Fotosynteza oksygeniczna jest jedną z najważniejszych reakcji chemicznych na naszej planecie. Przekształcanie energii świetlnej w energię chemiczną zachodzi w centrach reakcji dwóch fotosystemów: fotosystemu I (PSI) i fotosystemu II (PSII)1 (Rycina 1A). PSI to duży, wysoce konserwatywny, wielopodjednostkowy kompleks pigmentowo-białkowy, który ewoluował ponad 3,5 miliarda lat temu2,3. Kompleks ten, zawierający około 100 cząsteczek chlorofilu i około 20 karotenoidów, ułatwia transport elektronów przez błonę tylakoidów z plastocyjaniny do ferredoksyny, która pełni rolę terminalnego akceptora elektronów w łańcuchu transportu elektronów fotosyntetycznych1,4,5(Rycina 1B, C). U roślin ta napędzana światłem separacja ładunków jest wynikiem przekazania energii świetlnej zarówno z pigmentów antenowych rdzenia PSI, jak i z peryferyjnych pigmentów antenowych kompleksu zbierającego światło I (LHCI) do centrum reakcji PSI (Rycina 1D). LHCI to swoisty dla PSI kompleks antenowy w błonie tylakoidów, składający się z czterech wiążących chlorofil a/b białek antenowych LHCA6,7.

Rysunek 1: Fotosyntetyczny łańcuch transportu elektronów oraz ogólna struktura kompleksu PSI-LHCI. (A) Fotosyntetyczny łańcuch transportu elektronów składa się z czterech głównych kompleksów fotosyntetycznych związanych z błoną oraz trzech rozpuszczalnych przenośników elektronów. Przepływ elektronów (czerwone strzałki) przez łańcuch transportowy oraz pompowanie protonów (czarne strzałki) do lumenu służą do wytwarzania siły redukcyjnej (NADPH) i produkcji ATP na potrzeby asymilacji węgla37,38,39,40. Utworzone za pomocą Biorender.com. (B) Struktura roślinnego PSI-LHCI widziana od strony lumenu. PsaA i PsaB to największe podjednostki PSI, które tworzą rdzeń kompleksu. LHCI to kompleks antenowy zbierający światło związany z PSI, składający się z czterech anten, LHCA1-4. (C) Kompleks PSI-LHCI koordynuje ponad 150 ligandów. Przedstawiono tutaj chlorofile (zielone), karotenoidy (różowe), chinony (fioletowe), lipidy (pomarańczowe) oraz klastry FeS centrum reakcji (żółto-pomarańczowe). (D) Centrum reakcji PSI jest podzielone na dwie gałęzie (A i B), zaczynając od P700, specjalnej pary chlorofili centrum reakcji, przechodząc przez dwa chlorofile akcesoryjne (A-1A/B), a następnie przez kolejną parę chlorofili (A0A/B). Za tymi chlorofilami w każdej gałęzi następuje fylochinon (A1A/B lub QA/B w niektórych publikacjach), zanim połączą się one w klastrze żelazowo-siarkowym Fx, a następnie w dwóch kolejnych klastrach, FA i FB, koordynowanych przez podjednostkę PsaC. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tego rysunku.
Pierwsza izolacja PSI z roślin w 1966 roku rzuciła światło na różnice w zawartości pigmentów zbierających światło między PSI a PSII, wykazując, że PSI jest silnie wzbogacone w β-karoten w porównaniu z PSII oraz że cytochromy f i b6 (część kompleksów cytochromu b6f) nie są ściśle związane z PSI, lecz luźno powiązane w obrębie błony tylakoidów8. Dziewięć lat później, poprzez częściową denaturację izolowanego PSI za pomocą traktowania SDS, wykazano, że dysocjacja małych podjednostek PSI hamuje fotoredukcję NADP+ przez PSI, podczas gdy sygnał P700 i większość chlorofili pozostały w obrębie pozostałej cząsteczki PSI o dużej masie cząsteczkowej, co wskazało na konieczność obecności niektórych małych podjednostek PSI dla pełnej funkcji biologicznej oraz określiło lokalizację centrum reakcji PSI9. Badania nad powiązaniem rdzenia PSI z LHCI zostały po raz pierwszy opublikowane na początku lat 80., kiedy zaobserwowano izolacje różnych gatunków PSI o różnych rozmiarach, zawierających odmienne stosunki chlorofilu A do P700, co sugerowało powiązanie PSI z obwodowym systemem antenowym zawierającym chlorofil10,11,12,13. Jednak dopiero w 2003 roku opublikowano pierwszą strukturę krystaliczną roślinnego PSI14. Struktura krystaliczna roślinnego PSI-LHCI podkreśliła niezwykłą konserwację między rdzeniem PSI roślin a cyjanobakterii i dostarczyła pierwszego obrazu rozmieszczenia chlorofili w obrębie rdzenia PSI roślin oraz anteny LHCI, co pogłębiło zrozumienie ścieżek transferu energii w obrębie kompleksu PSI-LHCI roślin14. W ciągu ostatniej dekady wyznaczono więcej struktur roślinnego PSI-LHCI, dodając szczegóły na poziomie atomowym do strukturalnego opisu superkompleksu15,16,17,18,19.
PSI nie tylko posiada wydajność kwantową bliską jedności, ale charakteryzuje się również najbardziej ujemnym potencjałem redukcyjnym występującym w naturze20,21. Pełne zrozumienie PSI-LHCI i jego właściwości jest niezbędne dla pojęcia mechanizmów napędzanego światłem transferu energii oraz zastosowania bioinspirowanych rozwiązań w przyszłych technologiach pozyskiwania światła. Aby pogłębić wiedzę na temat tego, w jaki sposób PSI-LHCI i jego liczne podjednostki mogą osiągać tak wydajną konwersję energii, kompleksy izolowane do badań muszą pozostać aktywne i nienaruszone. Niniejszy protokół umożliwia łagodne oczyszczanie kompleksu w tym aktywnym stanie22,23.
W niniejszej metodzie tkanki roślinne są rozbijane mechanicznie, a chloroplasty zawierające łańcuch transportu elektronów fotosyntezy są izolowane poprzez wirowanie. Membrany tylakoidów są oddzielane po hipotonicznej lizie chloroplastów, a następnie solubilizowane przy użyciu detergentu n-dodecyl-beta-maltosyd (β-DDM). Solubilizowane kompleksy błonowe zawierające chlorofil są rozdzielane za pomocą chromatografii wymiany anionowej, a następnie kompleks PSI-LHCI jest dodatkowo oczyszczany poprzez wirowanie w gradiencie sacharozy. Po usunięciu z gradientu oraz charakterystyce za pomocą spektroskopii i elektroforezy w żelu poliakrylamidowym z dodecylosiarczanem sodu (SDS-PAGE), kompleks może zostać przygotowany do dalszych eksperymentów. Procedura ta jest stosowana do oczyszczania kompleksu PSI-LHCI z roślin bez użycia znaczników powinowactwa. Po wprowadzeniu niewielkich modyfikacji może zostać ona dostosowana do preparowania kompleksu z innych organizmów, stabilizacji alternatywnych kompleksów PSI lub innych kompleksów łańcucha transportu elektronów fotosyntezy. Podobne protokoły zostały wykorzystane do otrzymania kompleksu PSI nadającego się do wysokorozdzielczej analizy strukturalnej23,24,25,26,27,28,29,30.