$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Znaczenie. Pomiar natlenienia tkanek daje wgląd w metabolizm specyficzny dla komórek i tkanek, wzrost i rozwój tkanek, żywotność, nowotworzenie i migrację komórek oraz interakcje z drobnoustrojami i innymi patogenami. Przedstawiona metoda daje nowe narzędzie do lepszego zrozumienia fizjologii wielokomórkowych kultur sferoidalnych: analizę natlenienia za pomocą ratiometrycznych sond nanocząstekO2 oraz dostarcza środków do oceny niedotlenienia, wizualizacji zależności od określonych szlaków produkcji energii oraz uzupełnia badania modelowe i alternatywne podejścia do obrazowania metabolicznego 43,44 na powszechnie dostępnym, niedrogim mikroskopie fluorescencyjnym. Pomiary ratiometryczne można wykonywać na fluorescencyjnym mikroskopie szerokopolowym (preferowane impulsowe wzbudzenie LED), laserowo-skaningowym mikroskopie konfokalnym, arkuszowym świetlnym i dwufotonowym, idealnie wyposażonym w komory inkubatora Ti O2. Co ważne, prezentowany pomiar mikroskopowyO2 można łatwo połączyć z wieloparametrową analizą na żywo różnych parametrów fizjologicznych i znaczników komórkowych (w przypadku heterokomórkowych kultur sferoidalnych), żywotności (barwienie żywe/martwe), metabolizmu lipidów (sondy fluorescencyjne wykrywające lipidy), dynamiki pH (barwniki, nanocząstki i białka fluorescencyjne) lub [Ca2+] wykonywane w dostępnych kanałach spektralnych fluorescencji lub równolegle, dając rozszerzony wgląd w funkcję komórek w czasie rzeczywistym w sferoidach, biodrukowanych konstruktach i potencjalnych przeszczepach tkanek.
Hodowle sferoidalne znajdują zastosowanie w badaniach komórek nowotworowych, mikrośrodowiska niszowego guza i komórek macierzystych, nowotworów, badań przesiewowych skuteczności leków i toksyczności, a także jako elementy budulcowe tkanek do biofabrykacji tkanek i samoorganizacji45. Mogą one być generowane z wielu typów komórek przy użyciu różnych podejść46. Popularność modelu sferoidalnego wymusza ich standaryzację z punktu widzenia rzetelności badań i poprawy analizy danych, czego ostatnio próbowano poprzez opracowanie pierwszej bazy danych sferoidów8.
Oczekuje się, że nasz protokół pomoże lepiej zrozumieć żywy metabolizm sferoidów, ustandaryzować ten model eksperymentalny, a następnie poprawić ich długoterminową stabilność, odtwarzalność i żywotność w materiałach biodrukowanych i wszczepialnych.
Modyfikacje. Protokół ten opisuje zastosowanie mikrowzorzystej powierzchni agarozy o niskiej przyczepności (tworzenie oparte na mikropleśni29) do wysokowydajnego wytwarzania sferoid obciążonych sondą O2 do analizy natleniania. Alternatywne metody produkcji sferoidów, takie jak wiszące krople, nakładanie ultra niskich płytek mocujących, powlekanie lipidowe lub tworzenie swobodnego pływania, są również zgodne z sugerowanym protokołem ładowania sondyO2. Prezentowany protokół został zoptymalizowany dla sferoid hDPSC i sferoid kokulturowych hDPSC z HUVEC (1:1). Inne linie komórkowe są z pewnością możliwe do zastosowania 15,17,47,48; Jednak może być wymagana pewna optymalizacja protokołu ze względu na różne właściwości adhezji komórek, warunki hodowli, wymagania dotyczące substratu metabolicznego i kompatybilność komórek z barwieniem nanocząstek. Wybór odpowiedniej ratiometrycznej sondy czułej na nanocząstki O2 musi być dokonany w zależności od konkretnego modelu komórki i zgodnie z właściwościami fotowybielania sondy w zastosowanym zestawie mikroskopowym (intensywność i rodzaj źródła światła, czułość spektralna kamery) oraz dostępność odpowiednich filtrów wzbudzenia/emisji dla odpowiednich referencyjnych i czułych kanałów spektralnych O2 sondy.
