Tutaj prezentujemy protokół oceny neuroprotekcyjnych aktywności testowych związków u Caenorhabditis elegans, w tym agregacji poliglutaminy, śmierci neuronów i zachowania chemounikania, a także przykładowej integracji wielu fenotypów.
Artykuł metodologiczny
* These authors contributed equally
Tutaj prezentujemy protokół oceny neuroprotekcyjnych aktywności testowych związków u Caenorhabditis elegans, w tym agregacji poliglutaminy, śmierci neuronów i zachowania chemounikania, a także przykładowej integracji wielu fenotypów.
Związane z wiekiem nieprawidłowe fałdowanie i agregacja patogennych białek są odpowiedzialne za kilka chorób neurodegeneracyjnych. Na przykład, choroba Huntingtona (HD) jest głównie napędzana przez powtórzenia nukleotydowe CAG, które kodują rozszerzony przewód glutaminowy w białku huntingtyny. Tak więc, hamowanie agregacji poliglutaminy (polyQ), a w szczególności neurotoksyczności związanej z agregacją, jest użyteczną strategią zapobiegania chorobie Huntingtona i innym chorobom związanym z poliQ. W artykule przedstawiono uogólnione protokoły eksperymentalne do oceny zdolności neuroprotekcyjnych badanych związków przeciwko HD przy użyciu uznanych modeli transgenicznych Caenorhabditis elegans polyQ. Szczep AM141 został wybrany do testu agregacji polyQ, ponieważ związany z wiekiem fenotyp dyskretnych agregatów fluorescencyjnych można łatwo zaobserwować w ścianie ciała w stadium dorosłym ze względu na specyficzną dla mięśni ekspresję białek fuzyjnych polyQ::YFP. W przeciwieństwie do tego, model HA759 z silną ekspresją dróg ekspandowanych poliQ w neuronach ASH jest używany do badania śmierci neuronów i zachowań chemounikania. Aby kompleksowo ocenić zdolność neuroprotekcyjną związków docelowych, powyższe wyniki testów są ostatecznie przedstawiane jako wykres radarowy z profilowaniem wielu fenotypów w sposób bezpośredniego porównania i bezpośredniego oglądania.
Postępująca neurodegeneracja w chorobie Huntingtona obejmuje patogenną zmutowaną huntingtynę z nieprawidłowym odcinkiem polyQ kodowanym przez powtórzenia trinukleotydowe CAG1,2,3. Zmutowane białka huntingtyny z więcej niż 37 powtórzeniami glutaminy są podatne na agregację i akumulację w mózgach pacjentów z HD i modelach zwierzęcych4,5, co ostatecznie prowadzi do neurodegeneracji6. Pomimo braku jasności co do roli agregatów polyQ w patologii choroby5, hamowanie agregacji polyQ i związanej z tym toksyczności jest użyteczną strategią terapeutyczną w przypadku HD i innych chorób polyQ4,7,8.
Ze względu na zachowanie szlaków sygnalizacji neuronalnej i łatwe do skonstruowania modele chorób transgenicznych, Caenorhabditis elegans jest powszechnie stosowany jako główny organizm modelowy do badania zaburzeń neurologicznych9,10,11,12. Na przykład, transgeniczne modele C. elegans wyrażające podatne na agregację ekspansje polyQ mogą obiektywnie naśladować cechy podobne do HD, takie jak selektywna utrata komórek neuronalnych, tworzenie agregatów cytoplazmatycznych i defekty behawioralne13. Badanie potencjalnego wpływu próbek testowych na odwrócenie tych fenotypów w uznanych modelach nicieni polyQ doprowadziło do zidentyfikowania wielu obiecujących kandydatów terapeutycznych, np. polisacharydów7,14,15, oligosacharydy16, naturalne małe cząsteczki17,18 oraz ekstrakty i formuły ziołowe19,20.
