Ten artykuł zawiera szczegółowe protokoły zadawania penetrującego urazowego uszkodzenia mózgu (PTBI) dorosłym Drosophila i badania wynikającej z tego neurogenezy.
Artykuł metodologiczny
Ten artykuł zawiera szczegółowe protokoły zadawania penetrującego urazowego uszkodzenia mózgu (PTBI) dorosłym Drosophila i badania wynikającej z tego neurogenezy.
Molekularne i komórkowe mechanizmy leżące u podstaw neurogenezy w odpowiedzi na chorobę lub uraz nie są dobrze poznane. Jednak zrozumienie tych mechanizmów ma kluczowe znaczenie dla opracowania neuronowych terapii regeneracyjnych. Drosophila melanogaster jest wiodącym modelem w badaniach nad rozwojem neuronalnym, ale historycznie nie był wykorzystywany do badania regeneracji mózgu dorosłych. Dzieje się tak przede wszystkim dlatego, że dorosły mózg wykazuje bardzo niską aktywność mitotyczną. Niemniej jednak, penetrujące urazowe uszkodzenie mózgu (PTBI) w centralnym mózgu dorosłego Drosophila wyzwala generowanie nowych neuronów i nowego gleju. Potężne narzędzia genetyczne dostępne u Drosophila w połączeniu z opisanym tutaj prostym, ale rygorystycznym protokołem urazów sprawiają, że mózg dorosłego Drosophila jest solidnym modelem do badań nad regeneracją neuronów. Znajdują się tu szczegółowe instrukcje dotyczące (1) penetrujących urazów centralnego mózgu dorosłego oraz (2) sekcji, immunohistochemii i obrazowania po urazie. Protokoły te dają wysoce powtarzalne wyniki i ułatwią dodatkowe badania w celu przeanalizowania mechanizmów leżących u podstaw regeneracji neuronów.
Uszkodzenie mózgu i układu nerwowego jest główną przyczyną zgonów i niepełnosprawności na całym świecie. Około 1,5 miliona Amerykanów cierpi na urazowe uszkodzenia mózgu (TBI) każdego roku1, podczas gdy około 6 milionów osób w samych Stanach Zjednoczonych cierpi na choroby neurodegeneracyjne, takie jak choroba Parkinsona i Alzheimera2. Zarówno choroba, jak i uraz mózgu mogą powodować zwyrodnienie neuronów, prowadząc do wad sensorycznych, poznawczych i motorycznych3. Opracowanie strategii terapeutycznych naprawy ludzkiego mózgu było trudne ze względu na złożoną fizjologię mózgu. Organizmy modelowe, takie jak Drosophila melanogaster, zapewniają prosty system identyfikacji podstawowych mechanizmów leżących u podstaw neurodegeneracji i potencjalnych celów terapeutycznych4.
Muszka owocowa Drosophila melanogaster od ponad stu lat jest potężnym organizmem modelowym, rozwijając dziedziny genetyki, biologii rozwojowej i neuronauki5,6. Mózg Drosophila składa się tylko z ~90 000 neuronów7, milion razy mniej niż przeciętny ludzki mózg8, a mimo to mają wiele podobieństw. Zarówno mózgi ludzkie, jak i muchy wykorzystują neuroprzekaźniki GABA, glutaminian, acetylocholinę oraz aminy biogenne dopaminę i serotoninę9. Neurony Drosophila i ludzkie również funkcjonują podobnie, ze wspólną architekturą synaptyczną i analogicznymi typami komórek nerwowych10. Mniejszy rozmiar mózgu Drosophila i dostępność zaawansowanych technik genetycznych, w połączeniu z zachowaniem mechanizmów molekularnych, komórkowych i fizjologicznych między Drosophila a ssakami, pozwala badaczom Drosophila zadawać pytania, które są niepraktyczne lub trudne do odpowiedzi w modelach ssaków.