Niektóre ratiometryczne sondyO2 są dostępne na rynku2. Alternatywnie można je przygotować we własnym zakresie poprzez współwytrącanie barwników referencyjnych i wrażliwych naO2-2 z polimerem, jak opisano w innym miejscu 24,25,49. Dla każdego indywidualnego modelu należy wykonać badania wstępne w celu określenia odpowiedniej sondy i optymalnych warunków mikroskopowych oraz zminimalizowania efektu fotowybielania sondy lub fotoindukowanego zużyciaO2 podczas pomiarów ratiometrycznych. Wcześniejsze badania nanocząstek wykrywającychO2 wykazały ich niską toksyczność komórkową, co pozwala na zastosowanie w szerokim zakresie stężeń barwienia (1-20 μg/ml). Ponieważ niektóre nanocząstki kationowe mogą samoczynnie agregować się podczas przechowywania, zalecamy utrzymywanie ich stężenia obciążenia na jak najniższym poziomie, aby zminimalizować ich potencjalny wpływ na tworzenie sferoidów. Opcjonalnie zawiesina nanocząstek może być filtrowana (0,2 μm) lub oczyszczana przez wirowanie (10 000 x g, 5 min) przed użyciem w celu usunięcia wszystkich agregatów z zawiesiny.
Chociaż oprogramowanie BioCAD i HMI jest specyficzne dla prezentowanej biodrukarki, protokół ten ma zastosowanie do innych biodrukarek, ponieważ zapewnione jest przygotowanie biotuszu, montaż, napełnianie standardowego wkładu oraz konstrukcja porowatego rusztowania hydrożelowego. Ponadto parametry biodruku, takie jak szybkość drukowania i temperatura, powinny być porównywalne dla różnych biodrukarek opartych na wytłaczaniu. Ciśnienie drukowania i średnica rozpórki zależą od rodzaju i średnicy igły, składu biotuszu, temperatury i lepkości wynikowej, ale mogą być punktem wyjścia do optymalizacji parametrów drukowania w celu biodruku biotuszów na bazie GelMA za pomocą różnych biodrukarek, chociaż niektóre biodrukarki używają wrzecion zamiast ciśnienia powietrza do wytłaczania biotuszu50.
Krytyczne kroki i rozwiązywanie problemów. Jednym z krytycznych etapów jest wybór sondyO2 , który opiera się na następujących względach: po pierwsze, dostępna konfiguracja mikroskopu fluorescencyjnego (tj. kompatybilne źródło światła wzbudzenia, filtry wzbudzenia i emisji, czułość kamery i przepuszczalność widmowa oraz apertura numeryczna obiektywu), które mogą ograniczać liczbę dostępnych sond pod względem ich fotostabilności, jasność i potencjalną fototoksyczność. Należy również zauważyć, że niektóre rodzaje olejków immersyjnych (w przypadku obiektywów immersyjnych z olejkiem) mogą zakłócać sygnały fluorescencji w kolorze czerwonym i podczerwonym. Uważamy, że testy fotostabilności są bardzo ważne i że muszą być wykonywane podczas wstępnej konfiguracji i testów wstępnych. Należy wziąć pod uwagę potencjalny przesłuch spektralny między kanałami fluorescencyjnymi a różnymi barwnikami. Rzeczywiście, potencjalna ciemna i fotoindukowana toksyczność sondyO2 i innych wybranych barwników, w odniesieniu do konkretnego modelu komórkowego, musi zostać oceniona podczas optymalizacji protokołu51. Specyficznym problemem dla nanocząstek może być ich samoagregacja, którą można złagodzić poprzez optymalizację ich stężenia roboczego, składu podłoża barwiącego (np. zawartość surowicy), sonikację nanocząstek przed zmieszaniem z pożywką lub użycie wstępnie wybarwionych i przemytych komórek za pomocą sondy O2 do tworzenia sferoid zamiast ładowania sondy podczas procedury tworzenia i kompaktyzacji sferoidy.
