Glej Müllera (MG) to dominujący glej w siatkówce nerwowej. Mają podobne funkcje w porównaniu z innymi komórkami glejowymi w innych częściach ośrodkowego układu nerwowego, takie jak utrzymanie homeostazy wody i jonów, odżywianie neuronów i ochrona tkanki. MG mają jeszcze jedną fascynującą cechę: chociaż są dojrzałymi glejami, nadal wyrażają wiele genów wyrażanych w komórkach progenitorowych siatkówki (RPC) w późnym okresie rozwoju1,2. Zakłada się, że to podobieństwo jest przyczyną naturalnie występującej regeneracji neuronów opartej na MG w siatkówce ryby po uszkodzeniu siatkówki3,4. Podczas tego procesu MG ponownie wchodzi do cyklu komórkowego i deróżnicuje się w RPC, które następnie różnicują się we wszystkich sześciu typach neuronów siatkówki. Chociaż zjawisko to występuje naturalnie u ryb, MG ssaków nie przekształcają się w neurony5,6. Można je jednak przeprogramować. Wykazano, że wiele czynników przeprogramowuje MG w RPC/neurony; wśród tych czynników jest podstawowy czynnik transkrypcyjny helisa-pętla-helisa (bHLH) achaete-scute homolog 1 (Ascl1), który bierze udział w regeneracji ryb7,8. U myszy Ascl1 ulega ekspresji tylko w RPC podczas retinogenezy, ale nie występuje w dojrzałych MG lub neuronach siatkówki9.
Przeprogramowanie komórek bezpośrednio in vivo jest nie tylko wyzwaniem metodologicznym, ale także wymaga zgody instytucjonalnego komitetu ds. opieki i użytkowania zwierząt. Aby uzyskać zatwierdzenie, wymagane są wstępne dane dotyczące zastosowanego lub zmienionego czynnika (czynników), stężeń, skutków niedocelowych, mechanizmów leżących u podstaw objawów, toksyczności i skuteczności. Systemy hodowli komórkowych umożliwiają testowanie tych kryteriów przed użyciem w modelach in vivo. Ponadto, ponieważ MG stanowią tylko około 5% całej populacji komórek siatkówki10, hodowle MG pozwalają na badanie ich funkcji11, a także ich zachowania, w tym migracji12,13, proliferation14, reakcja stresowa na uraz/uszkodzenie15,16, ich interakcja z innymi typami komórek, takimi jak mikroglej17 lub komórki zwojowe siatkówki (RGC)18, lub ich potencjał neurogenny19,20,21. Wielu badaczy wykorzystuje unieśmiertelnione linie komórkowe do swoich badań, ponieważ mają one nieograniczony potencjał proliferacyjny i mogą być łatwo utrzymywane i transfekowane. Komórki pierwotne są jednak preferowane do testów biologicznie istotnych niż komórki unieśmiertelnione, ponieważ mają prawdziwe cechy komórkowe (ekspresję genów i białek) i, co ważniejsze, reprezentują pewien etap rozwoju, a zatem mają "wiek". Wiek zwierzęcia (a co za tym idzie komórek uzyskanych od zwierzęcia) jest szczególnie istotnym czynnikiem w przeprogramowywaniu komórek, ponieważ plastyczność komórek zmniejsza się wraz z postępem etapu rozwoju22.
Ten protokół opisuje szczegółowo, jak przeprogramować pierwotne MG za pomocą miRNA jako aktualną metodę in vitro do badania regeneracji. Ten model hodowli pierwotnej MG został opracowany w 2012 roku w celu oceny charakterystyki proliferacji komórek MG u myszy z nokautem P53 (myszy trp53-/-)23. Wykazano, że hodowane MG zachowują swoje cechy glejowe (tj. ekspresję białek S100β, Pax6 i Sox2 ocenianą za pomocą znakowania immunofluorescencyjnego) i że przypominają one in vivo MG (mikromacierz MG oczyszczonego FACS)23. Wkrótce potem mRNA glejowe i ekspresja białka zostały zwalidowane i potwierdzone w innym podejściu przy użyciu wektorów wirusowych20. Kilka lat później potwierdzono, że zdecydowana większość komórek znalezionych w tych hodowlach to MG przy użyciu specyficznego dla MG Rlbp1CreERT:tdTomatoreporter mouse24. Co więcej, kwantyfikacja zestawu miRNA zarówno w MG oczyszczonym FACS, jak i hodowanym pierwotnym MG wykazała, że poziomy miRNA MG (mGLiomiR) nie różnią się zbytnio w hodowanym MG w fazie wzrostu. Wydłużone okresy hodowli powodują jednak zmiany w poziomach miRNA, a co za tym idzie w poziomach mRNA i ekspresji białek, ponieważ miRNA są regulatorami translacyjnymi25.
