Ten protokół przedstawia eksperymentalne procedury przeprowadzania testu śladu adhezyjnego w celu zobrazowania zdarzeń adhezji podczas szybkiej adhezji toczenia komórek.
Subskrypcja JoVE jest wymagana do oglądania tego materiału. Zaloguj się lub rozpocznij bezpłatny okres próbny.
Artykuł metodologiczny
* These authors contributed equally
Ten protokół przedstawia eksperymentalne procedury przeprowadzania testu śladu adhezyjnego w celu zobrazowania zdarzeń adhezji podczas szybkiej adhezji toczenia komórek.
Zrost toczny, ułatwiony przez interakcje za pośrednictwem selekcji, jest wysoce dynamiczną, pasywną ruchliwością w rekrutacji leukocytów do miejsca zapalenia. Zjawisko to występuje w żyłkach zakapilarnych, w których przepływ krwi popycha leukocyty ruchem tocznym na komórki śródbłonka. Stabilne walcowanie wymaga delikatnej równowagi między tworzeniem wiązań adhezyjnych a ich mechanicznie napędzaną dysocjacją, dzięki czemu ogniwo pozostaje przyczepione do powierzchni podczas toczenia się w kierunku przepływu. W przeciwieństwie do innych procesów adhezji zachodzących w stosunkowo statycznych środowiskach, adhezja walcowa jest bardzo dynamiczna, ponieważ komórki toczne przemieszczają się przez tysiące mikronów z prędkością kilkudziesięciu mikronów na sekundę. W związku z tym konwencjonalne metody mechanobiologiczne, takie jak mikroskopia sił trakcyjnych, nie nadają się do pomiaru poszczególnych zdarzeń adhezji i związanych z nimi sił molekularnych ze względu na krótki czas i wymaganą wysoką czułość. W tym miejscu opisujemy naszą najnowszą implementację testu śladu adhezyjnego do obrazowania interakcji selektyny P: PSGL-1 w adhezji tocznej na poziomie molekularnym. Metoda ta wykorzystuje nieodwracalne linki napinające na bazie DNA w celu wytworzenia trwałej historii zdarzeń adhezji molekularnej w postaci ścieżek fluorescencyjnych. Ścieżki te można obrazować na dwa sposoby: (1) zszywając ze sobą tysiące obrazów ograniczonych dyfrakcją, aby uzyskać duże pole widzenia, umożliwiając ekstrakcję śladu adhezyjnego każdej toczącej się komórki o długości tysięcy mikronów, (2) wykonując DNA-PAINT w celu zrekonstruowania obrazów o wysokiej rozdzielczości ścieżek fluorescencyjnych w małym polu widzenia. W tym badaniu test śladu adhezyjnego został wykorzystany do zbadania komórek HL-60 toczących się przy różnych naprężeniach ścinających. W ten sposób byliśmy w stanie zobrazować rozkład przestrzenny oddziaływania selektyny P: PSGL-1 i uzyskać wgląd w ich siły molekularne poprzez intensywność fluorescencji. W związku z tym metoda ta stanowi podstawę do ilościowego badania różnych interakcji komórka-powierzchnia zaangażowanych w adhezję toczną na poziomie molekularnym.
Kaskada adhezji opisuje, w jaki sposób krążące komórki łączą się ze ścianą naczynia krwionośnego i toczą się wzdłuż niej1. Pasywne rolowanie odbywa się głównie za pośrednictwem selektyn, głównej klasy komórkowych cząsteczek adhezyjnych (CAM)1. Pod ścinającym przepływem krwi leukocyty eksprymujące ligand-1 glikoproteiny selektyny P (PSGL-1) tworzą wysoce przejściowe wiązania z selektyną P, które mogą ulegać ekspresji na powierzchni komórek śródbłonka objętych stanem zapalnym. Proces ten ma kluczowe znaczenie dla migracji leukocytów do miejsca zapalenia2. Ponadto, PSGL-1 jest również mechanowrażliwy....
