$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Architektura mikrotubul różni się znacznie w zależności od typu komórek, aby wspierać różne funkcje1,2. Jego dynamiczna natura wzrostu i kurczenia się pozwala na szybką adaptację do sygnałów zewnątrz- i wewnątrzkomórkowych oraz reagowanie na stale zmieniające się potrzeby komórki. W związku z tym można go uznać za "morfologiczny odcisk palca" odgrywający kluczową rolę w tożsamości komórkowej.
Farmakologiczne celowanie w cytoszkielet mikrotubul za pomocą inhibitorów małych cząsteczek doprowadziło do mnóstwa fundamentalnych odkryć w biologii rozwojowej, biologii komórek macierzystych, biologii nowotworów i neurobiologii3,4,5,6,7. Podejście to, choć niezbędne, wiąże się z różnymi ograniczeniami, takimi jak toksyczność i skutki niezamierzone. Na przykład jeden z najczęściej stosowanych środków ukierunkowanych na mikrotubule, nokodazol, jest silnym lekiem depolimeryzującym mikrotubule8. Jednak inhibitory małocząsteczkowe, takie jak nokodazol, są aktywne od momentu aplikacji, a biorąc pod uwagę zasadniczy charakter cytoszkieletu mikrotubul dla wielu krytycznych funkcji komórkowych, globalna depolimeryzacja mikrotubul może powodować efekty niezgodne z celem, które mogą być nieodpowiednie dla wielu zastosowań. Dodatkowo, leczenie nokodazolem jest nieodwracalne, chyba że próbki zostaną wypłukane z leku, co uniemożliwi ciągłe obrazowanie na żywo, a tym samym precyzyjne śledzenie poszczególnych włókien mikrotubul.
Rozwój związków aktywowanych światłem rozpoczął się od stworzenia fotoklatkowych cząsteczek i zwiastował nową erę w celowaniu i monitorowaniu efektów hamowania wzrostu mikrotubul w sposób precyzyjny i kontrolowany czasowo. Jedna rodzina odwracalnie fotoprzełączalnych leków, fotostatyny (PST), została opracowana przez zastąpienie składnika stilbenu komretastatyny A-4 azobenzenem9. PST są nieaktywne do momentu oświetlenia światłem UV, przy czym nieaktywna konfiguracja trans przekształca się w aktywną konfigurację cis przez odwracalną izomeryzację. Cis-PST hamują polimeryzację mikrotubul poprzez wiązanie się z miejscem wiązania kolchicyny β-tubuliny, blokując jej interfejs z β-tubuliną i zapobiegając dimeryzacji wymaganej do wzrostu mikrotubul10. W kohorcie PST PST-1P pojawił się jako związek wiodący, ponieważ ma najwyższą moc, jest w pełni rozpuszczalny w wodzie i wykazuje szybki początek bioaktywności po naświetleniu.
Najbardziej efektywna izomeryzacja trans- do cis-izomeryzacji PST występuje przy długościach fal między 360-420 nm, co umożliwia podwójne opcje aktywacji PST. Linia laserowa o długości fali 405 nm w typowym mikroskopie konfokalnym może być podawana w celu optymalnego ukierunkowania przestrzennego na zahamowanie wzrostu mikrotubul. Możliwość precyzyjnego określenia miejsca i czasu aktywacji PST za pomocą oświetlenia laserowego 405 nm ułatwia precyzyjną kontrolę czasową i przestrzenną, umożliwiając zakłócenie dynamiki mikrotubul na poziomie subkomórkowym, w czasie reakcji poniżej sekundy9. Alternatywnie, niedrogie światło LED UV pozwala na oświetlenie całego organizmu w celu wywołania zakłócenia architektury mikrotubul w całym organizmie. Może to być opłacalna alternatywa dla badaczy, dla których celem jest precyzyjnie określony początek hamowania, a nie celowanie przestrzenne. Kolejną cechą PST jest ich inaktywacja na żądanie poprzez zastosowanie zielonego światła o długości fali w zakresie 510-540 nm9. Umożliwia to śledzenie włókien mikrotubul przed, w trakcie i po zahamowaniu wzrostu za pośrednictwem PST.
PST, choć wciąż stosunkowo nowym projektem, były używane w licznych zastosowaniach in vitro w różnych dziedzinach badań11, w tym badając nowe mechanizmy migracji komórek u ameboidów12, w neuronach wyizolowanych z mózgu nowonarodzonego myszy13, oraz rozwój nabłonka skrzydeł u Drosophila melanogaster14. Inne leki reagujące na światło okazały się cennymi narzędziami w ukierunkowanym zaburzeniu funkcji komórkowych. Na przykład, analog blebbistatyny, azydoblebbistatyna, został użyty do zwiększonego hamowania miozyny w oświetleniu15,16. Podkreśla to potencjał nowych odkryć dzięki zdolności do kontrolowanego czasowo hamowania funkcji komórkowych.
Żywe organizmy 3D prezentują doskonałe, ale bardziej delikatne systemy do manipulowania dynamiką mikrotubul na poziomie całego zwierzęcia, pojedynczej komórki lub subkomórki w warunkach fizjologicznych. W szczególności preimplantacyjny zarodek myszy oferuje wyjątkowy wgląd w wewnętrzne funkcjonowanie komórki, a także relacje międzykomórkowe w organizmie17. Ukierunkowane czasowo i przestrzennie następujące po sobie cykle aktywacji i dezaktywacji PST przyczyniły się do scharakteryzowania mostka interfazowego, postcytokinetycznej struktury między komórkami, jako niecentrycznego centrum organizującego mikrotubule w preimplantacyjnym zarodku myszy16. Podobny układ eksperymentalny wykazał udział rosnących mikrotubul w uszczelnianiu zarodka myszy, aby umożliwić tworzenie blastocysty18. Co więcej, PST wykorzystano również w całych zarodkach danio pręgowanego do zbadania migracji komórek neuronalnych poprzez hamowanie wzrostu mikrotubul w podzbiorze komórek w tyłomózgowiu19.
Ten protokół opisuje eksperymentalną konfigurację i użycie PST-1P w preimplantacyjnym zarodku myszy. Przedstawione tutaj instrukcje mogą również pomóc w zastosowaniu PST do szerokiego zakresu celów, takich jak badanie segregacji chromosomów i podziału komórek, transport ładunku wewnątrzkomórkowego oraz morfogeneza i migracja komórek. Co więcej, takie badania pomogą we wdrożeniu PST w układach organoidowych, blastoidach i innych modelach zarodków, takich jak Caenorhabditis elegans i Xenopus laevis, a także potencjalnie rozszerzą zastosowanie PST w technologiach zapłodnienia in vitro.