Opisane tutaj są dwa główne modele polyQ C. elegans i odpowiednie protokoły dla potencjalnych zastosowań, czego przykładem jest badanie nad astragalanem, polisacharydem wyizolowanym z Astragalus membranaceus7. Do testu agregacji polyQ u C. elegans stosowanym modelem jest transgeniczny szczep AM141, który po osiągnięciu dorosłości wykazuje fluorescencyjne puncta rozproszone w mięśniu ściany ciała z powodu ekspresji białka fuzyjnego Q40::YFP, przewodu poliQ składającego się z 40 reszt (poliQ40) połączonych z żółtym białkiem fluorescencyjnym (YFP)21,22. Szczep HA759 został użyty do zbadania przeżycia neuronów i zachowania chemounikania, ponieważ wyraża zarówno białko zielonej fluorescencji (GFP), jak i Htn-Q150 (ludzki szlak poliQ pochodzący z huntingtyny składający się ze 150 reszt) silnie w neuronach ASH, ale słabo w innych neuronach, co skutkuje postępującą neurodegeneracją i śmiercią komórek ASH7,13. Kompleksowe podsumowanie potencjału neuroprotekcyjnego kandydatów terapeutycznych można uzyskać poprzez integrację wyników z różnych testów.
UWAGA: Składy roztworów wykorzystanych w tym protokole znajdują się w Tabeli 1.
1. Przygotowanie materiałów do analizy z użyciem Caenorhabditis elegans
2. Test agregacji PolyQ
(1)3. Testy neurotoksyczności indukowanej przez PolyQ
(2)
(3)4. Tworzenie wykresu radarowego
Transgeniczny szczep polyQ AM141 wykazuje silną ekspresję białek fuzyjnych Q40::YFP w komórkach mięśni ściany ciała7,21. Jak pokazano na Ryc. 1A, dyskretny fenotyp agregatów tego szczepu można zidentyfikować za pomocą zautomatyzowanego protokołu obrazowania i analizy opisanego w niniejszym artykule. Ilość agregatów Q40::YFP u nicieni AM141 zwiększyła się znacząco po 48 h od stadium L1. Tendencja ta została jednak zahamowana przez zastosowanie astragalanu (Ryc. 1B), co wykazuje potencjał ochronny astragalanu przeciwko agregacji polyQ. Zazwyczaj jako punkty czasowe do liczenia agregatów Q40::YFP w celu oceny efektu przeciwagregacyjnego badanych próbek można wygodnie przyjąć 72 h lub 96 h. W niniejszym protokole fluorescencyjne agregaty nicieni AM141 były rejestrowane za pomocą zautomatyzowanego systemu obrazowania, choć do tego celu można również wykorzystać mikroskopy fluorescencyjne7.
Szczep C. elegans HA759 wykazuje ekspresję zarówno markera GFP, jak i Htn-Q150 w sensorycznych neuronach ASH, co prowadzi do postępującej utraty i dysfunkcji tych neuronów11,13. Nicienie zamocowano na 2% podkładkach z agarozy, aby określić przeżywalność neuronów ASH (Ryc. 2A), a następnie poddano wizualizacji mikroskopowej w celu wykrycia neuronów ASH. Utrata fluorescencji GFP w obustronnych neuronach ASH w obszarach głowy nicieni wskazuje na śmierć neuronów ASH (Ryc. 2B). Przeżywalność neuronów ASH u nicieni HA759 w grupie kontrolnej po inkubacji w temperaturze 15 °C przez 3 dni wynosi <40%7,20, co wskazuje na neurotoksyczność indukowaną przez polyQ. Zatem ten test przeżywalności neuronów ASH może być wykorzystany do wizualnej oceny wpływu badanych związków na neurony C. elegans, np. efektu neuroprotekcyjnego astragalany, ale nie glikanu z Poria (Ryc. 2C).
Ponieważ zaburzenia behawioralne są głównym objawem klinicznym w chorobach polyQ, test unikania chemosensorycznego (Rysunek 3A) z wykorzystaniem dużych populacji nicieni HA759 został zaprojektowany jako uproszczony test do badania wpływu badanych próbek na funkcjonalną utratę neuronów ASH spowodowaną agregacją polyQ. Jak pokazano na Rysunku 3B, indeks unikania nicieni HA759 w nieleczonej grupie kontrolnej wynosił ~0,5, co jest zgodne z wcześniejszymi doniesieniami14. Co ciekawe, indeks unikania wzrósł do >0,6 u nicieni traktowanych astragalanem w temperaturze 15 °C przez 3 dni (Rysunek 3B), co wykazuje neuroprotekcyjny wpływ tego polisacharydu przeciwko upośledzeniom behawioralnym.
