiolka szklana | Fisher Scientific | 03-338B | |
| Kapsułka Hatchfry | Argent | ||
| Hyb- roztwór | 50% formamidu, 5X SSC, 0,1% roztwór | ||
| Tween-20 Hyb+ | HYB-, 5 mg/ml torula RNA, 50 ug/ml heparyny | ||
| MAB (10X) | 1 M kwas maleinowy, 1,5 M NaCl, pH 7,5 | ||
| MABT | 1X MAB, 0,1% Tween-20 | ||
| Kwas maleinowy | Sigma-Aldrich | M0375 | |
| Paraformaldehyd | Sigma Aldrich | 158127 | |
| PBS (10X) | 8% NaCl, 0,2% KCl, 1,44% Na2HPO4, 0,24% KH2PO4 | ||
| PBST | 1X PBS, 0,1% Tween-20 | ||
| PBST2 | 1X PBS, 0,2% Tween-20 | ||
| Żywność | Wymieszaj po 2 g spiruliny i enkapsulonu hatchfry w 50 ml wody z systemu rybnego i dobrze wstrząśnij | ||
| Proteinaza K | Sigma-Aldrich | P5568 | Służy do przepuszczalności larw |
| Roztwór | proteinazy K20 μ g / mL, 1% DMSO końcowe stężenie w PBST | ||
| Spirulina mikrodrobny proszek | Argent | ||
| SSC (20X) | 3 M NaCl, 0,3 M octan sodu bezwodny, pH 7, autoklaw | ||
| SSCT (0,2X) | Rozcieńczony od 20X SSC, 0,1% Tween-20 | ||
| SSCT (2X) | Rozcieńczony od 20X SSC, 0,1% Tween-20 | ||
| Bufor | barwiący100 mM Tris pH 9,5, 50 mM MgCl2, 100 mM NaCl, 0,1% Tween-20 | ||
| barwiący | 200 μ g/ml chlorek jodonitrotetrazolu, 200 μ g/ml soli disodowej fosforanu 5-bromo-4-chloro-3-indolilofosforanu, w buforze barwiącym | ||
| Roztwór | 1 mM EDTA, pH 5,5, w PBST | ||
| Torula (drożdże) RNA | Sigma-Aldrich | R6625 | |
| Trikaina | Sigma Aldrich | E10521 | 2%, pH 7 |
| Bufor | 50% formamidu, 2X SSC, 0,1% Tween-20 |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.