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
1. Znakowanie oligonukleotydów i hybrydyzacja
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Powyższy protokół opisuje procedurę eksperymentalną testu odcisków adhezyjnych (adhesion footprint assay). Ogólny schemat doświadczenia przedstawiono na Rysunku 1, od montażu komory przepływowej (Rysunek 1A), poprzez funkcjonalizację powierzchni (Rysunek 1B), aż po etapy przeprowadzania eksperymentu i obrazowania (Rysunek 1C).
Rysunek 2 przedstaw.......
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Test śladu adhezyjnego umożliwia wizualizację zdarzeń adhezji molekularnej między PSGL-1 a selektyną P podczas adhezji toczenia komórek. Proces ten jest inicjowany przez wychwytywanie za pośrednictwem selektyny P, a następnie toczenie pod wpływem płynnego naprężenia ścinającego. Potencjalne problemy podczas eksperymentu zwykle obejmują słabe zwijanie komórek lub brak ścieżek fluorescencyjnych, nawet jeśli komórki toczą się dobrze. Problemy te często wynikają z kontroli jakości na krytycznych etapach protokołu, zgodnie z .......
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Autorzy deklarują brak konfliktu interesów.
Ta praca była wspierana przez Canada Foundation of Innovation (CFI 35492), Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada Discovery Grant (RGPIN-2017-04407), New Frontiers in Research Fund (NFRFE-2018-00969), Michael Smith Foundation for Health Research (SCH-2020-0559) oraz University of British Columbia Eminence Fund.
....Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| 4-kanałowa prowadnica wiertła | Wykonany | na zamówienie druk 3D z | |
| 4-otworową prowadnicą | na zamówienie | Wywierć czysty szkiełko mikroskopowe za pomocą Dremel z wiertłami z powłoką diamentową na 4-kanałowej prowadnicy wiertarskiej, która ma układ pasujący do środków 8-32 gwintowanych otworów na aluminiowym zacisku. | |
| Aceton | VWR | BDH1101-4LP | |
| Przekładka akrylowa | Wykonane | Wytnij dwa bloki arkuszy akrylowych o wymiarze 40 mm x 30 mm x 2,5 mm. Na każdym bloku wywierć dwa otwory o średnicy 3 mm, które są dokładnie wyrównane z 4-40 otworami w aluminiowym uchwycie. | |
| Aluminiowy uchwyt na wióry | Wykonany | Blok aluminiowy anodowany maszynowo w uchwycie w kształcie litery C o wymiarze zewnętrznym 640 mm x 500 mm x 65 mm i wymiarze otworu 400 mm x 380 mm x 65 mm. Wloty i wyloty są gwintowane gwintem 8-32. | |
| Aminosilan | AlfaAesar | L14043 | CAS 1760-24-3 |
| Antybiotyk/roztwór przeciwgrzybiczy | Cytiva HyClone | SV3007901 | Pen/Strep/Fungiezone |
| Koraliki, polistyren powlekany ProtG | Spherotech | PGP-60-5 | |
| Albumina surowicy bydlęcej | VWR | 332 | |
| Bufor FARBA | 0,05% Tween-20, 5 mM Tris, 75 mM MgCl2, 1 mM bufor EDTA | ||
| , T50M5 | 10mM Tris, 50 mM NaCl, 5 mM MgCl2 | ||
| Buffer, Rolling | HBSS with 2mM CaCl2, 2 mM MgCl2, 10 mM Hepes, 0.1% bufor BSA | ||
| , Wash | 10 mM Tris, 50 mM NaCl, 5 mM MgCl2 i 2 mM CaCl2, 0,05% Tween 20 | ||
| Chlorek wapnia | VWR | BDH9224 | |
| Kolby do hodowli komórkowych | VWR | 10062-868 | |
| Stężony kwas siarkowy | VWR | BDH3072-2.5LG | 95-98% |