Aby ocenić całkowitą zdolność neuroprotekcyjną badanych związków, dane z powyższych poszczególnych testów można zintegrować i przedstawić w formie wykresu radarowego dla wielu fenotypów, co czyni go unifikującą cechą fenotypów polyQ, odpowiednią do bezpośredniego porównania i wizualizacji. Jak pokazano na Rysunku 4, pole trójkąta w grupie leczonej astragalem jest większe niż w grupie kontrolnej, co wskazuje na działanie przeciw-polyQ badanego polisacharydu.

Rysunek 1: Wpływ astragalanu na agregację polyQ40. (A) Reprezentatywne obrazy nicieni AM141 po traktowaniu astragalanem lub bez niego przez 96 h w temperaturze 20 °C. Obrazy fluorescencyjne (panele lewe) pozyskano z płytek 384-dołkowych przy użyciu systemu obrazowania i analizy wysokoprzepustowej, a agregaty Q40::YFP (panele prawe) zostały automatycznie zidentyfikowane przez system. Wstawki przedstawiają powiększone widoki obrazów nicieni ukazujące agregaty polyQ. Paski skali = 500 µm. (B) Ilościowe oznaczenie agregatów Q40::YFP. Liczbę agregatów Q40::YFP w nicieniach AM141 monitorowano za pomocą systemu obrazowania wysokoprzepustowego co 24 h przez 4 dni po traktowaniu astragalanem lub bez niego w temperaturze 20 °C. W każdym punkcie czasowym oceniono obecność agregatów u około 100-150 nicieni w każdej grupie. Wyniki przedstawiono w formie krzywych dopasowanych na podstawie średniej liczby agregatów na nicienia. Skróty: polyQ = poliglutamina; YFP = żółte białko fluorescencyjne; FITC = izotiocyjanian fluoresceiny. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 2: Wpływ astragalany na indukowaną przez Htn-Q150 śmierć neuronów ASH. (A) Schemat przygotowania preparatu w agarozie. (B) Reprezentatywne mikrografie nicieni HA759 obrazujące przeżycie i śmierć neuronów ASH przy powiększeniu 400x. Paski skali = 20 µm. Nicienie HA759 zostały sfotografowane przy użyciu mikroskopu fluorescencyjnego po leczeniu astragalaną lub bez niej w temperaturze 15 °C przez 3 dni od stadium L1. (C) Efekt ochronny astragalany przeciwko indukowanej przez polyQ śmierci neuronów ASH. Glikan z Poria, polisacharyd z Poria cocos, został użyty jako kontrola. Dane przedstawiono jako średnie ± SD z trzech powtórzeń, reprezentatywne dla ponad trzech niezależnych eksperymentów. Analizę statystyczną przeprowadzono za pomocą nieparzystego, dwustronnego testu t, aby porównać dane grupy kontrolnej z danymi grup astragalany i glikanu z Poria. *p < 0.05; ns = brak istotności. Skrót: GFP = zielone białko fluorescencyjne. Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 3: Wpływ astraganu na zaburzenia behawioralne wywołane przez Htn-Q150. (A) Schemat płyty do testu unikania. (B) Reprezentatywne wyniki testu unikania. Indeks unikania zdefiniowano jako stosunek liczby nicieni w strefie N do całkowitej liczby nicieni na płycie. Wyniki przedstawiono jako średnie ± SD z trzech powtórzeń, reprezentatywne dla trzech niezależnych eksperymentów. Analiza statystyczna indeksu unikania została przeprowadzona przy użyciu nieparzystego dwustronnego testu t. **p < 0.01. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 4: Ogólna zdolność neuroprotekcyjna astragalany.Dane z trzech różnych testów zostały zaimportowane do oprogramowania OriginPro w celu stworzenia wykresu radarowego, który służy do profilowania ogólnego wpływu astragalany na wiele fenotypów zależnych od polyQ. Proszę kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.
Tabela 1. Kliknij tutaj, aby pobrać tę tabelę.
Ponieważ agregacja poliQ i proteotoksyczność są ważnymi cechami zaburzeń polyQ, takich jak choroba Huntingtona13, zalecamy stosowanie wielu modeli i metod w celu kompleksowej oceny zdolności neuroprotekcyjnych badanych związków, w tym testu agregacji polyQ w szczepie AM141, testu przeżycia neuronów ASH w szczepie HA759 oraz testu unikania chemosensorycznego w szczepie HA759. Przedstawione tutaj protokoły zostały wykorzystane do oceny zdolności neuroprotekcyjnych badanych próbek wobec toksyczności polyQ, w tym hamującego wpływu zarówno na agregację polyQ, jak i związaną z tym neurotoksyczność 7,14,15,16,17,19,20, wykazując ich potencjał w odkrywaniu leków na HD i inne choroby polyQ.
