RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
pl_PL
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Yuan Cao*1,2, Ji-Yu Qiu*1,3, Da Chen1,2, Chen-Yao Li1,4, Shu-Juan Xing1,5, Chen-Xi Zheng1, Xin Liu2, Yan Jin1,6, Bing-Dong Sui1
1State Key Laboratory of Military Stomatology & National Clinical Research Center for Oral Diseases & Shaanxi International Joint Research Center for Oral Diseases, Center for Tissue Engineering, School of Stomatology,The Fourth Military Medical University, 2Department of Orthodontics, School of Stomatology,The Fourth Military Medical University, 3Department of VIP Dental Care, School of Stomatology,The Fourth Military Medical University, 4School of Basic Medicine,The Fourth Military Medical University, 5College of Life Science,Northwest University, 6Xi'an Institute of Tissue Engineering and Regenerative Medicine
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Obecny protokół opisuje metodę ekstrakcji pęcherzyków zewnątrzkomórkowych z krwi obwodowej i tkanek stałych z późniejszym profilowaniem antygenów powierzchniowych i ładunków białkowych.
Krążące i rezydujące w tkankach pęcherzyki zewnątrzkomórkowe (EVs) stanowią obiecujące cele jako nowe biomarkery teranostyczne i wyłaniają się jako ważni gracze w utrzymaniu homeostazy organizmu i postępie szerokiego spektrum chorób. Podczas gdy obecne badania koncentrują się na charakterystyce endogennych egzosomów o pochodzeniu endosomalnym, mikropęcherzyki pęcherzykowe pęcherzyki pęcherzykowe z błony plazmatycznej zyskują coraz większą uwagę w zdrowiu i chorobie, które charakteryzują się obfitością cząsteczek powierzchniowych rekapitulujących sygnaturę błonową komórek macierzystych. W tym miejscu przedstawiono powtarzalną procedurę opartą na wirowaniu różnicowym w celu ekstrakcji i scharakteryzowania EV z osocza i tkanek stałych, takich jak kości. Protokół opisuje ponadto późniejsze profilowanie antygenów powierzchniowych i ładunków białkowych pojazdów elektrycznych, które są w ten sposób identyfikowalne dla ich pochodzenia i identyfikowane ze składnikami związanymi z potencjalną funkcją. Metoda ta będzie przydatna do korelacyjnej, funkcjonalnej i mechanistycznej analizy EV w badaniach biologicznych, fizjologicznych i patologicznych.
Pęcherzyki zewnątrzkomórkowe (EV) zostały zaproponowane do zdefiniowania dwuwarstwowych struktur zewnątrzkomórkowych uwalnianych przez komórki1, które odgrywają ważną rolę w różnych zdarzeniach fizjologicznych i patologicznych2. EV uwalniane przez zdrowe komórki można ogólnie podzielić na dwie główne kategorie, a mianowicie egzosomy (lub małe EV) utworzone przez wewnątrzkomórkowy szlak transportu endocytarnego3 i mikropęcherzyki (lub duże EV) powstałe przez zewnętrzne pączkowanie błony plazmatycznej komórki4. Podczas gdy wiele badań koncentruje się na funkcji EV pobranych z komórek hodowanych in vitro5, EV pochodzące z krążenia lub tkanek są bardziej złożone i niejednorodne, co ma tę zaletę, że odzwierciedla prawdziwy stan organizmu in vivo6. Co więcej, prawie wszystkie rodzaje tkanek mogą wytwarzać EV in vivo, a te EV mogą działać jako posłańcy w tkance lub być przenoszone przez różne płyny ustrojowe, zwłaszcza krew obwodową, aby ułatwić komunikację ogólnoustrojową7. EV w krążeniu i tkankach są również celami w diagnostyce i leczeniu chorób8.
Podczas gdy egzosomy były intensywnie badane w ostatnich latach, mikropęcherzyki pełnią również ważne funkcje biologiczne, które można łatwo wydobyć bez ultrawirowania, co sprzyja badaniom podstawowym i klinicznym9. Warto zauważyć, że kluczową kwestią dotyczącą EV wyizolowanych z krążenia i tkanek jest to, że pochodzą one z różnych typów komórek10. Ponieważ mikropęcherzyki są usuwane z błony komórkowej i charakteryzują się dużą ilością cząsteczek na powierzchni komórki9, możliwe jest użycie markerów macierzystej błony komórkowej do identyfikacji pochodzenia komórkowego tych EV. W szczególności technika cytometrii przepływowej (FC) może być stosowana do wykrywania markerów błonowych. Co więcej, naukowcy mogą wyizolować pojazdy elektryczne i przeprowadzić dalsze analizy w oparciu o funkcjonalne ładunki.