Nasze obecne zrozumienie neurogenezy u dorosłych u Drosophila, zarówno podczas homeostazy, jak i po urazie, pozostaje ograniczone. Więcej wiadomo na temat neurogenezy podczas normalnego rozwoju. Na przykład neurony i komórki glejowe są tworzone podczas rozwoju z komórek prekursorowych, zwanych neuroblastami10,11. W centralnej części mózgu wyróżniono co najmniej trzy różne typy neuroblastów. Zarówno neuroblasty linii typu I, jak i typu II opuszczają cykl komórkowy ~20-30 godzin po utworzeniu poczwarki12. W przeciwieństwie do tego, neuroblasty w ciele grzyba są ostatnimi, które kończą podział komórek i robią to poprzez apoptozę zależną od Żniwiarzy ~85-90 godzin po utworzeniu poczwarki13. Po eclosion mózg dorosłej Drosophila ma niewiele dzielących się komórek (~1 komórka/mózg), głównie glia14. Dorosłe płaty wzrokowe posiadają wolno pracujące neuroblasty zdolne do neurogenezy15, podczas gdy dorosły centralny mózg nie ma znanych neuroblastów. Niedobór neuronalnych komórek progenitorowych i ograniczona proliferacja komórek bardzo przypomina sytuację w mózgu dorosłych ssaków, co podkreśla potencjalne znaczenie mechanizmów neurogenezy dorosłego osobnika u Drosophila dla ludzi.
Odkrycie niskiego poziomu neurogenezy u dorosłych płatów wzrokowych Drosophila po urazie15 doprowadziło do hipotezy, że centralny mózg dorosłego Drosophila również może być zdolny do neurogenezy u dorosłych16. Protokół ten opisuje stworzenie rygorystycznego, powtarzalnego modelu centralnego uszkodzenia mózgu u dorosłego Drosophila, który może być wykorzystany do zbadania neurogenezy w dorosłym centralnym mózgu. Biorąc pod uwagę podobieństwa między architekturą i funkcją mózgu człowieka i Drosophila, odkrycia te mogą prowadzić do identyfikacji krytycznych celów neurogenezy terapeutycznej w uszkodzonych i chorych mózgach ludzkich.
Ten protokół jest zgodny z wytycznymi UW-Madison dotyczącymi opieki nad zwierzętami.
1. Generowanie dorosłej Drosophila dla PTBI
2. Penetrujące urazowe uszkodzenie mózgu (PTBI; Rysunek 1)
3. Etykietowanie EdU
4. Preparacja, immunohistochemia i montaż
5. Obrazowanie konfokalne
UWAGA: Obrazuj mózgi za pomocą laserowo-skaningowego mikroskopu konfokalnego z laserami wzbudzającymi i kostkami filtrów emisyjnych odpowiednich dla DAPI i fluorescencyjnych przeciwciał drugorzędowych (tj. odpowiednio 405 nm, 488 nm i 568 nm, 633 nm).
6. Analiza danych
PTBI stymuluje proliferację komórek
Aby określić zakres neurogenezy po PTBI mózgu centralnego, zmierzono odpowiedź proliferacyjną u młodych dorosłych samców, które zebrano i poddano urazowi w ciągu 6 h od wyklucia. Znaczący wzrost proliferacji zaobserwowano 24 h po urazie, wykorzystując przeciwciało anty-fosfohistona 3 (PH3), będące markerem komórek znajdujących się w fazie aktywnej mitozy. W 24 h po PTBI zaobserwowano około 3 komórek PH3+ w kontrolnych mózgach centralnych oraz 11 komórek PH3+ w uszkodzonych mózgach centralnych (Ryc. 2A-D). Większość dzielących się komórek znajduje się w pobliżu miejsca urazu. Drugi test podziałów komórkowych został wykorzystany do ilościowego oznaczenia skumulowanej proliferacji komórek po pojedynczym urazie oraz do oceny stopnia przeżywalności nowo powstałych komórek. 5-etynylo-2'-deoksyurydyna (EdU) jest analogiem tymidyny, który może być włączany do nowo syntetyzowanego DNA, trwale znakując komórki, które przeszły syntezę DNA. Muchy poddano 4-dniowej impulsowej podaży EdU, po której nastąpił 3-dniowy okres prześledzenia (chase). Wykazano w ten sposób, że znakowane komórki były żywotne i przeżyły co najmniej 3 dni po proliferacji. Do 7. dnia w kontrolnych mózgach centralnych znajdowało się średnio 2 komórki EdU+, natomiast w uszkodzonych mózgach centralnych średnio 11 komórek EdU+ (Ryc. 2E). Jest to wynik zbliżony do uzyskanych 24 h po urazie przy użyciu przeciwciała PH3. Gdy proliferację komórek zmierzono po 14 dniach, w nieuszkodzonych kontrolach średnio występowała 1 komórka EdU+ na mózg centralny, podczas gdy w uszkodzonych mózgach średnio 29 komórek EdU+ (Ryc. 2E), co dowodzi, że proliferacja komórek trwa co najmniej do drugiego tygodnia po PTBI.
