Mysi siekacz to organ, który rośnie nieprzerwanie przez cały okres życia myszy. Nabłonkowe i mezenchymalne komórki macierzyste znajdujące się w tkankach proksymalnych siekaczy dają początek potomstwu, które różnicuje się w ameloblasty, odontoblasty i fibroblasty miazgi. Komórki te odgrywają kluczową rolę we wspieraniu trwałego obrotu tkanek siekaczy, co sprawia, że siekacz mysi jest doskonałym modelem do badania homeostazy dorosłych komórek macierzystych. Uważa się, że komórki macierzyste zawierają długowieczne komórki w stanie spoczynku, które mogą być znakowane analogami nukleotydów, takimi jak 5-etynylo-2'-deoksyurydyna (EdU). Komórki zachowują tę etykietę w czasie i są odpowiednio nazywane komórkami zachowującymi znacznik (LRC). Metody wizualizacji LRC in vivo stanowią solidne narzędzie do monitorowania homeostazy komórek macierzystych. W niniejszym opracowaniu opisaliśmy metodę wizualizacji i analizy LRC. Nasze innowacyjne podejście obejmuje LRC w siekaczach myszy po oczyszczeniu tkanek i barwieniu EdU w całości, a następnie mikroskopii konfokalnej i trójwymiarowej (3D) rekonstrukcji za pomocą oprogramowania do obrazowania. Metoda ta umożliwia akwizycję obrazowania 3D i bezstronną ocenę ilościową w porównaniu z tradycyjną analizą LRC na przekrojonych szkiełkach.