Obecny protokół zapewnia dokładną procedurę ekstrakcji i charakteryzowania EV z próbek in vivo. EV są izolowane za pomocą wirowania różnicowego, a charakterystyka EV obejmuje identyfikację morfologiczną za pomocą analizy śledzenia nanocząstek (NTA) i transmisyjnej mikroskopii elektronowej (TEM), analizę pochodzenia za pomocą FC oraz analizę ładunku białka za pomocą western blot. Jako przedstawiciele stosuje się osocze krwi i kość szczęki myszy. Badacze mogą odwołać się do tego protokołu dla pojazdów elektrycznych z innych źródeł i wprowadzić odpowiednie modyfikacje.
Eksperymenty na zwierzętach zostały przeprowadzone zgodnie z wytycznymi Instytucjonalnego Komitetu ds. Opieki i Użytkowania Zwierząt Czwartego Wojskowego Uniwersytetu Medycznego oraz wytycznymi ARRIVE. W niniejszym badaniu wykorzystano 8-tygodniowe myszy C57Bl/6 (bez preferencji ani dla samic, ani samców). Etapy związane z izolacją EV osocza i tkanek są zilustrowane na Rysunek 1. Osocze jest traktowane jako przedstawiciel opisujący procedurę izolacji EV z płynów ustrojowych. Kość szczęki jest traktowana jako reprezentatywna w celu wyjaśnienia procedury izolacji EV z tkanek litych.
1. Przygotowanie próbek osocza i kości szczęki
2. Ekstrakcja EV
3. Identyfikacja morfologiczna EV
4. Analiza pochodzenia pojazdów elektrycznych
UWAGA: Identyfikacja komórkowego pochodzenia EV wymaga zastosowania przeciwciał dla typowych markerów błony komórkowej. Minimalna objętość osocza do ekstrakcji EV dla poniższej procedury wynosi 300 μL. W oparciu o dwuwarstwowe struktury lipidowe EV, do ich oznaczania można użyć barwnika membranowego. W przypadku próbek osocza krwi do reprezentacji wybiera się CD18 dla limfocytów14. W przypadku próbek kości szczęki jako przykład wybrano receptor związany z osteoklastami (OSCAR) dla osteoklastów15. Przed FC upewnij się, że cytometr przepływowy jest dostosowany do pomiaru EVs16, ponieważ dolna granica rozmiaru jest znacznie różna między różnymi cytometrami przepływowymi.
5. Analiza zawartości białka w EV
UWAGA: Analiza zawartości białka w EVs jest przeprowadzana za pomocą western blot. Na przykład EV osocza i kości wybrano do analizy dehydrogenazy 6-fosfoglukonianu (PGD) i kinazy pirogronianowej M2 (PKM2) pod kątem stanu metabolicznego. Golgin84 (organelle Golgiego) zastosowano jako kontrolę negatywną, a flotylinę (białko błonowe), kaweolinę (integralne białko kaweoli) i β-aktynę (cytoszkielet) 17 zastosowano jako kontrolę pozytywną w EV w porównaniu z próbkami komórek. Mitofilina i α-aktynina-4 zostały wybrane jako duże markery EV, podczas gdy CD9 i CD81 zostały wybrane jako małe markery EV, aby zademonstrować subpopulacje EV18. Apoa1 został wybrany jako marker lipopcząstek osocza19. Szczegółowe informacje na temat odczynników znajdują się w Tabeli materiałów.
Zgodnie z eksperymentalnym przepływem pracy, EVs mogą być ekstrahowane z krwi obwodowej i tkanek stałych (Rysunek 1). Kość szczęki myszy w wieku 8 tygodni wynosi około 0,1 ± 0,05 g, a od myszy można pobrać około 300 μl osocza. Postępując zgodnie z krokami protokołu, można zebrać odpowiednio 0,3 mg i 3 μg EV. Zgodnie z analizą TEM i NTA, typowymi cechami morfologicznymi EV są okrągłe pęcherzyki błonowe w kształcie miseczki o średnicy w zakresie od 50 do 300 nm (Rysunek 2). FC może wykrywać EV znakowane barwnikiem membranowym pod użyteczną kontrolą, a analiza FC pokazuje procentową ekspresję określonych markerów błonowych na EV, co sugeruje ich pochodzenie z komórek macierzystych (Rysunek 3). Analiza Western blot pokazuje ekspresję PGD i PKM2, odpowiednio, jako reprezentatywną zawartość białka w EV osocza i EV kości, wskazując na stan metaboliczny (Figura 4). Ujemna ekspresja Golgin84 w EV jest również wykrywana przy obecności Mitofiliny, α-aktyniny-4, flotyliny-1, kaweoliny-1 i β-aktyny, która jest powszechnie wzbogacana w duże EV (mikropęcherzyki) pochodzące z błony plazmatycznej. Można również wykryć mały marker EV CD9, podczas gdy ekspresja CD81 jest niska lub nieobecna, z brakiem obecności Apoa1 w plazmowych EV (Rysunek 4).