Proliferacja komórek jest zależna od wieku
Najsilniejszą odpowiedź proliferacyjną w centralnej części mózgu zaobserwowano w ciągu pierwszych 24 h po wyjściu z poczwarki (Rysunek 3). W 7. dniu po wyjściu z poczwarki uraz penetrujący nadal wywołuje istotny wzrost proliferacji, średnio 6 komórek PH3+ na centralną część mózgu. Niemniej jednak do 14. dnia po wyjściu z poczwarki zdolność komórek do podziału po PTBI znacząco spada do 1 dzielącej się komórki, co jest wynikiem zbliżonym do mózgów kontrolnych (Rysunek 3). Zatem potencjał do proliferacji komórek po PTBI jest zależny od wieku.
Nowo powstałe neurony mogą rzutować do odpowiednich obszarów docelowych
W celu oceny regeneracji neuronalnej po PTBI zastosowano system znakowania perma-twin15. Śledzenie linii perma-twin trwale znakuje dzielące się komórki i ich potomstwo zielonym białkiem fluorescencyjnym (GFP) lub czerwonym białkiem fluorescencyjnym (RFP)15. W próbkach uszkodzonych, w 2. dniu i po 2 tygodniach, wykryto więcej klonów perma-twin niż w kontrolnych (Rysunek 4A-E). Co istotne, w około 50% mózgów po PTBI 2 tygodnie po urazie pojawiły się nowe neurony ciał grzybnych (Rysunek 4N). Nowe neurony te rzutowały swoje dendryty prawidłowo do kielicha ciał grzybnych, a aksony prawidłowo do płatów ciał grzybnych (Rysunek 4D,F,G). Wskazuje to, że nowo powstałe komórki mogą być funkcjonalnymi neuronami biorącymi udział w naprawie uszkodzonych ciał grzybnych. Inne obszary mózgu, które wydawały się regenerować, to ciało elipsoidalne (EB) (Rysunek 4H,I), płaty antenalne (AL) (Rysunek 4J,K) oraz róg boczny (LH) (Rysunek 4L,M), w których duże klony występowały odpowiednio w około 26%, 26% i 20% przypadków (Rysunek 4N). Wyniki te podkreślają użyteczność tego systemu w badaniach nad neurogenezą u osobników dorosłych. Proponowany model sekwencji zdarzeń następujących po PTBI i prowadzących do generowania nowych neuronów przedstawiono na Rysunku 5.

Rysunek 1: Przebijający uraz czaszkowo-mózgowy (PTBI) w obrębie centralnego mózgu dorosłej Drosophila. (A) Schemat zewnętrznej strony głowy dorosłej muchy. Jest to widok z przodu, zatem prawa strona zwierzęcia znajduje się po lewej stronie widza. (B) Schemat wnętrza głowy dorosłej Drosophila z zaznaczoną na szaro trajektorią urazu. Jest to widok z tyłu, zatem na tym obrazie oraz na kolejnych rysunkach prawa strona mózgu znajduje się po prawej stronie. PTBI centralnego mózgu wpływa na wiele struktur mózgu, w tym na ciało grzybkowate (zielone) oraz tkanki poza mózgiem, w tym ciało tłuszczowe (niebieskie) i hemocyty (czerwone). CB = obszar centralny mózgu. OL = obszar płata optycznego. (C) Widok grzbietowy żywej głowy dorosłego osobnika, w której ciała grzybkowate (groty strzałek) są znakowane zielonym białkiem fluorescencyjnym (GFP). Jest to „standardowy genotyp” (szczegóły w tekście). Protokół PTBI w sposób powtarzalny prowadzi do uszkodzenia ciał grzybkowatych. Rysunek ten został zaadaptowany z publikacji16. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 2: PTBI stymuluje proliferację komórek. Schematy grupy kontrolnej bez urazu (A) oraz grupy PTBI (B). Niebieskie ramki w prawych górnych rogach wskazują obszary mózgu przedstawione w większym powiększeniu na panelach (C) i (D). (C,D) Do oceny proliferacji komórek 24 h po urazie użyto przeciwciała PH3 (kolor czerwony). W mózgach kontrolnych (C) występuje niewiele komórek PH3+, a żadna nie znajduje się w pobliżu MB. Jednak w mózgach po PTBI (D) komórki PH3+ występują w pobliżu MB. (E) Ilościowe oznaczenie