Wprowadzono zautomatyzowany system obrazowania i analizy do wykrywania i zliczania agregatów polyQ w teście agregacji polyQ. Zaletą tej metody jest wysoka przepustowość i oszczędność czasu, a także znaczne zmniejszenie liczby błędów subiektywnych w pracochłonnym procesie liczenia. W przypadku całej płytki 384-dołkowej akwizycja i analiza obrazu zajmuje tylko <1 godzinę. Jednak konwencjonalna metoda obrazowania mikroskopowego również wykazała podobną wydajność w tym laboratorium bez użycia automatycznego urządzenia do obrazowania7.
W typowym teście agregacji Q40::YFP dla każdego punktu czasowego zaleca się łącznie 100-150 nicieni na zabieg, który można przeprowadzić w dołach replikowanych zawierających 10-15 nicieni każdy. Należy jednak zauważyć, że larwy L1 mogą być bardziej wrażliwe na niektóre zabiegi lub wyższe stężenia. W związku z tym wyższe dawki badanych związków mogą hamować ich wzrost, prowadząc do wyników fałszywie dodatnich z powodu powolnego wzrostu, a tym samym opóźnionej agregacji polyQ. Zazwyczaj można przeprowadzić test oczyszczania z żywności, aby rozwiązać ten problem i zapewnić odpowiedni zakres stężeń badanych związków23.
Nicienie transgeniczne HA759 stosowane w testach neurotoksyczności polyQ koekspresją OSM-10::GFP i Htn-Q150, umożliwiając jednoznaczną identyfikację obustronnych neuronów czuciowych ASH. W związku z tym przeżycie neuronów ASH ocenia się na podstawie obecności lub braku ekspresji GFP; zwykle ~ 40-75% neuronów ASH w nicieniach kontrolnych jest martwych23,24. Co ciekawe, genetyczne tło mutacji pqe-1 (wzmacniacz poliglutaminy-1) w szczepie HA759 (pqe-1; Htn-Q150) przyspiesza toksyczność za pośrednictwem polyQ, prowadząc do śmierci większości neuronów ASH w ciągu trzech dni, nawet w temperaturze 15 °C, a zatem szczep ten jest hodowany w temperaturze 15 °C w celu przeprowadzenia testu przeżycia neuronów, jak wcześniej donoszono 23,24.
Utrata funkcjonalna neuronów ASH w nicieniach HA759 może wystąpić przed wykryciem śmierci komórki i agregatów białkowych13; w związku z tym test zachowania unikającego osmotycznego jest niezbędny do oceny toksyczności za pośrednictwem poliQ. Aby zminimalizować potencjalny wpływ mniej aktywnych nicieni HA759 w niskiej temperaturze na eksperymenty behawioralne, płytki testowe unikania inkubuje się w wilgotnym inkubatorze o temperaturze 23 °C, a nie w temperaturze 15 °C, jak w teście przeżycia neuronów przy użyciu tego szczepu. Ponadto doniesiono, że nicienie transgeniczne Htn-Q150/OSM-10::GFP są bardzo wrażliwe na dotyk nosa; w związku z tym alternatywnym wykrywaniem funkcji neuronów ASH jest test dotyku nosa13.
Autorzy oświadczają, że nie mają konkurencyjnych interesów finansowych.
Dziękujemy byłym członkom Huang Lab, którzy pomogli rozwinąć i ulepszyć protokoły użyte w tym artykule, w szczególności Hanrui Zhang, Lingyun Xiao i Yanxia Xiang. Prace te były wspierane przez Projekt 111 (grant nr B17018) oraz Fundację Nauk Przyrodniczych Prowincji Hebei (numer grantu H2020207002).