Rysunek 1: Ilustracja protokołu ekstrakcji EVs. (A) Etapy ekstrakcji EV z osocza krwi obwodowej za pomocą wirowania różnicowego. (B) Etapy ekstrakcji EV tkanek za pomocą wirowania różnicowego. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 2: Identyfikacja morfologiczna EV. (A) Reprezentatywny obraz transmisyjnego mikroskopu elektronowego (TEM) przedstawiający morfologię EV. Podziałka = 200 nm. (B) Reprezentatywne obrazy analizy śledzenia nanocząstek (NTA) i wyniki kwantyfikacji pokazują rozkład wielkości i liczbę cząstek EV. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 3: Analiza pochodzenia EVs. (A) Różne zestawy probówek z różnymi elementami sterującymi eksperymentu. (B) Rozkład koralików o rozmiarach 1 μm, 0,5 μm i 0,2 μm pokazany na wykresie scatted. (C) Reprezentatywne wykresy gęstości przedstawiające PBS (probówka A), proste barwienie EV (probówka B), proste barwienie barwnika membranowego (probówka C) i podwójne barwienie próbek EV (probówka D). (D) Analiza cytometrii przepływowej odsetka EV CD18 dodatnich w EV osocza krwi w kolorze czerwonym w porównaniu z kontrolą tylko przeciwciał drugorzędowych w kolorze czarnym. (E) Analiza cytometryczna przepływowa odsetka dodatnich EV OSCAR z próbek kości w kolorze czerwonym w porównaniu z kontrolą tylko przeciwciał drugorzędowych w kolorze czarnym. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 4: Analiza zawartości białka w EVs. (A) Reprezentatywne obrazy EV osocza western blot pokazujące obecność dehydrogenazy 6-fosfoglukanianu (PGD) i Mitofiliny, α-aktyniny-4, CD9, flotyliny-1, kaweoliny-1 i β-aktyny w EV osocza oraz ujemnej ekspresji CD81, Golgin84 i Apoa1. (B) Reprezentatywne obrazy EV kości western blot wykazujące obecność kinazy pirogronianowej M2 (PKM2) i Mitofiliny, α-aktyniny-4, CD9, CD81, flotyliny-1, kaweoliny-1 i β-aktyny w EV kości oraz ujemną ekspresję Golgin84. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.
| numer | 1 | cyfra arabska | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 |
| BSA (μL) | 0 | 1 | cyfra arabska | 4 | 8 | 12 | 16 | 20 |
| NS (μL) | 20 | Rozdział 19 | Rozdział 18 | 16 | 12 | 8 | 4 | 0 |
Tabela 1: Standardowe rozwiązanie robocze testu BCA. Dodaj 0,5 mg/ml BSA i 0,9% NS do trzech zduplikowanych studzienek, jak pokazano w tabeli.
Autorzy nie mają do ujawnienia żadnych konfliktów interesów.
Obecny protokół opisuje metodę ekstrakcji pęcherzyków zewnątrzkomórkowych z krwi obwodowej i tkanek stałych z późniejszym profilowaniem antygenów powierzchniowych i ładunków białkowych.
Ta praca była wspierana przez granty z Narodowej Fundacji Nauk Przyrodniczych Chin (32000974, 81870796, 82170988 i 81930025) oraz Chińskiej Fundacji Nauk Podoktoranckich (2019M663986 i BX20190380). Jesteśmy wdzięczni za pomoc ze strony Narodowego Centrum Demonstracyjnego Nauczania Eksperymentalnego dla Medycyny Podstawowej (AMFU).