proliferujących komórek. Liczby odzwierciedlają proliferujące komórki w całym mózgu, a nie tylko w okolicy ciała grzybobocznego. Po 24 h w mózgach kontrolnych bez urazu średnia liczba wynosiła 3 komórki PH3+/mózg (n = 11 mózgów, 28 komórek), natomiast 24 h po PTBI w mózgach średnia liczba wynosiła 11 komórek PH3+/mózg (n = 17 mózgów, 181 komórek). Po 7 dniach w kontroli bez urazu stwierdzono niewiele komórek EdU+, ze średnią 2 komórki EdU+/mózg (n = 15 mózgów, 24 komórki), podczas gdy w mózgach 7 dni po PTBI średnia liczba wynosiła 11 komórek EdU+/mózg (n = 22 mózgi, 238 komórek). Po 14 dniach w kontroli bez urazu średnia liczba wynosi 1 komórka EdU+/mózg (n = 8 mózgów, 11 komórek), natomiast w mózgach 14 dni po PTBI średnia liczba wynosi 29 komórek EdU+/mózg (n = 14 mózgów, 400 komórek). W tym zestawie eksperymentów wykorzystano młode dorosłe samce w ciągu 6 h od wyklucia. Nieparzyste testy t dla próbek kontrolnych i PTBI w trzech punktach czasowych dały odpowiednio wartości p<0.0001, p<0.0001 i p<0.0002. Słupki błędów odzwierciedlają odchylenie standardowe (SD). Ten rysunek został zaadaptowany z literatury16. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 3: Odpowiedź proliferacyjna na PTBI maleje wraz z wiekiem. Aby zbadać, czy wiek wpływa na stopień proliferacji komórek następującej po urazie, porównano nowo wyklute dorosłe samce z osobnikami w wieku 7 dni, 14 dni i 28 dni przed PTBI, stosując przeciwciała anty-PH3 do oceny proliferacji komórek 24 h po urazie. Muchy z urazem w ciągu 6 h od wyklucia miały średnio 11 komórek PH3+/mózg (n = 17 mózgów, 182 komórki) w porównaniu do średnio 3 komórek PH3+/mózg w grupie kontrolnej w tym samym wieku (n = 11 mózgów, 28 komórek). Muchy w wieku 7 dni, które poddano PTBI, miały średnio 6 komórek PH3+/mózg (n = 11 mózgów, 65 komórek) w porównaniu do grupy kontrolnej w tym samym wieku ze średnią 2 komórek PH3+/mózg (n = 5 mózgów, 12 komórek). Gdy muchy osiągnęły wiek 14 dni przed PTBI i poddano je ocenie 24 h później, stwierdzono średnio 1 komórkę PH3+/mózg (n = 8 mózgów, 11 komórek), co było podobne do grupy kontrolnej w tym samym wieku, która również wykazywała średnio 1 komórkę PH3+/mózg (n = 4 mózgi, 2 komórki). W przypadku much w wieku 28 dni, zarówno grupa kontrolna bez urazu (n = 4, 1 komórka), jak i grupa PTBI (n = 3, 1 komórka) wykazywały średnio 0 komórek PH3+/mózg. Nieparzyste testy t dla porównań PTBI z grupą kontrolną w tych 4 punktach czasowych wyniosły odpowiednio p<0,0001, p<0,04, p<0,07 i p<0,84. Rycina została opracowana na podstawie źródła16. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 4: Śledzenie linii komórkowych perma-twin wykazuje regenerację mózgu i prawidłowe kierowanie aksonów po PTBI. System śledzenia linii komórkowych perma-twin15 został wykorzystany do analizy neurogenezy po PTBI. System ten trwale znakuje dzielące się komórki i ich potomstwo zielonym białkiem fluorescencyjnym (GFP) lub czerwonym białkiem fluorescencyjnym (RFP). Muchy hodowano w temperaturze 17 °C, aby system pozostawał nieaktywny podczas rozwoju. Samce F1 niosące transgene perma-twin zbierano po wykluciu, następnie poddawano urazowi i przeniesiono do temperatury 30 °C w celu rekonwalescencji przez 2 lub 14 dni. (A) W nieurazionych kontrolach 2-dniowych w całym mózgu rozproszone są niektóre komórki GFP+. (B) W 14. dniu w kontrolnym centralnym mózgu obecnych jest stosunkowo mało komórek GFP+. (C) W porównaniu z nimi, w mózgach urazowanych w 2. dniu znajduje się więcej komórek