$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Zmieniona odpowiedź na lewamizol może zidentyfikować geny wymagane do postsynaptycznej sygnalizacji cholinergicznej i funkcji mięśni. Niniejszy protokół opisuje test płynnego lewamizolu stosowany do ilościowego oznaczania paraliżu zależnego od czasu w okresie 1 godziny. Uczniowie dokonują przewidywań dotyczących skutków pewnych mutacji genetycznych, przeprowadzają eksperyment na dużej próbie, a następnie oceniają ilościowo swoje wyniki. Ten test jest prostym i skutecznym sposobem ilościowego oznaczania paraliżu wywołanego lewamizolem bez wybierania lub szturchania zwierząt, dzięki czemu nadaje się do laboratoriów licencjackich, a także naukowców zajmujących się przekaźnictwem nerwowo-mięśniowym. Omówiono tutaj niektóre z najczęstszych pułapek, ograniczenia testu oraz odmianę protokołu, która umożliwia jego stosowanie u zwierząt z nokautem RNAi; Omówiono tutaj również, w jaki sposób ten test można osadzić w doświadczeniu badawczym opartym na kursie licencjackim.
Niezbędne jest prawidłowe przygotowanie płytek 24-dołkowych. Po pierwsze, trawniki bakteryjne muszą być całkowicie suche, zanim zauważy się zwierzęta L1 w studniach. Jeśli nie zostaną wystarczająco wysuszone, bakterie mieszają się z roztworem lewamizolu podczas testu, zmieniając płyn w mętny i uniemożliwiając osobnikom policzenie robaków. Po drugie, podczas synchronizacji robaków za pomocą preparatu wybielającego, zwierzęta nie mogą być zbyt długo wystawione na działanie roztworu wybielacza, ponieważ spowoduje to rozpad powłoki ochronnej na jajach. Po trzecie, ważne jest, aby dostrzec tylko 20-30 L1 na odwiert, ponieważ zbyt wiele robaków w studniach niezwykle utrudnia dokładne policzenie liczby poruszających się w wyznaczonym czasie. Wreszcie, ważne jest, aby zachować technikę aseptyczną podczas przygotowywania płytek, ponieważ nie można zbadać zanieczyszczonych studni.
Istnieje kilka ograniczeń, które należy wziąć pod uwagę podczas wykonywania tego testu. Po pierwsze, liczenie liczby poruszających się robaków w każdym dołku co 5 minut może być przytłaczające dla osób, które nie mają wcześniejszego doświadczenia laboratoryjnego, a to może prowadzić do nieprecyzyjnego zbierania danych. Jeśli chodzi o inne testy stosowane do określania wrażliwości leku 18,19, eksperyment ten można przeprowadzić z mniejszą liczbą punktów czasowych. Po drugie, posiewanie wygłodzonych L1 wyizolowanych z preparatu wybielającego jest łatwą metodą uzyskania zsynchronizowanej populacji; Należy jednak dokonać dostosowań, jeśli czas rozwoju różni się między badanymi szczepami. Do tego testu możliwe jest pobranie zwierząt w późnym czwartym stadium larwalnym (L4) na 24-dołkową płytkę; Jednak przy przygotowywaniu wielu talerzy jest to zbyt pracochłonne. Alternatywnie, należy określić czas potrzebny każdemu szczepowi do osiągnięcia L4, a następnie umieścić L1 w studzienkach w różnym czasie, aby dostosować się do różnic w szybkości dojrzewania. Wreszcie, podczas gdy test ten może być wykorzystany do identyfikacji nowych genów ważnych dla postsynaptycznej funkcji mięśni11, zmieniona odpowiedź lewamizolu może być również spowodowana mutacją lub knockdownem RNAi genów presynaptycznych12. W przypadku zaobserwowania zmienionej wrażliwości lewamizolu, należy przeprowadzić dodatkowe eksperymenty w celu ustalenia przyczyny tego fenotypu.
Dokonując kilku modyfikacji w 24-dołkowych płytkach, opisany test pływania lewamizolu można również przeprowadzić na zwierzętach z nokautem RNAi11. Nokaut genów przez RNAi można osiągnąć poprzez karmienie bakterii C. elegans, które wyrażają dwuniciowe RNA odpowiadające genowi będącemu przedmiotem zainteresowania20. Do przygotowania płytek RNAi należy dodać 1 ml 1M IPTG i 1 ml 25 mg/ml karbenicyliny na litr pożywki po wyjęciu z autoklawu. Kultury bakteryjne hoduje się, wybierając pojedynczą kolonię do 3 ml bulionu LB plus 3 μl 25 mg/ml karbenicyliny i wytrząsając w temperaturze 37 °C przez noc, a mapa płytki jest tworzona, gdy różne bakterie zostaną zauważone w studzienkach. C. elegans są synchronizowane przez preparat wybielający zgodnie z opisem; jednak szczep eri-1 (mg366) nadwrażliwy na RNAi powinien być stosowany zamiast typu dzikiego, aby zwiększyć knockdown genu. Knockdowny RNAi skutkują tymi samymi fenotypami lewamizolu, które obserwuje się w przypadku mutantów utraty funkcji11.
Przedstawiony tutaj protokół może być wykorzystany w badaniach laboratoryjnych, jako samodzielny eksperyment w laboratorium licencjackim lub w pierwszych tygodniach zaawansowanego kursu licencjackiego jako wprowadzenie do podstawowych technik C . elegans i funkcji nerwowo-mięśniowych. Na bardziej zaawansowanym kursie opartym na odkryciach studenci mogą użyć tego testu, aby określić, czy utrata homologów genów C. elegans zmutowanych u osób z zespołami miastenicznymi, dystrofiami mięśniowymi lub miopatiami zmienia wrażliwość na lewamizol. Podsumowując, ten prosty, niedrogi test wrażliwości na lewamizol zapewnia praktyczne podejście do nauki sygnalizacji w NMJ i zdobywania doświadczenia w pracy z systemem modelowym C. elegans .