RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
pl_PL
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Ten artykuł opisuje protokół do określania różnic w podstawowym stanie redoks i redoks odpowiedzi na ostre perturbacje w pierwotnych neuronach hipokampa i kory mózgowej za pomocą konfokalnej mikroskopii na żywo. Protokół może być stosowany do innych typów komórek i mikroskopów przy minimalnych modyfikacjach.
Homeostaza mitochondriów redoks jest ważna dla żywotności i funkcji neuronów. Chociaż mitochondria zawierają kilka systemów redoks, bardzo obfity bufor redoks disiarczku tiolu, glutation, jest uważany za głównego gracza w obronie przeciwutleniającej. Dlatego pomiar potencjału redoks mitochondriów glutationu dostarcza przydatnych informacji na temat statusu redoks mitochondriów i stresu oksydacyjnego. Glutaredoksyna1-roGFP2 (Grx1-roGFP2) jest genetycznie kodowanym, opartym na zielonym białku fluorescencyjnym (GFP) wskaźnikiem ratiometrycznym potencjału redoks glutationu, który ma dwa wrażliwe na stan redoks piki wzbudzenia przy 400 nm i 490 nm z pojedynczym pikiem emisji przy 510 nm. W tym artykule opisano, jak przeprowadzić konfokalną mikroskopię na żywo Grx1-roGFP2 ukierunkowanego na mitochondria w pierwotnych neuronach hipokampa i kory mózgowej. Opisano, jak ocenić potencjał redoks mitochondrialnego glutationu w stanie stacjonarnym (np. w celu porównania stanów chorobowych lub długotrwałego leczenia) oraz jak zmierzyć zmiany redoks po ostrym leczeniu (na przykładzie leku ekscytotoksycznego N-metylo-D-asparaginianu (NMDA)). Ponadto w artykule przedstawiono współobrazowanie Grx1-roGFP2 i wskaźnika potencjału błony mitochondrialnej, tetrametylorodaminy, estru etylowego (TMRE), w celu zademonstrowania, w jaki sposób Grx1-roGPF2 może być multipleksowany z dodatkowymi wskaźnikami do analiz wieloparametrycznych. Protokół ten zawiera szczegółowy opis sposobu (i) optymalizacji ustawień konfokalnego laserowego mikroskopu skaningowego, (ii) stosowania leków do stymulacji, a następnie kalibracji czujnika za pomocą diamidu i ditiotreitolu oraz (iii) analizowania danych za pomocą ImageJ/FIJI.
Kilka ważnych enzymów mitochondrialnych i cząsteczek sygnałowych podlega regulacji tiolowej redoks1. Co więcej, mitochondria są głównym komórkowym źródłem reaktywnych form tlenu i są selektywnie podatne na uszkodzenia oksydacyjne2. W związku z tym mitochondrialny potencjał redoks bezpośrednio wpływa na bioenergetykę, sygnalizację komórkową, funkcję mitochondriów i ostatecznie żywotność komórki3,4. Macierz mitochondrialna zawiera duże ilości (1-15 mM) buforu redoks disiarczku tiolu glutationu (GSH) w celu utrzymania homeostazy redoks i wzmocnienia obrony antyoksydacyjnej5,6. GSH może być kowalencyjnie przyłączany do białek docelowych (S-glutationylacja) w celu kontrolowania ich statusu i aktywności redoks i jest wykorzystywany przez szereg enzymów detoksykujących, które redukują utlenione białka. Dlatego potencjał redoks mitochondriów glutationu jest parametrem wysoce informacyjnym podczas badania funkcji i patofizjologii mitochondriów.
roGFP2 to wariant GFP, który stał się wrażliwy na redoks poprzez dodanie dwóch powierzchniowo wystawionych cystein, które tworzą sztuczną parę ditiol-dwusiarczek7,8. Ma pojedynczy pik emisyjny przy ~510 nm i dwa piki wzbudzenia przy ~400 nm i 490 nm. Co ważne, względne amplitudy dwóch pików wzbudzenia zależą od stanu redoks roGFP2 (
Obrazowanie Grx1-roGFP2 można wykonać na szerokiej gamie mikroskopów, w tym na mikroskopach fluorescencyjnych o szerokim polu, mikroskopach konfokalnych z wirującym dyskiem i laserowych skaningowych mikroskopach konfokalnych. Ekspresję czujnika w neuronach pierwotnych można osiągnąć za pomocą różnych metod, które obejmują lipofekcję11, koprecypitację DNA/fosforanu wapnia12, transfer genów za pośrednictwem wirusa lub wykorzystanie zwierząt transgenicznych jako źródła komórek (
W tym artykule, ekspresja Grx1-roGFP2 ukierunkowanego na mitochondria w pierwotnych neuronach hipokampa i kory mózgowej szczura jest używana do oceny podstawowego mitochondrialnego stanu redoks glutationu i jego ostrego zaburzenia za pośrednictwem rAAV. Dostępny jest protokół konfokalnego obrazowania na żywo ze szczegółowymi instrukcjami, jak (i) zoptymalizować ustawienia laserowego skaningowego mikroskopu konfokalnego, (ii) przeprowadzić eksperyment z obrazowaniem na żywo oraz (iii) analizować dane za pomocą FIJI.