GFP+, które mają tendencję do skupiania się w pobliżu miejsca urazu (grot strzałki). (D) W 14. dniu po urazie w pobliżu miejsca urazu widoczne są duże klony. Niektóre z tych klonów mają aksony biegnące wzdłuż traktów ciał grzybowych (grot strzałki). Przedstawiono tutaj tylko kanał GFP; w próbkach PTBI występowały podobne klony RFP+. (E) Liczba klonów zwiększa się w czasie po PTBI. Kontrolne mózgi nieurazowane (n = 13) mają średnio 10 klonów w 2. dniu, podczas gdy mózgi PTBI w 2. dniu (n = 20) mają średnio 23 klony (p<0,00002). W 7. dniu mózgi kontrolne miały średnio 9 klonów na mózg (n = 18), podczas gdy mózgi PTBI w 7. dniu miały średnio 39 klonów na mózg (n = 16) (wartość p<0,00000002). Jest to znacznie więcej niż liczba klonów obserwowana w 2. dniu po urazie (wartość p<0,0009). W 14-dniowych mózgach kontrolnych średnio występuje 10 klonów na mózg, co nie różni się znacząco od kontroli 2- i 7-dniowych. Jednak w 14. dniu po PTBI występuje średnio 66 klonów GFP+, co jest wartością znacząco wyższą niż w przypadku kontroli o tym samym wieku (p<0,0000003) lub mózgów 2 dni po PTBI (wartość p<0,0001). Słupki błędów reprezentują SD. (F-M) PTBI stymuluje tworzenie klonów w wielu obszarach mózgu. Panele po lewej stronie to schematy obszarów mózgu, w których 14 dni po PTBI znaleziono duże klony (A, H, J, L). Panele po prawej pokazują duże powiększenia reprezentatywnych mózgów (G, I, K, M). W wielu 14-dniowych mózgach występowały klony rzutujące na konkretne obszary docelowe. Były to: ciało grzybowe (MB) (F,G), ciało elipsoidalne (EB) (H,I), płat antenowy (AL) (J,K) oraz róg boczny (LH) (L,M). (N) Zarówno liczba, jak i rozmiar klonów zwiększają się z czasem po PTBI. Proporcje obszarów mózgu z dużymi klonami obliczono w 2., 7. i 14. dniu w mózgach kontrolnych i urazowanych. W 2. dniu ~8% mózgów kontrolnych (n = 13) wykazywało klony AL, podczas gdy w 2-dniowych mózgach urazowanych (n = 20) nie stwierdzono klonów AL. W 7-dniowych mózgach kontrolnych (n = 18) 6% miało klony AL i 6% miało klony EB. W 7. dniu po PTBI (n = 16) 6% mózgów również miało klony AL, 6% miało klony EB, a 19% miało duże klony MB. W 14. dniu mózgi kontrolne (n = 9) nie wykazywały żadnych specyficznych obszarów z klonami, podczas gdy 47% mózgów PTBI (n = 15) miało klony MB, 20% mózgów PTBI miało klony AL, 27% mózgów PTBI miało klony EB i 27% miało klony LH. Rycina została zaadaptowana z publikacji16. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tej ryciny.

Rycina 5: Model podsumowujący regenerację po penetrującym urazowym uszkodzeniu mózgu (PTBI). U młodych dorosłych osobników Drosophila w obrębie centralnego mózgu znajdują się spoczynkowe komórki podobne do neuroblastów, w których brakuje ekspresji kanonicznych genów neuroblastów. Do 24 h po PTBI spoczynkowe komórki podobne do neuroblastów zostają aktywowane, wykazują ekspresję genów neuroblastów i zaczynają proliferować. Zarówno w 4 h, jak i w 24 h po PTBI występuje fala śmierci komórkowej16. W 7. dniu tempo proliferacji nadal pozostaje wysokie, a wiele z nowych komórek przyjęło tożsamość dojrzałych komórek, stając się neuronami lub glejem. W 14. dniu po PTBI powstają duże klony nowych neuronów z aksonami i dendrytami prawidłowo skierowanymi do odpowiednich obszarów docelowych. Deficyty lokomocyjne zostają również zniesione do 14. dnia, co sugeruje, że dorosłe Drosophila potrafią regenerować się funkcjonalnie i strukturalnie. Rycina ta została zaadaptowana z Referencji16. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.
