Tomografia mikrokomputerowa (μCT) jest najpowszechniejszą metodą obrazowania do charakteryzowania trójwymiarowej (3D) morfologii kości i nowo powstałej kości podczas gojenia złamań w badaniach translacyjnych. Badania nad gojeniem się złamań kości długich u gryzoni zazwyczaj obejmują wtórne gojenie i tworzenie zmineralizowanego kalusa. Kształt utworzonego kalusa i gęstość nowo powstałej kości mogą się znacznie różnić w zależności od punktów czasowych i zabiegów. Podczas gdy standardowe metodologie ilościowego określania parametrów nienaruszonej kości korowej i beleczkowej są szeroko stosowane i wbudowane w komercyjnie dostępne oprogramowanie, brakuje konsensusu co do procedur analizy gojącego się kalusa. Celem tej pracy jest opisanie znormalizowanego protokołu, który określa ilościowo frakcję objętości kości i gęstość mineralną kalusa w gojącym się kalusie. Protokół opisuje różne parametry, które należy wziąć pod uwagę podczas obrazowania i analizy, w tym wyrównanie próbki podczas obrazowania, wielkość objętości będącej przedmiotem zainteresowania oraz liczbę warstw, które są konturowane w celu zdefiniowania kalusa.