Wszystkie eksperymenty na zwierzętach były zgodne z krajowymi i instytucjonalnymi wytycznymi, w tym z Dyrektywą Rady 2010/63/UE Parlamentu Europejskiego, i uzyskały pełną aprobatę etyczną Ministerstwa Spraw Wewnętrznych (Urząd ds. Dobrostanu Zwierząt Uniwersytetu w Heidelbergu i Regierungspraesidium Karlsruhe, licencje T14/21 i T13/21). Pierwotne neurony hipokampa i kory mózgowej zostały przygotowane z nowonarodzonych szczeniąt myszy lub szczurów zgodnie ze standardowymi procedurami i były utrzymywane przez 12-14 dni, jak opisano wcześniej13.
1. Przygotowanie roztworów
| składnik | Mw | Stężenie (M) | Ilość (g) | Objętość (ml) |
| Zawartość NaCl | Klasa 58,44 | pkt.5 | godz. 14.61 | 50 | Rozdział
| Kcl | Klasa 74,55 | pkt.3 | Pytanie 1,12 | 5 |
| MgCl2·6H2O | 203,3 | pkt.Pytanie 1.9 | cyfra arabska | 5 |
| CaCl2·2H2O | 147.01 | 1 | Pytanie 1,47 | 10 |
| glicyna | 75.07 | 0,1 | 0,375 | pkt.50 | Rozdział
| sacharoza | 342,3 pkt. | 1,5 | Godzina 25,67 | 50 | Rozdział
| Pirogronian sodu | 110.04 | 0,1 | 0,55 | pkt.50 | Rozdział
| HEPESY | 238,3 | pkt.1 | Pytanie 11,9 | 50 | Rozdział
| glukoza | 180,15 | pkt.Rozdział 2.5 | Rozdział 45 | 100 | szt.
Tabela 1: Roztwory podstawowe dla bufora do obrazowania.
| składnik | Roztwór podstawowy (M) | Stężenie końcowe (mM) | Objętość (ml) |
| Zawartość NaCl | 5 | 114 | Rozdział2.3 |
| Kcl | 3 | Norma 5,29 | 0,176 | pkt.
| MgCl2 | Pytanie 1.9 | 1 | 0,053 | pkt.
| CaCl2 | 1 | cyfra arabska | 0,2 | pkt.
| glicyna | 0,1 | 0,005 | pkt.0,005 | pkt.
| sacharoza | 1,5 | Rozdział 52 | 3,5 |
| Pirogronian sodu | 0,1 | 0,5 | 0,5 |
| HEPESY | 1 | 10 | 1 |
| glukoza | Rozdział 2.5 | 5 | 0,2 | pkt.
Tabela 2: Skład bufora obrazowania. Wskazane objętości służą do przygotowania 100 ml buforu do obrazowania.
2. Wczytywanie komórek za pomocą TMRE
UWAGA: W tym protokole TMRE jest używany w trybie bez wygaszania15 przy końcowym stężeniu 20 nM. Ogólnie rzecz biorąc, należy stosować najniższe możliwe stężenie TMRE, które nadal zapewnia wystarczającą intensywność sygnału pod wybranym mikroskopem. Ze względu na nierównomierne parowanie objętość podłoża w różnych studniach może się różnić w długoterminowych kulturach pierwotnych. Aby zapewnić stałe stężenie TMRE we wszystkich studzienkach, nie należy dodawać TMRE bezpośrednio do studzienek. Zamiast tego należy zastąpić pożywkę w każdym dołku taką samą ilością pożywki zawierającej TMRE. Poniższy protokół jest przeznaczony dla neuronów pierwotnych w 24-dołkowych płytkach zawierających ~ 1 ml pożywki na dołek.