Chociaż urazy penetrujące mózg dorosłego Drosophila zostały opisane wcześniej 15,17,18, urazy te koncentrowały się na płatach wzrokowych, a nie na centralnym mózgu. Do tej pory brakuje również szczegółowych instrukcji, jak postępować w przypadku urazów. Protokół ten opisuje model penetrującego uszkodzenia centralnego mózgu dorosłego Drosophila, który odtwarza statystycznie istotne dowody na neurogenezę u dorosłych po PTBI.
Powtarzalność tego protokołu PTBI wynika częściowo z korpusu grzyba jako obszaru docelowego urazu. Ciało grzyba jest duże, składa się z ~ 2200 neuronów ze złożonymi trzpieniami dendrytowymi i aksonowymi w dużych i wysoce stereotypowych układach18. Ciała komórkowe neuronów ciała grzyba leżą blisko powierzchni mózgu i mogą być wizualizowane przez naskórek głowy za pomocą ekspresji białka zielonej fluorescencji (GFP) (Figura 1C). Prekursory ciała grzyba są ostatnimi nerwowymi komórkami macierzystymi, które ulegają apoptozie podczas rozwoju 13,12,19. Tak więc, wiele neuronów ciała grzyba jest dość młodych w momencie ekleksji. Doprowadziło to do hipotezy, że ciało grzyba może mieć większy potencjał mitotyczny niż inne regionymózgu16. Ponadto ciało grzyba ma kluczowe znaczenie dla uczenia się i zapamiętywania18. To pozwala zapytać, czy neurogeneza wywołana przez PTBI prowadzi do powrotu do sprawności.
Inne czynniki, które przyczyniają się do powtarzalności wyników, obejmują wykorzystanie krzyżowanych much o spójnych genotypach, wykonywanie krzyżówek w tym samym kierunku za każdym razem, precyzyjną kontrolę temperatur odchowu i starzenia się oraz analizę samców i samic osobno. Użycie much F1 z krzyżówki zmniejsza prawdopodobieństwo analizy mózgów homozygotycznych pod względem spontanicznych mutacji. Standardowy krzyż y[1] w[1]; UAS-mCD8-GFP; OK107-GAL4 dorosłe samice do y[1] w[1] dorosłego samca muchy daje potomstwo F1 o genotypie y[1] w[1]; UAS-mCD8-GFP/+; OK107-GAL4/+. OK107-GAL4 ulega ekspresji we wszystkich wewnętrznych neuronach ciała grzyba i napędza ekspresję reportera związanego z błoną UAS-mCD8-GFP , umożliwiając wizualizację ciał grzybów i ich projekcji. W przypadku krzyżówek perma-twin, krzyżówki muszą pozostawać w temperaturze 17 °C przez cały czas, aby system śledzenia linii był wyłączony. Gwarantuje to, że żadne dzielące się komórki nie są znakowane podczas rozwoju, a znakowane są tylko dorosłe neurony i glej. W tym celu pomieszczenie dla much może być również utrzymywane w temperaturze 17 °C. Chociaż początkowy opis systemu perma-twin15 zalecał hodowlę much w temperaturze 18 °C, może to prowadzić do znacznego oznakowania tła.
Aby zapewnić spójność, zaleca się również, aby muchy kontrolne nie zostały uszkodzone na podkładce CO2 podczas wykonywania PTBI. Gwarantuje to, że oba zestawy much mają identyczną ekspozycję na środek znieczulający. Ponadto pożądane jest, aby odtwarzalność całkowicie penetrowała głowę. Należy jednak uważać, aby nie zginać końcówki szpilki o podkładkę, co uniemożliwiłoby jej wykorzystanie w przypadku przyszłych obrażeń. Dla wykwalifikowanych praktyków muchy PTBI nie mają zbyt wielu niezamierzonych szkód. Niemniej jednak zbyt mocne naciskanie na klatkę piersiową, aby ustabilizować muchę podczas kontuzji, może być śmiertelne. Jednym ze sposobów oceny zakresu niezamierzonego urazu jest ilościowe określenie śmiertelności much PTBI 24 godziny po urazie. W przypadku jednostronnie zranionych much może to być 50% lub więcej dla początkujących. Dlatego, aby upewnić się, że obserwowane wyniki są spowodowane PTBI, a nie niezamierzonymi urazami, zaleca się, aby początkujący ćwiczyli podawanie PTBI na ~20 muchach dziennie przez kilka tygodni i nie analizowali powstałych mózgów, dopóki śmiertelność w ciągu 24 godzin nie będzie stale <10%.
