Zjawiska wywołane światłem w wysokiej rozdzielczości są interesujące w wielu dziedzinach, takich jak nanoinżynieria1,2,3, kataliza4,5 i biofotonika6. Niektóre oryginalne projekty, które pozwalają na takie eksperymenty, można znaleźć w literaturze, w tym modyfikacje uchwytów na próbki1,4,7,8,9 oraz światłowód podłączony do mikroskopu10,11.
Połączenie oświetlenia światłem, płynnego środowiska i transmisyjnej mikroskopii elektronowej (TEM) daje doskonałą okazję do szczegółowych, dynamicznych badań procesów wywołanych światłem. Jednak warunki wysokiej próżni wewnątrz mikroskopu są raczej niekorzystne dla wielu cieczy, zwłaszcza roztworów wodnych. Enkapsulacja cieczy, która chroni ją przed środowiskiem, może być osiągnięta za pomocą kilku technik opartych głównie na podłożach grafenowych12, krzemu nitride13, lub carbon14. Oprócz badań w dziedzinie materiałoznawstwa2, tak zwane komórki płynne oferują możliwości prowadzenia niekonwencjonalnych obserwacji mikroskopowych na próbkach biologicznych w pobliżu ich rodzimych warunków15. Takie obserwacje są niezwykle wymagające, zwłaszcza dla żywych mikroorganizmów, takich jak komórki bakteryjne. Wiązka elektronów jako promieniowanie jonizujące powoduje nieodwracalne uszkodzenia uwodnionych próbek, dlatego dawka elektronów musi być określona16. Jest to konieczne, aby zminimalizować niekorzystne efekty, kontrolować uszkodzenia i uniknąć mylących artefaktów. Optymalna maksymalna dawka elektronów, która pozwala na obserwacje żywych komórek, jest nadal wątpliwym tematem16, ale dawka 30 e−/nm2 wydaje się być wartością progową, przynajmniej dla bakterii17.
Niektóre z tematów interesujących dla takich badań mikroskopowych to procesy zachodzące podczas przeciwbakteryjnej terapii fotodynamicznej (APDT)18. Krótko mówiąc, terapia przebiega w następujący sposób. Komórki bakteryjne są otoczone światłoczułą cieczą zwaną fotouczulaczem. Gdy oświetlenie świetlne jest nadawane na określonej długości fali, cytotoksyczne reaktywne formy tlenu (ROS) są generowane w wyniku przeniesienia energii lub ładunku ze wzbudzonych cząsteczek fotouczulacza do tlenu naturalnie występującego w roztworze. Patogeny wystawione na działanie ROS są szybko inaktywowane z bardzo wysoką skutecznością, bez skutków ubocznych19. Odpowiedź na terapię jest różna dla różnych drobnoustrojów – na przykład wpływ tego samego fotouczulacza może być zupełnie inny dla bakterii Gram-dodatnich i Gram-ujemnych20. Ogólnie rzecz biorąc, ustalono, że głównym celem ROS są zewnętrzne struktury komórek, gdzie uszkodzenie skutkuje zaburzeniami funkcjonalnymi błony komórkowej, a w konsekwencji prowadzi do śmierci bakterii21,22. Jednak uszkodzenie kwasów nukleinowych i białek może być również uważane za przyczynę inaktywacji18, więc nadal nie wiadomo, które struktury komórkowe są głównymi celami podczas tego procesu19. Głębsze zrozumienie szkodliwych procesów może pomóc w ulepszeniu tej ostatecznej terapii. W porównaniu z metodami mikroskopii świetlnej stosowanymi w badaniach APDT23, techniki TEM dają więcej możliwości przyjrzenia się mechanizmowi APDT z wyższą rozdzielczością i powiększeniem24. TEM został już z powodzeniem wykorzystany do obserwacji komórek w trakcie trwającej terapii, co pozwoliło nam na zbadanie uszkodzeń bakterii Gram-dodatnich i szczegółowe opisanie zmian zachodzących w obrębie ściany komórkowej6,25.
Obecny protokół przedstawia odpowiednią konfigurację eksperymentalną do obrazowania w wysokiej rozdzielczości inaktywacji bakterii wywołanych światłem za pomocą TEM, co wymaga odpowiedniego systemu oświetlenia światłem, hermetyzacji komórek cieczą i ścisłej kontroli dawki elektronów. Bakterią użytą do obserwacji był Staphylococcus aureus, a jako fotouczulacz użyto roztworu błękitu metylenowego. Specjalny zestaw oświetlenia świetlnego składa się z przestrajalnego lasera półprzewodnikowego połączonego bezpośrednio z kolumną mikroskopu za pomocą światłowodu. Taka konstrukcja zapewnia równomierne napromieniowanie w całej próbce ze względu na prawie równoległe ułożenie światłowodu do osi mikroskopu. Monochromatyczne światło o dużym natężeniu generowane przez laser można następnie wykorzystać do badania różnych efektów fotochemicznych. Światło użyte w eksperymencie miało długość fali równą 660 nm, ponieważ w obszarze widzialnym błękit metylenowy ma piki absorpcyjne przy 613 nm i 664 nm26. Protokół enkapsulacji płynów oparty jest na substratach węglowych, co sprawia, że zabieg jest szybki i nieskomplikowany. Na koniec przedstawiono metodę niskodawkowej obserwacji in situ komórek w cieczy. Omówiono trudności związane z przygotowaniem próbki, wpływem dawki elektronów na wrażliwą próbkę oraz rozsądną interpretacją obrazu.