W 2013 roku ten model hodowli MG został wykorzystany do przetestowania różnych czynników transkrypcyjnych pod kątem ich zdolności do przeprogramowania MG na neurony siatkówki20. Stwierdzono, że Ascl1 jest bardzo solidnym i niezawodnym czynnikiem przeprogramowującym. Nadekspresja Ascl1 za pośrednictwem wektorów wirusowych indukowała zmiany morfologiczne, ekspresję markerów neuronalnych i nabywanie właściwości elektrofizjologicznych neuronów. Co ważniejsze, spostrzeżenia i wyniki uzyskane z tych pierwszych eksperymentów in vitro zostały z powodzeniem przeniesione do aplikacji in vivo22,26, wykazując, że pierwotne hodowle MG stanowią solidne i wiarygodne narzędzie do wstępnych badań przesiewowych czynników i oceny cech glejowych przed wdrożeniem in vivo.
Kilka lat temu pokazano, że wzbogacone w mózg miRNA miR-124, które jest również wysoko wyrażane w neuronach siatkówki, może indukować ekspresję Ascl1 w hodowlanych MG21. Ekspresję Ascl1 w żywych komórkach wizualizowano za pomocą myszy reporterowej Ascl1 (Ascl1CreERT:tdTomatoSTOPfl/fl). Mysz reporterowa to genetycznie zmodyfikowana mysz, która ma gen reporterowy wstawiony do swojego DNA. Ten gen reporterowy koduje białko reporterowe, które w tym badaniu jest tdTomato, białkiem czerwonej fluorescencji. To białko reporterowe informuje o ekspresji interesującego genu, w tym przypadku Ascl1. Innymi słowy, komórki, które wyrażają Ascl1, zmienią kolor na czerwony. Ponieważ Ascl1 jest wyrażany tylko w RPCs9, ta mysz Ascl1 CreERT:tdTomatoSTOPfl/fl umożliwia śledzenie konwersji MG do RPC z ekspresją Ascl1, co oznacza, że konwertujące komórki będą wyrażać czerwone fluorescencyjne białko reporterowe tdTomato. Jest to nieodwracalne etykietowanie, ponieważ DNA tych komórek jest zmienione. W związku z tym każde późniejsze różnicowanie neuronów zostanie uwidocznione, ponieważ etykieta tdTomato pozostaje w różnicujących się komórkach. Jeśli ekspresja Ascl1 RPC pochodząca z MG (z etykietą tdTomato) różnicuje się w neurony, neurony te nadal będą miały swoją czerwoną etykietę. Mysz ta umożliwia zatem nie tylko znakowanie RPC pochodzących od MG do obrazowania żywych komórek, ale także umożliwia mapowanie losów i śledzenie linii tych pochodzących z MG (czerwonych) RPC. Niedawno zidentyfikowano zestaw miRNA w RPC, a kultury MG myszy Ascl1CreERT:tdTomatoSTOPfl/fl RPC-reporter wykorzystano do badań przesiewowych i testowania wpływu tych miRNA na zdolność i wydajność przeprogramowywania27. Okazało się, że jeden z kandydatów, miR-25 RPC-miRNA, jest zdolny do przeprogramowania hodowanego MG w komórki wykazujące ekspresję Ascl1 (Ascl1-Tomato+). Te przeprogramowane komórki z czasem przyjmują cechy neuronalne, w tym morfologię neuronów (małe somaty i krótkie lub długie drobne procesy), ekspresję transkryptów neuronalnych mierzoną za pomocą scRNA-Seq, a także ekspresję białek neuronalnych zwalidowaną za pomocą znakowania immunofluorescencyjnego27.
Tutaj protokół szczegółowo opisuje, jak hodować i transfekować MG z myszy P12 zaadaptowanych z poprzedniej pracy21,24,27. Do tego protokołu wybrano wspomniany miRNA miR-25, miRNA o wysokiej ekspresji w RPC, z niskimi poziomami ekspresji w MG lub neuronach siatkówki. W celu nadekspresji miR-25 stosuje się mysie mimiki miR-25, czyli sztuczne cząsteczki miRNA. Jako kontrolę wybiera się mimimikę miRNA z Caenorhabditis elegans, która nie pełni żadnej funkcji w komórkach ssaków. Wizualizacja konwersji MG na RPC została zrealizowana za pomocą myszy reporterowej RPC (Ascl1CreERT:tdTomatoSTOPfl/fl), myszy o mieszanym tle (szczepy C57BL/6, S129 i ICR). Hodowlę tę można jednak przeprowadzić ze wszystkimi szczepami myszy, w tym ze szczepami typu dzikiego. W ciągu ostatnich kilku lat pierwotny protokół został zmodyfikowany w celu skrócenia czasu trwania fazy wzrostu i ogólnego okresu hodowli oraz zapewnienia bardziej solidnego statusu komórek glejowych i zminimalizowania stopnia degeneracji komórek, która występuje w dłuższych okresach hodowli. Wydłużono również regularne okno czasowe transfekcji z 3 h do 2 dni. Jak wspomniano wcześniej, chociaż obecny protokół opisuje hodowle MG jako narzędzie do badań nad regeneracją, metoda jest nie tylko przydatna do testowania czynników przeprogramowujących, ale może być również dostosowana do innych zastosowań, w tym badań nad zachowaniami migracyjnymi lub proliferacyjnymi MG, paradygmatami związanymi z urazami/uszkodzeniem komórek i/lub identyfikacją podstawowych mechanizmów i szlaków.