| Pęseta do trzymania szkiełek nakrywkowych | Techni-Tool | 758TW150 | |
| Wiertło z powłoką diamentową bity | Technologia ścierna | C5250510 | 0,75 mm wiertło diamentowe |
| DNA, amina-ssDNA (górna nić) | IDT DNA | Niestandardowy oligo | CCGGGCGACGCAGGAGGG /3AmMO/ |
| DNA, biotyna-ssDNA (dolna nić) | IDT DNA | Niestandardowy oligo | /5BiotinTEG/ TTTTT CCCTCCTGCGTCGCCCGG |
| DNA, nić imager do DNA-PAINT | IDT DNA | Niestandardowy oligo | GAGGGAAA TT/3Cy3Sp/ |
| DNA, nić do obrazowania do trwałego znakowania | IDT DNA | Niestandardowy oligo | CCGGGCGACGCAGG /3Cy3Sp/ |
| Taśma dwustronna | Scotch | 237 | 3/4 cala szerokość, trwała taśma dwustronna |
| EDTA | Thermofisher | 15575020 | 0,5 M EDTA, pH 8,0 |
| Epoksydowy | Goryl | 42001 | 5-minutowy czas utwardzania |
| Płodowa surowica bydlęca (FBS) | Avantor | 97068-085 | |
| GelGreen | Biotium | 41005 | |
| Lodowaty kwas octowy | VWR | BDH3094-2.5LG | |
| Szkło, Szkiełka nakrywkowe | Fisher Scientific | 12-548-5P | |
| Szkło, Szkiełko mikroskopowe | VWR | 48300-026 | 75 mm x 25 mm x 1 mm |
| Szkło, Słoik do barwienia | VWR | 74830-150 | Słoik do barwienia Wheaton (900620) |
| Zrównoważony roztwór soli Hanksa (HBSS) | Lonza | 04-315Q | |
| Hemocytometr | Sigma-Aldrich | Z359629-1EA | |
| Ogniwa HL-60 | ATCC | CCL-240 | |
| Wspornik przesuwny komory wilgotnościowej | Wykonany na zamówienie | druk 3D z filamentem ABS | |
| Nadtlenek wodoru | VWR | BDH7690-1 | 30% |
| Imidazol | Sigma-Aldrich | I2399 | |
| Wloty / wyloty | Wykonane | Przewierć osiem dociskowych 8-32 za pomocą wierteł kobaltowych. Wkład 1,5 cm rurki polietylenowe (Tygon, ID 1/32" Ø 3/32") do każdej pustej dociskowej | |
| Iscove Modified Dulbecco Media (IMDM) | Lonza | 12-722F | |
| Chlorek magnezu | VWR | BDH9244 | |
| Magnetyczne kulki Ni-NTA | Invitrogen | 10103D | |
| Rurki pocztowe | EMS | EMS71406-10 | |
| Metanol | VWR | BDH1135-4LP | |
| Micro Bio-Spin P-6 Kolumny żelowe | Biorad | 7326200 | W buforze SSC |
| PEG | Laysan Bio | MPEG-SVA-5000 | |
| PEG-biotyna | Laysan Bio | Biotyna-PEG-SVA-5000 | |
| Wodorotlenek potasu | VWR | 470302-132 | |
| Białko, białko G | Abcam | ab155724 | N-końcowy His-Tag i C-końcowy Białko cysteiny |
| , selektyna P-Fc | R& D System | 137-PS | Rekombinowana ludzka selektyna P/CD62P Fc Chimera białko |
| białko CF, streptawidyna | Cedarlan | CL1005-01-5MG | |
| Pompa Strzykawka | Aparat Harvard | 704801 | |
| Wodorowęglan sodu | Ward' s Science | 470302-444 | |
| Chlorek sodu | VWR | 97061-274 | |
| Sulfo-SMCC | Thermofisher | 22322 | |
| Strzykawka | Hamilton | 81520 | Strzykawki z PTFE luer lock, 5 mL |
| Igły strzykawkowe | BD | 305115 | Precision Glide 26 g, długość 5/8 cala |
| TCEP | Sigma-Aldrich | C4706-2G | |
| Tris | VWR | BDH4502-500GP | |
| Przewody, adapter | Tygon | ABW00001 | Formulacja 3350, średnica wewnętrzna 1/32"; średnica zewnętrzna 3/32" |
| Przewody polietylenowe | BD Intramedic | 427406 | Intramedic (PE20) średnica wewnętrzna 0,38mm; średnica zewnętrzna 1,09mm |
| Tween-20 | Sigma-Aldrich | 93773 |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.