3. Optymalizacja ustawień skaningowego mikroskopu konfokalnego
UWAGA: Ten krok ma na celu znalezienie najlepszego kompromisu między jakością obrazu a żywotnością komórek podczas obrazowania na żywo. W tej sekcji opisano optymalizację ustawień obrazowania roGFP. Jeśli przeprowadzane jest obrazowanie wieloparametryczne, należy przeprowadzić podobną optymalizację, w tym sprawdzenie, czy linia bazowa jest stabilna bez oznak bielenia lub fototoksyczności, w odniesieniu do dodatkowych wskaźników.
4. Ocena podstawowego stanu redoks
5. Obrazowanie na żywo ostrych zabiegów
UWAGA: Poniższy protokół opisuje obrazowanie mitochondrialnej odpowiedzi redoks na leczenie NMDA. Interwały między obrazami i czas trwania eksperymentu mogą wymagać dostosowania do innych metod leczenia.
6. Analiza danych

Kwantyfikacja różnic w mitochondrialnym stanie redoks w stanie ustalonym po wycofaniu czynnika wzrostu
Aby zademonstrować ilościowe określenie różnic w stanie stacjonarnym w mitochondrialnym stanie redoks, neurony pierwotne wyhodowane w standardowym pożywce porównano z neuronami hodowanymi bez czynników wzrostu przez 48 godzin przed obrazowaniem. Wycofanie czynnika wzrostu powoduje apoptotyczną śmierć komórki neuronalnej po 72 h16. Komórki zobrazowano po 48 godzinach, aby sprawdzić, czy jest to poprzedzone zmianami w mitochondrialnym stanie redoks. Pierwotne neurony korowe szczura wyhodowane na szkiełkach nakrywkowych pokrytych poli-L-ornityną zostały zakażone rAAV-mito-Grx1-roGFP2 w dniach in vitro 6 (DIV6) i zostały zobrazowane w DIV12. Obrazowanie na żywo przeprowadzono w temperaturze pokojowej zgodnie z sekcją 4 niniejszego protokołu na odwróconym laserowym skaningowym mikroskopie konfokalnym wyposażonym w obiektyw 40x/1,10 zanurzenia w wodzie. Ustawienia konfokalne to 7 przewiewnych jednostek otworkowych, rozmiar piksela 568,7 nm (512 x 512 pikseli), prędkość skanowania 600 Hz, moc lasera 405 nm 3%, moc lasera 488 nm 1%, szerokość pasma emisji 505-550 nm i średnia klatek 4. Nie było istotnej różnicy między surowymi stosunkami 405:488 nm w tych dwóch warunkach (Rysunek 3B). Po normalizacji danych podzbiór komórek o zwiększonym stosunku 405:488 nm został wykryty w grupie wycofania czynnika wzrostu (Rysunek 3C). Wskazuje to, że mitochondrialne zmiany redoks mogą poprzedzać śmierć komórki neuronalnej i podkreśla znaczenie normalizacji danych max/min dla porównania podstawowych stanów redoks między grupami.
Dynamiczne zmiany w mitochondrialnym stanie redoks po leczeniu neuronów NMDA
Receptor glutaminianu typu NMDA (NMDAR) odgrywa kluczową rolę w plastyczności neuronów, ale może również pośredniczyć w uszkodzeniu neuronów i śmierci komórki. Patologiczna aktywacja NMDAR prowadzi do kilku niekorzystnych skutków dla mitochondriów, które obejmują przeciążenie macierzy wapniowej, utlenianie i fragmentację mitochondriów oraz przejście przepuszczalności mitochondriów. W poprzednim badaniu wyżej opisany protokół został wykorzystany do zbadania związku przyczynowo-skutkowego między wywołanym przez NMDA mitochondrialnym przeciążeniem wapnia a utlenianiem mitochondriów13. Pierwotne neurony hipokampa szczura wyhodowane na szkiełkach nakrywkowych pokrytych poli-D-lizyną/lamininą zostały zakażone rAAV-mito-Grx1-roGFP2 na DIV4 i zobrazowane na DIV12. Obrazowanie na żywo przeprowadzono w temperaturze 37 °C na mikroskopie konfokalnym z odwróconym dyskiem wirującym, wyposażonym w obiektyw wielofunkcyjny 20x/0,75 (zastosowano zanurzenie w wodzie) i system inkubacji na stoliku. Mito-Grx1-roGFP2 był wzbudzany sekwencyjnie co 20 s za pomocą linii laserowych 405 nm i 488 nm, a emisja była zbierana za pomocą filtra emisyjnego 527/55 nm dla obu długości fal wzbudzenia. Leczenie neuronów 30 μM NMDA spowodowało utlenianie mitochondriów w ciągu kilku minut (Rysunek 4A,B). Warto zauważyć, że kwasica mitochondrialna wywołana przez NMDA spowodowała znaczne wygaszenie fluorescencji roGFP2, zgodnie z dobrze znaną czułością pH8. Aby potwierdzić, że to zależne od pH hartowanie nie wpłynęło na stosunek 405:4889, mitochondria zostały w pełni utlenione przez DA przed dodaniem NMDA w eksperymencie kontrolnym. Wstępne traktowanie DA wyklucza dalsze utlenianie mitochondriów przez NMDA, a zatem stosunek 405:488 nie zmienił się w tym eksperymencie pomimo znacznego wygaszenia intensywności fluorescencji roGFP2 (Figura 4C).