Nie zaobserwowaliśmy problemów związanych z głębokością penetracji światła w opisywanych modelach sferoidalnych, ale należy to wziąć pod uwagę przy doborze sygnałów o intensywności ratiometrycznej, wielkości konstruktów sferoidalnych i biofabrykowanych (przeszczepów tkankowych) oraz optymalizacji barwienia komórek odpowiednimi barwnikami. Oczekuje się, że sonda MMIR1 o ściśle dopasowanych długościach fal emisji czerwonej i bliskiej podczerwieni zapewni najniższe tło i najlepszą penetrację światła tkankowego w porównaniu z innymi sondami biosensorów fluorescencyjnych emitujących światło czerwono-niebieskie lub zielone.
Produkcja i obsługa obrazów proporcjowych (i potencjalnie demiksowanie lub dekonwolucja spektralna) może być wykonana w oprogramowaniu dostarczonym przez dostawcę lub w opcjach opensource, takich jak ImageJ, Fiji52,53, napari (https://napari.org), MATLAB i inne. Krytycznym krokiem będzie odjęcie tła i zmierzenie zmian intensywności sygnału w zakresie liniowym.
Kalibracja sondyO2: Rotenon i antymycyna A są inhibitorami kompleksów I i III mitochondrialnego łańcucha transportu elektronów, odpowiednio, blokując oddychanie komórkowe 54,55,15 i indukując rozpraszanie gradientów O 2 w sferoidach i ich równoważenie ze środowiskowymO2. Tak więc zmiana stężenia środowiskowegoO2 (tj. 20%, 15%, 10%, 5%, 2,5%, 1%, 0% O2) pozwoli na ratiometryczną kalibrację intensywności lub żywotności fosforescencji sondy O2 czułej na komórki w komórkach. Zazwyczaj inkubatory sterowaneO2 nie są w stanie osiągnąć bezwzględnego 0%O2 i w niektórych sytuacjach wymagany jest szybki test odpowiedzi sondy na odtlenienie. W takich przypadkach do próbki należy dodać 25-100 μg/ml oksydazy glukozowej lub mieszaniny Na2SO3/K2HPO4 (50 mg/ml na każdy związek na 10-krotny roztwór w wodzie destylowanej). Co ważne, jeśli linia komórkowa ma znaczny stopień niemitochondrialnego zużyciaO2, należy to wziąć pod uwagę podczas wykonywania eksperymentów z hamowaniem oddychania i kalibracją.
Ograniczenia i przyszłe badania. Głównym ograniczeniem proponowanej metody i detekcji ratiometrycznej w ogóle jest kalibracja i konwersja obserwowanych poziomów proporcji na rzeczywiste poziomyO2 , co ze względu na wewnętrzne różnice w sprzęcie i ustawieniach akwizycji obrazu użytkownika sprawiłoby, że kalibracja proporcji byłaby specyficzna dla przyrządu i komórki. Co ważne, w przypadku szerokokątnego mikroskopu fluorescencyjnego i opisanej konfiguracji, obrazy proporcji odzwierciedlają raczej połączone projekcje niż idealne przekroje optyczne, a kalibracjaO2 nie miałaby sensu. Z drugiej strony pokazujemy, że półilościowe pomiary wskaźnikowe dostarczają statystycznie istotnego i łatwego do zmierzenia fenotypowania porównawczego sferoid wytwarzanych z różnych źródeł i mających różnice w natlenieniu.
Przyszłe badania nad stworzeniem bardziej dostępnych i przystępnych cenowo podejść mikroskopowych zaprojektowanych dla żywych obiektów 3D, takich jak SPIM, arkusz świetlny, theta, obrazowanie dwufotonowe i luminescencyjne w połączeniu z uczeniem maszynowym 56,57,58,59,19, pomogą wprowadzić wieloparametryczne obrazowanie O2 do jeszcze większej liczby zastosowań ilościowych.