$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Mysi jajowód jest podobny pod względem funkcji i morfologii do ludzkiego jajowodu1. Oba składają się z pseudostratyfikowanego nabłonka rzęskowego, składającego się z dwóch historycznie opisanych komórek rezydujących w nabłonku: komórek rzęskowych i komórek wydzielniczych1,2. Jajowód ma trzy klasycznie rozpoznane segmenty: lejek, bańkę i przesmyk. W niedawnym badaniu Harwalkar i wsp.3 badał morfologię jajowodów i ekspresję genów, co doprowadziło do rozszerzenia kategoryzacji rezydentnych komórek nabłonkowych na siedem odrębnych populacji. Ponadto ustalili połączenie ampułkowo-przesmykowe jako odrębny segment oviduct3. Opisana tutaj metoda, która koncentruje się na lejku, bańce i przesmyku, może być łatwo rozszerzona o połączenie ampułkowo-przesmykowe2,3. Obszar lejkowy zawiera ujście lub otwór jajowodu i obejmuje obszar fimbrialny, a także bliższą łodygę. Poruszając się w kierunku macicy, następnie jest bańka, a następnie przesmyk. Komórki rzęskowe są najbardziej widoczne na dystalnym końcu regionu, proksymalnym do jajnika lub lejka, podczas gdy komórki wydzielnicze są najbardziej widoczne w bliższym końcu lub segmencie przesmyku1. W przeciwieństwie do ludzkiego jajowodu, mysi jajowód jest zwiniętą strukturą podtrzymywaną przez mesosalpinx, przedłużenie szerokiego więzadła otrzewnej1,4. Ponadto jajowód myszy jest zamknięty w worku kaletkowym, który zwiększa prawdopodobieństwo transferu oocytów do jajowodu4. Bańka jest identyfikowana jako miejsce zapłodnienia, z którego rozwijające się zarodki przechodzą do przesmyku przed wejściem do macicy5. Segmenty jajowodów mają średnicę 200-400 μm, a dłuższe obszary ampułki i przesmyku mają około 0,5-1,0 cm długości4. Janowód rozszerza się podczas cyklu rujowego, a bańka i lejek są bardziej rozciągliwe niż przesmyk1.
Nadmierna proliferacja komórek, zwłaszcza komórek wydzielniczych, charakteryzuje zmiany prekursorowe do surowiczych guzów znajdujących się w jamie miednicy6. Te prekursorowe surowicze zmiany śródnabłonkowe powstają w nabłonku jajowodu wyłącznie w okolicy fimbulicznej; Nie wiadomo, dlaczego tworzenie zmian jest ograniczone do tego regionu, w którym zwykle dominującym typem komórek jest orzęsiony, a nie wydzielniczy2,7,8. Regionalność pod względem prawidłowych funkcji fizjologicznych, a także zwiększone zainteresowanie jajowodowym pochodzeniem raka jajnika9,10,11,12,13, podkreśla znaczenie oddzielnej oceny segmentów jajowodu.
Opisana tutaj metoda szczegółowo opisuje zbiór oddzielnych segmentów jajowodów do późniejszych analiz ekspresji genów specyficznych dla segmentu i funkcji zdysocjowanych komórek. Tradycyjnie, wiele tkanek jest przetwarzanych w celu ekstrakcji całego RNA metodą fenolu: chloroformu lub metodą pełnej ekstrakcji na kolumnie; Stwierdziliśmy jednak, że jakość RNA została utrzymana przy jednoczesnym uzyskaniu wystarczającej wydajności przy użyciu opisanej metody łączenia. Korzystając z tej metody, bardzo małe funkcjonalne segmenty jajowodu mogą być przetwarzane do dalszych analiz, zamiast badać jajowód jako całość, co może maskować wyniki reprezentatywne dla różnych segmentów14.
Zdysocjowane mysie komórki jajowodowe rzadko były badane za pomocą cytometrii przepływowej, najprawdopodobniej z powodu ograniczenia wydajności komórek z tej tkanki. Jednym ze sposobów rozwiązania tego problemu była dysocjacja komórek, hodowanie ich w hodowli, a następnie stymulowanie ponownego różnicowania in vitro w celu uzyskania odpowiedniej liczby komórek do dalszej analizy komórek15,16,17,18. Ograniczeniem tego podejścia jest czas ex vivo i zmienione mikrośrodowisko w hodowli, które prawdopodobnie zmieniają ekspresję genów. Istnieje również założenie, że redyferencjacja morfologiczna ma taką samą sygnaturę transkrypcyjną i proteomiczną, jaka była obecna u nienaruszonego zwierzęcia. Obecna metoda dysocjacji została zaprojektowana w celu uzyskania jak największej liczby komórek nabłonkowych w heterogenicznej populacji komórek jajowodowych przy zachowaniu różnicowania pojedynczych komórek. Co więcej, podejście w większości nieenzymatyczne prawdopodobnie ogranicza utratę białek powierzchniowych komórek.