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| C. elegans szczepy | |||
| AM141 rmIs133 [unc-54p::Q40::YFP] | Caenorhabditis Genetics Center (CGC) | https://cgc.umn.edu/strain/AM141 | |
| HA759 rtIs11 [osm-10p::GFP + osm-10p::HtnQ150 + dpy-20(+)] | Caenorhabditis Genetics Center (CGC) | ||
| https://cgc.umn.edu/strain/HA759E. coli szczepy | |||
| NA22 | Caenorhabditis Genetics Center (CGC) | https://cgc.umn.edu/strain/NA22 | |
| OP50 | Caenorhabditis Genetics Center (CGC) | ||
| https://cgc.umn.edu/strain/OP50Reagent | |||
| Agar | Shanghai EKEAR Bio-Technology Co., Ltd. | EQ1001-500G | https://www.ekear.com |
| Agarose | Biowest | 111860 | |
| Butanedione | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd. | 80042427 | https://www.reagent.com.cn/goodsDetail/d027c00e64c9404d9aa41391fbb59 5d0 |
| Cholesterol | Sigma-Aldrich | C8667 | https://www.sigmaaldrich.cn/CN/zh/product/sigma/c8667?context=product |
| Glycerol | Aladdin Co., Ltd. | G116203 | |
| https://www.aladdin-e.com/zh_cn/g116203.html Peptone | Guangdong HuanKai Microbial Science and Technology Co., Ltd. | 050170B | https://www.huankai.com/show/21074.html |
| Azydek sodu | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd. | 80115560 | https://www.reagent.com.cn/goodsDetail/5e981aa807664e26af 551e96ff5f07cd |
| Wodorotlenek sodu | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd. | 10019718 | https://www.reagent.com.cn/goodsDetail/450dfdb1132a4d8a817 d3d8c68ec25e6 |
| Roztwór podchlorynu sodu | Fabryka odczynników chemicznych w Kantonie | 7681-52-9 | http://www.chemicalreagent.com/product/DetailProduct.aspx?id=125 |
| Tryptone | Oxoid Ltd. | LP0042B | https://www.thermofisher.cn/order/catalog/product/LP0042B#/LP0042B |
| Ekstrakt drożdżowy | Oxoid Ltd. | LP0021B | https://www.thermofisher.cn/order/catalog/product/LP0021B#/LP0021B |
| Equipment | |||
| 384-dołkowa płytka do hodowli komórkowej | Nest Biotechnology Co., Ltd. | 761001 | |
| https://www.cell-nest.com/page94?_l=en&product_id=85 48-dołkowa płytka do hodowli komórkowej | Nest Biotechnology Co., Ltd. | 748001 | https://www.cell-nest.com/page94?_l=en&product_id=85 |
| szalka Petriego 90 mm | Sangon Biotech (Shanghai) Co., Ltd. | F611003 | |
| Autoklaw https://www.sangon.com/productDetail?productInfo.code=F611003 Mikroskop | Panasonic | MLS-3781L-PC | |
| ChongQing Optical Co., Ltd. | ZSA0745 | http://www.coicuop.com/plus/view.php?aid=64 | |
| Mikroskop fluorescencyjny | Guangzhou Micro-shot Optical Technology Co., Ltd. | Mshot MF31-LED | https://www.mshot.com/article/442.html |
| System obrazowania o wysokiej zawartości | Urządzenia molekularne | ImageXpress | https://www.moleculardevices.com/products/cellular-imaging-systems#High-Content-Imaging |
| Mikrowirówka | GeneCompany | https://www.genecompany.com/index.php/Home/Goods/goodsdetails/gid/189.html | |
| cyfrowa GENESPEED X1Guangzhou Micro-shot Optical Technology Co., Ltd. | MS60 | https://www.mshot.com/article/677.html | |
| Kuchenka mikrofalowa | Midea Corp. | M1-211A | https://www.midea.cn/10000/10000000001 00511264425.html |
| Parafilm M | Sigma-Aldrich | P7793-1EA | https://www.sigmaaldrich.cn/CN/en/product/sigma/p7793?context=product |
| Shaker | Zhicheng Inc. | ZWY-2102C | |
| http://www.zhicheng.net/Product/0865291356.htmlSoftware | |||
| Oprogramowanie do akwizycji i analizy obrazu | Molecular Devices | MetaXpress | https://www.moleculardevices.com/products/cellular-imaging-systems/acquisition-and-analysis-software/metaxpress |
| OriginPro | OriginLab Corp. | Wersja 9.8.5.204 | 1. Wprowadzenie do oprogramowania: https://www.originlab.com/index.aspx?go=Products/Origin 2. Instrukcja tworzenia wykresu radarowego: https://www.originlab.com/doc/Origin-Help/RadarChart-Graph 3. Film instruktażowy dotyczący tworzenia wykresu radarowego: https://www.originlab.com/videos/details.aspx?pid=1813 |