Aby określić ilościowo ilość proliferacji stymulowanej przez centralny PTBI w mózgu, można zastosować zarówno barwienie immunologiczne antyfosfohistonu H3 (PH3), jak i inkorporację 5-etynylo-2'-deoksyurydyny (EdU). Anty-PH3 znakuje komórki przed i w trakcie metafazy, ograniczając wykrywanie tylko do ułamka aktywnie dzielących się komórek. Tak więc barwienie anty-PH3 zapewnia tylko częściowy wgląd w proliferację. EdU jest analogiem tymidyny, który może być włączony do nowo zsyntetyzowanego DNA. Karmiąc muszki EdU przed i po urazie, można uzyskać pełniejszy obraz komórek, które dzielą się lub podzieliły po urazie. Fakt, że wszystkie dzielące się komórki są trwale oznaczone, jest pomocny zarówno w identyfikacji komórek o powolnych cyklach, jak i w badaniu przetrwania komórek po początkowej proliferacji. Z niejasnych powodów, ale być może z powodu ograniczonej przepuszczalności bariery krew-mózg, znakowanie EdU jest nieefektywne i zaniża proliferację komórek w dorosłym mózgu. Dowodzi tego podobna liczba komórek PH3 + i EdU + zarówno w mózgach kontrolnych, jak i eksperymentalnych po 24 godzinach od PTBI oraz obserwacja, że tylko podzbiór nowych komórek w klonach bliźniaków zawiera EdU16. Aby uzyskać maksymalne oznakowanie, konieczne jest wstępne karmienie much EdU, ponieważ ranne muchy nie wznawiają żerowania przez kilka godzin po PTBI. Karmienie oceniano, dodając barwnik spożywczy do roztworu EdU i monitorując ilość barwnika w jelitach przez naskórek brzucha16.
Należy zauważyć, że chociaż w kroku 4 dostarczyliśmy protokół sekcji mózgu, można zastosować alternatywne techniki. Kilka z nich jest dostępnych we wcześniej opublikowanych protokołach 20,21,22. Drosophila melanogaster oferuje tani model z potężnymi narzędziami genetycznymi i molekularnymi, które można wykorzystać do badania mechanizmów leżących u podstaw regeneracji wielu tkanek, w tym jelit i składników układu nerwowego. Przedstawiono tutaj nowatorski i powtarzalny model urazu, który można wykorzystać do badania reakcji na uraz mózgu. Dane uzyskane za pomocą tych protokołów potwierdzają tezę, że centralny mózg dorosłego Drosophila zachowuje zdolność proliferacyjną, generując nowe neurony w odpowiedzi na uraz. Obserwacje te uzasadniają dalsze badania zarówno zakresu neurogenezy dorosłych, jak i leżących u jej podstaw mechanizmów molekularnych. Po zidentyfikowaniu składników zaangażowanych w regenerację neuronów w tym systemie, możemy przekształcić naszą wiedzę o neurogenezie dorosłych Drosophila na ludzi.
Autorzy nie pozostają w konflikcie interesów.
Jesteśmy wdzięczni Stacey Rimkus i Becky Katzenberger za pomoc techniczną oraz Eduardo Moreno za udostępnienie akcji perma-twin. Chcielibyśmy podziękować Barry'emu Ganetzky'emu i Davidowi Wassarmanowi za ożywione dyskusje, które niewątpliwie przyczyniły się do rozwoju nauki, a także Kentowi Mokowi, Cayli Guerrze i Baileyowi Spiegelbergowi za ich wkład w rozwój laboratorium. Przeciwciała FasII zostały opracowane przez Coreya Goodmana i uzyskane z Developmental Studies Hybridoma Bank, utworzonego przez NICHD NIH i utrzymywanego na Uniwersytecie Iowa, Wydział Biologii, Iowa City, IA 52242. Większość szczepów Drosophila użytych w tym badaniu została uzyskana z Bloomington Drosophila Stock Center (BDSC; NIH P40OD018537). Prace te były wspierane przez NIH T32 GM007133 (KLC); NIH NS090190 (GBF); NIH NS102698 (GBF); Szkoła Podyplomowa Uniwersytetu Wisconsin (GBF); oraz UW-Madison Women in Science and Engineering Leadership Institute (WISELI) (GBF).