Wieloparametryczna analiza zmian w mitochondriach dendrytycznych wywołanych przez NMDA
Aby ocenić sekwencję czasową wywołanych przez NMDA zmian w morfologii mitochondriów, potencjale błonowym i stanie redoks, przeprowadzono równoległe obrazowanie fluorescencji TMRE i mito-Grx1-roGFP2 w wysokiej rozdzielczości przestrzennej i czasowej. Pierwotne neurony korowe szczura wyhodowane na szkiełkach nakrywkowych pokrytych poli-L-ornityną zostały zakażone rAAV-mito-Grx1-roGFP2 na DIV6 i zobrazowane na DIV12. Obrazowanie na żywo przeprowadzono w temperaturze pokojowej na odwróconym konfokalnym laserowym mikroskopie skaningowym przy użyciu obiektywu zanurzeniowego 63x/1,40 oleju, prędkości skanowania 600 Hz, rozmiaru piksela 90,2 nm (1024 x 1024 pikseli przy 2-krotnym zoomie skanowania), wielkości otworka 3 przewiewnych jednostek i średniej klatki 2. Co 30 s rejestrowano trzy obrazy w trybie sekwencyjnym: wzbudzenie 405 nm/emisja 505-550 nm; wzbudzenie 488 nm/emisja 505-550 nm; Wzbudzenie 552 nm/emisja 560-600 nm. Leczenie neuronów 60 μM NMDA spowodowało utratę sygnału TMRE i wzrost stosunku roGFP 405:488 nm, po którym nastąpiło pewne opóźnione zaokrąglenie mitochondriów (Figura 5).

Rysunek 1: Schematyczne przedstawienie funkcji Grx1-roGFP2 i widm wzbudzenia roGFP2. (A) Stres oksydacyjny i działanie antyoksydacyjnych systemów obronnych utleniają komórkową pulę glutationu. Grx1 w białku fuzyjnym Grx1-roGPF2 sprzyja szybkiej równowadze stanu redoks roGFP2 ze stanem redoks puli glutationu. Status redoks puli roGFP2 można ocenić, monitorując stosunek emisji fluorescencji GFP przy 510 nm po wzbudzeniu przy 405 nm i 488 nm. Zredukowane gatunki są pokazane na niebiesko; Utlenione gatunki są pokazane na czerwono. (B) Widma wzbudzenia w pełni zredukowanego (niebieskiego) i utlenionego (czerwonego) roGFP2. Po utlenieniu roGFP2 emisja fluorescencji przy wzbudzeniu 400 nm wzrasta, podczas gdy emisja przy wzbudzeniu 490 nm maleje. Ten rysunek został zmodyfikowany w stosunku do poprzedniej publikacji13. Widma wzbudzenia w B zostały narysowane na podstawie Rysunek 1B z 8. Linie przerywane w B wskazują długości fal powszechnie stosowanych linii laserowych 405 nm i 488 nm. Skróty: GSH = glutation; GSSG = utleniony glutation; Grx = glutaredoksyna; roGFP = wrażliwy na redoks wariant białka zielonej fluorescencji. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 2: Przebieg pracy metody. Ekspresję wrażliwego na wzbudzenie białka fluorescencyjnego redoks roGFP2 w neuronach można osiągnąć za pomocą kilku metod, które obejmują transfekcję, lipofekcję, transfer genów wirusa i transgeniczne zwierzęta. Czujnik może być używany do badania neuronalnego stanu redoks w hodowanych neuronach pierwotnych, eksplantatach tkanek ex vivo i nienaruszonych zwierzętach. Obrazowanie roGFP2 można wykonywać na różnych mikroskopach, w tym mikroskopach fluorescencyjnych o szerokim polu, mikroskopach konfokalnych i mikroskopach 2-fotonowych. Analizę danych obrazowania roGFP2 można przeprowadzić za pomocą ogólnodostępnego oprogramowania ImageJ/FIJI. Skrót: roGFP = wrażliwy na redoks wariant białka zielonej fluorescencji. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 3: Wycofanie czynnika wzrostu powoduje utlenianie mitochondriów neuronalnych. (A) Reprezentatywne obrazy w proporcji 405:488 nm neuronów hodowanych w obecności (+ GF) lub braku (- GF) czynników wzrostu przez 48 godzin przed obrazowaniem. Skale oznaczone kolorami reprezentują nieznormalizowane proporcje 405:488 nm (niższe proporcje odpowiadają stanowi zredukowanemu, wyższe współczynniki odpowiadają stanowi utlenionemu). Podziałka = 50 μm. (B) Kwantyfikacja stosunku 405:488 nm w poszczególnych neuronach. (C) Max/min skalibrowany stosunek 405:488 nm poszczególnych neuronów. Okrągłe symbole reprezentują pojedyncze komórki; słupek reprezentuje średnią. N = 40-44 komórki z 3 szkiełek nakrywkowych z jednego preparatu. Skrót: GF = czynnik wzrostu. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 4: Utlenianie mitochondriów neuronalnych wywołane przez NMDA. (A) Reprezentatywne obrazy o stosunku 405:488 nm przed i po leczeniu NMDA 30 μM oraz po kalibracji max/min za pomocą DA i DTT. Przy tym powiększeniu sygnał roGFP jest najczęściej wykrywany w dendrytach soma i proksymalnych. Skala oznaczona kolorami reprezentuje nieznormalizowane proporcje 405:488 nm (niższe współczynniki odpowiadają stanowi zredukowanemu; wyższe współczynniki odpowiadają stanowi utlenionemu). Podziałka liniowa = 50 μm. (B) Kwantyfikacja przebiegu obrazowania pokazana w A. NMDA indukuje szybkie i trwałe utlenianie mitochondriów, które można skalibrować za pomocą DA i DTT. (C) Kwasica mitochondrialna wywołana przez NMDA powoduje spadek fluorescencji GFP zarówno przy wzbudzeniu 405 nm, jak i 488 nm (górny panel). Aby wyizolować efekt zależny od pH i potwierdzić, że stosunek 405:488 nm jest niewrażliwy na pH, neurony najpierw maksymalnie utleniono za pomocą DA, a następnie poddano prowokacji NMDA w obecności DA (dolny panel). W tych warunkach NMDA nadal powoduje kwasicę mitochondrialną, ale nie dalsze utlenianie mitochondriów. W związku z tym, chociaż zarówno ślad 405 nm, jak i 488 nm wykazują spadek intensywności fluorescencji spowodowany pH, stosunek 405:488 nm pozostaje stabilny. Ten rysunek został zmodyfikowany z 13. Skróty: GFP = zielone białko fluorescencyjne; roGFP = wrażliwy na redoks wariant białka zielonej fluorescencji; NMDA = N-metylo-D-asparaginian; DA = diamid; DTT = ditiotreitol. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 5: Wywołane przez NMDA zmiany w potencjale błonowym, stanie redoks i morfologii mitochondriów dendrytycznych. (A) Trzy obrazy w dużym powiększeniu z eksperymentu poklatkowego, uzyskane w czasie t = 1, 4 i 9 min, pokazujące mitochondria dendrytyczne i aksonalne. Koloryzacja reprezentuje intensywność TMRE (patrz pasek kalibracji). (B) Obrazy o proporcjach roGFP 405:488 nm z tego samego eksperymentu poklatkowego co w (A) przy t = 1, 4 i 9 min. Należy zauważyć, że ze względu na ograniczoną skuteczność infekcji AAV, tylko podzbiór neuronów wyraża mito-Grx1-roGFP2, a zatem nie wszystkie mitochondria TMRE-dodatnie są roGFP-dodatnie. Kolorowy pasek kalibracji reprezentuje nieznormalizowane proporcje 405:488 nm (niższe współczynniki odpowiadają stanowi zredukowanemu; wyższe współczynniki odpowiadają stanowi utlenionemu). (C) Kwantyfikacja intensywności TMRE, stosunku roGFP 405:488 nm i okrągłości pojedynczego mitochondrium (oznaczone strzałkami w A, B). Po 1 minucie zapisu linii bazowej do roztworu kąpieli dodano 60 μM NMDA. Podziałka = 5 μm. Oś y w C przedstawia stosunek roGFP 405:488 nm względem linii podstawowej T0 (zielona linia przerywana), intensywność fluorescencji TMRE względem linii podstawowej T0 (czerwona linia przerywana) oraz deskryptor kształtu FIJI/ImageJ "okrągłość" (linia ciągła). Skróty: GFP = roGFP = wrażliwy na redoks wariant białka zielonej fluorescencji; mito-Grx1-roGFP2 = glutaredoksyna-1 połączona z N-końcem roGFP; AAV = wirus związany z adenowirusem; TMRE = tetrametylorodamina, ester etylowy; NMDA = N-metylo-D-asparaginian. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.