| 4% paraformaldehydu | Transmisyjny mikroskop elektronowy | Biosharp | 143174 |
| Alexa fluor 488 przeciwciało wtórne przeciwko kozom | Yeason | 34306ES60 | Cytometria przepływowa |
| Alexa fluor 488 przeciwciało drugorzędowe przeciwko królikowi | Invitrogen | A11008 | Cytometria przepływowa |
| Przeciwciało anty-CD18 | Abcam | ab131044 | Cytometria przepływowa |
| Przeciwciało anty-CD81 | Abcam | ab109201 | Przeciwciało Western blot |
| anty-CD9 | Huabio | ET1601-9 | Przeciwciało Western blot |
| anty-mitofiliny | Abcam | ab110329 | Western |
| blot APOA1 Rabbit pAb | Abclone | A14211 | Western blot |
| Zestaw do oznaczania białka BCA | TIANGEN | PA115 | Western blot |
| BLUeye Prestained Protein Ladder | Sigma-Aldrich | 94964-500UL | Western blot |
| Albumina surowicy bydlęcej | MP Biomedical | 218072801 | Western blot |
| Przeciwciało kaweoliny-1 | Santa Cruz Biotechnology | sc-53564 | Western blot |
| CellMask Pomarańczowa plama błony plazmatycznej | Invitrogen | C10045 | Cytometria przepływowa |
| Chemiluminescencja | Amersham Biosciences | N/A | Western blot |
| Zakrzywione nożyce operacyjne | Instrument chirurgiczny JZ Izolacja | J21040 | EV |
| Waga elektroniczna | Zhi Ke | Izolacja ZK-DST | EV |
| Spektrofotometr epokowy | BioTek | N/A | Western blot |
| Probówki Eppendorfa | Izolacja Eppendorf | 3810X | EV |
| Przeciwciało flotyliny-1 | PTM BIO | PTM-5369 | Western blot |
| System obrazowania żelowego | Tanon | 4600 | Western blot |
| Golgin84 | Novus | nbp1-83352 | Western blot |
| Siatki - Formvar/Carbon Coated - Miedź 200 mesh | Polysciences | 24915 | Transmisyjny mikroskop elektronowy |
| Roztwór heparyny | StemCell | Izolacja 7980 | EV |
| Liberase Research Grade | Sigma-Aldrich | 5401127001 | Izolacja EV |
| Mikroskopijna pęseta | Instrument chirurgiczny JZ Izolacja | JD1020 | EV |
| Cytometr przepływowy NovoCyte | ACEA | N/A | Cytometria przepływowa |
| Omni-PAGE Hepes-Tris Gels Hepes 4 ~ 20%, 10 dołków | Epizyme | LK206 | Western blot |
| OSCAR( D-19) | przeciwciałoSanta Cruz Biotechnology | SC-34235 | Cytometria przepływowa |
| PBS (2x) | ZHHC | PW013 | Western blot |
| Pentobarbital sodu | Sigma-Aldrich | 57-33-0 | Znieczulenie |
| Peroksydaza AffiniPure Goat Anti-Mouse IgG (H + L) | Jacson | 115-035-003 | Peroksydaza Western blot |
| AffiniPure Goat Anti-Rabbit IgG (H+L) | Jacson | 111-035-003 | Western blot |
| Kwas fosfatungsowy | RHAWN | 12501-23-4 | Transmisyjny mikroskop elektronowy |
| PKM2(D78a4) xp rabbit mab | Sygnalizacja komórkowa | 4053t | Western blot |
| Folia polietylenowa (PE) | Xiang yi | 200150055 | Transmisyjny mikroskop elektronowy |
| Membrany z polifluorku winylidenu | Roche | 3010040001 | Western blot |
| Inhibitory proteazy | Roche | 4693132001 | Western blot |
| Rekombinowane przeciwciało anty-PGD | Abcam | ab129199 | Westernblot |
| Bufor do lizy RIPA | Beyotime | P0013 | Westernblot |
| Bufor ładujący SDS-PAGE (5x) | Cwbio | CW0027S | Western blot |
| Rozmiar koralików | Invitrogen | F13839 | Cytometria przepływowa |
| Stołowe mikrowirówki szybkoobrotowe | Izolacja Hitachi | CT15E | EV |
| Transmisyjny mikroskop elektronowy | HITACHI | H-7650 | Transmisyjny mikroskop elektronowy |
| Tween-20 | MP Biomedicals | 19472 | Western blot |
| Vortex Mixer Genie | Scientific Industries | SI0425 | Izolacja EV |
| ZetaView BASIC NTA - Mikroskop wideo do śledzenia nanocząstek PMX-120 | Particle Metrix | N/A | Analiza śledzenia nanocząstek |
| α-Actinin-4 Rabbit mAb | Abclone | A3379 | Western blot |
| i beta-aktyna | Cwbio | CW0096M | Western blot |