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| #11 Jednorazowe skalpele | Santa Cruz Biotechnology | SC-395923 | Służy do oddzielania głów Drosophila od tułowia przed sekcją mózgu |
| Czarne szalki Sylgarda o średnicy 150 mm | Dow | 1696157 | wykonane w laboratorium z odczynnikami z Dow; używane do preparowania mózgu |
| Szkiełka nakrywkowe 18 mm | dowolne | do montażu mózgów na szkiełkach | |
| mikroskopowych4',6-Diamidino-2-Phenylindol, Dichlorowodorek (DAPI) | ThermoFisher | D1306 | do immunohistochemii |
| 70% Etanol | wykonany z 95% etanolu pozyskiwanego w różny sposób | ||
| anty-mysi Cy5 | Jackson ImmunoResearch | 715-175-151 | do immunohistochemii |
| anty-królik 568 | ThermoFisher | A11036 | do immunohistochemii |
| bydła albumina surowicy (BSA) | Sigma Aldrich | A7030 | do immunohistochemii |
| Bezbarwny lakier do paznokci | dowolny | do uszczelniania szkiełek nakrywkowych | |
| Zestaw do znakowania Click-It EdU | InVitrogen | C10640 | do wykrywania nowo zsyntetyzowanego DNA |
| CO2 bubbler | Genesee Scientific | 59-181 | do znieczulenia |
| Podkładka CO2 | Genesee Scientific | 59-114 | do znieczulenia |
| Regulator CO2 i dostarczyć | dowolny | do znieczulenia | |
| Mikroskop konfokalny | dowolny | do obrazowania stałych, barwionych i montowanych | |
| zatyczek bawełnianych do mózgów | Genesee Scientific | 51-101 | do znakowania EdU |
| fiolki Drosophila | Genesee Scientific | 32-109 | dla EdU etykietowanie |
| Bufor Fix (Rury, EGTA, magnez; PEM) | składniki pochodzące z różnych firm | do naprawy mózgów dorosłych; 100 mM piperazyno-N,N'-bis(kwas 2-etanosulfonowy) [RURY], 1 mM EGTA, 1 mM MgSO4, pH 7,0 | |
| Formaldehyd | Sigma | Aldrich 252549 | do naprawy dorosłych mózgów, dodany do PEM |
| Grade 3 okrągłe filtry Whatman, okrągłe 23 mm | Tisch Scientific | 1003-323 | do etykietowania EdU |
| Rurki Microfuge | dowolne | do utrwalania i barwienia reakcji oraz do przechowywania szpilek Minutien | |
| Szkiełka mikroskopowe | dowolne | do montażu mózgów | |
| Szpilki Minutien | Fine Science Tools | 26002-10 | do uszkodzeń mózgu; 12,5 μ końcówka o średnicy m i 100 μ pręt o średnicy m |
| mysi anty-Fasiclin II | Badania rozwojowe Bank hybrydoma | 1D4-s | do immunohistochemii |
| Mikroskop stereoskopowy NIGHTSEA adapter fluorescencyjny | Mikroskopia elektronowa Nauki | SFA-GR | zestaw fluorescencyjny do mikroskopu preparacyjnego |
| pipety i końcówki P20, P200 i P1000 | dowolne | do roztworów | |
| pomiarowych salina buforowana fosforanami (PBS) | składniki pochodzące z różnych firm | do preparowania mózgów i wytwarzania immunohistochemicznych roztworów blokujących i myjących; 100 mM K2HPO4, 140 mM NaCl, pH 7,0 | |
| sól fizjologiczna buforowana fosforanem z 0,1% Triton X-100 (PT) | pochodzące z różnych firm | do mycia wypreparowanych mózgów | |
| sól fizjologiczna buforowana fosforanami z 0,1% Triton X-100 + 2% albumina surowicy bydlęcej (PBT) | składniki pochodzące od różnych firm | Roztwór blokujący do immunohistochemii i do rozcieńczania przeciwciał | |
| królik anty-PH3 | Santa Cruz Biotechnology, Inc | sc-8656-R | do immunohistochemii |
| Etykiety wzmacniające | Avery | 5721 | w celu zachowania przestrzeni między szkiełkiem mikroskopowym a szkiełkiem nakrywkowym |
| Rozmiar 0 pędzle dowolne | do manipulowania i stabilizacji dorosłej Drosophila podczas urazu | ||
| Triton X-100 | Sigma Aldrich | 93443 | |
| Dwie pary kleszczyków zegarmistrzowskich #5 | Fine Science Tools | 11255-20 | używane do przytrzymywania szpilek Minutien i do sekcji mózgu |
| Vectashield | Vector Laboratories | H-1000 | medium montażowe do szkiełek mikroskopowych |