Autorzy oświadczają, że nie ma dla nich konfliktu interesów.
Ten artykuł opisuje protokół do określania różnic w podstawowym stanie redoks i redoks odpowiedzi na ostre perturbacje w pierwotnych neuronach hipokampa i kory mózgowej za pomocą konfokalnej mikroskopii na żywo. Protokół może być stosowany do innych typów komórek i mikroskopów przy minimalnych modyfikacjach.
Ta praca była wspierana przez Deutsche Forschungsgemeinschaft (BA 3679/5-1; DLA 2289: BA 3679/4-2). A.K. jest wspierany przez stypendium ERASMUS+. Dziękujemy Iris Bünzli-Ehret, Ricie Rosner i Andrei Schlicksupp za przygotowanie neuronów pierwotnych. Dziękujemy dr Tobiasowi Dickowi za dostarczenie pLPCX-mito-Grx1-roGFP2. Eksperymenty pokazane w
| chlorek wapnia (CaCl2· 2H2O) | Sigma-Aldrich | C3306 | |
| Diamid (DA) | Sigma-Aldrich | D3648 | |
| Ditiothreitol (DTT) | Carl Roth GmbH | 6908.1 | |
| Glukoza (roztwór podstawowy 2,5 M) | Sigma-Aldrich | G8769 | |
| Glukoza | Sigma-Aldrich | G7528 | |
| Glicyna | neoFroxx GmbH | LC-4522.2 | |
| HEPES (roztwór podstawowy 1 M) | Sigma-Aldrich | 15630-080 | |
| HEPES | Sigma-Aldrich | H4034 | |
| Chlorek magnezu (MgCl2· 6H2O) | Sigma-Aldrich | 442611-M | |
| N-metylo-D-asparaginian (NMDA) | Sigma-Aldrich | M3262 | |
| Chlorek potasu (KCl) | Sigma-Aldrich | P3911 | |
| Chlorek sodu (NaCl) | neoFroxx GmbH | LC-5932.1 | |
| Pirogronian sodu (0,1 M roztwór podstawowy) | Sigma-Aldrich | S8636 | |
| Pirogronian sodu | Sigma-Aldrich | P8574 | |
| Sacharoza | Carl Roth GmbH | 4621.1 | |
| Nadchloran estru etylowego tetrametylorodaminy (TMRE) | Sigma-Aldrich | 87917 | |
| equipment | |||
| komora obrazowania | Life Imaging Services (Bazylea, Szwajcaria) | 10920 | Komora Ludin Typ 3 dla & Oslash; |
| Laserowy skaningowy mikroskop konfokalny | 12 mm, mikroskopLeica | DMI6000 | |
| laserowy skaningowy mikroskop konfokalny, jednostka skanująca | Pompa | perystaltyczna LeicaSP8 | |
| VWR | PP1080 181-4001 | ||
| , kamera | Hamamatsu | C9100-02 EMCCD | |
| konfokalny z wirującym dyskiem, system inkubacji | TokaiHit | INU-ZILCF-F1 | |
| konfokalny z wirującą tarczą, mikroskop | Nikon | Ti | |
| konfokalny z wirującą tarczą, jednostka skanująca | Yokagawa | CSU-X1 | |
| software | |||
| FIJI | https://fiji.sc | ||
| wtyczka StackReg | https://github.com/fiji-BIG/StackReg/blob/master/src/main/java/StackReg_.java | ||
| https://github.com/fiji-BIG/TurboReg/blob/master/src/main/java/TurboReg_.java | wtyczki | TurboReg |